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当前共找到 37368 篇文献，本页显示第 2301 - 2320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2301 | 2026-02-14 |
Combined Vibrio and nanoplastics stress promotes nanoplastic accumulation while reducing bacterial lethality in shrimp
2026-Jan-13, NPJ science of food
IF:6.3Q1
DOI:10.1038/s41538-025-00697-0
PMID:41530206
|
研究论文 | 本研究首次揭示了副溶血弧菌能捕获纳米塑料并促进其在凡纳滨对虾体内的转运，同时纳米塑料通过降低病原体毒力影响感染过程 | 首次证明细菌可作为纳米塑料载体影响其生物转运，并发现纳米塑料能通过激活宿主能量代谢和免疫通路增强抗病能力 | 研究仅针对单一虾种和特定病原体，自然环境中的多因素交互作用未充分探讨 | 探究纳米塑料与病原细菌对水生生物的交互影响机制 | 凡纳滨对虾（Litopenaeus vannamei）及其病原体副溶血弧菌（Vibrio parahaemolyticus） | 环境毒理学 | 细菌感染 | 单细胞转录组学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2302 | 2026-02-14 |
Single-cell immune transcriptomics reveals an inflammatory-inhibitory set-point spectrum in autoimmune diabetes
2026-Jan-09, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199050
PMID:41325163
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研究论文 | 本研究通过单细胞免疫转录组学揭示了自身免疫性糖尿病中炎症-抑制设定点的连续谱，并识别了潜在的免疫治疗靶点 | 首次在单细胞水平上比较了LADA和T1D的免疫特征，定义了NF-κB/EGFR-JAK/STAT梯度和HLA-C-KIR轴作为关键调控机制 | 样本量相对有限，且仅基于外周血单核细胞，未直接分析胰腺组织中的免疫细胞 | 探究自身免疫性糖尿病（包括T1D和LADA）中决定不同炎症状态的免疫学机制 | LADA患者、新诊断T1D患者和健康对照者的外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性糖尿病 | 单细胞RNA测序，配对T和B细胞受体分析 | NA | 单细胞转录组数据，V(D)J序列数据 | 超过400,000个PBMCs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2303 | 2026-02-14 |
Chronic macrophage activation derails muscle repair by disrupting mannose-receptor-linked plasticity revealed by endogenous irg1/acod1 tracking
2026-Jan-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68204-3
PMID:41501052
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研究论文 | 本研究利用靶向irg1/acod1的GFP敲入斑马鱼模型，追踪了在急性和慢性炎症条件下巨噬细胞状态在肌肉损伤修复过程中的动态转变，揭示了慢性巨噬细胞活化通过破坏甘露糖受体（mrc1b/cd206）相关的可塑性来损害肌肉修复的机制 | 首次在体内实时追踪了巨噬细胞在急性和慢性炎症下的动态状态转变，发现了混合M1/M2巨噬细胞状态的存在，并阐明了慢性炎症通过MyD88依赖性途径抑制mrc1b表达、限制巨噬细胞异质性从而损害肌肉修复的新机制 | 研究主要基于斑马鱼模型，其在哺乳动物中的普适性有待验证；慢性炎症模型通过基因突变诱导，可能与人类疾病中的慢性炎症状态存在差异 | 探究慢性炎症如何改变巨噬细胞功能并影响肌肉损伤修复过程 | 斑马鱼巨噬细胞在肌肉损伤修复过程中的动态行为与功能 | 发育生物学与免疫学 | 肌肉损伤与慢性炎症 | GFP敲入斑马鱼模型、单细胞转录组测序、基因突变模型 | 斑马鱼遗传模型 | 活体成像数据、单细胞转录组数据、基因表达数据 | 未明确具体样本数量，但涉及野生型、nlrc3l突变型及慢性感染模型等多组斑马鱼 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | NA |
| 2304 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics, spatial profiling and organoid modeling drive transformative advances in chronic liver disease and hepatocellular carcinoma immunomicroenvironment research
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1743439
PMID:41668742
|
综述 | 本文综述了单细胞测序、空间转录组学和类器官模型等前沿技术在慢性肝病及肝细胞癌免疫微环境研究中的突破性应用 | 强调了多组学分析、空间定位和类器官建模的协同整合，推动研究范式从静态细胞描述转向时空机制解码，从群体水平认知转向个体化病理生理和治疗预测 | NA | 系统理解慢性肝病的复杂免疫病理机制，为构建针对肝脏免疫微环境时空调控的精准免疫治疗策略奠定技术基础 | 慢性肝病（CLD）及肝细胞癌（HCC）的免疫微环境 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，空间转录组学，类器官建模，多组学整合 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2305 | 2026-02-14 |
Molecular crosstalk between MASLD and IVDD revealed through integrated biomarker discovery analysis
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1703972
PMID:41668749
|
研究论文 | 本研究通过整合生物信息学分析和实验验证，揭示了代谢功能障碍相关脂肪肝病（MASLD）与椎间盘退变（IVDD）之间潜在的分子串扰 | 首次通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，系统性地研究了MASLD与IVDD之间的共享分子机制，并识别出多个共同的生物标志物和信号通路 | 研究为初步证据，需要更大规模的队列和功能实验来验证所识别的生物标志物和通路的因果作用 | 探究MASLD与IVDD之间的共享致病机制和分子串扰 | MASLD和IVDD患者及对照组的血液样本、公开的转录组数据集 | 生物信息学 | 代谢功能障碍相关脂肪肝病、椎间盘退变 | bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq、加权基因共表达网络分析、LASSO回归、Scissor分析 | LASSO回归、Scissor分析 | 转录组数据、单细胞数据 | 10,388个NAFLD细胞、35,846个IVDD细胞，以及患者和对照的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq、bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2306 | 2026-02-14 |
Single cell atlas of the comorbidity mechanism between chronic obstructive pulmonary disease and lung adenocarcinoma: a study of multi-omics combined analysis
2026, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.20672
PMID:41669548
|
研究论文 | 本研究通过多组学联合分析，揭示了慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌共病机制中的关键基因和通路 | 首次结合孟德尔随机化、多组学分析和单细胞RNA测序，系统性地识别并验证了连接COPD与LUAD的炎症相关关键基因 | 研究主要基于公共数据集和患者血液样本验证，缺乏组织样本的直接验证和功能实验 | 揭示COPD与LUAD之间的共病分子机制，识别潜在的生物标志物和治疗靶点 | 慢性阻塞性肺疾病和肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, qPCR, 全基因组关联研究, 孟德尔随机化 | LASSO回归 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 涉及多个公共数据集（GSE76925, GSE116959, GSE270667, GSE189357）和患者血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2307 | 2026-02-14 |
Tfh2 and a subset of Tfh1 cells associate with antibody-mediated immunity to malaria
2025-Dec-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.196828
PMID:41118256
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和VDJ测序，揭示了人类外周血T滤泡辅助细胞在疟疾感染期间的异质性，并识别出与抗体介导的免疫相关的特定亚群 | 发现pTfh1细胞可进一步分为CCR7+和CCR7-两个亚群，且只有Tfh1-CCR7+和Tfh2细胞与保护性抗体产生正相关，这超越了传统的CXCR3/CCR6分类 | 研究基于受控人类疟疾感染模型，可能无法完全反映自然感染情况；样本量未明确说明，可能影响统计效力 | 探究人类T滤泡辅助细胞在疟疾感染期间的异质性及其与抗体介导免疫的关联 | 健康个体在受控人类疟疾感染前后的外周血T滤泡辅助细胞 | 免疫学 | 疟疾 | 单细胞RNA测序, VDJ测序 | NA | 单细胞转录组数据, VDJ序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2308 | 2026-02-14 |
Kidney diseases and single-cell sequencing research: a bibliometric analysis from 2015 to 2024
2025-Dec, Renal failure
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/0886022X.2025.2521457
