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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2026-02-20 |
A pathomics-based pyroptosis signature predicts survival in clear cell renal cell carcinoma
2026-Feb-18, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04685-y
PMID:41706247
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研究论文 | 本研究开发了一种基于病理组学特征和细胞焦亡信号的新型预后模型,用于预测透明细胞肾细胞癌患者的生存情况 | 首次在ccRCC中整合病理组学特征与细胞焦亡相关信号构建预后模型,并揭示了关键基因在肿瘤微环境中的表达模式 | 模型主要基于TCGA数据库的回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证其临床应用价值 | 开发更准确的预后工具以改善透明细胞肾细胞癌的临床管理 | 透明细胞肾细胞癌患者 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 病理组学分析、单细胞测序 | StepCox[forward]+Lasso算法 | 全切片数字病理图像、基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2302 | 2026-02-20 |
A hybrid neighborhood enhanced contrastive learning and self-knowledge distillation method for scRNA-seq data clustering analysis
2026-Feb-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btag084
PMID:41706646
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研究论文 | 本文提出了一种名为scKD的新方法,结合混合邻域增强对比学习和自知识蒸馏策略,用于提升单细胞RNA测序数据的聚类分析性能 | 整合了混合邻域增强对比学习模型与自知识蒸馏策略,以提高聚类准确性并准确识别主要细胞类型和罕见细胞亚型 | 未在摘要中明确提及 | 解决单细胞RNA测序数据高维度、复杂性和噪声带来的挑战,实现精确的细胞类型分类 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习, 知识蒸馏 | 基因表达数据 | 多个真实世界数据集(具体数量未在摘要中提供) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2303 | 2026-02-20 |
Spatiotemporal Role of GLI2 in Driving SHH-Medulloblastoma Tumorigenesis
2026-Feb-18, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag033
PMID:41706711
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研究论文 | 本研究通过构建GLI2扩增的小鼠模型,揭示了GLI2在驱动SHH型髓母细胞瘤发生中的时空作用及MAPK通路的关键角色 | 首次构建了GLI2扩增的髓母细胞瘤小鼠模型,明确了GLI2作为SHH-MB主要致癌驱动因子的作用,并发现胚胎期Math1+祖细胞对GLI2诱导的肿瘤发生具有特异性易感性 | 研究主要基于小鼠模型,虽然与人类肿瘤相似,但可能存在物种差异;未涉及临床治疗干预的验证 | 探究GLI2在SHH型髓母细胞瘤发生发展中的驱动机制及发育起源 | GLI2扩增的SHH型髓母细胞瘤小鼠模型及人类肿瘤样本 | 数字病理学 | 髓母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学分析 | 小鼠遗传模型 | 单细胞转录组数据, 组织图像数据 | 未明确样本数量,但涉及多个发育时间点(E13.5-E15.5胚胎期及出生后)的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2304 | 2026-02-20 |
TWIST1 drives endothelial-to-mesenchymal-transition to stabilize atherosclerotic plaques
2026-Feb-18, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-69808-z
PMID:41708636
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研究论文 | 本研究探讨了转录因子TWIST1在动脉粥样硬化斑块中通过驱动内皮-间质转化来促进斑块稳定的作用 | 挑战了传统观点,即内皮-间质转化仅导致斑块不稳定,提出TWIST1驱动的内皮-间质转化可促进斑块稳定性 | 研究主要基于小鼠模型和体外细胞培养,人类体内验证有限 | 探究TWIST1在动脉粥样硬化斑块进展中的作用及其机制 | 高胆固醇血症小鼠的内皮细胞和人类主动脉内皮细胞 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,组织学分析,细胞培养 | NA | RNA测序数据,组织图像,细胞实验数据 | 高胆固醇血症小鼠模型和人类主动脉内皮细胞培养 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2305 | 2026-02-20 |
