单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28063 篇文献，本页显示第 23161 - 23180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23161 | 2024-08-08 |
Are dropout imputation methods for scRNA-seq effective for scATAC-seq data?
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab442
PMID:34718405
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研究论文 | 本文评估了几种先进的scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中推断缺失峰的有效性 | 首次系统评估了scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中的应用 | 不同方法在不同数据集上的表现差异较大，使用时应谨慎 | 评估scRNA-seq插补方法在scATAC-seq数据中的有效性 | scATAC-seq数据中的缺失峰 | 单细胞测序 | NA | ATAC-seq | NA | scATAC-seq数据 | 未具体说明 |
| 23162 | 2024-08-08 |
PCMDB: a curated and comprehensive resource of plant cell markers
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab949
PMID:34718712
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研究论文 | 本文介绍了一个名为PCMDB的植物细胞标记数据库，该数据库通过手动筛选超过13万篇研究出版物，收集了22种组织中263种细胞类型的81,117个细胞标记基因。 | PCMDB是首个为植物研究社区设计的全面且经过精心策划的细胞标记数据库，支持多种分析工具和可视化方法。 | NA | 开发一个全面的植物细胞标记数据库，以支持细胞类型注释和单细胞研究。 | 植物细胞标记基因和细胞类型。 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 81,117个细胞标记基因，涉及263种细胞类型和22种组织，涵盖6种植物物种。 |
| 23163 | 2024-08-08 |
A Single-Cell RNA-Seq-Based Approach for Genome-Wide Identification of Cell Essential Genes
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1720-5_18
PMID:34709625
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研究论文 | 本文介绍了一种基于单细胞RNA测序的高通量方法，用于鉴定足细胞必需基因 | 该研究利用单细胞RNA测序技术，通过分析所有单个细胞中表达的基因，识别特定细胞类型的必需基因 | 该方法目前仅在鼠足细胞中进行了验证，尚未在其他细胞类型中广泛应用 | 旨在开发一种高效的方法来识别特定细胞类型的必需基因 | 鼠足细胞的必需基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 鼠足细胞的单细胞样本 |
| 23164 | 2024-08-08 |
Astrocyte Reactivity in Alzheimer's Disease: Therapeutic Opportunities to Promote Repair
2022, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
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综述 | 本文综述了星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及其在疾病发展中的潜在治疗机会 | 单细胞转录组学揭示了阿尔茨海默病脑中的星形胶质细胞与正常健康星形胶质细胞的差异，并探讨了针对星形胶质细胞的干预措施在治疗阿尔茨海默病中的潜在价值 | NA | 探讨星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的作用及通过调控星形胶质细胞功能作为未来治疗途径的可能性 | 星形胶质细胞在阿尔茨海默病中的角色及其治疗潜力 | 神经退行性疾病 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 23165 | 2024-08-08 |
Identification of lncRNAs involved in maternal-to-zygotic transition of in vitro-produced porcine embryos by single-cell RNA-seq
2022-Jan, Reproduction in domestic animals = Zuchthygiene
DOI:10.1111/rda.14034
PMID:34725864
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研究论文 | 本研究基于先前发表的单细胞RNA测序数据，系统分析了猪体外受精和早期孤雌激活胚胎中长非编码RNA（lncRNA）的表达动态 | 首次详细比较了猪体外受精和孤雌激活胚胎中lncRNA的表达差异，并揭示了这些差异与胚胎发育特定阶段的信号通路相关 | 研究仅限于体外受精和孤雌激活胚胎，未涉及体内胚胎的比较 | 探究猪早期胚胎发育过程中lncRNA的表达动态及其在母源到合子过渡中的作用 | 猪的成熟卵母细胞和体外受精及早期孤雌激活胚胎 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 包括猪成熟卵母细胞和1至8细胞阶段的体外受精及孤雌激活胚胎 |
| 23166 | 2024-08-08 |
Relationships between type 2 diabetes, cell dysfunction, and redox signaling: A meta-analysis of single-cell gene expression of human pancreatic α- and β-cells
2022-Jan, Journal of diabetes
IF:3.0Q2
DOI:10.1111/1753-0407.13236
PMID:34725923
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meta-分析 | 本研究通过单细胞RNA测序数据的meta分析，探讨了2型糖尿病与细胞功能障碍及氧化还原信号之间的关系。 | 利用单细胞RNA测序技术深入研究了2型糖尿病中α-和β-细胞的转录组变化，并评估了氧化还原信号在其中的作用。 | 研究仅基于六项研究的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量和研究多样性的限制。 | 旨在深入理解2型糖尿病中α-和β-细胞的细胞机制及其与氧化还原信号的关系。 | 研究对象包括来自健康供体和2型糖尿病患者的胰腺胰岛α-和β-细胞。 | NA | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究包括来自六项研究的单细胞RNA测序数据 |
| 23167 | 2024-08-08 |
Capturing tumour heterogeneity in pre- and post-chemotherapy colorectal cancer ascites-derived cells using single-cell RNA-sequencing