PMID:40545992
|
文献计量分析 | 本文对2015年至2024年间使用单细胞RNA测序（scRNA-seq）进行肾脏疾病研究的出版物进行了文献计量分析 | 首次系统性地通过文献计量学方法评估了scRNA-seq在肾脏疾病研究中的应用格局和新兴趋势，识别了主要贡献国家、机构、作者及研究热点 | 分析基于Web of Science Core Collection数据库，可能未涵盖所有相关出版物；且为回顾性分析，无法预测未来具体技术发展 | 评估scRNA-seq技术在肾脏疾病研究领域的应用现状、发展趋势及研究热点 | 2015年至2024年间发表的关于scRNA-seq在肾脏疾病中应用的学术出版物 | 生物信息学与计算生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文献元数据 | 1,210篇出版物 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2309 | 2026-02-14 |
Tumoroid model recreates clinically relevant phenotypes of high grade serous ovarian cancer (HGSC) cells, carcinoma associated fibroblasts, and macrophages
2025-Jun-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6614892/v1
PMID:40585272
|
研究论文 | 本研究开发了一种包含卵巢癌细胞、间充质干细胞和巨噬细胞的异质三组分肿瘤球模型，用于模拟高级别浆液性卵巢癌的临床相关表型 | 首次构建了包含三种关键细胞成分的异质肿瘤球模型，成功重现了HGSC的化疗耐药、癌症干细胞富集、迁移、侵袭和上皮-间质转化等关键表型 | 模型中使用的是细胞系而非原代肿瘤细胞，且仅包含三种细胞类型，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 研究高级别浆液性卵巢癌肿瘤微环境中不同细胞成分的相互作用及其对疾病表型的影响 | 高级别浆液性卵巢癌细胞（OVCAR3、OVCAR4、OVCAR8）、原代间充质干细胞、U937来源的M2样巨噬细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、侵袭实验、迁移实验 | 3D肿瘤球模型 | 基因表达数据、细胞表型数据 | 使用三种卵巢癌细胞系、原代MSCs和U937巨噬细胞构建的肿瘤球模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2310 | 2026-02-14 |
A metabolic-radioimmune signature predicts therapy response and immune reprogramming in non-small cell lung cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1693277
PMID:41306526
|
研究论文 | 本研究系统探讨了非小细胞肺癌（NSCLC）中放疗诱导的肿瘤微环境（TME）代谢重塑，并基于放疗抵抗相关代谢基因（RRMGs）建立了一个预测模型，以优化治疗分层和放疗增敏剂发现 | 首次系统整合了NSCLC肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）的批量转录组数据和肿瘤组织的单细胞RNA-seq数据，利用scFEA算法重建代谢通量图，并识别出7个关键的RRMGs构建预后模型，同时预测并实验验证了新的放疗增敏剂 | 研究主要基于转录组数据，缺乏蛋白质水平或代谢组学的直接验证；模型在独立队列中的验证AUC相对较低（0.618），可能需要更多样本进一步验证；实验验证仅限于细胞水平，缺乏体内模型或临床前研究 | 优化NSCLC的放疗治疗分层，发现新的放疗增敏剂，并理解放疗诱导的代谢重编程如何驱动治疗抵抗 | 非小细胞肺癌（NSCLC）的肿瘤细胞、肿瘤引流淋巴结（TDLNs）和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 批量转录组分析, WGCNA, Cox回归, CIBERSORT, TIDE算法, scFEA算法, qRT-PCR, 蛋白质印迹, 分子对接 | 预后风险模型（基于RRMGs）, 列线图 | 转录组数据, 单细胞RNA-seq数据 | TCGA放疗队列和独立放疗免疫治疗队列的数据，具体样本数未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2311 | 2026-02-14 |
SLC12A7 serves as a prognostic and immunotherapeutic biomarker identified by multi-omics analysis
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1712579
PMID:41668766
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研究论文 | 本研究通过多组学分析发现SLC12A7在多种癌症中上调，与不良预后相关，并可能作为免疫治疗靶点 | 首次对SLC12A7进行泛癌分析，结合单细胞RNA测序数据揭示其在肿瘤微环境中的异质性，并通过体外实验验证其在肝细胞癌中的促癌功能 | 研究主要基于公共数据库的回顾性分析，体外实验仅针对肝细胞癌细胞系，缺乏体内验证和临床样本的直接验证 | 阐明SLC12A7在癌症中的潜在致癌作用，评估其作为预后生物标志物和免疫治疗靶点的价值 | 多种癌症类型，重点关注肝细胞癌（HCC） | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组学分析，单细胞RNA测序，体外功能实验 | NA | 转录组数据，临床数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA、GTEx、cBioPortal、TIMER 2.0和GEO数据库的多个癌症数据集，具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq，bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2312 | 2026-02-14 |
Integrated single-cell and spatial transcriptomics combined with whole-exome sequencing reveal key hub genes and epithelial heterogeneity in bladder cancer
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1748105
PMID:41669266
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组、空间转录组和全外显子组测序数据，揭示了膀胱癌上皮细胞的异质性，并鉴定了与肿瘤突变负荷相关的关键枢纽基因 | 首次整合单细胞RNA-seq、空间转录组和WES数据，结合TMB分析，系统解析膀胱癌上皮细胞亚群，并利用Ro/e算法识别出关键的TMB相关上皮亚群Epi14 | 样本量相对有限（13个单细胞样本，30个WES样本），且为回顾性研究，需要更大规模的前瞻性队列验证 | 阐明膀胱癌上皮细胞的异质性及其在肿瘤发生发展中的作用，并鉴定与肿瘤突变负荷相关的关键基因 | 膀胱癌患者组织样本中的上皮细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA-seq, 全外显子组测序, 空间转录组学, qPCR, Western blot | 随机生存森林, UMAP, Monocle2, CellChat, CytoTRACE, spacexr, PROGENy | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 外显子组测序数据, 批量转录组数据 | 13个单细胞RNA-seq样本, 514个批量转录组样本, 30个WES样本, 共77,263个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, 全外显子组测序 | NA | NA |
| 2313 | 2026-02-14 |
Identifying cell-type-specific spatially variable genes with ctSVG
2024-Dec-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5655066/v1
PMID:39764138
|
研究论文 | 本文提出了一种名为ctSVG的计算方法，专门用于在单细胞分辨率下识别细胞类型特异性空间可变基因 | 开发了ctSVG方法，能够准确分配Visium方块至细胞，并识别出与样本范围SVGs或细胞类型标记基因不重叠的新基因，从而更充分利用空间位置信息 | NA | 旨在解决先前方法在识别空间可变基因时未能充分利用空间位置信息的问题 | Visium HD空间转录组学数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | Visium HD空间转录组学平台 |
| 2314 | 2026-02-14 |
Applications of spatial transcriptomics and artificial intelligence to develop integrated management of pancreatic cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.007
PMID:39271261
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综述 | 本文综述了空间转录组学和人工智能在胰腺癌综合管理中的应用 | 整合空间转录组学和人工智能工具，以更精确地分析肿瘤微环境中的细胞间通讯，并识别新的生物标志物和治疗靶点 | NA | 探索空间转录组学和人工智能在胰腺癌早期诊断和个性化治疗中的应用 | 胰腺癌 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序, seqFISH | NA | 测序数据, 图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2315 | 2026-02-14 |
Crosstalk between tumor and microenvironment: Insights from spatial transcriptomics
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.009
PMID:39271263
|
综述 | 本文综述了肿瘤与微环境之间的相互作用，重点关注空间转录组学技术在解析肿瘤异质性、进化及克隆状态中的应用 | 整合空间转录组学技术视角，系统阐述肿瘤异质性驱动因素及肿瘤-微环境动态互作机制 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献总结 | 探讨肿瘤异质性、进化及克隆状态的驱动因素，并分析肿瘤与微环境的相互作用 | 肿瘤组织及其微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2316 | 2026-02-14 |
