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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2281 - 2300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2025-10-06 |
Mapping the topography of spatial gene expression with interpretable deep learning
2025-Feb, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-024-02503-3
PMID:39849132
|
研究论文 | 开发了一种名为GASTON的无监督可解释深度学习算法，用于分析空间转录组数据并构建组织切片的地形图 | 提出了isodepth概念来量化空间基因表达模式，并开发了能够同时学习isodepth、空间梯度和分段线性表达函数的深度学习算法 | 未提及具体的数据稀疏程度对算法性能的影响及计算复杂度分析 | 解决空间转录组数据稀疏性问题，分析空间基因表达模式 | 多种组织中的空间基因表达模式，包括大脑神经元分化和肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组技术 | 深度学习神经网络 | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2282 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptome-wide Mendelian randomization and colocalization analyses uncover cell-specific mechanisms in atherosclerotic cardiovascular disease
2025-Jul-03, American journal of human genetics
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.ajhg.2025.06.001
PMID:40555237
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研究论文 | 本研究开发了一个单细胞水平上的孟德尔随机化和共定位分析流程，用于揭示动脉粥样硬化性心血管疾病的细胞特异性机制 | 首次将顺式孟德尔随机化与共定位分析结合应用于单细胞水平，相比传统的批量RNA测序TWAS方法，能够发现更多细胞特异性的基因-表型关联 | 单细胞eQTL数据集的样本量相对较小 | 通过单细胞转录组分析揭示动脉粥样硬化性心血管疾病的细胞特异性遗传机制 | 14种免疫细胞类型，包括单核细胞和斑块巨噬细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，免疫组织化学，全基因组关联分析 | 孟德尔随机化，共定位分析 | 单细胞转录组数据，GWAS数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2283 | 2025-10-06 |
HECLIP: histology-enhanced contrastive learning for imputation of transcriptomics profiles
2025-Jul-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf363
PMID:40569046
|
研究论文 | 提出一种名为HECLIP的深度学习框架，能够直接从H&E染色的组织学图像推断空间基因表达谱 | 采用以图像为中心的对比学习策略，减少对空间转录组数据的依赖，实现准确且有生物学意义的基因表达预测 | NA | 开发可扩展的计算方法，弥合组织学成像与转录组学之间的差距 | H&E染色的组织学图像和空间基因表达谱 | 数字病理学 | NA | 深度学习，对比学习 | 深度学习框架 | 图像，基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2284 | 2025-10-06 |
Enhancing TREM2 expression activates microglia and modestly mitigates tau pathology and neurodegeneration
2025-Mar-23, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03420-8
PMID:40122810
|
研究论文 | 本研究通过增强TREM2表达激活小胶质细胞，适度减轻tau病理和神经退行性病变 | 首次在PS19 tauopathy小鼠模型中证明TREM2-WT过表达可适度降低磷酸化tau水平并保护神经元完整性，而T47H变异体则表现为功能丧失 | 研究仅在小鼠模型中进行，对人类疾病的直接适用性尚需验证；治疗效果仅为适度改善 | 探究TREM2在tau病理和神经退行性病变中的作用机制 | PS19 tauopathy小鼠模型，人类野生型TREM2（TREM2-WT）和R47H变异体（TREM2-R47H） | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | PS19 tauopathy小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2285 | 2025-10-06 |
Charting Postnatal Heart Development Using In Vivo Single-Cell Functional Genomics
2025-Mar-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.03.10.642473
PMID:40161658
