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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2026-04-24 |
Histone lactylation maintains bovine early embryo development via regulating embryonic genome activation
2026-Apr-23, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-026-01398-8
PMID:42021385
|
研究论文 | 研究组蛋白乳酸化修饰通过调控胚胎基因组激活来维持牛早期胚胎发育 | 首次揭示组蛋白乳酸化修饰在牛早期胚胎发育中的作用及其通过调控胚胎基因组激活影响胚胎发育的机制,并发现β-烟酰胺单核苷酸可逆转抑制效应 | 未提及具体局限性 | 探究组蛋白乳酸化修饰对牛早期胚胎发育的影响及其机制 | 牛体外受精胚胎 | 数字病理学 | 生殖疾病 | 单细胞RNA测序、5-乙炔尿苷染色 | NA | 基因表达数据 | 牛体外受精胚胎(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2282 | 2026-04-24 |
Immune Mediators in Birdshot Chorioretinopathy: A Systematic Review
2026-Apr-23, Ocular immunology and inflammation
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/09273948.2026.2655441
PMID:42023421
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综述 | 系统综述了麻雀脉络膜视网膜病变(BSCR)中的免疫介质及其作为生物标志物或治疗靶点的潜力 | 首次系统整合BSCR中细胞因子、趋化因子和免疫细胞群的证据,并强调Th17、CD8+和NK细胞在发病机制中的作用 | 纳入研究数量有限(14项),且多为小样本研究;缺乏足够的多组学数据整合 | 评估BSCR中免疫介质的表达及其作为生物标志物或治疗靶点的潜在价值 | BSCR患者的外周血、房水和玻璃体液样本 | 数字病理学 | 麻雀脉络膜视网膜病变 | RNA测序 | NA | 文本 | 纳入14项研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2283 | 2026-04-24 |
The MIF-CD74 axis drives colorectal cancer via glycolytic reprogramming and is targeted by a novel small-molecule inhibitor
2026-Apr-22, Cellular oncology (Dordrecht, Netherlands)
DOI:10.1007/s13402-026-01202-9
PMID:42018204
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研究论文 | 揭示MIF-CD74轴通过糖酵解重编程驱动结直肠癌进展,并鉴定出一种新型小分子抑制剂 | 首次阐明MIF-CD74轴通过上调糖酵解酶促进结直肠癌瓦博格效应的新机制,并发现新型高效抑制剂F3277-0933 | 未在更大规模临床队列中验证抑制剂疗效,且体外实验向临床转化仍需进一步研究 | 研究MIF在结直肠癌代谢重编程中的作用机制及其靶向治疗潜力 | 结直肠癌组织样本、细胞系及小鼠模型 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞测序、虚拟筛选、功能实验 | NA | 单细胞测序数据、临床样本数据、药物筛选数据 | TCGA/GTEx/CPTAC/HPA数据库数据及临床样本验证 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞测序分析数据集GSE166555和GSE144735 |
| 2284 | 2026-04-24 |
Cell migration inducing protein alleviates adverse remodeling after ischemia and reperfusion injury by controlling fibroblast activation
2026-Apr-22, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvag086
PMID:42019016
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研究论文 | 探究细胞迁移诱导蛋白在控制成纤维细胞活化后减轻缺血再灌注损伤后不良重塑的作用 | 首次揭示CEMIP通过调节透明质酸周转和抑制成纤维细胞向肌成纤维细胞转化,在心肌梗死后愈合中发挥保护作用 | 仅使用全球Cemip敲除小鼠模型,未在特定细胞类型中验证,且机制研究主要基于体外实验 | 研究CEMIP在心肌梗死后心脏重塑中的功能及其潜在治疗靶点 | 小鼠心肌缺血再灌注损伤模型及心脏成纤维细胞 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞基因表达数据 | 小鼠心脏样本,具体数量未提及 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2285 | 2026-04-24 |
SPP1+ macrophage-driven interactions shape the tumor microenvironment in lymph node metastatic acral melanoma
2026-Apr-22, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-026-08755-5
PMID:42020397
|
研究论文 | 通过对淋巴结转移性肢端黑色素瘤进行单细胞RNA测序,揭示SPP1+巨噬细胞驱动的肿瘤微环境重塑及其在转移中的作用 | 首次在肢端黑色素瘤中系统描绘肿瘤微环境在淋巴结转移中的单细胞层面变化,发现SPP1巨噬细胞通过自分泌扩增及SPP1-CD44轴与S100A8黑色素瘤细胞相互作用,并验证了抗SPP1治疗的治疗潜力 | 样本量有限(需结合独立验证队列),功能性验证主要依赖体外和体内实验,尚需进一步临床转化验证 | 阐明肿瘤微环境在肢端黑色素瘤淋巴结转移中的作用机制 | 肢端黑色素瘤患者的肿瘤组织和配对正常组织(伴或不伴淋巴结转移) | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 治疗初治肢端黑色素瘤患者的肿瘤及配对正常样本,涉及淋巴结转移与非转移病例的比较 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 2286 | 2026-04-24 |
Predictive model for clear cell renal cell carcinoma: a novel model integrating sunitinib resistance and prognosis related genes and clinical factors
2026-Apr-22, Clinical & translational oncology : official publication of the Federation of Spanish Oncology Societies and of the National Cancer Institute of Mexico
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12094-026-04357-x
PMID:42020680
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研究论文 | 开发一种整合舒尼替尼耐药性、预后相关基因和临床因素的列线图模型,用于预测肾透明细胞癌患者的药物敏感性、治疗反应和生存结果 | 首次将舒尼替尼耐药相关基因(IFITM1、IMPA2、KCNN3)与临床因素整合,构建临床基因预后列线图模型(CGPNM),实现药物敏感性、治疗反应和生存结果的综合预测 | 摘要未提及研究的局限性 | 识别与肾透明细胞癌舒尼替尼耐药和预后相关的关键基因,并开发一个整合基因和临床因素的临床基因预后列线图模型 | 肾透明细胞癌(ccRCC)患者 | 机器学习 | 肾透明细胞癌 | RNA-seq | 列线图模型 | 基因表达数据、临床因素数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2287 | 2026-04-24 |
Imputing causality and clonal dynamics from single-cell transcriptomics in paroxysmal nocturnal hemoglobinuria
2026-Apr-22, Leukemia
IF:12.8Q1
DOI:10.1038/s41375-026-02914-5
PMID:42020783
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞,揭示PIGA突变干细胞的克隆动态和因果关系 | 首次从单细胞转录组层面解析PNH患者中正常造血干细胞与PNH型造血干细胞在骨髓衰竭背景下的差异表达模式,以及免疫负向选择对正常造血干细胞的影响 | 样本量较小,仅纳入PNH细胞比例较大(>50%)和较小(10-50%)的两组患者,可能无法完全反映疾病异质性 | 探究阵发性睡眠性血红蛋白尿症中PIGA突变干细胞的克隆扩增机制及骨髓衰竭的病理生理学 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | 阵发性睡眠性血红蛋白尿症患者,根据PNH细胞比例分为大(>50%)和小(10-50%)两组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2288 | 2026-04-24 |
Reference-free discovery with barcoded single-cell sequencing
2026-Apr-22, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-026-03084-6
PMID:42020848
|
研究论文 | 提出sc-SPLASH方法,用于条形码单细胞RNA测序和空间转录组的无参考发现,能高效揭示转录组变异 | 首次实现基于统计的无参考发现方法sc-SPLASH,独立BKC子模块优化条形码数据预处理,速度比UMI-tools快约50倍,并能在海绵和海鞘等无参考物种中检测分泌重复蛋白 | 本文未明确提及方法在复杂样本或高噪声数据中的性能限制,以及可能对低表达转录本的敏感性 | 开发无需参考基因组的单细胞RNA测序和空间转录组变异发现方法 | 海绵(Spongilla)和海鞘(Ciona)的免疫样细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据 | 未提供具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2289 | 2026-04-24 |
Dysfunction of the neurovascular unit as a temporal driver in Alzheimer's pathogenesis