Deep learning-based multimodal spatial transcriptomics analysis for cancer
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.08.001
PMID:39271260
|
书本章节 | 本章探讨了深度学习与多模态空间转录组学在癌症研究中的整合应用 | 将深度学习与多模态空间转录组学结合，为癌症诊断和治疗提供全面且可操作的见解，代表了肿瘤学向更精准和个性化方向的范式转变 | NA | 推进癌症诊断、治疗规划和精准医学 | 癌症生物学，包括肿瘤异质性、微环境相互作用和治疗反应 | 机器学习 | 癌症 | 空间转录组学，多模态数据分析 | 卷积神经网络 | 多模态数据（包括基因组、蛋白质组、影像和临床数据） | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2317 | 2026-02-14 |
Current computational methods for spatial transcriptomics in cancer biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.006
PMID:39271268
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综述 | 本文综述了当前在癌症生物学中用于空间转录组学的计算方法 | NA | NA | 回顾和总结空间转录组学在癌症生物学中的计算分析方法 | 空间转录组学数据及其在癌症研究中的应用 | 计算生物学 | 癌症 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2318 | 2026-02-14 |
Data enhancement in the age of spatial biology
2024, Advances in cancer research
DOI:10.1016/bs.acr.2024.06.008
PMID:39271267
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综述 | 本文综述了空间转录组学与其他数据类型（如单细胞转录组学和详细组织染色图像）整合的计算方法，旨在克服当前空间转录组学技术在分辨率或同时分析基因数量方面的限制 | 深入探讨了整合空间转录组学与互补数据源的计算方法，以克服现有技术在分辨率或基因分析数量上的局限，并强调了这些方法在癌症生物学理解中的革命性潜力 | 作为综述文章，未涉及具体实验数据或新算法开发，主要聚焦于现有挑战和解决方案的概述 | 旨在通过整合空间转录组学与其他数据类型，提升对细胞异质性和微环境的理解，特别是在癌症等复杂疾病中 | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、详细组织染色图像 | 空间转录组学 | 癌症 | 空间转录组学、单细胞转录组学、组织染色 | NA | 空间转录组学数据、单细胞转录组学数据、图像数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2319 | 2026-02-14 |
Integrated multi-omics single cell atlas of the human retina
2023-Nov-17, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-3471275/v1
PMID:38014002
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研究论文 | 本文构建了一个综合多模态的人类视网膜细胞图谱，整合了转录组和染色质可及性数据 | 首次整合了大规模多模态单细胞数据，揭示了超过110种细胞类型，并精细映射了GWAS和eQTL变异 | NA | 创建全面的人类视网膜细胞图谱以促进对视网膜功能和病理的理解 | 人类视网膜细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 约240万个细胞，来自55名捐赠者 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2320 | 2026-02-13 |
T cell populations are negatively correlated with natural killer and macrophage cell populations in aspirate samples of peripheral lymphadenopathies
2026-Dec, Virulence
IF:5.5Q1
DOI:10.1080/21505594.2026.2624191
PMID:41606824
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结核病患者肉芽肿淋巴结细针穿刺样本，揭示了细胞组成、感染细胞识别及细胞间通讯网络 | 首次在结核病肉芽肿淋巴结穿刺样本中应用单细胞RNA测序技术，同时检测宿主细胞转录组和结核分枝杆菌RNA，实现感染细胞的单细胞水平识别 | 样本量较小（19例患者），个体间细胞亚群丰度差异较大，穿刺样本可能无法完全代表整个淋巴结的细胞组成 | 解析结核病肉芽肿淋巴结的细胞组成特征和细胞间通讯网络 | 结核病患者的肉芽肿淋巴结细针穿刺样本 | 单细胞组学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 19例结核病患者的淋巴结穿刺样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |