单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28027 篇文献，本页显示第 22941 - 22960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22941 | 2024-08-08 |
[Advances and applications of organoids: a review]
2021-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.200764
PMID:34841798
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综述 | 本文综述了类器官的分类、特性、当前应用、与其他技术的结合使用及未来展望 | 类器官作为一种新型模型系统，能够更精确地模拟人体生理现象，并可与基因编辑、芯片器官和单细胞RNA测序等技术结合，突破传统模型的局限 | NA | 探讨类器官在疾病建模、药物研究、精准医学和再生医学中的应用 | 类器官及其与其他技术的结合应用 | NA | NA | 基因编辑、器官芯片、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 22942 | 2024-08-08 |
Identifying disease-critical cell types and cellular processes across the human body by integration of single-cell profiles and human genetics
2021-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.03.19.436212
PMID:34845454
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研究论文 | 本文介绍了sc-linker框架，通过整合单细胞RNA测序、表观基因组图谱和全基因组关联研究（GWAS）的统计数据，推断遗传变异影响疾病的潜在细胞类型和过程 | sc-linker框架的创新之处在于它能够整合多种数据类型，包括单细胞RNA测序、表观基因组图谱和GWAS数据，以推断疾病相关的细胞类型和细胞过程 | NA | 识别遗传变异影响疾病的关键细胞类型和细胞过程 | 分析了来自209个个体、涵盖11种组织类型和6种疾病状况的160万个单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 160万个单细胞RNA测序数据，来自209个个体 |
| 22943 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of Adult Testis in Protogynous Hermaphroditic Orange-Spotted Grouper, Epinephelus coioides
2021-Nov-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222212607
PMID:34830486
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对橙点石斑鱼的成年睾丸细胞进行了研究，识别并定义了多种细胞类型及其标记基因。 | 首次对橙点石斑鱼的成年睾丸进行单细胞RNA测序，揭示了其细胞类型和标记基因的表达模式。 | 研究仅限于橙点石斑鱼的成年睾丸，未涉及其他发育阶段或其他物种。 | 探究橙点石斑鱼成年睾丸中的精子发生过程及其细胞类型。 | 橙点石斑鱼的成年睾丸细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约9500个睾丸细胞 |
| 22944 | 2024-08-08 |
A Portrait of Intratumoral Genomic and Transcriptomic Heterogeneity at Single-Cell Level in Colorectal Cancer
2021-Nov-17, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina57111257
PMID:34833475
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综述 | 本文综述了结直肠癌中单细胞水平的肿瘤内基因组和转录组异质性的研究进展 | 介绍了单细胞技术在定义细胞亚群和分离稀有细胞群信号方面的应用，以及其在结直肠癌精准医疗中的潜力 | NA | 探讨单细胞技术在结直肠癌精准医疗中的应用，以及其在早期诊断、治疗反应预测和发现新药物靶点方面的可能性 | 结直肠癌的肿瘤内基因组和转录组异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | NGS | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 22945 | 2024-08-08 |
Identification of Potential Long Non-Coding RNA Candidates that Contribute to Triple-Negative Breast Cancer in Humans through Computational Approach
2021-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222212359
PMID:34830241
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研究论文 | 本研究通过计算方法分析了公开的单细胞RNA测序数据，识别了与三阴性乳腺癌相关的潜在长非编码RNA候选物 | 本研究首次详细探索了长非编码RNA在三阴性乳腺癌患者中的作用，并识别了197个潜在的新型lncRNA | 研究仅使用了公开的单细胞RNA测序数据，可能需要更多的实验验证来确认这些lncRNA的功能 | 探索长非编码RNA在三阴性乳腺癌中的作用，并识别潜在的治疗干预生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者中的长非编码RNA和mRNA表达变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及三阴性乳腺癌患者的RNA测序数据 |
| 22946 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Expression of Aging- and Senescence-Associated Genes in Distinct Cancer Cell Populations
2021-11-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113126
PMID:34831349
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研究论文 | 本研究分析了公开的慢性髓性白血病、结直肠癌、肝细胞癌、肺癌和胰腺导管腺癌的bulk mRNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了衰老和衰老相关基因在不同癌细胞群体中的表达 | 首次检测到多种衰老/衰老诱导基因在恶性疾病中相对于健康对照样本的上调，并揭示了这些基因在细胞发育过程中的重要性 | 仅检测了少数癌症类型中衰老相关基因与转录组广泛变化之间的相关性 | 分析衰老相关转录模式，探讨衰老和衰老相关基因在人类恶性肿瘤中的作用 | 慢性髓性白血病、结直肠癌、肝细胞癌、肺癌和胰腺导管腺癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种癌症类型的样本 |
