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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2281 | 2026-03-06 |
Comprehensive multi-omics single-cell data integration reveals greater heterogeneity in the human immune system
2022-Oct-21, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.105123
PMID:36185375
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SuPERR的新型分析工作流程,用于整合多组学单细胞数据,以提高人类免疫系统中细胞类型识别的分辨率和准确性 | 开发了SuPERR工作流程,通过整合转录组、蛋白质组和细胞受体库信息,首次实现了更精确的细胞聚类和隐藏细胞亚群的发现,同时有效去除细胞双联体和防止细胞类型误分类 | NA | 提高多组学单细胞数据集中细胞类型识别的分辨率和分类准确性,以揭示人类免疫系统中更大的异质性 | 人类免疫系统细胞,包括骨髓中的抗体分泌细胞稀有亚群 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学、蛋白质组学、细胞受体库分析 | NA | 单细胞多组学数据(转录组、蛋白质组、细胞受体库) | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2282 | 2026-03-06 |
Early life stress exacerbates obesity in adult female mice via mineralocorticoid receptor-dependent increases in adipocyte triglyceride and glycerol content
2022-Sep-01, Life sciences
IF:5.2Q1
DOI:10.1016/j.lfs.2022.120718
PMID:35714704
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研究论文 | 本研究探讨了早期生活压力通过盐皮质激素受体依赖机制加剧成年雌性小鼠肥胖,特别是通过增加脂肪细胞甘油三酯和甘油含量 | 揭示了早期生活压力(MSEW)通过盐皮质激素受体(MR)介导的机制,影响脂肪细胞甘油外流和甘油三酯储存,从而加剧肥胖的新途径 | 研究仅针对雌性小鼠,未涉及雄性;且主要关注内脏脂肪(gWAT),其他脂肪库的影响未明确 | 探究早期生活压力对脂肪组织稳态功能的具体影响,以及盐皮质激素受体在介导肥胖反应中的作用 | 雌性小鼠的性腺白色脂肪组织(gWAT) | NA | 肥胖 | 脂质组学、转录组学、单细胞RNA测序、体外脂解实验 | NA | 脂质组学数据、转录组学数据、单细胞RNA测序数据 | 未明确具体样本数量,但涉及肥胖雌性MSEW小鼠与对照组的比较 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2283 | 2026-03-06 |
NFkB-signaling promotes glial reactivity and suppresses Müller glia-mediated neuron regeneration in the mammalian retina
2022-07, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24181
PMID:35388544
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研究论文 | 本研究探讨了NFkB信号通路在哺乳动物视网膜中如何影响胶质细胞对损伤的反应以及Müller胶质细胞向神经元重编程的过程 | 揭示了NFkB信号在损伤后Müller胶质细胞中的激活作用,并证明抑制NFkB能增强Ascl1过表达的Müller胶质细胞向神经元样细胞的重编程 | 研究主要基于啮齿动物视网膜模型,可能无法完全反映人类视网膜的再生机制 | 探究NFkB信号通路在调节哺乳动物视网膜Müller胶质细胞介导的神经元再生中的作用 | 啮齿动物视网膜中的Müller胶质细胞 | 神经再生 | 视网膜损伤 | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2284 | 2026-03-06 |
Fetal vs adult megakaryopoiesis
2022-06-02, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020009301
PMID:35108353
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综述 | 本文综述了胎儿与成人巨核细胞生成的差异,探讨其分子机制、发育调控及临床意义 | 挑战传统观念,提出胎儿和新生儿巨核细胞生成具有发育独特的增殖、多倍体化和细胞质成熟解耦特征,而非“不成熟”,并强调单细胞RNA测序技术对巨核细胞亚群功能分化的新见解 | NA | 比较胎儿与成人巨核细胞生成的生物学差异,并探讨其分子机制和临床相关性 | 胎儿、新生儿和成人的巨核细胞及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2285 | 2026-03-06 |
Decoding the pathogenesis of Diamond-Blackfan anemia using single-cell RNA-seq