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研究论文 | 通过整合单核转录组学和基于图像的空间转录组学，构建了出生后心脏发育的时空图谱，并开发了PIP-seq技术功能验证心肌细胞成熟调控因子 | 开发了PIP-seq（基于探针的Indel可检测扰动测序）高通量平台，能够同时捕获sgRNA表达、扰动状态和单核分辨率转录组谱 | NA | 解析出生后心脏发育过程中心肌细胞成熟的调控机制 | 出生后心脏发育过程中的心肌细胞 | 单细胞功能基因组学 | 心血管疾病 | 单核转录组学, 空间转录组学, PIP-seq | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学, 扰动测序 | NA | PIP-seq（基于探针的Indel可检测扰动测序）平台 |
| 2286 | 2025-10-06 |
Lymphocyte Subpopulations in the Healthy Human Lacrimal Gland and Their Variations With Age and Sex, Systematic Review 1960-2023
2025-03, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70167
PMID:40105662
|
系统综述 | 系统回顾1960-2023年间关于健康人泪腺中淋巴细胞亚群及其随年龄和性别变化的研究 | 首次对健康人泪腺淋巴细胞亚群进行系统综述并纳入meta分析 | 40岁以下个体代表性不足(12.6%)，女性代表性不足(38.9%)，研究间定义和量化标准存在高度变异性 | 定义人泪腺中主要淋巴细胞亚群及其随年龄和性别的变化 | 774名健康个体(其中722名为尸体) | 免疫学 | NA | 苏木精-伊红染色,免疫组织化学,免疫荧光 | NA | 组织病理学数据 | 20项观察性研究，774名健康个体 | NA | NA | NA | NA |
| 2287 | 2025-10-06 |
Construction of the Single-Cell Landscape of Hashimoto's Thyroiditis Tissue and Peripheral Blood by Single-Cell RNA Sequencing
2025-02, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70153
PMID:39931830
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序构建桥本甲状腺炎组织和外周血的单细胞图谱 | 首次构建桥本甲状腺炎的单细胞全景图谱，发现新的细胞亚群B_MEF2B_BCL6和TFC_PAX8_NKX2-1 | 样本量较小（6例HT患者组织+4例PBMC+1例正常对照） | 探索桥本甲状腺炎的发病机制 | 桥本甲状腺炎患者的甲状腺组织和外周血单核细胞 | 单细胞组学 | 桥本甲状腺炎 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 6例HT患者甲状腺组织、4例HT患者PBMC、1例正常甲状腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2288 | 2025-10-06 |
Single-Cell Analysis of Endothelial Cell Injury in IgA Nephropathy
2025-02, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70149
PMID:39945225
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析IgA肾病中肾内皮细胞的损伤机制 | 首次通过单细胞测序揭示IL-6通过Rac1负调控VE-cad表达的新机制 | 研究主要基于生物信息学分析，实验验证仅限于HRGECs细胞模型 | 探究IgA肾病中肾内皮细胞在肾脏损伤中的具体作用机制 | IgA肾病患者的肾脏活检组织和人肾小球内皮细胞 | 单细胞组学 | IgA肾病 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 细胞实验 | hdWGCNA, AUCell | 单细胞基因表达数据 | 来自GEO数据库的IgA肾病和对照肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2289 | 2025-10-06 |
A20 as a Potential Therapeutic Target for COVID-19
2025-01, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.70127
PMID:39853876
|
综述 | 本文探讨A20作为COVID-19潜在治疗靶点的作用机制 | 首次系统阐述A20在COVID-19病理过程中的调控作用，并结合单细胞RNA-seq数据验证其抗感染和抗炎功能 | 文献综述性质，缺乏原始实验验证 | 研究A20在COVID-19发病机制中的调控作用 | COVID-19患者和健康个体的单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 来自NCBI GEO数据库的健康个体和不同严重程度COVID-19患者数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2290 | 2025-10-06 |
Epithelial tubule interconnection driven by HGF-Met signaling in the kidney
2024-Dec-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2416887121
PMID:39705305
|
研究论文 | 本研究揭示了HGF-Met信号通路通过MAPK和MMPs促进肾脏上皮小管吻合的机制 | 首次发现HGF能够独立于细胞增殖促进上皮小管吻合，并建立了可视化定量分析小管连接的实验方法 | 研究仅限于胚胎小鼠肾脏模型，尚未在人类或其他成年动物模型中验证 | 探究肾脏上皮小管吻合的分子机制 | 胚胎小鼠肾脏上皮小管 | 发育生物学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，荧光图像 | 胚胎小鼠肾脏组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2291 | 2025-10-06 |