2026-Apr-22, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-026-00548-2
PMID:42021347
|
综述 | 系统回顾了阿尔茨海默病进展中神经血管单元功能障碍的作用,以及空间转录组学和类器官技术在NVU研究中的应用 | 强调神经血管单元功能障碍可能是阿尔茨海默病发病的早期驱动因素,并整合三维NVU类器官、单细胞分辨率空间转录组学和人工智能技术构建功能结构模型的新视角 | 未明确提及本综述的局限性,但可能受限于现有研究数据的完整性和技术进步的速度 | 系统梳理神经血管单元功能障碍在阿尔茨海默病进展中的时序作用及相关技术应用 | 神经血管单元功能障碍事件,包括内皮细胞紧密连接损伤、周细胞退化、星形胶质细胞和小胶质细胞激活、神经元凋亡,以及Aβ沉积与NVU功能障碍的协同作用 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 空间转录组学, 类器官技术, 人工智能, 机器学习, 深度学习 | NA | 文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | 单细胞分辨率空间转录组学 |
| 2290 | 2026-04-24 |
Single-cell and spatial transcriptomics in Phragmites australis reveal the association of B chromosomes with plant invasiveness
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04079-x
PMID:42021342
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和比较基因组学,构建了芦苇的单细胞图谱,发现B染色体与植物入侵性相关 | 首次在非模式入侵植物中构建细胞类型分辨的分子图谱,并揭示B染色体基因在入侵种群中拷贝数扩增且差异表达 | 未提供明确的局限性信息 | 阐明入侵植物芦苇的分子和基因组机制,特别是B染色体在入侵过程中的作用 | 芦苇(Phragmites australis)的入侵种群(北美)和本地种群(欧洲) | machine learning | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、比较基因组学 | NA | 基因表达数据 | 欧洲本地种群和北美入侵种群的普通花园栽培样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2291 | 2026-04-24 |
Single-cell analysis highlights the role of CD4+ IFN-I-related T cells in Behcet's uveitis during Interferonα-2a therapy
2026-Apr-22, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-026-00810-7
PMID:42021381
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研究论文 | 通过单细胞分析揭示CD4+ IFN-I相关T细胞在贝赫切特病葡萄膜炎患者接受干扰素α-2a治疗中的作用 | 首次从单细胞水平阐明IFNα-2a通过恢复CD4+ IFN-I相关T细胞频率并调控LLT1-CD161相互作用抑制NK细胞炎症表型的治疗机制 | 未说明具体局限性 | 探究IFNα-2a治疗通过免疫细胞调节对活动性贝赫切特病葡萄膜炎的疗效机制 | 活动性贝赫切特病葡萄膜炎患者、治疗后患者、健康对照的外周血单核细胞及CD4+ T细胞 | 机器学习和数字病理学 | 贝赫切特病 | 单细胞RNA测序、批量mRNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括12例活动性BD患者、治疗后BD患者及健康对照的外周血样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'测序 |
| 2292 | 2026-04-24 |
Machine learning predictions surpass individual mRNAs as a proxy of single-cell protein expression
2026-Apr-22, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-026-04083-1
PMID:42021407
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研究论文 | 比较九种机器学习方法从单细胞RNA测序数据推断蛋白质表达的能力,发现机器学习预测优于单独使用mRNA作为蛋白质表达代理 | 系统评估多种机器学习方法在单细胞层面预测蛋白质表达的性能,揭示全转录组模式的预测能力优于直接mRNA推断 | 模型泛化能力有限,要求训练数据与测试数据的细胞类型组成高度相似,当前应用范围受限 | 评估机器学习方法替代mRNA作为单细胞蛋白质表达代理的可行性 | 单细胞RNA测序数据及其对应的表面蛋白质表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 机器学习方法(9种) | 单细胞RNA测序数据、蛋白质表达数据 | 多数据集及组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2293 | 2026-04-24 |
Heterogeneity of bacterial host-pathogen interactions across biological scales
2026-Apr-21, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/msystems.01804-25
PMID:41914736
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综述 | 本文综述了单细胞技术如何揭示宿主-病原体相互作用的动态和异质性,探讨了从单细胞到组织和整个生物体的多尺度感染结果 | 整合了显微成像、单细胞转录组学、蛋白质组学及新兴的双RNA-seq和空间方法,强调多尺度异质性在决定感染结局中的关键作用 | 未明确讨论跨尺度模型整合的计算挑战及临床转化中的实际限制 | 理解宿主-病原体相互作用的异质性及其对感染结局的影响 | 细菌病原体与宿主细胞之间的相互作用 | 机器学习 | 感染性疾病 | 单细胞RNA-seq, 蛋白质组学, 双RNA-seq, 空间转录组学 | 计算与数学建模 | 转录组数据, 蛋白质组数据, 空间数据 | 不适用 | 不适用 | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 不适用 | 不适用 |
| 2294 | 2026-04-24 |
Hypoxia inducible factor network reflects kidney disease progression in diabetes and sodium-glucose co-transporters inhibition
2026-Apr-21, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02653-0
PMID:42009641
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示糖尿病肾病患者中缺氧诱导因子网络反映疾病进展及SGLT2抑制剂治疗反应 | 首次通过单细胞转录组数据构建启动子锚定的HIF调控网络,并使用多组学数据验证,实现对糖尿病肾病的进展和治疗反应的量化评估 | 该研究未明确提及具体局限性,但可能包括样本来源有限(主要为年轻2型糖尿病患者)以及网络在更广泛人群中的验证仍需进一步研究 | 探讨缺氧诱导因子网络如何反映糖尿病肾病的进展以及SGLT2抑制剂的治疗效果 | 患有2型糖尿病的年轻人(临床DKD证据极少)、晚期DKD患者(来自KPMP项目)以及缺氧人肾类器官模型 | 计算生物学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序、多组学分析、空间转录组学 | 调控网络模型 | 单细胞转录组数据、表观基因组数据(多组学)、空间转录组数据 | 未在摘要中明确样本量,但提及年轻T2D患者、KPMP项目参与者以及肾类器官模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2295 | 2026-04-24 |
Glo1 promotes glioma progression by modulating Sox2 transcriptional networks in glioma stem-like cells
2026-Apr-20, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noag090
PMID:42011505
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和功能基因组学等方法,发现Glo1通过调节Sox2转录网络促进胶质瘤干细胞驱动的肿瘤进展 | 首次揭示Glo1在胶质瘤干细胞中的功能及其通过Sox2转录网络的调控机制,并验证了药理学抑制Glo1的治疗潜力 | 未提及是否在更大队列中验证Glo1的临床相关性,以及Sox2下游具体靶基因的深入解析 | 探究Glo1在胶质瘤干细胞中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 胶质瘤干细胞和小鼠模型 | 机器学习 | 胶质瘤 | 单细胞转录组测序、功能基因组学、体外实验、患者来源异种移植模型、子宫内电穿孔模型 | NA | 单细胞转录组数据、临床数据 | 人类和小鼠胶质母细胞瘤模型的单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2296 | 2026-04-24 |
CD44 expression in renal tubules during maladaptive repair is a potential marker for the transition from acute kidney injury to chronic kidney disease in rats
2026-Apr-20, Toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.tox.2026.154473
PMID:42019744
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研究论文 | 本研究探讨了大鼠急性肾损伤向慢性肾病转化过程中肾小管CD44的表达及其作为不良修复标志物的潜力 | 首次系统揭示了CD44在急性肾损伤向慢性肾病转化过程中的动态表达模式,并发现血清CD44可能成为顺铂肾毒性中肾小管不良修复的循环标志物 | 该研究仅在大鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证其临床相关性 | 探索CD44作为急性肾损伤向慢性肾病转化过程中肾小管不良修复标志物的可能性 | 大鼠肾小管上皮细胞 | 机器学习 | 肾病 | 基因芯片分析、单细胞RNA测序、免疫组织化学 | NA | 基因表达数据、组织病理图像 | 大鼠模型,具体样本数量未列出 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 小鼠缺血再灌注模型单细胞RNA测序分析 |
| 2297 | 2026-04-24 |
Time-series single-cell transcriptomics and spatial metabolomics reveal spatiotemporal tobacco leaf response to herbivory
2026-Apr-17, Journal of advanced research
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jare.2026.04.048
PMID:42002027
|
研究论文 | 通过时间序列单细胞转录组学和空间代谢组学揭示烟草叶片应对草食动物取食的时空响应机制 | 首次构建了烟草叶片草食胁迫下的单细胞分辨率动态防御网络,并鉴定了WRKY81作为早期防御启动的关键调控因子 | 未详细说明局限性,但从方法看可能包括VIGS验证的瞬时性及代谢物空间分布的检测精度限制 | 解析烟草叶片对草食动物取食防御反应在细胞类型和时间尺度上的调控机制 | 模拟草食胁迫下的烟草叶片细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学、共表达分析、伪时间分析、配体-受体推断、qRT-PCR、VIGS | NA | 单细胞转录组数据、空间代谢物分布数据 | 28,318个烟草叶片细胞 | NA | 单细胞RNA测序、空间代谢组学 | NA | NA |
| 2298 | 2026-04-24 |
Integrated spatial and single‑cell transcriptomics maps disulfidptosis in renal cell carcinoma and reveals PDLIM1 as a prognostic biomarker and potential therapeutic target
2026-Apr-14, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102765
PMID:41985321
|
研究论文 | 整合空间和单细胞转录组学绘制肾细胞癌中二硫下垂的图谱,并揭示PDLIM1作为预后生物标志物和潜在治疗靶点 | 首次在肾细胞癌中综合空间转录组学和单细胞RNA测序,系统绘制二硫下垂的异质性图谱,并鉴定PDLIM1作为新的预后生物标志物和治疗靶点 | 尚未在独立大样本队列中验证PDLIM1的临床价值,缺乏体内功能验证实验 | 阐明肾细胞癌中二硫下垂的组织分布及其临床相关性,并鉴定潜在生物标志物和治疗靶点 | 肾细胞癌组织样本(6例空间转录组学样本、4个单细胞RNA测序队列)和肾癌细胞系 | 机器学习 | 肾细胞癌 | 空间转录组学, 单细胞RNA测序, RCTD反卷积, CytoTRACE分析, sh-RNA敲降 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 6个肾癌切片的空间转录组数据和4个单细胞RNA测序队列 | NA | 空间转录组学, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2299 | 2026-04-24 |
STC2-mediated calcium homeostasis dysregulation in the osteosarcoma microenvironment: Insights from single-cell sequencing and machine learning
2026-Apr-14, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2026.102763
PMID:41985319
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研究论文 | 通过单细胞测序和机器学习分析,揭示STC2介导的钙稳态失调在骨肉瘤微环境中的作用 | 首次结合单细胞测序和多种机器学习算法,识别STC2作为骨肉瘤中钙稳态失调的关键预后基因,并探讨其在免疫治疗反应中的潜在预测价值 | STC2与免疫检查点抑制剂反应之间的关联仍需要进一步验证 | 探究钙稳态失调在骨肉瘤进展中的作用,并识别关键预后基因 | 骨肉瘤细胞系(U2OS和143B)以及骨肉瘤微环境中的内皮细胞、成纤维细胞和恶性细胞 | 机器学习和数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞测序 | 机器学习算法 | 单细胞表达谱数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2300 | 2026-04-24 |
[Preliminary study on the role of IL-1β+ neutrophils in bone regulation of periodontitis mice]
2026-Apr-09, Zhonghua kou qiang yi xue za zhi = Zhonghua kouqiang yixue zazhi = Chinese journal of stomatology
|
研究论文 | 本研究探讨白细胞介素-1β阳性中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 | 首次揭示IL-1β+中性粒细胞通过TLR4-NF-κB信号通路抑制MC3T3-E1细胞成骨分化,为牙周炎骨再生免疫治疗提供新靶点 | 未提及明显局限性 | 探究IL-1β+中性粒细胞在牙周炎小鼠骨调控中的作用及机制 | 牙周炎小鼠模型及MC3T3-E1细胞 | 数字病理学 | 牙周炎 | 单细胞转录组测序, Micro-CT, 流式细胞术 | NA | 图像, 文本 | 20只8周龄雄性C57BL/6J小鼠 | Illumina | 单细胞RNA测序 | NA | NA |