单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 22941 - 22960 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22941 | 2024-08-08 |
Cycloleucine negatively regulates porcine oocyte maturation and embryo development by modulating N6-methyladenosine and histone modifications
2022-Feb, Theriogenology
IF:2.4Q1
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研究论文 | 研究通过抑制RNA的N6-甲基腺苷（mA）修饰，探讨了环亮氨酸（CL）对猪卵母细胞成熟和早期胚胎发育的影响 | 首次揭示了RNA mA抑制剂环亮氨酸在猪卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的作用及其分子机制 | NA | 探究RNA mA修饰在猪卵母细胞成熟和早期胚胎发育中的作用 | 猪卵母细胞和早期胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22942 | 2024-08-08 |
Evaluating microglial phenotypes using single-cell technologies
2022-02, Trends in neurosciences
IF:14.6Q1
DOI:10.1016/j.tins.2021.11.001
PMID:34872773
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综述 | 本文总结了利用单细胞技术评估微胶质细胞表型的可用方法 | 介绍了单细胞测序方法和新的多组学方法，以扩展对微胶质细胞功能的理解 | NA | 探讨单细胞技术在微胶质细胞生物学中的应用 | 微胶质细胞的表型和功能 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 转录组 | 数千个细胞 |
| 22943 | 2024-08-08 |
Identification of heterogeneity and prognostic key genes associated with uveal melanoma using single-cell RNA-sequencing technology
2022-02-01, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000000783
PMID:34879031
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了葡萄膜黑色素瘤中的细胞异质性和与预后相关的关键基因 | 发现了与转移性葡萄膜黑色素瘤相关的新细胞簇，并识别了影响细胞间通讯的关键信号通路基因 | NA | 揭示葡萄膜黑色素瘤的生物学特性，为判断转移或复发的风险提供理论依据 | 葡萄膜黑色素瘤的细胞异质性和预后相关基因 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞测序数据 | 数据来自GSE139829和GSE138433 |
| 22944 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing and Assay for Transposase-Accessible Chromatin Using Sequencing Reveals Cellular and Molecular Dynamics of Aortic Aging in Mice
2022-02, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316883
PMID:34879708
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和转座酶可及染色质测序技术，分析了不同年龄C57/BL6J小鼠主动脉的转录组和转座酶可及染色质谱，揭示了主动脉衰老的细胞和分子动力学机制。 | 本研究首次整合了异质性转录组和染色质可及性数据，识别了细胞特异性的转录因子调控网络和开放染色质状态，并构建了衰老轨迹模型。 | NA | 探究年龄相关血管衰老在主动脉细胞亚群中的细胞和分子机制。 | C57/BL6J小鼠主动脉的转录组和转座酶可及染色质谱。 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，转座酶可及染色质测序 | NA | 转录组数据，染色质可及性数据 | 4周、26周和86周的C57/BL6J小鼠 |
| 22945 | 2024-08-08 |
Clinical characterization and immunosuppressive regulation of CD161 (KLRB1) in glioma through 916 samples
2022-Feb, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.15236
PMID:34881489
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研究论文 | 本研究探讨了CD161在胶质瘤中的临床特征及其免疫抑制调控作用 | 首次在大规模临床样本中证实CD161在胶质瘤生物学中的关键作用，并发现其作为胶质瘤免疫治疗新靶点的潜力 | NA | 旨在揭示CD161在胶质瘤中的分子机制及其对免疫监视逃避的影响 | CD161在胶质瘤中的表达及其对T细胞毒性的抑制作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序, 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 916个胶质瘤样本，包括313个来自中国胶质瘤基因组图谱数据库的样本和603个来自癌症基因组图谱数据库的样本 |
| 22946 | 2024-08-08 |
Hubness reduction improves clustering and trajectory inference in single-cell transcriptomic data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab795
PMID:34871374
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研究论文 | 本文研究了单细胞RNA测序（scRNAseq）数据中的中心性现象，并探讨了减少中心性对聚类、轨迹推断和可视化的影响 | 本文首次探讨了通过直接修正中心性来避免剧烈降维，从而保留更多信息的可能性 | NA | 研究单细胞RNA测序数据中的中心性现象及其对数据分析的影响 | 单细胞RNA测序数据中的中心性现象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22947 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing demonstrates complex resistance landscape in CLL and MCL treated with BTK and BCL2 inhibitors