2022-May-10, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00389-z
PMID:35534476
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA-seq技术分析了Diamond-Blackfan贫血(DBA)患者的纯化红细胞祖细胞转录组,揭示了红细胞祖细胞周期异常与DBA发病机制的关联,并发现干扰素介导的细胞周期控制是糖皮质激素临床疗效的基础 | 首次在单细胞水平上解码DBA的发病机制,揭示了红细胞祖细胞在S期进入时面临复制压力并激活P53信号通路,同时发现干扰素通路在治疗响应中的作用,为DBA提供了新的替代治疗策略 | 研究样本量有限,且主要基于转录组分析,未深入探讨蛋白质水平或体内验证,可能影响结论的普适性 | 解码Diamond-Blackfan贫血的发病机制,并探索新的治疗策略 | DBA患者的纯化红细胞祖细胞,分为未治疗、糖皮质激素响应和非响应三组 | 数字病理学 | 贫血 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | 来自DBA患者骨髓的纯化红细胞祖细胞样本,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2286 | 2026-03-06 |
Where Are They Now: Spatial and Molecular Diversity of Tissue-Resident Macrophages in the Kidney
2022-05, Seminars in nephrology
IF:2.8Q2
DOI:10.1016/j.semnephrol.2022.10.002
PMID:36435683
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综述 | 本文综述了肾脏驻留巨噬细胞(KRMs)在肾脏中的空间和分子多样性,及其在稳态、疾病和修复中的作用 | 利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了KRMs的异质性,识别了分子、功能和空间上不同的亚群及其在肾损伤后的动态变化 | NA | 探讨肾脏驻留巨噬细胞的多样性和功能,以促进肾脏疾病的治疗和肾脏健康 | 肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 2287 | 2026-03-06 |
Urine Single-Cell RNA Sequencing in Focal Segmental Glomerulosclerosis Reveals Inflammatory Signatures
2022-Feb, Kidney international reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.ekir.2021.11.005
PMID:35155868
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研究论文 | 本研究利用尿液单细胞RNA测序技术,揭示了局灶节段性肾小球硬化症患者尿液细胞中的炎症特征和足细胞上皮-间质转化特征 | 首次在FSGS患者尿液中进行单细胞RNA测序分析,识别出单细胞亚型和足细胞特异性表达特征,并验证了这些特征在肾活检组织中的表达差异 | 样本量较小(12名患者,17份尿液样本),且为横断面研究,无法追踪疾病进展过程中的动态变化 | 探索FSGS患者尿液细胞中的疾病相关分子特征,评估尿液细胞分析作为诊断和预后工具的潜力 | 局灶节段性肾小球硬化症患者的尿液细胞 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 12名FSGS患者,共17份尿液样本,捕获为23个尿液细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2288 | 2026-03-06 |
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk3070
PMID:34793243
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研究论文 | 本研究应用单细胞多组学技术,分析了四种主要HLA I类等位基因下CD8 T细胞对SARS-CoV-2的应答特征 | 首次统一表征了不同HLA I类等位基因如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的表位特异性、TCR多样性和记忆T细胞库的利用 | 仅关注了四种主要HLA I类等位基因,可能未涵盖所有遗传变异的影响 | 探究HLA I类等位基因变异如何塑造CD8 T细胞对SARS-CoV-2的免疫应答和记忆反应 | SARS-CoV-2感染相关的CD8 T细胞 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组和TCR序列数据 | 未明确指定样本数量,但涉及四种HLA I类等位基因的CD8 T细胞分析 | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 2289 | 2026-03-06 |
IL-17 Producing Lymphocytes Cause Dry Eye and Corneal Disease With Aging in RXRα Mutant Mouse
2022, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2022.849990
PMID:35402439
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研究论文 | 本研究探讨了RXRα突变小鼠中IL-17相关机制在干眼病发展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序结合流式细胞术和共聚焦显微镜,揭示了RXRα突变导致γδ T细胞中IL-17表达增加,从而促进干眼病发展的机制 | 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且未探讨其他免疫细胞类型在干眼病中的潜在作用 | 研究RXRα突变小鼠中IL-17相关机制如何导致干眼病和角膜疾病 | Pinkie小鼠(RXRα功能缺失突变)和野生型C57BL/6小鼠的角膜、结膜组织及免疫细胞 | 数字病理学 | 干眼病 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、流式细胞术、共聚焦显微镜 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | Pinkie小鼠和野生型C57BL/6小鼠的角膜和结膜组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2290 | 2026-03-06 |
A Spatial Quantitative Systems Pharmacology Platform spQSP-IO for Simulations of Tumor-Immune Interactions and Effects of Checkpoint Inhibitor Immunotherapy
2021-Jul-26, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers13153751
PMID:34359653
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研究论文 | 本文介绍了一个名为spQSP-IO的混合计算模型平台,用于模拟肿瘤-免疫相互作用及检查点抑制剂免疫疗法的效果 | 开发了结合定量系统药理学模型和基于代理的空间模型的新平台,以整合空间数据并增强预测能力 | 未明确提及具体数据限制或模型验证的局限性 | 研究肿瘤微环境和癌症-免疫细胞相互作用在肿瘤发展中的作用,并评估抗PD-1治疗的效果 | 非小细胞肺癌的虚拟患者模型 | 机器学习 | 肺癌 | 定量系统药理学模型、基于代理的模型、空间转录组学 | 混合计算模型 | 空间数据、成像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2291 | 2026-03-06 |
Fxr signaling and microbial metabolism of bile salts in the zebrafish intestine
2021-07, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abg1371
PMID:34301599
|
研究论文 | 本研究通过斑马鱼模型,揭示了胆汁盐代谢和Fxr信号通路在非哺乳类脊椎动物中的保守性及微生物修饰作用 | 首次在斑马鱼中系统解析了胆汁盐合成、转运及微生物修饰的全过程,并利用单细胞RNA测序构建了肠道上皮细胞图谱,明确了Fxr在回肠及其他细胞类型中的转录调控功能 | 研究主要基于斑马鱼模型,结果向哺乳动物的直接推演可能存在物种差异,且微生物修饰的具体机制仍需进一步探索 | 探究非哺乳类脊椎动物中胆汁盐代谢和Fxr信号通路的保守性与调控机制 | 斑马鱼的肝脏、肠道及肠道微生物 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2292 | 2026-03-06 |
Testicular germ cell tumors arise in the absence of sex-specific differentiation
2021-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.197111
PMID:33912935
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研究论文 | 本研究探讨了睾丸生殖细胞肿瘤的起源机制,发现NANOS2缺失导致生殖细胞无法进行性别特异性分化,从而驱动肿瘤发生 | 揭示了NANOS2作为关键内在因子,在连接遗传风险因素与肿瘤易感性中的核心作用,并首次通过单细胞RNA测序和谱系追踪证明胚胎癌细胞仅来源于NANOS2缺失的生殖细胞 | 研究基于小鼠模型(129.MOLF-Chr19),可能不完全反映人类睾丸生殖细胞肿瘤的复杂性 | 探究睾丸生殖细胞肿瘤的起始机制,特别是性别特异性分化失败在肿瘤发生中的作用 | 小鼠睾丸生殖细胞,包括NANOS2缺失的生殖细胞和胚胎癌细胞 | 生殖生物学与肿瘤学 | 睾丸生殖细胞肿瘤 | 单细胞RNA测序,谱系追踪实验 | NA | RNA测序数据 | 使用129.MOLF-Chr19小鼠模型和NANOS2报告等位基因 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2293 | 2026-03-06 |
Expression of SARS-CoV-2 Entry Factors in the Pancreas of Normal Organ Donors and Individuals with COVID-19
2020-12-01, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.11.005
PMID:33207244