Immune regulation and cellular crosstalk drive non-fibrotic lung remodeling in pre-metamorphic frogs exposed to paraquat
2026-Feb-18, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-026-02546-2
PMID:41709280
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研究论文 | 本研究通过组织学分析、行为学实验和单细胞RNA测序,探讨了Microhyla fissipes蝌蚪在环境相关浓度百草枯暴露下的急性肺反应,揭示了非纤维化肺重塑机制 | 首次在蝌蚪模型中揭示百草枯诱导的非纤维化肺重塑,涉及免疫调节和细胞互作,并发现发育信号通路如Wnt/β-catenin的重新激活 | 结论仅适用于蝌蚪阶段和短期暴露,需要进一步研究评估长期或变态后结果 | 研究环境化学应激下脊椎动物肺的急性损伤反应、恢复力和发育可塑性 | Microhyla fissipes蝌蚪的肺组织 | 单细胞组学 | 肺损伤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,涉及Microhyla fissipes蝌蚪 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2306 | 2026-02-20 |
A comprehensive evaluation of long-read de novo transcriptome assembly
2026-Feb-18, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04001-5
PMID:41709347
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研究论文 | 本文对长读长从头转录组组装工具进行了全面评估,并比较了其与短读长组装工具的性能 | 首次系统性地评估了RATTLE、RNA-Bloom2和isONform等长读长从头转录组组装工具,并分析了组装选择对差异表达检测的下游影响 | 与参考基因组引导的方法相比,长读长从头组装在准确性和冗余度方面仍存在局限性 | 评估和比较长读长从头转录组组装工具的性能,为无高质量参考基因组时的差异表达分析提供策略指导 | 长读长从头转录组组装工具(RATTLE、RNA-Bloom2、isONform)和短读长组装工具(Trinity) | 生物信息学 | NA | 长读长测序、短读长测序、转录组组装、差异表达分析 | NA | 测序数据(模拟数据、spike-in sequin转录本、真实样本数据) | 人类和豌豆(Pisum sativum)样本,测序深度覆盖600万至6000万读长 | Oxford Nanopore Technologies, Pacific Biosciences | 长读长测序、单细胞测序 | Oxford Nanopore Technologies, PacBio | ONT cDNA测序、ONT直接RNA测序、PacBio 10×单细胞测序 |
| 2307 | 2026-02-20 |
Deciphering immune features and cellular heterogeneity in PRRSV infection via single-cell RNA sequencing
2026-Feb-17, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01828-25
PMID:41467841
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了PRRSV感染期间肺部免疫特征和细胞异质性 | 首次在单细胞水平上全面描绘了PRRSV感染下肺部免疫细胞的转录组图谱,并识别出SPP1巨噬细胞亚群作为病毒主要靶细胞 | 研究仅基于转录组数据,未结合蛋白质组或功能验证实验 | 阐明PRRSV感染如何扰乱肺部免疫细胞群体及诱导免疫功能障碍的机制 | PRRSV感染仔猪的肺部细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 46,922个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2308 | 2026-02-20 |
Elucidation of population-based bacterial adaptation to antimicrobial treatment by single-cell sequencing analysis of the gut microbiome of a hospital patient
2026-Feb-17, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.01631-24
PMID:41468549
|
研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术,分析了一名接受抗生素治疗的急性脑出血患者的肠道微生物组,揭示了抗生素耐药基因的广泛存在、进化路径及水平基因转移事件 | 首次在患者个体层面,通过单细胞测序技术系统性地描绘了抗生素治疗期间肠道微生物组中抗生素耐药基因的多样性、进化动态及跨物种水平基因转移网络,并发现了具有不同耐药基因进化模式的肺炎克雷伯菌菌株 | 研究仅基于单一样本(一名患者),样本量小,限制了结果的普适性;研究为观察性分析,未能建立因果关系 | 阐明在抗生素治疗压力下,基于人群的细菌适应性进化机制,特别是抗生素耐药基因的获得与传播 | 一名患有急性脑出血并接受抗生素治疗的成年男性患者的肠道微生物组 | 微生物组学 | 脑出血 | 单细胞测序 | NA | 单细胞基因组数据 | 1名患者的肠道微生物组样本 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2309 | 2026-02-20 |
A single-cell transcriptional reference for the functional and developmental diversity of neonatal innate lymphoid cells
2026-Feb-17, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117000
PMID:41706587
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序结合发育与功能分析,深入解析了脐带血中循环固有淋巴样细胞的复杂亚群多样性 | 首次在免疫学幼稚的脐带血中系统描绘了cILC的详细转录图谱,识别了多个新亚群,包括cILC1的六个子集和cILC2的四个主要亚型,并揭示了cILC3的替代激活途径 | 研究主要基于脐带血样本,可能无法完全反映成人或病理状态下的cILC多样性;人工胸腺器官模型的应用可能限制了发育潜能的全面评估 | 旨在建立新生儿固有淋巴样细胞的单细胞转录参考图谱,解析其功能与发育多样性 | 脐带血中的循环固有淋巴样细胞(cILCs) | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量,但基于脐带血来源的cILCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2310 | 2026-02-20 |
Single-cell atlas of hepatic cellular plasticity and immune niche reprogramming in liver cirrhosis
2026-Feb-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-07858-z
PMID:41709311
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研究论文 | 本研究利用公开单细胞测序数据集,解析肝硬化中免疫细胞亚型、基因表达谱及转录因子活性变化,以揭示其在疾病发生发展中的作用 | 整合多种生物信息学工具(如Seurat、Monocle、CellChat)系统分析肝硬化单细胞图谱,首次揭示TNF-α/ETS2驱动的巨噬细胞极化、IL-1α/β/THRA相关的CD4+ T细胞极化及成纤维细胞-B细胞MIF信号轴增强三大调控轴 | 基于公开数据集进行二次分析,缺乏实验验证;样本来源及临床信息可能受限;未涉及空间转录组学或多组学整合分析 | 解析肝硬化中免疫微环境的重编程机制及细胞可塑性变化 | 肝硬化患者的肝组织单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | 肝硬化 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 35,017个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2311 | 2026-02-20 |
B-cell subsets have different capacities for phagocytosis and subsequent presentation of antigen to cognate T cells
2026-Feb-09, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkaf282
PMID:41082629
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研究论文 | 本研究探讨了不同B细胞亚群的吞噬能力及其与抗原呈递功能的关系 | 开发了2微米吞噬性抗原偶联珠靶标,首次系统比较了B细胞亚群通过BCR、清道夫、Fc和补体受体途径吞噬同源和非同源抗原的能力,并发现仅腹膜腔B1细胞能吞噬非同源抗原 | 吞噬能力差异无法完全用吞噬受体差异表达解释,暗示存在未知调控机制,具体分子机制尚未阐明 | 阐明不同B细胞亚群的吞噬功能差异及其对抗原呈递的影响 | 滤泡B2细胞、边缘区B细胞和B1细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2312 | 2026-02-20 |
The glia-immune network: Astrocytes and oligodendrocytes as microglial co-ordinators in health and disease
2026-Feb, The Journal of physiology
DOI:10.1113/JP287015
PMID:40492604
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞和少突胶质细胞作为小胶质细胞的协调者,在中枢神经系统免疫网络中的作用及其在健康和疾病中的相关性 | 强调了单细胞转录组学技术揭示的巨胶质细胞在免疫信号通路中的参与,挑战了传统上认为免疫功能仅限于免疫细胞的观念 | NA | 探讨巨胶质细胞来源的免疫信号及其在健康和疾病中的意义 | 星形胶质细胞、少突胶质细胞和小胶质细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2313 | 2026-02-20 |
Single-cell RNA sequencing reveals the protective role of renal Cx3cr1+ macrophages in cisplatin-induced acute kidney injury
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70302
PMID:41147753
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肾巨噬细胞亚群在顺铂诱导的急性肾损伤中的异质性,并发现Cx3cr1+巨噬细胞亚群通过AXL-GAS6信号轴促进凋亡细胞清除,从而发挥肾脏保护作用 | 首次在顺铂诱导的急性肾损伤模型中系统解析肾巨噬细胞的单细胞转录组异质性,并鉴定出具有保护功能的Cx3cr1+巨噬细胞亚群及其作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,人体中的验证尚不充分;单细胞测序样本量有限,可能未覆盖所有巨噬细胞亚群 | 探究急性肾损伤过程中肾巨噬细胞亚群的分类、功能及其在肾脏修复中的作用机制 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠模型中的肾脏组织及巨噬细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,细胞耗竭实验,过继转移实验,细胞共培养实验 | NA | 单细胞转录组数据,bulk转录组数据 | 顺铂诱导的急性肾损伤小鼠肾脏组织(未明确具体样本数) | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2314 | 2026-02-20 |
Construction of the cancer cell continuum reveals hybrid EMT state driving lung adenocarcinoma aggression
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00991-9
PMID:41290994
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和细胞轨迹推断技术,重构了肺腺癌中的上皮-间质转化(EMT)连续谱,识别了五种EMT状态,并揭示了混合E/M状态与高转移潜力和不良预后的关联 | 首次在肺腺癌中系统性地重建了EMT连续谱,识别了关键的混合E/M状态及其调控网络,并开发了基于EMT连续谱特征的风险分层模型 | 研究样本量较小(仅10名患者),且未在独立队列中进行广泛验证,可能限制了结果的普适性 | 旨在阐明肺腺癌中EMT连续谱的调控机制及其与肿瘤侵袭和预后的关系 | 肺腺癌患者的恶性上皮细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 细胞轨迹推断技术 | 单细胞RNA测序数据 | 来自10名肺腺癌患者的16,310个恶性上皮细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2315 | 2026-02-20 |
New insights into macrophage heterogeneity in renal injury and repair
2026-Feb, The FEBS journal
DOI:10.1111/febs.70369
PMID:41396841
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术,揭示了巨噬细胞在顺铂诱导的急性肾损伤不同阶段的异质性及其在肾脏损伤与修复中的关键作用 | 利用单细胞RNA测序技术首次系统解析了急性肾损伤中巨噬细胞的动态变化,并识别出四个不同的肾脏巨噬细胞亚群,明确了单核来源巨噬细胞在损伤进展中的促炎作用和肾脏驻留Cx3cr1巨噬细胞通过AXL-GAS6信号介导的胞葬作用促进修复的机制 | 研究主要基于顺铂诱导的急性肾损伤模型,可能无法完全代表其他类型肾损伤的巨噬细胞异质性,且未深入探讨巨噬细胞亚群间的相互作用或长期影响 | 探究巨噬细胞在急性肾损伤中的异质性及其在肾脏损伤与修复过程中的具体功能 | 顺铂诱导的急性肾损伤模型中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2316 | 2026-02-20 |
A fibroblast-like endothelial cell state promotes atherosclerosis via C/EBPβ-activated TGF-β signaling
2026-Feb, The EMBO journal
DOI:10.1038/s44318-025-00684-x
PMID:41495247
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了小鼠主动脉在动脉粥样硬化过程中内皮细胞向成纤维细胞样状态转变的分子机制,并识别C/EBPβ作为驱动这一表型转换的关键转录因子 | 首次在动脉粥样硬化血管中识别出一个独特的成纤维细胞样内皮细胞群体,并阐明C/EBPβ通过激活TGF-β信号通路驱动内皮-间质转化的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;单细胞测序技术可能无法完全捕获所有细胞状态动态 | 探究动脉粥样硬化过程中内皮细胞表型可塑性的分子机制 | 小鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2317 | 2026-02-20 |
Deciphering the Heterogeneity of Pulmonary Macrophages in Response to Fine Particles
2026-Feb, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202507293
PMID:41504080
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研究论文 | 本研究通过开发双标记金纳米颗粒模型,结合荧光激活细胞分选和单细胞RNA测序技术,揭示了肺部巨噬细胞亚群对细颗粒物响应的异质性及其功能多样性 | 开发了一种新型双标记金纳米颗粒模型,用于捕获细颗粒物响应性细胞亚群,并结合单细胞RNA测序技术,首次系统性地鉴定了14个具有部分重叠但功能各异的巨噬细胞亚群,特别是突出了AMs_3、AMs_7和recMacs_4亚群在颗粒物响应中的关键作用 | 研究主要基于金纳米颗粒模型,可能无法完全模拟真实环境中细颗粒物的复杂成分和效应;样本来源和规模可能有限,需进一步验证在更广泛人群或疾病模型中的普适性 | 探究肺部细胞对吸入细颗粒物的响应异质性,特别是识别关键的响应性细胞亚群及其功能特征 | 肺部巨噬细胞,包括肺泡巨噬细胞、募集巨噬细胞和间质巨噬细胞 | 单细胞组学 | 肺部疾病 | 荧光激活细胞分选,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2318 | 2026-02-20 |
Exploration of the mechanism of anlotinib in reversing PD-1 immunotherapy resistance: insights from single-cell sequencing
2026-Feb, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-026-01000-3
PMID:41571876
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序探索了安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 首次通过单细胞RNA测序建立并解析了penpulimab耐药模型,揭示了安罗替尼通过重编程肿瘤免疫微环境来逆转耐药的具体细胞与分子靶点 | 研究为临床前模型,尚未在人体临床试验中得到验证 | 探索安罗替尼逆转PD-1免疫疗法耐药性的机制 | 免疫检查点抑制剂耐药的肿瘤模型 | 单细胞测序 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2319 | 2026-02-20 |
Single-cell atlas of the transcriptome and chromatin accessibility in the human retina
2026-Feb, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02454-1
PMID:41578023
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研究论文 | 本研究构建了一个整合双模态的人类视网膜细胞图谱,包含转录组和染色质可及性数据 | 整合了来自125名不同祖先背景捐赠者的约390万个细胞,包括未发表数据,识别了超过130种细胞类型,并分析了跨细胞类型的转录组、染色质和基因调控网络差异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | 单细胞转录组数据, 染色质可及性数据 | 约390万个细胞来自125名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2320 | 2026-02-20 |
Intranasal Human NSC-Derived EVs Therapy Can Restrain Inflammatory Microglial Transcriptome, and NLRP3 and cGAS-STING Signalling, in Aged Hippocampus
2026-Feb, Journal of extracellular vesicles
IF:15.5Q1
DOI:10.1002/jev2.70232
PMID:41656949
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研究论文 | 本研究探讨了通过鼻内给予人诱导多能干细胞来源的神经干细胞外泌体(hiPSC-NSC-EVs)来抑制老年海马体中的炎症小胶质细胞转录组以及NLRP3和cGAS-STING信号通路,从而改善神经炎症老化和认知功能 | 首次在晚期中年小鼠模型中,通过鼻内给予hiPSC-NSC-EVs,系统性地证明了其能抑制海马体的神经炎症老化,并鉴定出外泌体中的特定miRNA(miRNA-30e-3p和miRNA-181a-5p)分别靶向抑制NLRP3炎症小体和STING通路 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中进行验证;长期疗效和安全性有待进一步评估;特定miRNA的作用机制需更深入探究 | 评估hiPSC-NSC-EVs疗法对老年海马体神经炎症老化的抑制作用及其对认知功能的改善效果 | 晚期中年(18个月大)的雄性和雌性C57BL6/J小鼠,以及基因工程RAW细胞 | 神经科学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq),体外细胞实验 | NA | 基因表达数据,蛋白质水平数据 | C57BL6/J小鼠(具体数量未明确),基因工程RAW细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |