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当前共找到 41407 篇文献,本页显示第 2281 - 2300 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2281 2026-06-14
ScRNA-seq Data Reveal Gene Upregulation and Downregulation in Oxygen-Induced Retinopathy
2026-Jun-11, Medical science monitor : international medical journal of experimental and clinical research IF:2.2Q3
研究论文 通过单细胞RNA测序数据分析氧气诱导的视网膜病变中的基因上调和下调 首次利用单细胞RNA测序数据全面解析氧气诱导视网膜病变中的关键基因表达变化,并鉴定了多个潜在靶基因如Hnrnpu、Vamp2等 研究基于小鼠模型,结果需在人类样本中验证;数据来源单一(GSE150703),可能缺乏普适性 探索早产儿视网膜病变中氧气诱导视网膜病变的靶基因 小鼠视网膜组织细胞 数字病理学 早产儿视网膜病变 单细胞RNA测序 不适用 基因表达数据 来自GSE150703数据集的视网膜组织样本 不适用 单细胞RNA测序 不适用 不适用
2282 2026-06-14
Causal effect estimation from trans-regulatory single-cell CRISPR screens
2026-Jun-10, Cell genomics IF:11.1Q1
评论 介绍从反式调控单细胞CRISPR筛选实验中估计因果效应的关键概念和原则 系统解析了在单细胞CRISPR研究中将统计关联解释为因果效应所需的核心假设,并通过实例展示假设违背如何导致偏差 未提出新的统计方法或验证框架,仅对现有方法进行因果假设层面的综述性分析 阐明在反式调控单细胞CRISPR研究中实现因果效应估计的统计原则与假设条件 单细胞CRISPR筛选实验中的基因扰动与表达数据的因果关联 机器学习 NA CRISPR, 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2283 2026-06-14
A Systemic Immune State Axis Distinguishes Psoriatic Arthritis from Psoriasis
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过分析多项公开数据集,定义了区分银屑病关节炎与银屑病的系统性免疫状态轴 首次定义了一个与银屑病关节炎相关的系统性免疫状态坐标(CRS),该坐标独立于皮肤炎症反应轴(DIR),并在多种数据层面验证其区分能力 研究依赖公开数据集,可能受限于样本异质性和数据整合的批次效应;主要关注未治疗患者,治疗影响未充分探讨 揭示区分银屑病与银屑病关节炎的系统性免疫状态特征 银屑病患者、银屑病关节炎患者及健康对照者 机器学习 银屑病、银屑病关节炎 全血甲基化测序、单细胞RNA测序、RNA测序、甲基化测序 NA 甲基化数据、单细胞转录组数据、转录组数据 跨四个核心公开数据集,涉及全血甲基化、PBMC单细胞RNA测序(受试者层面汇总)、皮肤RNA测序和纯化CD4 T细胞甲基化,外加两个外部皮肤队列 NA 单细胞RNA测序、全血甲基化测序、RNA测序 NA NA
2284 2026-06-14
Integrated Transcriptomic Analysis Suggests a C1Q-Related Macrophage-Fibroblast Signaling Axis in Keloids
2026-Jun-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组分析,揭示瘢痕疙瘩中C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞信号轴 首次提出C1Q相关的巨噬细胞-成纤维细胞通讯模型,并通过体外实验初步验证C1Q对瘢痕疙瘩成纤维细胞的激活作用 研究主要基于公共数据集和初步体外实验,缺乏体内实验验证和更深入的机制研究 阐明巨噬细胞功能状态如何调控瘢痕疙瘩中成纤维细胞的病理性激活 瘢痕疙瘩组织中的巨噬细胞和成纤维细胞 生物信息学 瘢痕疙瘩 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 组织免疫荧光 NA 转录组数据, 图像 多个公共数据集及组织样本 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
2285 2026-06-14
Integrating Single-Cell Profiling with Generative AI for De Novo Design of MMP9 Protein Binders in Diffuse Large B-Cell Lymphoma