2022-01-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006211
PMID:34861696
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研究论文 | 本研究通过单细胞DNA测序分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者在接受Bruton酪氨酸激酶（BTK）抑制剂和B细胞淋巴瘤2（BCL2）抑制剂治疗后产生的抗药性基因组景观 | 首次报道了BCL2抗药性突变在套细胞淋巴瘤（MCL）患者中的出现，并揭示了CLL和MCL在靶向治疗下的复杂克隆抗药性机制 | 研究样本仅限于8名患者，可能不足以全面代表所有CLL和MCL患者的抗药性情况 | 探究CLL和MCL患者在接受BTK和BCL2抑制剂治疗后的基因组抗药性机制 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞DNA测序 | NA | DNA | 8名患者 |
| 22948 | 2024-08-08 |
Matrix factorization for biomedical link prediction and scRNA-seq data imputation: an empirical survey
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab479
PMID:34864871
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综述 | 本文综述了矩阵分解方法在生物医学链接预测和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据插补中的应用 | 本文系统地比较了15个真实数据集上的代表性矩阵分解方法，并提供了选择不同生物医学矩阵完成任务的矩阵分解方法的一般指南 | NA | 评估矩阵分解方法在不同场景下的性能，并为生物医学链接预测和scRNA-seq数据插补提供改进方向 | 生物医学链接预测和单细胞RNA测序数据插补 | 生物信息学 | NA | 矩阵分解 | 矩阵分解方法 | 生物医学数据，单细胞RNA测序数据 | 15个真实数据集 |
| 22949 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse left ventricle reveals cellular diversity and intercommunication
2022-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠左心室的细胞景观，揭示了细胞多样性和细胞间通信网络 | 首次详细描述了小鼠左心室的单细胞转录组特征，并揭示了细胞亚型及其潜在功能 | NA | 探索小鼠左心室的细胞多样性和细胞间通信，寻找心血管疾病的治疗靶点 | 小鼠左心室的细胞景观 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 (tSNE) | 转录组数据 | 小鼠左心室的细胞 |
| 22950 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing for Everybody
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1944-5_15
PMID:34870822
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研究论文 | 本文描述了Smart-seq2协议，用于单细胞全长mRNA测序，适用于多种细胞类型，且成本相对较低 | 介绍了Smart-seq2协议，该协议易于优化并适用于标准分子生物学实验室 | NA | 帮助新手研究人员选择最佳的单细胞测序协议 | 单细胞全长mRNA测序协议 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA序列 | 多种细胞类型 |
| 22951 | 2024-08-08 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文开发了一种增强的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工作流程，用于揭示冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 本文设计了一个用户友好的、可重复的工作流程，并开发了一个交互式网络应用程序PlaqView，以促进对心血管单细胞数据集的进一步探索和分析 | NA | 开发和应用scRNA-seq分析工作流程，以研究动脉粥样硬化斑块微环境并发现潜在的治疗方法 | 冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 使用了Wirka等人之前发表的人类冠状单细胞数据集 |
| 22952 | 2024-08-08 |
Serglycin Is Involved in Adipose Tissue Inflammation in Obesity
2022-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100231
PMID:34872979
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研究论文 | 本研究探讨了serglycin在饮食诱导的肥胖相关脂肪组织炎症中的作用 | 首次揭示了serglycin在调节肥胖诱导的脂肪炎症中的作用 | NA | 研究serglycin表达对饮食诱导的脂肪组织炎症的影响 | serglycin在肥胖条件下对脂肪组织炎症的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用C57BL/6J遗传背景的小鼠进行8周高脂高蔗糖饮食实验 |
| 22953 | 2024-08-08 |
Robotic high-throughput biomanufacturing and functional differentiation of human pluripotent stem cells
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.11.004
PMID:34861164
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研究论文 | 本文介绍了一种机器人平台，用于高效生产人类诱导多能干细胞（hiPSCs）并实现其功能性分化 | 开发了一种全自动的机器人平台，用于在化学定义条件下进行hiPSC的培养和分化，实现了高吞吐量和标准化生产 | NA | 建立一个集成平台，用于高效细胞制造，以支持疾病模型、药物筛选和细胞治疗 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其功能性分化 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、代谢分析、电生理学 | NA | 细胞 | 最多90种不同患者和疾病特异性细胞系 |
| 22954 | 2024-08-08 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿脑中纹状体和皮质γ-氨基丁酸能神经元的起源结构——神经节隆起的细胞多样性 | 发现人类和啮齿类动物在中间神经元发育过程中共享保守的转录程序 | NA | 探究遗传变异如何通过影响特定细胞类型的发育而导致神经发育障碍 | 人类和啮齿类动物的中间神经元发育 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22955 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies a key role for Hhip in murine coronal suture development
2021-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27402-5
PMID:34880220
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胚胎期野生型小鼠冠状缝合线，定义其细胞群体结构，并探讨Hhip在冠状缝合线发育中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠冠状缝合线的细胞群体结构，并揭示了Hhip在调控缝合线发育中的重要作用 | NA | 研究Hhip在小鼠冠状缝合线发育中的作用 | 小鼠冠状缝合线的细胞群体结构及Hhip的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 胚胎期E16.5和E18.5的野生型小鼠冠状缝合线样本 |
| 22956 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the dynamic process and novel markers in porcine spermatogenesis
2021-Dec-07, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-021-00638-3
PMID:34872612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了150天龄猪睾丸中约16,966个细胞的转录组，揭示了猪精子发生过程中的动态变化和新标记物。 | 首次通过单细胞RNA测序分析了猪睾丸中雄性生殖细胞和体细胞的转录组，并发现了四个精子细胞亚群及两个新的细胞表面标记物。 | NA | 研究猪精子发生过程中的转录组动态变化和新标记物。 | 猪睾丸中的生殖细胞和体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约16,966个睾丸细胞 |
| 22957 | 2024-08-08 |
Representation learning of RNA velocity reveals robust cell transitions
2021-12-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2105859118
PMID:34873054
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Velocity Autoencoder（VeloAE）的表示学习方法，用于学习RNA速度的低维表示，从而稳健地估计细胞过渡 | 提出了一种新的表示学习方法VeloAE，用于处理高维RNA速度数据中的不稳定和不准确问题 | NA | 旨在提高RNA速度技术在量化细胞过渡和揭示异质细胞群中瞬态细胞动力学的准确性和稳定性 | RNA速度数据和细胞过渡 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | Autoencoder | 转录组数据 | 多个实验数据集 |
| 22958 | 2024-08-08 |
An efficient scRNA-seq dropout imputation method using graph attention network
2021-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04493-x
PMID:34876032
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研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的自动编码器结构网络GNNImpute，用于单细胞RNA测序数据中的dropout事件插补 | GNNImpute利用图注意力卷积聚合多层次相似细胞信息，并在非欧几里得空间的scRNA-seq数据上进行卷积操作，能准确有效地插补dropout并减少dropout噪声 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据dropout插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 图注意力网络 | 基因表达数据 | 分析了四个真实数据集 |
| 22959 | 2024-08-08 |
Delineation of colorectal cancer ligand-receptor interactions and their roles in the tumor microenvironment and prognosis
2021-12-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03162-0
PMID:34876143
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌中单细胞RNA测序数据，揭示了配体-受体相互作用的模式及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 本研究通过深入分析现有的配体-受体对，为结直肠癌亚型分类提供了新思路，为结直肠癌患者提供了一种新的风险筛查工具，并发现了潜在的配体-受体对目标和治疗途径 | NA | 研究配体-受体相互作用在结直肠癌中的模式及其对肿瘤微环境和临床价值的影响 | 结直肠癌中的配体-受体相互作用及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 55,539个单细胞RNA测序样本来自29名结直肠癌患者和1411名结直肠癌患者的三个批量RNA-seq数据集 |
| 22960 | 2024-08-08 |
Traditional chinese medicine syndromes classification associates with tumor cell and microenvironment heterogeneity in colorectal cancer: a single cell RNA sequencing analysis
2021-Dec-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-021-00547-7
PMID:34876190
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌中肿瘤细胞和微环境的异质性与中医证候分类的相关性 | 首次探讨了结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的关系，并揭示了不同证候分类下的肿瘤细胞特征基因和基因共表达网络 | 研究样本量较小，仅涉及11个原发性结直肠癌肿瘤，可能影响结果的普遍性 | 探讨结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的相关性和意义 | 结直肠癌中的肿瘤细胞和微环境异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个原发性结直肠癌肿瘤，共662个细胞 |