Decoding aging in the heart via single cell dual omics of non-cardiomyocytes
2024-Dec-20, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2024.111469
PMID:39735437
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研究论文 | 通过单细胞双组学技术解析心脏非心肌细胞在衰老过程中的分子变化 | 首次在单细胞水平同时应用转录组和表观基因组分析心脏非心肌细胞的衰老过程，揭示了细胞类型内衰老异质性和细胞间通讯的变化 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；仅关注非心肌细胞，未包含心肌细胞分析 | 解析心脏衰老的细胞和分子机制 | 年轻、中年和老年小鼠的心脏非心肌细胞 | 单细胞组学 | 心脏衰老相关疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序 | NA | 单细胞转录组数据, 单细胞表观基因组数据 | 年轻、中年和老年三个年龄组的小鼠心脏非心肌细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 2292 | 2025-10-06 |
Dual states of murine Bmi1-expressing intestinal stem cells drive epithelial development utilizing non-canonical Wnt signaling
2025-Aug-18, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2025.03.014
PMID:40262610
|
研究论文 | 本研究揭示了小鼠肠道发育早期Bmi1表达干细胞的功能特性及其通过非经典Wnt信号调控的机制 | 首次发现Bmi1细胞在Lgr5表达肠道干细胞出现前的早期发育阶段作为功能性干细胞存在，并揭示其通过非经典Wnt信号调控增殖状态 | 研究局限于小鼠模型，人类肠道发育中的类似机制仍需验证 | 探究肠道上皮发育过程中干细胞亚型的动态调控机制 | 小鼠肠道干细胞（Bmi1和Lgr5表达细胞） | 发育生物学 | NA | 谱系追踪，单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据，谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2293 | 2025-10-06 |
Presbycusis: Pathology, Signal Pathways, and Therapeutic Strategy
2025-Aug, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202410413
PMID:40349177
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综述 | 本文聚焦于老年性耳聋中血管纹的关键作用，探讨其病理机制、信号通路及治疗策略 | 重点强调血管纹在老年性耳聋中的作用，并引入单细胞转录组学技术解析其机制 | NA | 阐明老年性耳聋的病理机制并探索治疗策略 | 老年性耳聋（Presbycusis/ARHL）的病理机制 | NA | 老年性疾病 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2294 | 2025-10-06 |
Inhibition of SIRT1/HSF1 pathway contributes to doxorubicin-induced nephrotoxicity in ovarian tumor-bearing mice
2025-06, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02122-z
PMID:40347321
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研究论文 | 本研究探讨了SIRT1/HSF1信号通路在多柔比星诱导的卵巢癌荷瘤小鼠肾毒性中的作用机制 | 首次揭示SIRT1下调通过促进HSF1乙酰化导致足细胞损伤，是多柔比星肾毒性的新机制 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床样本中验证 | 探究SIRT1/HSF1通路在多柔比星诱导肾毒性中的作用机制 | 卵巢癌荷瘤小鼠、肾脏组织、小鼠足细胞 | 生物信息学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序、生物信息学分析、慢病毒转染 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、病理学数据 | 小鼠模型和细胞实验样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2295 | 2025-10-06 |
Convergent musk biosynthesis across host and microbiota in musk deer and muskrat
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学方法揭示了麝香鹿和麝鼠在麝香生物合成中的多层次趋同进化机制 | 首次发现不同哺乳动物物种间在麝香生物合成中从分子通路到微生物群落的多层次趋同进化现象 | 研究仅聚焦于两个物种，可能无法完全代表所有麝香生产动物的多样性 | 探究哺乳动物气味腺中介导趋同麝香生产的机制基础 | 森林麝香鹿和麝鼠的麝香分泌腺体 | 多组学整合分析 | NA | 单细胞RNA测序,宏基因组学,代谢组学 | NA | 单细胞转录组数据,宏基因组数据,代谢物数据 | 两个物种的麝香腺体组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,宏基因组测序 | NA | NA |
| 2296 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the ovarian immune microenvironment regulated by 17β-estradiol in neonatal mice
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了17β-雌二醇对新生小鼠卵巢免疫微环境的调控作用 | 首次全面表征新生小鼠卵巢免疫微环境对雌激素的敏感性，发现E2治疗可诱导巨噬细胞从M1向M2表型转换 | 研究仅使用C57BL/6J品系新生小鼠，结果可能不适用于其他发育阶段或品系 | 探究雌激素在卵巢中的免疫调节功能 | 新生小鼠卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | C57BL/6J新生小鼠卵巢样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2297 | 2025-10-06 |
The role of TIGIT-CD226-PVR axis in mediating T cell exhaustion and apoptosis in NSCLC
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02052-2
PMID:39725799
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研究论文 | 本研究探讨TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌中调控T细胞耗竭和凋亡的作用机制 | 首次系统揭示TIGIT-CD226-PVR信号轴在CD27+/CD127+T细胞亚群中的调控作用及其与免疫治疗疗效的关联 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类临床试验中得到验证 | 探索TIGIT-CD226-PVR信号轴在非小细胞肺癌T细胞耗竭和凋亡中的调控机制 | 非小细胞肺癌小鼠模型中的CD27+/CD127+T细胞 | 免疫肿瘤学 | 肺癌 | 单细胞测序技术、生物信息学分析、体外实验、体内研究 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2298 | 2025-10-06 |
Targeted editing of CCL5 with CRISPR-Cas9 nanoparticles enhances breast cancer immunotherapy
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02032-6
PMID:39870938
|
研究论文 | 本研究利用CRISPR-Cas9纳米颗粒靶向编辑CCL5基因以增强乳腺癌免疫治疗效果 | 首次将CRISPR-Cas9技术与FCPCV纳米颗粒结合用于乳腺癌免疫治疗，通过靶向编辑CCL5基因改善肿瘤免疫微环境 | 研究主要基于小鼠模型，尚未进行人体临床试验 | 开发新型乳腺癌免疫治疗策略 | 乳腺癌细胞和人源化小鼠模型 | 基因编辑与免疫治疗 | 乳腺癌 | CRISPR-Cas9基因编辑, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2299 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell sequencing and machine learning to uncover the role of mitophagy in subtyping and prognosis of esophageal cancer
2025-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-02061-1
PMID:39948301
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和机器学习方法，探索线粒体自噬在食管癌亚型分型和预后中的作用 | 首次将线粒体自噬相关基因与食管癌分子分型相结合，并利用机器学习算法识别核心基因构建预后模型 | 研究基于公共数据库数据，需要进一步实验验证 | 阐明线粒体自噬在食管癌中的分子机制并开发预后预测模型 | 食管癌患者 | 机器学习 | 食管癌 | RNA测序，单细胞测序 | LASSO回归，随机森林，XGBoost，多元COX回归 | 基因表达数据 | TCGA数据库中的食管癌患者数据及两个外部验证队列 | NA | 单细胞RNA测序，bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2300 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals sex differences in the subcellular composition and associated gene-regulatory network activity of human carotid plaques
2025-Apr, Nature cardiovascular research
IF:9.4Q1
DOI:10.1038/s44161-025-00628-y
PMID:40211055
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类颈动脉斑块在亚细胞组成和基因调控网络活性方面的性别差异 | 首次在单细胞水平系统揭示颈动脉斑块中性别特异的细胞表型和基因调控网络差异 | 样本量相对有限，仅分析了7,690个细胞 | 探究颈动脉斑块形成中的性别差异机制 | 人类颈动脉斑块细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7,690个颈动脉斑块细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |