单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
23241 2024-08-08
Adipocyte Heterogeneity Underlying Adipose Tissue Functions
2022-01-01, Endocrinology IF:3.8Q2
研究论文 本文讨论了利用单细胞RNA测序和单核测序技术研究脂肪细胞异质性的策略,以更好地理解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其与代谢疾病的关系 采用了单细胞RNA测序和单核测序技术来揭示脂肪细胞亚型的复杂性,这些技术之前因脂肪细胞的大小、浮力和脆弱性而难以应用 NA 深入了解不同脂肪库中的脂肪细胞亚型及其在代谢疾病中的作用 脂肪细胞亚型及其在不同脂肪库中的功能 NA 代谢疾病 单细胞RNA测序 NA 转录组 NA
23242 2024-08-08
Induction of Interferon-γ and Tissue Inflammation by Overexpression of Eosinophil Cationic Protein in T Cells and Exosomes
2022-01, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
研究论文 本研究探讨了T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮(SLE)发病机制中的作用,特别是嗜酸性阳离子蛋白(ECP)的过度表达。 首次揭示了ECP在T细胞和T细胞衍生的外泌体中过度表达可能导致SLE相关的肾炎、肝炎和关节炎。 研究仅限于小鼠模型,需要进一步的人体研究来验证这些发现。 研究T细胞衍生的外泌体蛋白在系统性红斑狼疮发病机制中的作用。 系统性红斑狼疮患者和健康对照的T细胞衍生的外泌体蛋白。 NA 系统性红斑狼疮 MACSPlex外泌体分析和蛋白质组学 NA 蛋白质 T细胞特异性ECP转基因小鼠(每组5只),老年T细胞特异性ECP转基因小鼠(每组3只),接受转移外泌体的小鼠(每组3只)
23243 2024-08-08
High-dimensional and single-cell transcriptome analysis of the tumor microenvironment in angioimmunoblastic T cell lymphoma (AITL)
2022-01, Leukemia IF:12.8Q1
研究论文 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞转录组分析技术,探讨了血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤(AITL)肿瘤微环境(TME)中的细胞组成和特征 首次详细描述了AITL TME中B细胞和CD8+ T细胞的特定表型和功能状态,揭示了非恶性细胞在AITL生物学中的重要作用 NA 深入理解AITL肿瘤微环境中非恶性细胞的作用和特征 AITL肿瘤微环境中的细胞组成和功能 数字病理学 淋巴瘤 质谱流式细胞术,单细胞转录组分析 NA 转录组 NA
23244 2024-08-08
Ex vivo mass cytometry analysis reveals a profound myeloid proinflammatory signature in psoriatic arthritis synovial fluid
2021-12, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究利用质谱流式细胞术(CyTOF)结合转录组分析,生成匹配的银屑病关节炎(PsA)滑液(SF)和血液白细胞的高维数据集,旨在识别未刺激淋巴细胞和髓系细胞中的细胞因子产生。 本研究首次通过多组学分析,生成了PsA滑液和血液的全面细胞图谱,揭示了PsA中潜在的致病性和治疗重要性的关键扩展髓系促炎模块。 NA 识别银屑病关节炎滑液中未刺激淋巴细胞和髓系细胞的细胞因子产生 银屑病关节炎(PsA)滑液(SF)和血液白细胞 数字病理学 银屑病关节炎 质谱流式细胞术(CyTOF) NA 高维数据集 新鲜滑液和配对血液样本
23245 2024-08-08
Aberrant lung lipids cause respiratory impairment in a Mecp2-deficient mouse model of Rett syndrome
2021-11-01, Human molecular genetics IF:3.1Q2
研究论文 本文研究了Rett综合征小鼠模型中Mecp2缺陷导致的肺部脂质异常及其对呼吸功能的影响 首次揭示了MECP2在肺部的自主缺失与呼吸症状之间的关系,并发现氟伐他汀降低脂质水平可改善呼吸异常 NA 探讨Rett综合征中肺部脂质异常与呼吸功能障碍的关系 Mecp2缺陷小鼠模型中的肺部脂质和呼吸功能 NA Rett综合征 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 Mecp2缺陷小鼠
23246 2024-08-08
Stratified Test Accurately Identifies Differentially Expressed Genes Under Batch Effects in Single-Cell Data
2021 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
研究论文 本文研究了在单细胞测序数据中,通过分层测试准确识别在批次效应下的差异表达基因 使用Van Elteren测试,一种分层的Wilcoxon秩和测试版本,有效缓解了批次效应问题,并改进了常见语言效应大小以补充该测试,进一步提高了其效用 NA 旨在解决单细胞测序数据分析中由于批次效应导致的差异表达基因识别问题 单细胞测序数据中的差异表达基因 生物信息学 NA 单细胞测序 Van Elteren测试 测序数据 涉及模拟数据和真实患者数据
23247 2024-08-08
T cells and monocyte-derived myeloid cells mediate immunotherapy-related hepatitis in a mouse model
2021-11, Journal of hepatology IF:26.8Q1
研究论文 本文通过小鼠模型研究了免疫检查点抑制剂(ICIs)相关肝炎的分子机制,特别是T细胞和单核细胞衍生的髓样细胞在其中的作用。 开发了一种新型小鼠模型,有助于深入了解与多种免疫疗法相关的免疫介导的肝毒性机制。 NA 阐明免疫检查点抑制剂(ICIs)相关肝炎的分子机制。 T细胞和单核细胞衍生的髓样细胞在ICIs相关肝炎中的作用。 NA 免疫相关肝炎 免疫表型分析和分子谱分析 小鼠模型 单细胞转录组数据 Pdcd1-/-小鼠
23248 2024-08-08
Single-cell nucleic acid profiling in droplets (SNAPD) enables high-throughput analysis of heterogeneous cell populations
2021-10-11, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为单细胞液滴核酸分析(SNAPD)的高通量技术,用于分析大量单个哺乳动物细胞中的转录标志物 SNAPD技术能够每小时分析超过100,000个细胞,可用于量化异质群体中的不同细胞类型,检测低至0.1%频率的稀有细胞,并通过微流控排序富集特定细胞类型 NA 开发一种快速、简单、高通量的方法来基于RNA标志物对细胞样本进行计数 单个哺乳动物细胞中的转录标志物 生物学 NA 单细胞液滴核酸分析(SNAPD) NA RNA 数万个单个哺乳动物细胞
23249 2024-08-08
Generating and Using Transcriptomically Based Retinal Cell Atlases
2021-09-15, Annual review of vision science IF:5.0Q1
research paper 本文介绍了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术生成和使用基于转录组学的视网膜细胞图谱的实验和计算方法 利用scRNA-seq技术生成跨多个脊椎动物物种的视网膜细胞图谱,扩展到整个眼睛和大脑视觉中心的研究 NA 探讨视网膜发育、细胞对损伤的反应、与视网膜疾病相关的基因表达模式以及细胞类型的进化 视网膜细胞及其在多个脊椎动物物种中的多样性 digital pathology NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 转录组数据 多个脊椎动物物种的视网膜细胞
23250 2024-08-08
Retinal organoids on-a-chip: a micro-millifluidic bioreactor for long-term organoid maintenance
2021-09-07, Lab on a chip IF:6.1Q2
研究论文 本研究设计了一种无剪切应力的微型微流控生物反应器,用于近乎无需人工的视网膜类器官维护 开发了一种自动化微型微流控设备,显著减少了剪切应力,用于生产与传统静态培养质量相当的视网膜类器官 NA 标准化视网膜类器官的生产和维护 视网膜类器官 生物工程 视网膜退化 立体光刻(SLA)3D打印 NA 细胞 在三个不同分化阶段(第41天、88天和128天)成功培养视网膜类器官超过一个月
23251 2024-08-08
LDHA is enriched in human islet alpha cells and upregulated in type 2 diabetes
2021-09-03, Biochemical and biophysical research communications IF:2.5Q3
研究论文 本文研究了乳酸脱氢酶A型(LDHA)在人胰岛α细胞中的表达及其在2型糖尿病中的上调情况 首次揭示了LDHA在人胰岛α细胞中的主要定位及其在2型糖尿病中的上调现象 药物抑制LDHA在分离的人胰岛中增强了胰岛素分泌,但在糖尿病条件下未能显著纠正胰岛素或胰高血糖素的分泌失调 探讨LDHA在人胰岛细胞中的表达及其在糖尿病条件下的变化 人胰岛α细胞和β细胞中的LDHA表达 NA 2型糖尿病 单细胞RNA测序(sc-RNA seq) NA RNA 涉及慢性高血糖处理的人胰腺胰岛和来自2型糖尿病患者的尸检胰腺样本
23252 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Stage Transition under Temperature Stress in Synchronized Plasmodium falciparum Cells
2021-09-03, Microbiology spectrum IF:3.7Q2
research paper 本研究通过单细胞RNA测序技术,探讨了在温度胁迫下同步化的恶性疟原虫细胞的细胞异质性和阶段转变 研究发现了在温度处理下,恶性疟原虫中一小部分群体的性发育主调控基因上调,并识别出在正常生长条件下上调应激反应途径的异质性应激响应子群 NA 探究恶性疟原虫在人体宿主内的细胞异质性 恶性疟原虫细胞 digital pathology NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 约12,000个同步化的细胞
23253 2024-08-08
Time-Series Single-Cell Sequencing Reveals Tumor Clonal Dynamics
2021-09, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文通过时间序列单细胞测序揭示肿瘤克隆动态 NA NA 研究肿瘤克隆的适应性景观及其在突变和治疗影响下的变化 肿瘤克隆 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 时间序列数据 NA
23254 2024-08-08
Identification of a special cell type as a determinant of the kidney tropism of SARS-CoV-2
2021-09, The FEBS journal