2026-Jun-05, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 结合单细胞RNA测序和生成式AI设计针对弥漫大B细胞淋巴瘤中MMP9的蛋白结合剂 首次整合单细胞RNA测序与生成式AI管道(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),用于设计靶向MMP9 PEX结构域的蛋白结合剂 研究仅验证了部分设计蛋白的结合能力,且蛋白结合剂的体内功能及疗效尚未评估 探索MMP9在弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的细胞来源,并设计靶向MMP9的蛋白结合剂 MMP9蛋白及其PEX结构域,弥漫大B细胞淋巴瘤ABC亚型中的特异性巨噬细胞 机器学习 弥漫大B细胞淋巴瘤 单细胞RNA测序,生成式AI(RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold),ELISA RFdiffusion、ProteinMPNN、AlphaFold 单细胞转录组数据、蛋白质结构数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2286 2026-06-14
Integrative Transcriptomics and Machine Learning Identify Macrophage-Associated Biomarkers in Hypertrophic Cardiomyopathy
2026-Jun-04, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过整合转录组学和机器学习,在单细胞水平上分析巨噬细胞相关基因在肥厚型心肌病中的表达,识别出三个核心基因并构建诊断模型 首次利用单细胞RNA测序结合机器学习方法系统鉴定肥厚型心肌病中巨噬细胞相关的生物标志物并建立诊断模型 基于公开数据集,结果需进一步在独立队列中验证;样本量有限,可能影响模型泛化性 探究肥厚型心肌病的分子机制,识别巨噬细胞相关的生物标志物并构建诊断模型 肥厚型心肌病患者的心肌组织细胞,包括巨噬细胞在内的免疫细胞亚群 机器学习 心血管疾病 单细胞RNA测序,批量RNA测序,LASSO回归 LASSO回归模型,机器学习 基因表达数据 多个公开数据集(GSE181764、GSE161921、GSE249925),具体样本量未明确 NA 单细胞RNA测序,批量RNA测序 NA NA
2287 2026-06-14
SpatioCell: deep integration of histology and spatial transcriptomics for profiling the cellular microenvironment at single-cell level
2026-Jun-03, Science bulletin IF:18.8Q1
研究论文 提出了SpatioCell算法,通过整合组织学与空间转录组学数据,以单细胞分辨率自动提取细胞类型和表达信息 创新性地通过动态规划结合形态与转录组信息,实现确定性单细胞空间重构,纠正去卷积错误并揭示被忽视的微环境特征 NA 开发一种计算算法,将空间转录组数据提升至单细胞分辨率,以深入理解细胞空间组织 三阴性乳腺癌组织样本中的空间转录组数据 数字病理学 乳腺癌 空间转录组学 动态规划 图像, 转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2288 2026-06-14
Beyond Molecular Classification in Metastatic Triple-Negative Breast Cancer: Toward Subtype-Guided Precision Oncology
2026-Jun-02, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
综述 本文综述了转移性三阴性乳腺癌的分子分类及其在精准肿瘤学中的应用 系统整合了mTNBC的基因组、转录组、表观遗传、免疫、基质及生物力学维度的肿瘤异质性,并介绍了新兴工具如单细胞RNA测序、空间转录组学和循环肿瘤DNA分析在患者分层中的潜力 临床实施需要更高的方法学标准化、经过验证的预测性生物标志物、可及的诊断平台以及能够捕捉治疗压力下亚型演变的动态监测策略 探索mTNBC的分子分类和亚型导向的精准治疗策略 转移性三阴性乳腺癌及其分子亚型(BL1、BL2、M、MSL、IM、LAR) 机器学习, 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 循环肿瘤DNA分析, 长链非编码RNA分析, 免疫组化 NA 基因表达数据, 表观遗传数据, 免疫组化数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, 10x Visium 单细胞RNA测序和空间转录组学技术
2289 2026-06-14
Effects of Ripasudil on Mouse Subconjunctival Immune Cell Motility Activated by Monocyte Chemoattractant Protein-1