2021-12-22, Bioscience reports
IF:3.8Q2
DOI:10.1042/BSR20212093
PMID:34708245
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了结直肠癌患者腹水来源细胞在化疗前后的肿瘤异质性 | 首次展示了单细胞分辨率下高度异质性的癌症亚群对特定化疗治疗的不同反应 | NA | 探索和表征结直肠癌患者腹水来源细胞的肿瘤异质性 | 结直肠癌患者腹水来源细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 19,653个细胞来自四个样本 |
| 23168 | 2024-08-08 |
Transcriptional landscape associated with TNBC resistance to neoadjuvant chemotherapy revealed by single-cell RNA-seq
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.09.002
PMID:34703883
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了超过5000个来自四名响应者和四名非响应者的单细胞转录组数据，揭示了三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）耐药的转录组图谱 | 本研究首次在单细胞水平上揭示了TNBC对NAC耐药的转录组图谱，并通过多变量生存分析确定了预测无复发生存的三个基因特征 | 本研究仅基于公开的转录组数据进行分析，未来需要进一步的实验验证和临床研究来确认这些发现 | 揭示三阴性乳腺癌对新辅助化疗耐药的机制，并寻找潜在的治疗靶点和预后标志物 | 三阴性乳腺癌（TNBC）对新辅助化疗（NAC）的耐药性 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过5000个单细胞，来自四名响应者和四名非响应者 |
| 23169 | 2024-08-08 |
Monitoring CAR T cell generation with a CD8-targeted lentiviral vector by single-cell transcriptomics
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.09.019
PMID:34729382
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研究论文 | 本研究设计了一种单细胞RNA测序方法，用于监测通过慢病毒载体递送CD19-CAR基因的过程 | 本研究揭示了三模态表达模式，并提出了一种基于分布的识别CAR T细胞和CD8+淋巴细胞的方法 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术监测CAR T细胞的生成过程 | 研究对象为通过慢病毒载体暴露的人类供体外周血单个核细胞 | 基因工程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 评估了400个与免疫反应相关的基因，包括特定于慢病毒载体的探针 |
| 23170 | 2024-08-08 |
Mitochondrial metabolism coordinates stage-specific repair processes in macrophages during wound healing
2021-12-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.004
PMID:34715039
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研究论文 | 本文研究了在伤口愈合过程中，巨噬细胞在不同阶段的线粒体代谢变化及其对修复过程的影响 | 首次揭示了线粒体代谢在伤口愈合不同阶段对巨噬细胞功能的关键调控作用 | 研究仅在老鼠皮肤伤口模型中进行，可能需要进一步在其他物种或人体中验证 | 探讨线粒体代谢在伤口愈合过程中对巨噬细胞功能的调控机制 | 早期和晚期伤口愈合阶段的巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞测序分析 | NA | 转录组数据 | 老鼠皮肤伤口模型中的巨噬细胞 |
| 23171 | 2024-08-08 |
A novel approach to identify the mechanism of miR-145-5p toxicity to podocytes based on the essential genes targeting analysis
2021-Dec-03, Molecular therapy. Nucleic acids
DOI:10.1016/j.omtn.2021.09.005
PMID:34729245
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研究论文 | 本文探讨了miR-145-5p对足细胞的毒性机制，通过分析其对足细胞关键基因的影响 | 本研究提供了一种新的方法来研究miRNA如何影响特定细胞类型，不仅识别miRNA药物副作用的分子机制，还能预测miRNA药物对各种细胞类型的毒性 | NA | 探索miR-145-5p对足细胞的毒性机制 | miR-145-5p对足细胞的影响及其关键基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 正常控制小鼠 |
| 23172 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
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研究论文 | 本研究通过随机单盲安慰剂对照的II期临床试验，验证了间充质干细胞（MSCs）治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了MSCs治疗COVID-19患者时，能够调动一种新型VNN2造血干细胞/祖细胞样（HSPC-like）细胞，并调节多种免疫细胞的功能 | NA | 验证间充质干细胞治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | COVID-19患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液 | 每个组29名患者 |
| 23173 | 2024-08-08 |
[Protective macrophages : New insights into the role of synovial macrophages in inflammatory joint diseases]
2021-Dec, Zeitschrift fur Rheumatologie
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s00393-021-01112-1
PMID:34705071
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研究论文 | 本文探讨了滑膜巨噬细胞在炎症性关节疾病中的保护作用和抗炎功能 | 利用单细胞测序和高级显微技术，揭示了巨噬细胞在组织稳态和组织再生中的多功能性，并发现了在滑膜组织中具有保护和抗炎作用的特殊上皮样巨噬细胞群体 | NA | 研究巨噬细胞在慢性炎症疾病中的作用，特别是其在类风湿性关节炎中的保护功能 | 巨噬细胞及其在炎症性关节疾病中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23174 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of the ciliary epithelium and contiguous tissues in the mouse eye
2021-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108811
PMID:34717927
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠眼中睫状上皮及其邻近组织的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 约一半的测序细胞来自邻近的视网膜，而非专门分离的睫状体 | 研究睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 小鼠眼中的睫状上皮及其邻近组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10,024个细胞 |
| 23175 | 2024-08-08 |
Miscell: An efficient self-supervised learning approach for dissecting single-cell transcriptome
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103200
PMID:34712916
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研究论文 | 本文开发了Miscell，一种使用深度神经网络作为潜在特征编码器的自监督学习方法，用于从单细胞转录组中挖掘信息 | Miscell在多种聚类指标上实现了至少可比或更好的性能，并能通过深度学习方法量化基因对细胞簇的影响，识别细胞类型特异性标记 | NA | 开发一种高效的自监督学习方法，用于解析单细胞转录组 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三个异质性数据集 |
| 23176 | 2024-08-08 |
Erratum to: Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging
2021-Nov-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab692
PMID:34718412
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23177 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome reveals the intra-tumoral heterogeneity and regulators underlying tumor progression in metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Nov-03, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00663-1
PMID:34732701
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和调控肿瘤进展的关键因素 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性及其分子机制 | NA | 旨在全面描绘转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和揭示其分子机制 | 转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和分子机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 6236个来自5个肝转移性胰腺导管腺癌病变的单个细胞 |
| 23178 | 2024-08-08 |
NRG1/ErbB signalling controls the dialogue between macrophages and neural crest-derived cells during zebrafish fin regeneration
2021-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26422-5
PMID:34732706
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研究论文 | 本文通过结合三重转基因斑马鱼胚胎的活体成像和单细胞RNA测序，详细绘制了斑马鱼幼体再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了NRG1/ErbB信号通路在调控巨噬细胞与神经嵴来源细胞间对话中的关键作用 | 本文首次详细绘制了斑马鱼再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了foxd3阳性神经嵴来源细胞在再生过程中的作用及NRG1/ErbB信号通路的关键调控作用 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性及特定细胞群的作用 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型及其相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 三重转基因斑马鱼胚胎 |
| 23179 | 2024-08-08 |
Dissecting mammalian spermatogenesis using spatial transcriptomics
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109915
PMID:34731600
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研究论文 | 使用空间转录组学技术Slide-seq，生成小鼠和人睾丸的空间基因表达图谱，揭示了精子发生过程中的细胞类型定位和基因表达模式 | 首次利用Slide-seq技术在近单细胞分辨率下捕捉小鼠和人睾丸的空间基因表达模式，并开发了一种计算框架来精确地定位睾丸细胞类型 | NA | 揭示哺乳动物精子发生过程中的空间基因表达模式及其在糖尿病诱导的男性不育中的潜在机制 | 小鼠和人的睾丸组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | Slide-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人的睾丸组织样本 |
| 23180 | 2024-08-08 |
Patch-seq of mouse DRG neurons reveals candidate genes for specific mechanosensory functions
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109914
PMID:34731626
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研究论文 | 本文通过结合机械敏感电流记录和单细胞RNA测序，研究了小鼠DRG神经元的机械感觉功能相关候选基因 | 本文首次将机械敏感电流记录与单细胞转录组测序相结合，实现了机械电特性与转录组定义的神经元群体之间的一一对应 | 本文的敲降实验排除了Tmem120a和Tmem150c作为感觉神经元中机械敏感电流的介导因子，但未进一步验证其他候选基因 | 揭示特定机械感觉功能的分子机制 | 小鼠DRG神经元的机械感觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种机械感觉神经元亚型 |