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当前共找到 39915 篇文献，本页显示第 22901 - 22920 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22901 | 2024-10-10 |
Single-Cell Sequencing Combined with Transcriptome Sequencing to Explore the Molecular Mechanisms Related to Psoriasis
2024, Clinical, cosmetic and investigational dermatology
DOI:10.2147/CCID.S484034
PMID:39376789
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研究论文 | 本研究结合单细胞测序和转录组测序，探索银屑病相关的分子机制 | 揭示了银屑病潜在的治疗药物和发病机制，为后续机制研究提供了新思路 | NA | 进一步探索银屑病的发病分子机制 | 银屑病的基因表达谱和差异表达基因 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | 单细胞测序、转录组测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及GSE151177、GSE41664、GSE30999三个数据集的基因表达谱 | NA | NA | NA | NA |
| 22902 | 2024-10-10 |
A single-cell atlas of Plasmodium falciparum transmission through the mosquito
2021-05-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-23434-z
PMID:34045457
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | 首次通过单细胞转录组学揭示了恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的发育轨迹和转录特征，并识别了人类和啮齿动物寄生虫之间的保守和非保守基因使用 | NA | 揭示恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况，为寻找抗疟药物和疫苗靶点提供依据 | 恶性疟原虫在蚊子体内传播过程中的基因使用情况 | NA | 疟疾 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22903 | 2024-10-10 |
Co-culture of functionally enriched cancer stem-like cells and cancer-associated fibroblasts for single-cell whole transcriptome analysis
2019-12-31, Integrative biology : quantitative biosciences from nano to macro
IF:1.5Q4
DOI:10.1093/intbio/zyz029
PMID:31820801
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研究论文 | 开发了一种平台，用于分离单细胞并培养单细胞衍生的球体，以功能性富集癌症干细胞样细胞（CSCs），并研究CSCs与癌症相关成纤维细胞（CAFs）的相互作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了CSCs与CAFs共培养对癌症干细胞特性和上皮/间充质状态的影响，并发现了与患者生存相关的关键基因 | 研究仅限于SUM149乳腺癌细胞系，需要进一步验证在其他癌症类型中的适用性 | 研究CSCs与CAFs的相互作用及其对乳腺癌发展和转移的影响 | 乳腺癌干细胞样细胞（CSCs）和癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | SUM149乳腺癌细胞和CAFs共培养的单细胞衍生的球体 | NA | NA | NA | NA |
| 22904 | 2024-10-09 |
Enhancing metastatic colorectal cancer prediction through advanced feature selection and machine learning techniques
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113033
PMID:39226823
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研究论文 | 本研究通过先进的特征选择和机器学习技术，提高了转移性结直肠癌的预测准确性 | 引入了创新的成本敏感快速相关性过滤（CS-FCBF）算法，显著提高了预测模型的性能 | NA | 提高转移性结直肠癌的预测准确性，改善患者生存结果 | 转移性结直肠癌的预测和诊断 | 机器学习 | 结直肠癌 | 成本敏感快速相关性过滤（CS-FCBF）算法 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 184个基因特征减少到9个关键基因 | NA | NA | NA | NA |
| 22905 | 2024-10-09 |
A multi-task deep learning model based on comprehensive feature integration and self-attention mechanism for predicting response to anti-PD1/PD-L1
2024-Dec-05, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2024.113099
PMID:39265355
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研究论文 | 本文提出了一种基于综合特征集成和自注意力机制的多任务深度学习模型，用于预测抗PD1/PD-L1治疗的反应 | 本文创新性地整合了多层次的特征，并利用自注意力机制构建了多任务深度学习模型，以提高预测免疫检查点抑制剂疗效的准确性 | 本文的模型在不同癌症类型中的表现存在差异，且样本量较小，可能影响模型的泛化能力 | 本研究旨在通过多维特征选择和深度学习模型构建，提高免疫检查点抑制剂疗效预测的准确性 | 本研究主要针对抗PD1/PD-L1治疗的反应进行预测 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 多任务深度学习模型 | 基因表达数据 | 本研究涉及的样本包括膀胱尿路上皮癌测试集1（n=298）、膀胱尿路上皮癌测试集2（n=89）、非小细胞肺癌测试集（n=27）和皮肤黑色素瘤测试集（n=27） | NA | NA | NA | NA |
| 22906 | 2024-10-09 |
RNA-seq and bulk RNA-seq data analysis of cancer-related fibroblasts (CAF) in LUAD to construct a CAF-based risk signature
2024-10-06, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-024-74336-1
PMID:39369095