2026-Jun-01, Investigative ophthalmology & visual science IF:5.0Q1
研究论文 探讨Rho激酶抑制剂ripasudil对单核细胞趋化蛋白-1激活的小鼠结膜下免疫细胞运动的影响 首次在体内和体外实验中证明ripasudil能够抑制MCP-1激活的巨噬细胞运动,为青光眼滤过手术后伤口愈合调控提供新思路 仅使用小鼠模型和细胞系,临床相关性需进一步验证;且细胞数量变化不显著,机制研究有限 研究ripasudil对MCP-1激活的免疫细胞运动的影响及其在青光眼滤过手术后伤口愈合中的潜在治疗价值 小鼠结膜下的LysM阳性细胞(巨噬细胞)以及THP-1和RAW264.7细胞系 机器学习 青光眼 单细胞RNA测序、免疫细胞化学、多光子显微镜成像、Boyden室实验 NA 图像、基因表达数据 LysM-eGFP敲入小鼠及THP-1/RAW264.7细胞系,样本量未明确 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2290 2026-06-14
Integrated Single-Cell Virtual Knockout and Machine Learning Analyses Reveal a Protective Role of CKAP2 in Gastric Cancer
2026-Jun-01, Molecules (Basel, Switzerland)
研究论文 通过整合单细胞虚拟敲除和机器学习分析,揭示了CKAP2在胃癌中的保护作用 首次结合单细胞虚拟敲除、机器学习算法及孟德尔随机化分析,系统研究CKAP2在胃癌中的保护机制及其与5-HT通路的关联 研究主要基于生物信息学分析和体外验证,缺乏体内动物模型实验及大规模临床队列的进一步验证 阐明CKAP2在胃癌进展中的作用,评估其预后价值和潜在保护意义 胃癌患者组织样本和胃癌细胞系 机器学习 胃癌 全转录组测序 加权基因共表达网络分析, 机器学习算法 表达数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2291 2026-06-14
The RELA-FTH1 axis in senescent cancer-associated fibroblasts creates a stromal iron sink that drives ferroptosis resistance and therapy failure across solid malignant tumors
2026-Jun-01, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1
研究论文 揭示衰老癌症相关成纤维细胞通过RELA-FTH1轴形成基质铁池,促进铁死亡抵抗和实体恶性肿瘤治疗失败 首次阐明senCAFs通过RELA-FTH1轴建立基质铁池,通过螯合微环境铁离子保护肿瘤细胞免于铁死亡,且该机制在多种实体瘤中具有泛癌普适性 研究主要依赖细胞系和异种移植模型,缺乏患者来源样本的验证,且未深入探究senCAFs与免疫细胞间的相互作用 研究衰老癌症相关成纤维细胞如何通过铁代谢重编程驱动实体瘤治疗抵抗 31种实体恶性肿瘤中的senCAFs及邻近肿瘤细胞 数字病理学 肺癌、前列腺癌、心血管疾病、老年病等(泛实体瘤) 单细胞RNA测序、空间转录组学、条件培养基实验、Transwell共培养、铁橙探针检测、基因干扰(shRNA/siRNA)、药物抑制、皮下异种移植模型 LASSO/Cox回归模型 单细胞RNA测序数据、空间转录组数据、临床预后数据 6个单细胞RNA测序数据集(共431,513个细胞)及TCGA独立队列 10x Genomics, Illumina 单细胞RNA测序, 空间转录组学 10x Chromium, Illumina NovaSeq 10x Chromium Single Cell 3'测序, 空间转录组学FFPE样本分析
2292 2026-06-14
SGO1 and SGO2 are Associated With Disease Progression and an Immunosuppressive Microenvironment in Papillary Renal Cell Carcinoma
2026-Jun, Cancer medicine IF:2.9Q2
research paper 本研究整合多组学数据探究SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中的表达模式、预后意义及对肿瘤免疫微环境的影响 首次揭示SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中协同促进肿瘤进展并与免疫抑制性微环境重塑相关 SGO1和SGO2与肿瘤免疫微环境的关联仍为相关性结论,尚需进一步机制研究建立直接的因果关系 确定SGO1和SGO2在乳头状肾细胞癌中的表达模式及预后意义,阐明其驱动肿瘤进展的功能机制,并评估其对肿瘤免疫微环境的影响 乳头状肾细胞癌(KIRP)中的SGO1和SGO2蛋白 machine learning 肾癌 多组学整合分析,单细胞转录组学,免疫组化,功能实验 NA 转录组数据,免疫组化图像 TCGA、GTEx和GEO数据库中的多组学数据集,以及患者样本的免疫组化分析 NA bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq NA NA
