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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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23201 | 2024-08-08 |
A Comprehensive Characterization of Monoallelic Expression During Hematopoiesis and Leukemogenesis via Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702897
PMID:34722498
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,系统地研究了骨髓单个核细胞中的单等位基因表达(MAE),构建了MAE图谱,并探讨了其在造血和白血病发生中的作用 | 首次系统地研究了造血和白血病发生过程中的常染色体MAE、细胞类型特异性MAE和随机MAE,增加了对MAE特征和功能的认识 | NA | 探讨单等位基因表达在造血和白血病发生中的作用和机制 | 骨髓单个核细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1,020个常染色体MAE,74个细胞类型特异性MAE,114个随机MAE |
23202 | 2024-08-08 |
Classical Dichotomy of Macrophages and Alternative Activation Models Proposed with Technological Progress
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9910596
PMID:34722776
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在种植牙科中的炎症调节作用及其激活/极化状态的基础,并提出了基于先进技术的替代激活模型。 | 通过应用CyTOF、scRNA-seq和HSI等先进技术,提出了替代激活模型,有助于巨噬细胞的分型和功能基因的划分。 | NA | 探索巨噬细胞的激活模型及其在种植牙科中的应用。 | 巨噬细胞及其在种植牙科中的作用。 | 数字病理学 | NA | CyTOF, scRNA-seq, HSI | NA | 图像, 基因序列 | NA |
23203 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing unveils distinct immune microenvironments with CCR6-CCL20 crosstalk in human chronic pancreatitis
2022-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324546
PMID:34702715
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术,分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的免疫微环境,特别是CCR6-CCL20信号通路的作用 | 首次揭示了慢性胰腺炎中不同病因患者胰腺免疫细胞的独特特征和CCR6-CCL20轴的免疫对话 | 研究样本仅限于接受胰腺切除术的患者,可能无法完全代表所有慢性胰腺炎患者的情况 | 旨在通过单细胞测序技术揭示慢性胰腺炎中胰腺免疫反应的关键信号分子 | 慢性胰腺炎患者的胰腺免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 包括不同病因的慢性胰腺炎患者和非慢性胰腺炎器官捐赠者的胰腺组织 |
23204 | 2024-08-08 |
Profiling of lung SARS-CoV-2 and influenza virus infection dissects virus-specific host responses and gene signatures
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01881-2021
PMID:34675048
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研究论文 | 本文利用NanoString GeoMX平台对固定石蜡包埋组织进行靶向转录组学分析,深入研究了COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部转录组图谱 | 本文展示了空间转录组学在识别组织内新基因特征方面的强大能力,为SARS-CoV-2的发病机制提供了新的见解 | NA | 更好地定义肺部对SARS-CoV-2感染的宿主反应,理解病毒发病机制,并验证临床研究中提出的潜在COVID-19生物标志物 | COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | NanoString GeoMX平台 | NA | 转录组数据 | COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部组织样本 |
23205 | 2024-08-08 |
Cell-Type-Specific Impact of Glucocorticoid Receptor Activation on the Developing Brain: A Cerebral Organoid Study
2022-05, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.2021.21010095
PMID:34698522
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研究论文 | 本研究使用诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的脑类器官模型,探讨了糖皮质激素受体(GR)激活对发育中大脑的细胞类型特异性影响。 | 首次在脑类器官模型中详细研究了GR激活对不同细胞类型的影响,并验证了其在人类神经元中的响应特征。 | 研究主要集中在体外模型,未来需要进一步的体内研究以验证这些发现。 | 探讨产前糖皮质激素暴露对发育中大脑的影响及其细胞类型特异性机制。 | 糖皮质激素受体(GR)激活对脑类器官中不同细胞类型的影响。 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞转录组学 | 脑类器官 | 转录组数据 | 使用了来自不同来源组织和性别的三个独立hiPSC系的脑类器官 |
23206 | 2024-08-08 |
Co-varying neighborhood analysis identifies cell populations associated with phenotypes of interest from single-cell transcriptomics
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01066-4
PMID:34675423
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研究论文 | 本文介绍了一种名为共变邻域分析(CNA)的无偏方法,用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | CNA方法比基于聚类的方法更灵活,能够更敏感和准确地识别与疾病相关的细胞状态 | NA | 开发一种新的统计方法,用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | 单细胞转录组数据中的细胞群体及其与样本属性的关联 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
23207 | 2024-08-08 |
Multiplexed droplet single-cell sequencing (Mux-Seq) of normal and transplant kidney
2022-03, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1111/ajt.16871
PMID:34687145
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研究论文 | 本文介绍了多重液滴单细胞测序(Mux-Seq)在正常和移植肾脏组织中的应用 | Mux-Seq方法能够减少实验批次偏差和变异,即使在样本输入非常小的情况下 | NA | 研究移植排斥反应中免疫和实质细胞的特征,以及正常和移植肾脏的组织反应 | 正常和移植肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序(scRNAseq) | NA | RNA | 六个正常肾脏和两个移植肾脏的组织样本 |
23208 | 2024-08-08 |
Pericyte Control of Blood Flow Across Microvascular Zones in the Central Nervous System
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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综述 | 本文综述了大脑微血管区域血流控制的当前知识,涉及命名问题和基于活体光学成像及单细胞转录组学的新进展 | 强调了壁细胞形态、基因表达和收缩动力学的重要区别,这些区别解释了动脉、过渡和毛细血管区域对血管活性介质反应的观察差异 | 仍有许多未解决问题,包括活体内激活不同周细胞类型的血管活性介质、周细胞-内皮细胞通讯在从毛细血管向动脉传递信号中的作用,以及神经系统疾病如何影响这些机制 | 探讨大脑微血管区域血流控制机制 | 大脑血管中的周细胞及其对血流控制的影响 | NA | NA | 活体光学成像、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
23209 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics sheds light on the identity and metabolism of developing leaf cells
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab489
PMID:34687312
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术,分析了在两种不同环境条件下生长的拟南芥幼叶细胞的转录组,揭示了发育中的叶片中不同细胞群的特征和代谢活动 | 本研究首次揭示了拟南芥幼叶中14种细胞群的单细胞转录组图谱,并提出了细胞类型特异性标记 | NA | 探索发育中的叶片中不同细胞群的转录组特征和代谢活动 | 拟南芥幼叶细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,800个高质量叶片细胞 |
23210 | 2024-08-08 |
Specialized Mechanosensory Epithelial Cells in Mouse Gut Intrinsic Tactile Sensitivity
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.026
PMID:34688712
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研究论文 | 本文研究了小鼠肠道中特化的机械感觉上皮细胞,探讨了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用。 | 首次揭示了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用,并展示了其在调节肠道生理功能中的重要性。 | NA | 探究Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用及其对肠道生理功能的调节。 | 小鼠肠道中的特化感觉肠内分泌细胞(EECs)及其表达的Piezo2机械门控离子通道。 | NA | NA | 单细胞RNA测序、光遗传学、光-电生理学、器官浴槽和体内研究。 | NA | 单细胞RNA测序数据、光遗传学激活数据、电生理数据。 | 使用了转基因小鼠模型,具体样本数量未详细说明。 |
23211 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and bioinformatics as tools to decipher cancer heterogenicity and mechanisms of drug resistance
2022-01, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2021.114811
PMID:34673017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术和生物信息学分析在解析癌症异质性和药物抗性机制中的作用 | 单细胞RNA测序技术和相关的生物信息学聚类及差异表达分析为癌症研究提供了新的工具,能够在单细胞分辨率下剖析肿瘤 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在解析癌症异质性和细胞系依赖性药物抗性中的作用 | 癌症异质性和药物抗性机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
23212 | 2024-08-08 |
HSP90-Specific nIR Probe Identifies Aggressive Prostate Cancers: Translation from Preclinical Models to a Human Phase I Study
2022-01, Molecular cancer therapeutics
IF:5.3Q1
DOI:10.1158/1535-7163.MCT-21-0334
PMID:34675120
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研究论文 | 本文开发了一种针对HSP90的近红外荧光探针HS196,用于区分非侵袭性和侵袭性前列腺癌,并在人体I期研究中验证了其有效性 | 首次将HSP90特异性近红外探针应用于临床,用于检测侵袭性前列腺癌 | NA | 开发一种非侵入性测试方法,以区分非侵袭性和侵袭性前列腺癌 | 前列腺癌的侵袭性检测 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 近红外荧光成像 | NA | 图像 | 涉及前列腺切除标本中的恶性结节 |
23213 | 2024-08-08 |
TNFα Induces LGR5+ Stem Cell Dysfunction In Patients With Crohn's Disease
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.10.010
PMID:34700029
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研究论文 | 本研究评估了肿瘤坏死因子α(TNFα)在健康对照和克罗恩病(CD)患者来源的肠类器官中的肠上皮反应 | 发现TNFα在CD患者来源的肠类器官中引起LGR5+干细胞功能障碍,而外源性PGE2治疗可以恢复这些干细胞的功能 | NA | 研究TNFα在克罗恩病中的作用及其对肠上皮细胞的影响 | 健康对照和克罗恩病患者的肠类器官 | NA | 克罗恩病 | 免疫组织化学、RNA测序、单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 克罗恩病患者和健康对照的肠类器官 |
23214 | 2024-08-08 |
The function of the m6A methyltransferase METTL3 in goat early embryo development under hypoxic and normoxic conditions
2022-Jan-01, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 本研究探讨了m6A甲基转移酶METTL3在山羊早期胚胎发育中,特别是在低氧和常氧条件下的作用 | 首次揭示了METTL3在氧化应激条件下对山羊早期胚胎发育的关键作用 | 研究仅限于体外实验,未涉及体内环境的影响 | 探讨METTL3在山羊早期胚胎发育中的作用及其在氧化应激条件下的影响 | 山羊早期胚胎,特别是8细胞阶段和囊胚阶段的发育 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 山羊胚胎的8细胞阶段和囊胚阶段的样本 |
23215 | 2024-08-08 |
Expression of chimeric antigen receptor therapy targets detected by single-cell sequencing of normal cells may contribute to off-tumor toxicity
2021-12-13, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2021.09.016
PMID:34678153
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
23216 | 2024-08-08 |
Diversity and convergence within peripheral glia development
2021-12, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2021.10.004
PMID:34689995
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞在发育过程中的多样性变化,并识别了成熟神经胶质细胞间的统一遗传特征 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了外周神经胶质细胞发育过程中的多样性和统一遗传特征 | NA | 探究外周神经胶质细胞的发育过程及其功能 | 外周神经胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
23217 | 2024-08-08 |
Untimely TGFβ responses in COVID-19 limit antiviral functions of NK cells
2021-12, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04142-6
PMID:34695836
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研究论文 | 研究探讨了COVID-19中NK细胞功能受TGFβ反应影响的机制 | 揭示了TGFβ在严重COVID-19中异常产生,抑制NK细胞功能的现象 | NA | 探究COVID-19中NK细胞功能受限的原因 | COVID-19患者的NK细胞及TGFβ反应 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19患者的血清样本 |
23218 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of the In Vivo Dynamics of Host Circulating Immune Cells Highlights the Importance of Myeloid Cells in Avian Flaviviral Infection
2021-12-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100116
PMID:34697228
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研究论文 | 本研究利用高通量单细胞转录组测序技术,构建了鸭循环免疫细胞的转录组图谱,并分析了鸭外周血白细胞(PBLks)在禽类登革病毒(TMUV)感染下的性别差异动态变化 | 首次揭示了鸭循环免疫细胞在TMUV感染下的性别差异反应,并发现了TMUV感染对鸭PBLks的性别特异性重编程 | NA | 研究鸭免疫系统与病毒的相互作用,特别是循环免疫细胞在病毒感染中的动态变化 | 鸭的循环免疫细胞及其在TMUV感染下的反应 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 14种外周血白细胞(PBLks)群体 |
23219 | 2024-08-08 |
Regulation of intestinal immunity and tissue repair by enteric glia
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04006-z
PMID:34671159
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研究论文 | 本文揭示了肠神经胶质细胞(EGCs)在肠道稳态、免疫和组织修复中的重要作用 | 首次阐明了IFNγ信号在肠神经胶质细胞中的中心作用,并揭示了IFNγ-EGC-CXCL10轴在免疫反应和组织修复中的关键角色 | NA | 研究肠神经胶质细胞在肠道稳态、免疫和组织修复中的作用 | 肠神经胶质细胞(EGCs)及其在肠道中的功能 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞转录组学分析 | NA | 转录组数据 | 小鼠和炎症性肠病患者 |
23220 | 2024-08-08 |
Dynamic transcriptional reprogramming leads to immunotherapeutic vulnerabilities in myeloma
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00766-y
PMID:34675390
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研究论文 | 本研究探讨了多发性骨髓瘤细胞如何通过动态转录重编程来适应治疗并逃避免疫疗法,揭示了治疗过程中产生的可利用的免疫治疗靶点。 | 本研究首次展示了多发性骨髓瘤细胞在治疗压力下如何通过转录重编程和增强子重连来适应并逃避免疫治疗,同时揭示了新的免疫治疗靶点CXCR4。 | NA | 揭示多发性骨髓瘤细胞如何通过转录重编程适应治疗并逃避免疫疗法,探索新的治疗策略。 | 多发性骨髓瘤细胞的转录重编程和增强子使用。 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组和染色质可及性分析 | NA | 转录组数据 | NA |