单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 22901 - 22920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22901 | 2024-08-08 |
Plant Cell Identity in the Era of Single-Cell Transcriptomics
2021-11-23, Annual review of genetics
IF:8.7Q1
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综述 | 本文综述了高通量单细胞转录组学方法在植物学中的应用，及其对理解植物细胞多样性、分化和功能的影响 | 提供了对植物细胞身份的新见解，包括细胞转换的全新视角和罕见及新型细胞类型的定义 | 指出了当前应用和分析单细胞转录组学在植物中的挑战 | 探讨单细胞转录组学在植物学中的应用及其对植物细胞身份理解的影响 | 植物器官和组织的单细胞转录组分析 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 多个植物器官和组织 |
| 22902 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses Reveal Mechanisms of Cancer Stem Cell Maintenance and Epithelial-Mesenchymal Transition in Recurrent Bladder Cancer
2021-11-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-20-4796
PMID:34526362
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和ATAC-seq技术，分析了13名不同复发风险膀胱癌患者的肿瘤细胞，揭示了膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 研究首次在单细胞水平上揭示了EZH2通过H3K27me3介导的NCAM1基因抑制，维持癌症干细胞特性，并阐明了TCF7在膀胱癌上皮-间质转化中的作用 | NA | 揭示膀胱癌复发中癌症干细胞维持和上皮-间质转化的分子机制 | 膀胱癌患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 膀胱癌 | 单细胞RNA测序，ATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 13名患者，共54,971个单细胞 |
| 22903 | 2024-08-08 |
Functional coordination of non-myocytes plays a key role in adult zebrafish heart regeneration
2021-11-04, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202152901
PMID:34523214
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研究论文 | 本文通过LIGER算法分析了斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞（non-CMs）的单细胞RNA测序数据，揭示了non-CMs的多样性和功能状态的动态变化 | 首次构建了斑马鱼心脏再生过程中non-CMs的细胞状态图谱，并开发了Topologizer算法来分析功能状态之间的拓扑关系和动态转换 | NA | 探究斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的分子和细胞基础 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | LIGER算法, Topologizer算法 | 单细胞RNA测序数据 | 61,977个非心肌细胞样本 |
| 22904 | 2024-08-08 |
Visualization of individual cell division history in complex tissues using iCOUNT
2021-11-04, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2021.08.012
PMID:34525348
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研究论文 | 本文开发了一种诱导性细胞分裂计数器（iCOUNT），用于在体外和体内报告人类和小鼠组织的细胞分裂事件，并通过分析神经干细胞/祖细胞（NSPCs）的分裂历史，揭示了干细胞行为的新的见解。 | 开发了iCOUNT工具，能够报告细胞分裂事件，并通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）识别与细胞分裂历史相关的功能性分子途径。 | NA | 研究干细胞的分裂潜力及其连续增殖的分子后果。 | 神经干细胞/祖细胞（NSPCs）及其后代。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22905 | 2024-08-08 |
Single-cell analyses of human pancreas: characteristics of two populations of acinar cells in chronic pancreatitis
2021-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00482.2020
PMID:34523348
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的细胞特征，特别是两种独特的腺泡细胞群 | 首次在单细胞水平上研究了慢性胰腺炎患者胰腺腺泡细胞的生理特性，并探讨了这些细胞对激动剂刺激的响应 | 研究样本量较小，仅包括五名患者，可能影响结果的普遍性 | 探讨慢性胰腺炎患者胰腺组织中细胞的特征及其对特定刺激的响应 | 慢性胰腺炎患者的胰腺组织及其中的腺泡细胞 | 数字病理学 | 慢性胰腺炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 五名患者 |
| 22906 | 2024-08-08 |
Cell-specific gene association network construction from single-cell RNA sequence
2021-11, Cell cycle (Georgetown, Tex.)
DOI:10.1080/15384101.2021.1978265
PMID:34530677
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研究论文 | 本文利用网络扰动理论和显著性分析，开发了一种细胞特异性网络，该网络基于单细胞分辨率下的分子表达来揭示基因-基因关联 | 本文首次利用单细胞RNA测序数据构建细胞特异性基因关联网络，并通过网络度理论识别枢纽基因 | NA | 开发一种新的方法来构建细胞特异性基因关联网络，并探索其在个性化药物设计和治疗中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的基因关联 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络扰动理论 | 基因表达数据 | NA |
| 22907 | 2024-08-08 |
Adipose tissue and adipose secretome in systemic sclerosis
2021-11-01, Current opinion in rheumatology
IF:5.2Q1
DOI:10.1097/BOR.0000000000000838
PMID:34534166
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综述 | 本文综述了脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症（SSc）病理中的作用，特别关注了脂肪细胞在脂肪向间充质转分化（AMT）中的局部效应，脂肪间质血管部分对SSc发病机制的影响，以及脂肪组织分泌组的系统效应。 | 新发现的从脂肪组织演化而来的成纤维细胞群体，如从脂肪源性间质细胞分化而来的COL11+癌症相关成纤维细胞，以及使用非常规标记物描述的人类肺部脂成纤维细胞，这些发现有助于进一步阐明脂肪细胞在SSc中的作用。 | NA | 探讨脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症发病机制中的重要作用。 | 脂肪组织及其分泌组在系统性硬化症中的作用。 | NA | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNAseq）和代谢组学 | NA | NA | NA |
| 22908 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis reveals defective decidua stromal niche attributes to recurrent spontaneous abortion
2021-Nov, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13125
PMID:34546587
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了复发性自然流产中母体蜕膜基质微环境的缺陷特征 | 首次揭示了复发性自然流产中蜕膜基质细胞的异常分化和细胞间通讯障碍 | NA | 探讨复发性自然流产中母体蜕膜细胞异质性的作用 | 复发性自然流产患者和健康对照者的蜕膜样本 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 66,078个单细胞样本 |
| 22909 | 2024-08-08 |
Transcription factor FOXF1 identifies compartmentally distinct mesenchymal cells with a role in lung allograft fibrogenesis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147343
PMID:34546975
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研究论文 | 本研究展示了转录因子FOXF1在成人肺部特定解剖位置的间质基质细胞群中的保留，并识别出这些表达胶原蛋白的特定亚群细胞在肺同种异体移植重塑和纤维化中的关键作用 | 首次揭示了FOXF1+细胞在肺同种异体移植纤维化中的作用，并阐明了其与Sonic hedgehog信号通路的相互作用 | NA | 研究转录因子FOXF1在肺同种异体移植纤维化中的作用及其分子机制 | 肺部间质基质细胞及其在肺同种异体移植中的作用 | NA | 肺纤维化 | Bulk和单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用Foxf1-tdTomato BAC和Foxf1-tdTomato Col1a1-GFP小鼠模型进行研究 |
| 22910 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Sequencing and Proteomics Reveal Neonatal Ileum Dynamic Developmental Potentials
2021-Oct-26, mSystems
IF:5.0Q1
DOI:10.1128/mSystems.00725-21
PMID:34546071
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和蛋白质组学分析，揭示了新生期回肠动态发育的潜力 | 发现了先前未知的发育变化，包括未分化细胞的特定增加、独特的肠细胞分化以及分泌细胞的时间依赖性减少 | NA | 探讨新生期小肠发育和成熟过程中的细胞分化和分子相互作用 | 新生期猪回肠的40,186个回肠上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 40,186个回肠上皮细胞 |
| 22911 | 2024-08-08 |
Microfluidic single-cell transcriptomics: moving towards multimodal and spatiotemporal omics
2021-10-12, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d1lc00607j
PMID:34541590
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review | 本文综述了微流控单细胞转录组学的最新进展，重点介绍了其方法学和技术趋势 | 文章讨论了微流控技术在单细胞转录组学中的应用，特别是向多模态和时空组学的转变，以及单细胞空间转录组学和时间转录组学的新进展 | 文章提到了当前微流控单细胞转录组学面临的挑战，包括需要解决的技术问题和未来的发展方向 | 综述微流控单细胞转录组学的方法和技术，探讨其未来发展 | 微流控单细胞转录组学技术及其在生物学中的应用 | digital pathology | NA | 微流控技术 | NA | 转录组数据 | 单细胞 |
| 22912 | 2024-08-08 |
Tunable and Contamination-Free Injection with Microfluidics by Stepinjection
2021-10-05, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.1c02721
PMID:34546041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为stepinjection的微流控技术，通过改进T型接头设计，有效避免了传统皮克注射器中的交叉污染问题。 | stepinjection技术通过在T型接头中采用阶梯通道设计，增大了扩散缓冲区，从而增加了液滴与注射通道入口之间的压力差，有效防止了交叉污染。 | NA | 展示stepinjection技术在污染敏感的酶学检测中的应用能力。 | 使用stepinjection技术将酪蛋白荧光素异硫氰酸酯（FITC-casein）注入含有savinase和无savinase（标记为红色荧光染料）的液滴混合物中，观察是否有交叉污染。 | 微流控技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 22913 | 2024-08-08 |
Genes related to SNPs identified by Genome-wide association studies of age-related hearing loss show restriction to specific cell types in the adult mouse cochlea
2021-10, Hearing research
IF:2.5Q1
DOI:10.1016/j.heares.2021.108347
PMID:34536825
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研究论文 | 研究通过全基因组关联研究识别与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在成年小鼠耳蜗中的表达 | 发现与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗细胞亚型中的广泛且不同的表达模式，以及与阿尔茨海默病和细胞极性及囊泡循环相关的基因集的重叠 | NA | 确定与年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因在耳蜗中的表达 | 年龄相关听力损失相关的单核苷酸多态性基因及其在耳蜗细胞亚型中的表达 | 基因组学 | 听力损失 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年小鼠耳蜗细胞亚型 |
| 22914 | 2024-08-08 |
Type I Interferon signaling controls the accumulation and transcriptomes of monocytes in the aged lung
2021-10, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.13470
PMID:34547174
|
研究论文 | 本文揭示了衰老导致肺部干扰素信号增强和趋化因子浓度升高，进而引起单核细胞向肺实质的浸润 | 发现了一种依赖于I型干扰素信号的新型单核细胞亚群（MO-ifn），该亚群在衰老过程中上调IFNAR1表达并表现出更大的转录组变化 | NA | 探讨生理性衰老过程中肺部免疫细胞的机制 | 衰老肺部的单核细胞及其转录组变化 | 免疫学 | 衰老相关疾病 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22915 | 2024-08-08 |
A single-cell tumor immune atlas for precision oncology
2021-10, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.273300.120
PMID:34548323
|
research paper | 本研究构建了一个单细胞肿瘤免疫图谱，用于精确肿瘤学 | 提出了一个综合的单细胞肿瘤免疫细胞图谱，并开发了一个自动细胞注释系统和空间转录组学工具 | NA | 旨在提高肿瘤预后和免疫治疗的分层方法 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其空间定位 | digital pathology | NA | single-cell and spatial transcriptomics | NA | single-cell data | 超过500,000个细胞，来自217名患者和13种癌症类型 |
| 22916 | 2024-08-08 |
Single-cell immune profiling reveals distinct immune response in asymptomatic COVID-19 patients
2021-09-16, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00753-7
PMID:34531370
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组和T/B细胞受体测序，分析了无症状COVID-19患者与中度患者的免疫反应差异 | 首次揭示了无症状COVID-19患者与中度患者在免疫反应上的显著差异，包括NK细胞和干扰素-γ的上调以及TCR克隆扩增的增强 | 研究样本量较小，且仅包括外周血单个核细胞样本，可能无法全面反映所有免疫细胞的反应 | 旨在识别无症状与中度COVID-19患者之间的免疫反应差异 | 无症状、中度和重度COVID-19患者以及健康对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序，TCR/BCR测序 | NA | 细胞 | 37份纵向收集的外周血单个核细胞样本 |
| 22917 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-Seq reveals transcriptional heterogeneity and immune subtypes associated with disease activity in human myasthenia gravis
2021-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-021-00314-w
PMID:34521820
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了39,243个细胞的转录组，揭示了与疾病活动相关的人类重症肌无力中的转录异质性和免疫亚型 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了重症肌无力患者的细胞转录组，发现了与疾病活动相关的特定细胞亚群 | 研究仅限于新发重症肌无力患者和健康对照，未涉及长期或慢性重症肌无力患者 | 深入理解重症肌无力发病机制中的细胞异质性 | 重症肌无力患者的免疫细胞 | 数字病理学 | 重症肌无力 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 39,243个细胞 |
| 22918 | 2024-08-08 |
Limited access to antigen drives generation of early B cell memory while restraining the plasmablast response
2021-09-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.08.017
PMID:34525339
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了小鼠对T依赖性抗原的早期B细胞反应，探讨了早期B细胞激活过程中的细胞命运决定及其对抗原和疫苗反应结果的影响。 | 研究揭示了抗原可及性对早期B细胞记忆生成和浆细胞样细胞反应的调控机制，并发现了非生发中心来源的早期记忆B细胞在免疫反应中的重要作用。 | 研究主要集中在小鼠模型上，可能需要进一步在其他物种或人类中验证这些发现。 | 探讨早期B细胞激活过程中的细胞命运决定及其对抗原和疫苗反应结果的影响。 | 小鼠的早期B细胞反应。 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 小鼠的B细胞样本 |
| 22919 | 2024-08-08 |
Pro-inflammatory and proliferative microglia drive progression of glioblastoma
2021-09-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109718
PMID:34525361
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，全面绘制了胶质母细胞瘤中的细胞群体，并揭示了SETD2突变型胶质母细胞瘤细胞与肿瘤微环境之间的相互作用。 | 本研究首次鉴定了一种特定的高级别胶质瘤相关小胶质细胞（HGG-AM），并阐明了其通过TGF-β1激活后表现出促炎和增殖特征，进而促进肿瘤进展的机制。 | NA | 旨在深入理解胶质母细胞瘤微环境及其分子基础，以开发更有效的治疗策略。 | 胶质母细胞瘤中的细胞群体及其相互作用。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22920 | 2024-08-08 |
ASGARD: A Single-cell Guided pipeline to Aid Repurposing of Drugs
2021-Sep-14, ArXiv
PMID:34545335
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研究论文 | 本文提出了一种名为ASGARD的新型药物推荐系统，该系统利用单细胞RNA测序技术来解决细胞间异质性问题，以促进精准医学 | ASGARD通过考虑所有细胞集群来定义一种新的药物评分，以预测药物，从而解决每个患者内部的细胞间异质性问题 | NA | 开发一种新的药物再利用推荐工具，以促进个性化医学 | ASGARD系统在多种疾病中的应用，包括乳腺癌、急性淋巴细胞白血病和COVID-19 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 涉及多种疾病的患者样本，包括三阴性乳腺癌患者样本 |