2293 2026-06-14
Single-Cell and Bulk Transcriptomics Uncover the Cellular Ecosystem of Vascular Invasion in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2026-May-31, Cells IF:5.1Q2
研究论文 通过单细胞和 bulk 转录组学揭示了肝内胆管癌中血管浸润的细胞生态系统 首次发现一种新型肿瘤样癌症相关成纤维细胞(tCAFs)在血管浸润阳性的肝内胆管癌中富集,并揭示缺氧-tCAFs-内皮细胞轴作为血管浸润的关键机制 未明确具体限制信息 探究肝内胆管癌中血管浸润的肿瘤微环境驱动因素及其分子机制 肝内胆管癌患者的肿瘤样本及临床特征 机器学学习,数字病理学 肝内胆管癌 单细胞 RNA 测序,bulk RNA 测序,空间转录组学,多重免疫荧光,RT-qPCR NA 转录组数据,空间转录组数据,图像数据 25 个肝内胆管癌样本 NA 单细胞 RNA 测序,空间转录组学 NA NA
2294 2026-06-14
Transcriptomic Signature of PDGF-BB Control of Annulus Fibrosus Reveals Modulation of Inflammatory and Neurogenic Pathways
2026-May-30, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过转录组分析揭示了PDGF-BB对人类纤维环细胞中炎症和神经源性信号通路及细胞外基质重塑的调控作用 首次通过转录组分析揭示PDGF-BB在健康和退变纤维环细胞中具有上下文依赖性的转录调控作用,并发现其通过调节GPCR网络和抑制炎症-神经源性信号通路发挥抗炎效果 未明确提出局限性 研究PDGF-BB对纤维环细胞生物学的影响及其在椎间盘退变中的作用机制 人类纤维环细胞(健康和退变) 转录组学 椎间盘退变 RNA-seq NA 转录组数据 健康和退变AF细胞经PDGF-BB处理3或5天 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA 使用了公开的单细胞RNA-seq数据集
2295 2026-06-14
Network-Based Bioinformatics Reveal Microenvironment-Driven Cell-to-Cell Communication in the Progression of Multiple Myeloma
2026-May-30, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 基于网络生物信息学分析揭示多发性骨髓瘤进展中微环境驱动的细胞间通讯 开发了一个结合CellChat、NicheNet等工具的计算流程,通过微环境特异性方法重建多发性骨髓瘤进展过程中的细胞间通讯网络,并识别关键细胞节点和信号通路 未明确提及 研究多发性骨髓瘤进展中肿瘤微环境驱动的细胞间通讯模式 多发性骨髓瘤进展过程中肿瘤微环境中的细胞群体 生物信息学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 三个公开的单细胞RNA测序数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2296 2026-06-14
Sinomenine Regulates PSMB9 to Mediate Therapeutic Effects in Rheumatoid Arthritis
2026-May-29, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本研究通过整合差异表达基因分析和加权基因共表达网络分析,鉴定出PSMB9为类风湿关节炎的枢纽基因,并探讨了青藤碱通过调控PSMB9发挥治疗作用的机制 首次将PSMB9鉴定为类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物和治疗靶点,并揭示了青藤碱通过直接结合并降低PSMB9蛋白表达发挥抗炎作用的新机制 未提及 识别类风湿关节炎的潜在诊断生物标志物,并研究其与免疫浸润的关系及青藤碱的治疗机制 类风湿关节炎患者样本中的差异表达基因和免疫细胞浸润 机器学习 类风湿关节炎 基因表达分析、加权基因共表达网络分析、单细胞RNA测序、细胞热转变分析、Western blot 加权基因共表达网络分析 基因表达数据、单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
2297 2026-06-14
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Cellular Heterogeneity and Developmental Dynamics of Goose Satellite Cells During Embryogenesis
2026-May-27, Cells IF:5.1Q2
研究论文 通过单细胞RNA测序揭示鹅胚胎发育过程中卫星细胞的异质性和发育动态 首次在鹅胚胎发育过程中对卫星细胞进行单细胞转录组分析,鉴定出三种功能状态(静息、激活、增殖/分化)及其连续线性伪时间轨迹,并揭示了细胞间通讯网络的动态变化 尚未提及具体局限 探究禽类胚胎发育过程中肌肉卫星细胞的细胞异质性和转录动态 鹅胚胎腿肌组织 单细胞生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组 四个胚胎阶段(E13、E15、E18、E23),每阶段4个雌性胚胎的混合组织,共42,886个细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2298 2026-06-14
A Dual-Gene Signature of PMAIP1 and GADD45A for Early Detection of Intrahepatic Cholangiocarcinoma in the Context of Primary Sclerosing Cholangitis
2026-May-27, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 通过单细胞转录组分析识别原发性硬化性胆管炎相关肝内胆管癌的早期检测双基因标志物 首次提出基于背景偏差框架分析PSC相关胆管癌发生,并识别出PMAIP1和GADD45A双基因标志物用于早期检测 仅在内部交叉验证和外部肿瘤-邻近验证队列中验证,尚需更多独立队列验证 探索PSC相关胆管癌发生过程中的恶性相关决定因素,建立早期检测标志物 原发性硬化性胆管炎患者、肝内胆管癌肿瘤组织和癌旁组织 数字病理学 肝内胆管癌 单细胞RNA测序 LASSO回归、穷举最优子集选择 单细胞转录组数据 包含PSC、ICC肿瘤组织和癌旁组织的样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2299 2026-06-14
Coevolution of NK and Tumor Cell States Along Multiple Myeloma Progression from Precursor Conditions
2026-May-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 探讨多发性骨髓瘤从癌前状态进展过程中NK细胞与肿瘤细胞状态的协同进化 首次整合NK细胞功能状态与基于CRISPR筛选的血浆细胞内在易感性程序,揭示多发性骨髓瘤进展中免疫-肿瘤协同重塑的阶段性共变模式,并突出NKG2A-HLA-E轴作为关键界面 未明确说明局限性(需结合全文补充) 阐明多发性骨髓瘤疾病演变过程中NK细胞状态变化及其与肿瘤细胞的免疫-肿瘤协同重塑机制 健康供者、意义未明的单克隆丙种球蛋白病、冒烟型多发性骨髓瘤和新诊断多发性骨髓瘤患者 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序、CRISPR筛选、多参数流式细胞术 NA 单细胞转录组数据 健康供者、MGUS、SMM和新诊断MM患者样本 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2300 2026-06-14
Integrative Multi-Omics Analysis Prioritizes Candidate Therapeutic Targets for Primary Open-Angle Glaucoma
2026-May-22, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2
研究论文 本研究通过整合多组学分析,优先确定了原发性开角型青光眼的候选治疗靶点 首次多组学框架结合大规模血浆蛋白质组与GWAS数据,并通过跨物种单细胞图谱定位候选蛋白于常规流出通路细胞,提出SEL1L作为新型小梁网稳态靶点及TFPI作为药物重定位靶点 未提供明确局限性信息 通过整合多组学分析识别原发性开角型青光眼的候选因果蛋白和治疗靶点 原发性开角型青光眼患者的血浆蛋白质组数据、GWAS统计汇总、人类和小鼠眼单细胞RNA-seq图谱 机器学习的多组学整合 原发性开角型青光眼 蛋白质组学、全基因组关联研究、孟德尔随机化、贝叶斯共定位、单细胞RNA测序 NA 蛋白质组数据、基因组数据(GWAS统计)、单细胞转录组数据 UK Biobank血浆蛋白质组53,022例样本及大规模POAG GWAS数据集 NA 单细胞RNA测序、蛋白质组学 NA NA
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