| 22947 | 2024-08-08 |
Comparative Analyses of Single-Cell Transcriptomic Profiles between In Vitro Totipotent Blastomere-like Cells and In Vivo Early Mouse Embryonic Cells
2021-11-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113111
PMID:34831338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术比较了体外培养的全能性类似囊胚细胞与体内早期小鼠胚胎细胞的转录组特征 | 首次报道了使用单一剪接体抑制剂pladienolide B（plaB）成功将小鼠多能干细胞重编程为全能性类似囊胚细胞（TBLCs），并发现TBLCs中存在一个表达高水平全能性相关基因的亚群 | 目前尚有争议TBLCs是否为与体内两细胞阶段胚胎等效的‘真正’全能干细胞 | 探讨体外培养的全能性类似囊胚细胞与体内早期小鼠胚胎细胞的转录组差异 | 体外培养的全能性类似囊胚细胞（TBLCs）与体内早期小鼠胚胎细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个体外培养的全能性类似囊胚细胞和体内早期小鼠胚胎细胞样本 |
| 22948 | 2024-08-08 |
Scientific Validation and Clinical Application of Lung Cancer Organoids
2021-11-04, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113012
PMID:34831235
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研究论文 | 本文探讨了肺腺癌类器官（LCO）的科学验证及临床应用，重点研究了LCO培养介质的优化及其在药物筛选中的应用 | 本文利用单细胞RNA测序技术验证LCO是否再现了原发性肿瘤的异质性和功能层次，并尝试通过培养含有间质细胞和免疫细胞的LCO来再现肿瘤微环境 | LCO的成功率差异较大，且培养介质成分显著不同，可能导致正常细胞类器官的过度生长 | 研究肺腺癌类器官的科学验证及其在药物发现和预后预测中的应用 | 肺腺癌类器官（LCO）及其培养介质 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | LCO的成功率从7%到87%不等，具体样本数量未详细说明 |
| 22949 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscapes of human cord blood hematopoietic stem cell differentiation during ex vivo culture
2021-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.616
PMID:34841734
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22950 | 2024-08-08 |
The Metabolic Control of Myeloid Cells in the Tumor Microenvironment
2021-10-30, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10112960
PMID:34831183
|
research paper | 本文讨论了肿瘤微环境中髓系细胞的代谢控制及其在肿瘤发生中的免疫代谢交叉对话机制 | 利用高维单细胞方法如质谱流式细胞术和单细胞RNA测序，揭示了髓系细胞在不同癌症中的表型多样性及其在抗肿瘤免疫与免疫抑制和逃避中的作用 | NA | 探讨髓系细胞的代谢程序及其在癌症免疫治疗中的潜在作用 | 肿瘤微环境中的髓系细胞及其代谢途径 | digital pathology | NA | scRNA-seq | NA | single-cell | NA |
| 22951 | 2024-08-08 |
Extensive GJD2 Expression in the Song Motor Pathway Reveals the Extent of Electrical Synapses in the Songbird Brain
2021-Oct-25, Biology
DOI:10.3390/biology10111099
PMID:34827092
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研究论文 | 本文通过原位杂交技术展示了GJD2 mRNA在控制鸣禽鸣叫产生的两个核HVC和RA中的表达情况，揭示了电突触在鸣禽大脑中的广泛分布 | 首次探索了鸣禽前运动神经网络中的电突触及其分子身份，并展示了GJD2 mRNA在不同细胞类型和鸣禽核中的分布 | NA | 研究电突触在鸣禽运动技能学习和产生中的作用 | 鸣禽的鸣叫行为及其控制神经网络 | 神经科学 | NA | 原位杂交技术，单细胞测序 | NA | mRNA表达数据 | 包括金丝雀和斑胸草雀的HVC和RA核 |
| 22952 | 2024-08-08 |
Single-Cell Approaches to Deconvolute the Development of HSCs
2021-10-25, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10112876
PMID:34831099
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综述 | 本文综述了造血干细胞（HSCs）发育领域的最新进展，并介绍了单细胞RNA测序、空间转录组学和分子条形码等先进技术在解析HSC生成中缺失信息方面的应用 | 引入了单细胞RNA测序、空间转录组学和分子条形码等先进技术来帮助获取关于HSC生成的缺失信息 | 文中讨论了未解决的问题，这些问题可能阻碍HSC的生产 | 旨在通过解析HSC的发育过程，促进基于HSC的免疫疗法的发展 | 造血干细胞（HSCs）的发育过程 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学、分子条形码 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22953 | 2024-08-08 |
Cell Differentiation Trajectory-Associated Molecular Classification of Osteosarcoma
2021-10-23, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12111685
PMID:34828292
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研究论文 | 本研究旨在探讨骨肉瘤细胞的分化轨迹，并构建具有各自特征的分子亚型，生成预测预后的多基因签名 | 通过综合单细胞RNA测序（scRNA-seq）、批量RNA测序和微阵列数据，识别与骨肉瘤肿瘤干细胞相关的基因（OSCGs），并基于这些基因对骨肉瘤患者进行分子分型，成功预测了总体生存率、肿瘤微环境和免疫浸润状态 | NA | 研究骨肉瘤细胞的分化轨迹及其在肿瘤预后和微环境中的作用 | 骨肉瘤细胞及其分子亚型 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | 使用来自骨肉瘤样本的多种数据进行分析 |
| 22954 | 2024-08-08 |
Accurate Single-Cell Clustering through Ensemble Similarity Learning
2021-10-22, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12111670
PMID:34828276
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研究论文 | 本文介绍了一种新的单细胞聚类算法，通过有效减少零膨胀噪声和准确估计细胞间相似性，能够在大规模单细胞测序数据中准确预测单细胞聚类 | 提出了一种基于不同相似性估计的集成相似性网络构建方法，并使用随机游走重启框架减少人工噪声 | 未提及具体限制 | 开发一种有效的计算方法，以准确预测单细胞聚类 | 单细胞测序数据中的单细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 集成相似性网络 | 单细胞测序数据 | 大规模单细胞测序数据 |
| 22955 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Using Machine Learning Techniques and Its Application to Medical Research
2021-Oct-21, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines9111513
PMID:34829742
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综述 | 本文综述了机器学习技术在单细胞分析中的应用及其在医学研究中的重要性 | 介绍了机器学习技术如何解决单细胞分析中的批次效应和转录噪音等问题，并展示了其在单细胞多组学分析中的应用 | 未明确提及具体的研究限制 | 探讨机器学习技术在单细胞分析中的应用及其对医学研究的贡献 | 单细胞分析技术及其在癌症研究中的应用 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习技术 | 单细胞数据 | NA |
| 22956 | 2024-08-08 |
Identification of Differentially Expressed Genes in Different Glioblastoma Regions and Their Association with Cancer Stem Cell Development and Temozolomide Response
2021-Oct-20, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11111047
PMID:34834399
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研究论文 | 本研究旨在识别与替莫唑胺（TMZ）耐药和胶质母细胞瘤（GBM）复发相关的潜在靶基因 | 通过基因集富集分析和蛋白质-蛋白质相互作用网络，识别了与肿瘤复发和TMZ耐药相关的新基因集 | 研究主要基于TCGA和本地队列的数据，可能存在样本选择的偏倚 | 识别与胶质母细胞瘤复发和替莫唑胺耐药相关的基因，为治疗提供新的分子策略 | 胶质母细胞瘤患者的基因表达数据 | 数字病理学 | 脑癌 | 基因表达谱分析 | 基因集富集分析 | 基因表达数据 | 包括TCGA的154个原发和13个复发肿瘤样本，本地队列的29个原发和4个复发肿瘤样本，以及Gene Expression Omnibus数据集的3589个单细胞RNA测序数据 |
| 22957 | 2024-08-08 |
Percutaneous Microwave Coagulation Therapy: A Promising Therapeutic Method for Breaking the Barrier of the Intertumor Heterogeneity
2021, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2021/7773163
PMID:34840703
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析四名肺癌患者的肿瘤微环境，并使用经皮微波凝固疗法治疗，结果显示该疗法能有效应对肿瘤间异质性 | 首次研究经皮微波凝固疗法解决肿瘤间异质性的能力 | 样本量较小，仅限于四名肺癌患者 | 探讨经皮微波凝固疗法在应对肿瘤间异质性方面的效果 | 四名肺癌患者的肿瘤微环境 | NA | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 四名肺癌患者 |
| 22958 | 2024-08-08 |
Novel omics technology driving translational research in precision oncology
2021, Advances in genetics
DOI:10.1016/bs.adgen.2021.08.003
PMID:34844717
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综述 | 本文总结了癌症研究面临的当前挑战，并推动使用新型基因组学解决方案，全面概述了三种最近的基因组学技术：液体活检、单细胞RNA测序和空间转录组学 | 介绍了三种新型基因组学技术及其在精准肿瘤学中的应用 | NA | 推动精准肿瘤学的转化研究 | 癌症及其相关基因组学技术 | 数字病理学 | NA | 液体活检、单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22959 | 2024-08-08 |
The Roles of IL-7 and IL-15 in Niches for Lymphocyte Progenitors and Immune Cells in Lymphoid Organs
2021, Current topics in microbiology and immunology
DOI:10.1007/978-3-030-86016-5_4
PMID:34850283
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研究论文 | 本文探讨了IL-7和IL-15在淋巴组织中对淋巴细胞前体和免疫细胞的作用 | 建立了IL-7和IL-15报告鼠系，成功检测到这两种细胞因子的表达，并利用单细胞RNA测序分析了淋巴组织中不同亚群的基质细胞 | 仍需进一步研究以阐明哪些基质细胞在骨髓中作为ILCs和NK细胞早期前体的niche | 研究IL-7和IL-15在淋巴组织中的作用及其对免疫细胞发育和维持的影响 | IL-7和IL-15在淋巴组织中的表达及其功能 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用特定细胞类型敲除鼠进行分析 |
| 22960 | 2024-08-08 |
A deficient MIF-CD74 signaling pathway may play an important role in immunotherapy-induced hyper-progressive disease
2023-06, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-021-09672-3
PMID:34797429
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）中的免疫细胞特征 | 首次发现HPD组中CD4+ T细胞和调节性T细胞（Tregs）的富集以及CD74-MIF信号通路的缺失 | 研究仅限于体外实验，需要进一步的临床验证 | 探究免疫治疗诱导的超进展性疾病（HPD）的生物学机制 | 从健康对照和肿瘤患者的外周血单个核细胞（PBMC）中分离的CD3+细胞 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 健康对照和接受免疫治疗的肿瘤患者的PBMC样本 |