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研究论文 | 本研究通过分析公共单细胞RNA测序数据和实验验证,探讨了SARS-CoV-2进入因子ACE2在正常和COVID-19患者胰腺中的表达模式 | 首次结合公共scRNA-seq数据集和多种实验技术(如荧光原位杂交、Western blotting)系统验证ACE2在人类胰腺中的表达分布,并发现其在COVID-19患者胰腺中的局限性表达 | 研究主要基于公共数据集和有限的患者样本,可能无法完全代表所有COVID-19相关糖尿病病例 | 探究SARS-CoV-2感染是否通过ACE2直接侵袭胰腺内分泌细胞,从而引发糖尿病 | 正常器官捐献者和COVID-19患者的胰腺组织 | 数字病理学 | COVID-19 | scRNA-seq, 荧光原位杂交, Western blotting, 免疫定位 | NA | 单细胞RNA测序数据, 图像数据 | 五个公共scRNA-seq数据集及COVID-19病例的胰腺组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2294 | 2026-03-06 |
Hydro-Seq enables contamination-free high-throughput single-cell RNA-sequencing for circulating tumor cells
2019-05-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10122-2
PMID:31092822
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Hydro-Seq的可扩展流体动力学单细胞RNA测序条形码技术,用于高通量循环肿瘤细胞分析 | Hydro-Seq技术具有高细胞捕获效率和污染去除能力,能够成功对21名乳腺癌患者样本中的666个CTC进行高通量单细胞RNA测序 | NA | 开发一种用于循环肿瘤细胞高通量单细胞RNA测序的技术,以解决CTC稀缺和血细胞大量污染的问题 | 循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 21名乳腺癌患者样本中的666个CTC | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2295 | 2026-03-05 |
MyD88 Deficiency Protects Mice From Experimental Autoimmune Encephalomyelitis by Influencing Both Dendritic Cells and T Cells
2026-Apr, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.70079
PMID:41363121
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研究论文 | 本研究探讨了MyD88在实验性自身免疫性脑脊髓炎(EAE)中的作用,特别是其对树突状细胞和T细胞的影响 | 通过重新分析多发性硬化症(MS)患者的单细胞RNA测序数据,揭示了MYD88在DC和CD4 T细胞中的显著上调,并发现Myd88缺失会减少DC与T细胞簇的相互作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,在人类MS患者中的直接验证有限 | 阐明MyD88信号在MS和EAE发病机制中的具体贡献,特别是在不同细胞类型中的作用 | 小鼠模型(EAE)、树突状细胞(DCs)、T细胞(包括Th1和Th17细胞) | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2296 | 2026-03-05 |
Nafamostat Mesylate Protects Against Acute Renal Ischemia-Reperfusion Injury by Alleviating Mitochondrial Dysfunction, Inhibiting Ferroptosis, and Regulating Proximal Tubular Cells: A Multi-Omics Analysis
2026-Apr, Therapeutic apheresis and dialysis : official peer-reviewed journal of the International Society for Apheresis, the Japanese Society for Apheresis, the Japanese Society for Dialysis Therapy
IF:1.5Q3
DOI:10.1002/1744-9987.70112
PMID:41436801
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研究论文 | 本研究探讨了甲磺酸萘莫司他对缺血再灌注诱导的急性肾损伤的保护作用及其机制 | 首次通过多组学分析(包括RNA测序和单细胞测序)揭示甲磺酸萘莫司他通过调节线粒体功能、抑制铁死亡和调控近端肾小管细胞来保护肾脏 | 研究仅基于大鼠模型,样本量较小(21只),且未涉及长期效果或临床验证 | 探索甲磺酸萘莫司他在缺血再灌注诱导的急性肾损伤中的作用机制 | 雄性大鼠的肾脏组织 | NA | 急性肾损伤 | RNA测序,单细胞测序,KEGG和GO富集分析 | NA | RNA序列数据 | 21只雄性大鼠 | NA | RNA-seq,单细胞测序 | NA | NA |
| 2297 | 2026-03-05 |
Inhibiting VTCN1 Overcomes Immunosuppression in Colorectal Cancer to Activate T Cells via Galectin-3
2026-Mar-04, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00323.2025
PMID:41778365
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研究论文 | 本研究通过整合多组学框架揭示了结直肠癌中VTCN1-galectin-3轴介导免疫抑制的机制,并验证了VTCN1抑制剂SGN-B7H4通过下调galectin-3激活T细胞、抑制肿瘤进展的治疗潜力 | 首次整合单细胞测序、转录组学和蛋白质组学系统阐明VTCN1-galectin-3轴在结直肠癌免疫抑制中的作用机制,并发现VTCN1抑制剂能显著下调T细胞中galectin-3表达 | 研究主要基于临床前模型,尚未开展人体临床试验验证疗效;免疫抑制机制可能涉及其他未探索的分子通路 | 阐明结直肠癌中VTCN1和galectin-3介导免疫抑制的分子机制,并评估靶向该通路的治疗策略 | 结直肠癌细胞系、T细胞及小鼠肿瘤模型 | 肿瘤免疫学 | 结直肠癌 | 单细胞测序、转录组学、蛋白质组学、划痕实验、Transwell侵袭实验 | NA | 单细胞测序数据、转录组数据、蛋白质组数据、细胞功能实验数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 2298 | 2026-03-05 |
Self-reinforcing IL-1b signaling accelerates the development and recurrence of TCF3::HLF-positive B-ALL
2026-Mar-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025031521
PMID:41774513
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研究论文 | 本文通过新建立的小鼠模型,揭示了TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病中自我强化的IL-1β信号网络是疾病进展和复发的核心驱动因素 | 首次发现TCF3::HLF直接结合IL1B基因座内的内含子调控元件,并利用单细胞RNA-seq证实IL1B在患者复发时显著诱导,突出了IL-1β阻断作为潜在治疗策略的临床相关性 | 研究主要基于小鼠模型和患者样本分析,尚未进行大规模临床试验验证IL-1β阻断疗法的有效性 | 探究TCF3::HLF阳性B-ALL的发病机制和潜在治疗靶点 | TCF3::HLF阳性B细胞急性淋巴细胞白血病小鼠模型和患者样本 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA-seq、表观遗传学分析 | NA | RNA-seq数据、表观遗传数据 | 患者样本(诊断与复发对比) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2299 | 2026-03-05 |
SEAL: Semantic-Aware Contrastive Learning for scRNA-seq clustering
2026-Mar-03, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3669981
PMID:41774662
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEAL的语义感知对比学习方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 通过随机掩蔽基因表达生成数据增强,并利用伪标签的语义信息进行对比学习,以捕获跨增强的语义不变表示,从而提高聚类性能 | 未明确讨论方法在高噪声或高丢失率数据下的具体局限性,也未与其他最新方法进行广泛比较 | 开发一种更稳定的单细胞RNA测序数据聚类方法,以准确区分不同细胞类型 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2300 | 2026-03-05 |
Vascular bundle plasticity and cellular heterogeneity drive asymmetric carbon partitioning in maize nodes
2026-Mar-03, Journal of experimental botany
IF:5.6Q1
DOI:10.1093/jxb/erag120
PMID:41774775
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研究论文 | 本研究结合组织学、荧光示踪和单细胞RNA测序,揭示了玉米基部节在异质磷供应下通过维管束可塑性和细胞异质性介导不对称碳分配的机制 | 首次在单细胞分辨率上揭示了玉米节点响应异质磷供应的维管束结构可塑性和细胞类型特异性转录重编程,并发现海藻糖-6-磷酸可能通过调控库强度参与此过程 | 研究主要关注磷异质性下的响应机制,其他养分或环境因素的交互作用尚未探讨;单细胞测序样本量相对有限 | 探究植物在异质养分供应下碳分配可塑性的结构和分子机制 | 玉米(Zea mays)基部节点组织 | 植物生物学/单细胞组学 | NA | 组织学分析、荧光示踪、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、拟时序分析 | NA | 组织切片图像、荧光成像数据、单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量,但包含异质磷供应处理的玉米节点组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |