单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28258 篇文献，本页显示第 22961 - 22980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22961 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 22962 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22963 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 22964 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Developmental Relationships and Specific Markers of Mouse Periodontium Cellular Subsets
2021-Aug, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2021.679937
PMID:34966906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠牙周组织细胞亚群的发育关系及特定标记物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了牙周组织细胞的异质性及其与牙囊细胞的关系，并鉴定了区分牙骨质细胞和牙槽骨成骨细胞的特定基因 | NA | 探讨牙周组织细胞的发育关系及其细胞间相互作用 | 小鼠牙周组织的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括PTHrP-mCherry牙囊细胞（P6）和2.3kb Col1a1启动子驱动的GFP牙周细胞（P25） |
| 22965 | 2024-08-08 |
scGET: Predicting Cell Fate Transition During Early Embryonic Development by Single-cell Graph Entropy
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.008
PMID:34954425
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scGET的计算方法，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据探索基因间的关联，用于预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | scGET方法通过将基因表达数据转换为局部网络熵，利用单细胞图熵（SGE）值定量描述细胞群体间基因调控网络的稳定性和关键性，从而在单细胞水平上检测细胞命运或谱系承诺的关键信号 | NA | 研究目的是开发一种新的计算方法来预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | 研究对象是早期胚胎发育过程中的细胞命运转变 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 22966 | 2024-08-08 |
GranatumX: A Community-engaging, Modularized, and Flexible Webtool for Single-cell Data Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.005
PMID:34973417
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研究论文 | 介绍了一种名为GranatumX的下一代软件环境，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | GranatumX允许生物学家在基于Web的图形环境中访问最新的scRNA-seq生物信息学方法，并为软件开发者提供了一个快速推广其工具的平台 | NA | 开发一个社区参与、模块化和灵活的Web工具，用于单细胞数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据分析 | NA |
| 22967 | 2024-08-08 |
Inhibition of Podocytes DPP4 Activity Is a Potential Mechanism of Lobeliae Chinensis Herba in Treating Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.779652
PMID:34950037
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研究论文 | 本文研究了传统中药半夏泻心汤（LCH）通过抑制足细胞中的DPP4活性来治疗糖尿病肾病（DKD）的潜在机制 | 首次通过单细胞测序数据和网络药理学方法，筛选出LCH中12种活性成分，并预测这些成分通过分子对接抑制DPP4活性，从而延缓足细胞增殖 | NA | 探讨半夏泻心汤治疗糖尿病肾病的机制 | 糖尿病肾病中的足细胞和DPP4活性 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 分子对接 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 22968 | 2024-08-08 |
Dissecting the Landscape of Activated CMV-Stimulated CD4+ T Cells in Humans by Linking Single-Cell RNA-Seq With T-Cell Receptor Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.779961
PMID:34950144
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群的异质性和潜在功能 | 首次详细分析了CMV再激活的CD4+ T细胞亚群的表型和TCR谱系，为理解CD4+ T细胞在CMV感染中的功能和相互作用提供了线索 | NA | 解析CMV感染中激活的CD4+ T细胞的景观 | 人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | RNA, TCR序列 | 来自人类外周血的CD4+ T细胞亚群 |
| 22969 | 2024-08-08 |
Single-Cell Regulatory Network Inference and Clustering Identifies Cell-Type Specific Expression Pattern of Transcription Factors in Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.676515
PMID:34955748
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并构建了细胞类型特异性的表达图谱 | 首次在单细胞水平上揭示了小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并创建了细胞类型特异性的表达图谱 | NA | 旨在识别复杂组织中的细胞类型，并进行大规模的细胞类型特异性基因表达分析 | 成年小鼠坐骨神经中的不同细胞类型及其转录因子表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 238个转录因子在9种不同细胞类型中表达 |
| 22970 | 2024-08-08 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于双光子显微镜的活体成像技术，用于非侵入性地监测和表征视网膜类器官的长期发育 | 使用荧光寿命成像显微镜（FLIM）和超光谱成像技术监测视网膜类器官的代谢轨迹和分子结构变化 | 组织产物的异质性和主观组织选择降低了类器官实验的可重复性 | 提高类器官质量控制，监测视网膜类器官的长期发育 | 视网膜类器官的代谢和分子结构变化 | 数字病理学 | NA | 双光子显微镜，荧光寿命成像显微镜（FLIM），超光谱成像 | NA | 图像 | 多个细胞系和生产批次的视网膜类器官 |
| 22971 | 2024-08-08 |
Airway Basal Cells Mediate Hypoxia-Induced EMT by Increasing Ribosome Biogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.783946
PMID:34955855
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研究论文 | 研究探讨了气道基底细胞在缺氧诱导的上皮间质转化（EMT）中的作用，特别是通过增加核糖体生物发生 | 首次揭示了气道基底细胞通过增强核糖体生物发生来介导缺氧诱导的EMT过程 | NA | 探究缺氧在气道上皮细胞中诱导EMT的机制 | 小鼠气管上皮细胞（MTECs）及其在缺氧条件下的反应 | NA | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术，免疫荧光检测，实时荧光定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 22972 | 2024-08-08 |
Galectin-9/TIM-3 as a Key Regulator of Immune Response in Gliomas With Chromosome 1p/19q Codeletion
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.800928
PMID:34956239
|
研究论文 | 本研究探讨了1p/19q共缺失的胶质瘤中Galectin-9/TIM-3作为免疫反应关键调节因子的生物学功能变化 | 发现1p/19q共缺失通过下调Galectin-9和TIM-3的表达水平，促进胶质瘤的抗肿瘤免疫反应 | NA | 揭示1p/19q共缺失胶质瘤中与免疫反应紧密相关的生物学功能变化 | 1p/19q共缺失的胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序, t-SNE算法, CIBERSORT分析 | NA | RNA序列数据, 单细胞测序数据 | 来自The Cancer Genome Atlas和中国胶质瘤基因组图谱数据库的胶质瘤患者临床病理和RNA测序数据 |
| 22973 | 2024-08-08 |
Hypoxia Contributes to Poor Prognosis in Primary IDH-wt GBM by Inducing Tumor Cells MES-Like Transformation Trend and Inhibiting Immune Cells Activity
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.782043
PMID:34956900
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研究论文 | 研究揭示了低氧环境对原发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 首次详细分析了低氧条件下肿瘤细胞的MES样转化趋势及对免疫细胞功能的抑制作用 | 研究依赖于公开数据库的数据，可能存在样本选择偏倚 | 探讨低氧环境对原发性IDH野生型胶质母细胞瘤中肿瘤细胞和免疫细胞的影响 | 原发性IDH野生型胶质母细胞瘤患者的肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 数据来自Gene Expression Omnibus (GEO) 和 The Cancer Genome Atlas (TCGA) 数据库 |
| 22974 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Revealed the Heterogeneity of Gonadal Primordial Germ Cells in Zebra Finch (Taeniopygia guttata)
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.791335
PMID:34957119
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了斑胸草雀生殖嵴原始生殖细胞的异质性 | 首次揭示了斑胸草雀原始生殖细胞的异质性，并发现了新的生物标志物 | NA | 评估斑胸草雀原始生殖细胞的异质性 | 斑胸草雀的原始生殖细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 从雄性和雌性斑胸草雀的胚胎生殖细胞中鉴定出20个细胞簇中的9种细胞类型 |
| 22975 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of the Rat Carotid Arteries Uncovers Potential Cellular Targets of Neointimal Hyperplasia
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.751525
PMID:34957241
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对比正常和狭窄的颈动脉，揭示了新生内膜增生潜在的细胞靶点 | 发现了同时表达血管平滑肌细胞和成纤维细胞标记的过渡细胞类型，并验证了N-肉豆蔻酰转移酶1作为血管平滑肌细胞合成表型的标记物 | 提出的新靶基因如Cyp7a1和Cdk4需要在未来的研究中进行验证 | 探索新生内膜增生的潜在细胞靶点和机制 | 大鼠颈动脉的正常和狭窄状态 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠的左（对照）和右（球囊损伤）颈动脉 |
| 22976 | 2024-08-08 |
Different Glucose Metabolic Features According to Cancer and Immune Cells in the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.769393
PMID:34966676
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研究论文 | 本文研究了肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞之间的葡萄糖代谢特征，并探讨了这些特征对肿瘤免疫状态的影响。 | 首次在单细胞水平上全面研究了肿瘤微环境中葡萄糖代谢特征，并发现GLUT可能是肿瘤免疫代谢状态的替代指标和免疫治疗辅助治疗的潜在靶点。 | NA | 探索肿瘤微环境中癌细胞与免疫细胞的葡萄糖代谢特征，以发现可行的代谢靶点。 | 肿瘤微环境中的癌细胞和免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 包括黑色素瘤、头颈癌和乳腺癌等多种人类癌症组织样本。 |
| 22977 | 2024-08-08 |
Identification of Subtypes and a Prognostic Gene Signature in Colon Cancer Using Cell Differentiation Trajectories
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.705537
PMID:34966734
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研究论文 | 本研究通过细胞分化轨迹分析，探索结直肠癌（CC）细胞的异质性，并构建基于CC分化相关基因（CDRG）的预后风险评分（RS）特征 | 首次通过单细胞RNA测序数据识别出两个具有不同分化状态的子集，并基于CDRG构建分子亚型和预后RS特征，能有效预测患者的临床结局和治疗反应 | NA | 探索结直肠癌细胞的分化轨迹及其临床意义，并构建基于CDRG的预后风险评分特征 | 结直肠癌细胞的分化轨迹和相关基因 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集使用The Cancer Genome Atlas数据，验证集使用GSE39582数据，涉及40个由YY1和EGR2调控的枢纽CDRG |
| 22978 | 2024-08-08 |
Identification of ZEB2 as an Immune-Associated Gene in Endometrial Carcinoma and Associated with Macrophage Infiltration by Bioinformatic Analysis
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/4372373
PMID:34970423
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析了子宫内膜癌中的免疫细胞组成，并发现ZEB2基因在免疫细胞中的特异性表达及其与肿瘤纯度和巨噬细胞浸润的关联 | 首次揭示了ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的独特作用，并探讨了其作为免疫治疗靶点的潜力 | NA | 探讨ZEB2在子宫内膜癌免疫环境中的作用及其作为治疗靶点的可能性 | 子宫内膜癌中的免疫细胞及ZEB2基因的表达与功能 | 数字病理学 | 子宫内膜癌 | 单细胞转录组测序, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自TCGA-UCEC的bulk RNA-seq数据和来自HPA数据库的免疫组织化学样本 |
| 22979 | 2024-08-08 |
Handling the Cellular Complex Systems in Alzheimer's Disease Through a Graph Mining Approach
2021, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-3-030-78775-2_16
PMID:34973018
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研究论文 | 本文通过图挖掘方法处理阿尔茨海默病中的细胞复杂系统，开发了一种针对单细胞RNA-seq实验的子通路分析方法，以识别潜在的扰动生物过程。 | 本文提出了一种新的子通路分析方法，用于处理单细胞RNA-seq数据，以减少假发现并识别与神经退行性变相关的扰动生物过程。 | NA | 旨在通过图挖掘方法揭示复杂人类疾病的病理机制，并改进诊断和治疗方法。 | 阿尔茨海默病中的细胞系统及其生物过程。 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA-seq | 图挖掘 | RNA-seq数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22980 | 2024-08-08 |
Low Expression of YTH Domain-Containing 1 Promotes Microglial M1 Polarization by Reducing the Stability of Sirtuin 1 mRNA
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.774305
PMID:34975410
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研究论文 | 本文研究了m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用，发现YTH域包含蛋白1（YTHDC1）的低表达通过降低Sirtuin 1 mRNA的稳定性促进小胶质细胞M1极化 | 首次揭示了YTHDC1在视网膜小胶质细胞炎症反应调节中的关键作用 | NA | 探讨m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用 | 视网膜小胶质细胞在葡萄膜炎中的变化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠视网膜细胞 |