研究论文 本文通过单细胞RNA测序和尿液蛋白质组学分析,识别出一种名为PT-3的特殊细胞类型,该细胞类型在肾脏中对SARS-CoV-2感染具有易感性 首次识别出PT-3细胞作为SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型,并发现其在不同肾脏疾病中的分布差异 NA 探究SARS-CoV-2在肾脏中的易感细胞类型及其机制 PT-3细胞及其在SARS-CoV-2感染中的作用 数字病理学 COVID-19 单细胞RNA测序(scRNA-seq),尿液蛋白质组学 NA 单细胞RNA测序数据,尿液蛋白质组数据 正常人肾脏和已有疾病肾脏的单细胞RNA测序数据,COVID-19患者和健康个体的尿液样本
23255 2024-08-08
Multiplexing Methods for Simultaneous Large-Scale Transcriptomic Profiling of Samples at Single-Cell Resolution
2021-09, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
综述 本文综述了基于DNA的样本多重标记方法在单细胞RNA测序(scRNA-seq)中的应用 详细比较了四种主要条码策略,并提供了根据个性化需求选择最合适条码技术的指南 NA 探讨样本多重标记技术在scRNA-seq中的应用及未来发展 单细胞RNA测序中的样本多重标记方法 测序技术 NA scRNA-seq NA 转录组数据 NA
23256 2024-08-08
Single-cell RNA-seq analysis identifies unique chondrocyte subsets and reveals involvement of ferroptosis in human intervertebral disc degeneration
2021-09, Osteoarthritis and cartilage IF:7.2Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人类椎间盘退变中的软骨细胞亚群,并揭示了铁死亡在椎间盘退变中的作用 首次报道了椎间盘髓核中的七个软骨细胞亚群,其中四个亚群(C1-C4)为新发现的亚群,并发现铁死亡途径在椎间盘退变中的富集 NA 探索椎间盘退变过程中髓核中细胞亚群及其生物学过程 人类椎间盘退变中的髓核组织 数字病理学 脊柱疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) Seurat包 基因表达数据 正常对照组和椎间盘退变模型组的髓核组织各6个样本
23257 2024-08-08
SARS-CoV-2 infection of the pancreas promotes thrombofibrosis and is associated with new-onset diabetes
2021-08-23, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 研究探讨了SARS-CoV-2感染胰腺后促进血栓纤维化并与新发糖尿病相关的情况 首次报道了SARS-CoV-2在胰腺中的感染情况,并观察到胰腺纤维化和血栓形成的现象 样本量较小,需要进一步的大规模研究验证 探究SARS-CoV-2感染胰腺与新发糖尿病之间的关系 胰腺中的ACE2和TMPRSS2表达,以及SARS-CoV-2在胰腺细胞中的免疫定位 数字病理学 糖尿病 单细胞RNA测序 NA 组织样本 8只非人类灵长类动物和5名COVID-19患者
23258 2024-08-08
Inferring single cell expression profiles from overlapped pooling sequencing data with compressed sensing strategy
2021-08-20, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文提出了一种利用重叠池化和压缩感知策略从重叠池化测序数据中推断单细胞表达谱的方法 通过重叠池化和压缩感知策略,能够在保持基因检测灵敏度和个体特异性的同时,节省约一半的文库成本 NA 开发一种降低大规模单细胞表达数据获取成本的方法 单细胞表达谱 生物信息学 NA scRNA-seq 压缩感知 测序数据 54个单细胞
23259 2024-08-08
Single-cell RNA-seq revealed diverse cell types in the mouse placenta at mid-gestation
2021-08-15, Experimental cell research IF:3.3Q2
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术(scRNA-seq)揭示了E10.5小鼠胎盘中多样化的细胞类型及其在细胞组成和通讯上的差异 本研究首次通过scRNA-seq技术详细分析了小鼠胎盘中的细胞异质性,并追踪了滋养层细胞和Hofbauer样细胞的发育轨迹 NA 研究旨在深入了解正常胎盘的细胞组成和通讯机制 小鼠胎盘中的细胞类型及其相互作用 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因表达数据 E10.5小鼠胎盘样本
23260 2024-08-08
Key molecular alterations in endothelial cells in human glioblastoma uncovered through single-cell RNA sequencing
2021-08-09, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 通过单细胞RNA测序技术研究人胶质母细胞瘤中内皮细胞的关键分子改变 构建了人脑内皮细胞的分子图谱,提供了对人类血脑屏障异质性及其在胶质母细胞瘤中分子改变的前所未有的分子洞察 NA 揭示人胶质母细胞瘤中内皮细胞的分子异质性及其在肿瘤中的改变 人胶质母细胞瘤中的内皮细胞及其配对的肿瘤周围组织 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 新鲜分离的人胶质母细胞瘤内皮细胞及配对的肿瘤周围组织
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