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研究论文 | 研究通过分析LUAD中的CAF相关RNA-seq数据，构建了一个基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后 | 构建了一个新的基于CAF的风险特征，并验证了其在预测LUAD预后和免疫治疗反应中的有效性 | NA | 开发一种基于CAF的风险特征，用于预测LUAD患者的预后和免疫治疗反应 | LUAD中的CAF及其相关基因表达数据 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA-seq | Lasso回归 | RNA-seq数据 | 2811个差异表达基因，其中1002个与CAF簇显著相关 | NA | NA | NA | NA |
| 22907 | 2024-10-09 |
Lumican promotes calcific aortic valve disease through H3 histone lactylation
2024-Oct-05, European heart journal
IF:37.6Q1
DOI:10.1093/eurheartj/ehae407
PMID:38976370
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研究论文 | 研究揭示了lumican在钙化性主动脉瓣疾病（CAVD）中的关键调节作用，特别是通过H3组蛋白乳酸化促进钙化过程 | 首次发现lumican通过介导H3组蛋白乳酸化促进主动脉瓣钙化 | NA | 探讨lumican在钙化性主动脉瓣疾病中的作用机制 | 主动脉瓣间质细胞（VICs）及其在钙化过程中的转变 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 9个人类主动脉瓣 | NA | NA | NA | NA |
| 22908 | 2024-10-09 |
C-ziptf: stable tensor factorization for zero-inflated multi-dimensional genomics data
2024-Oct-05, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05886-4
PMID:39369208
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研究论文 | 本文介绍了一种新的零膨胀多维基因组数据分解方法，名为零膨胀泊松张量分解（ZIPTF），并提出了共识ZIPTF（C-ZIPTF）以解决随机性问题 | 提出了ZIPTF和C-ZIPTF方法，能够有效处理零膨胀的多维基因组数据，并在重建精度和一致性方面优于传统方法 | NA | 开发一种能够有效处理零膨胀多维基因组数据的稳定张量分解方法 | 零膨胀的多维基因组数据，特别是单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 张量分解（TF） | 基因组数据 | 涉及合成数据、模拟scRNA-seq数据和真实的多样本多条件scRNA-seq数据 | NA | NA | NA | NA |
| 22909 | 2024-10-09 |
Antagonistic effects of the cytotoxic molecules granzyme B and TRAIL in the immunopathogenesis of sclerosing cholangitis
2024-10-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000830
PMID:38441998
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研究论文 | 研究了细胞毒性分子GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎免疫发病机制中的拮抗作用 | 首次揭示了GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的不同作用机制，GzmB促进细胞凋亡和纤维化，而TRAIL则调节炎症和细胞毒性免疫反应，减少肝损伤和纤维化 | 研究主要基于Mdr2-/-小鼠模型和患者样本，可能不完全适用于所有硬化性胆管炎病例 | 探讨GzmB和TRAIL在硬化性胆管炎中的作用及其对疾病进展的影响 | 硬化性胆管炎患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | 肝病 | 单细胞RNA测序、多参数流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | 患者样本和Mdr2-/-小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 22910 | 2024-10-09 |
COFFEE: consensus single cell-type specific inference for gene regulatory networks
2024-Sep-23, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae457
PMID:39311699
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研究论文 | 本文介绍了一种基于Borda投票的共识算法COFFEE，用于从单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络 | COFFEE算法通过整合10种已建立的基因调控网络推断方法，提高了在合成、精选和实验数据集上的性能 | COFFEE算法目前仅在10种算法上进行了基准测试，未来可能需要扩展到更多算法 | 开发一种适用于单细胞RNA测序数据的共识基因调控网络推断方法 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共识算法 | 基因调控网络 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22911 | 2024-10-09 |
Application of Unsupervised Multi-Omic Factor Analysis to Uncover Patterns of Variation and Molecular Processes Linked to Cardiovascular Disease
2024-Sep-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/66659
PMID:39373483
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研究论文 | 本文展示了一种无监督的多组学因子分析方法，用于揭示与心血管疾病相关的变异模式和分子过程 | 本文提出了多组学因子分析（MOFA）方法，用于无监督地分析复杂的多组学数据集，揭示主要的变异轴和相关的分子特征 | 本文主要集中在心血管疾病的急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征，未涵盖其他疾病类型 | 研究目的是通过多组学数据分析，揭示与心血管疾病相关的分子过程和变异模式 | 研究对象包括急性冠状动脉综合征和慢性冠状动脉综合征患者的血液样本 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 多组学因子分析（MOFA） | NA | 多组学数据 | 多个患者的血液样本，包括不同时间点的测量数据 | NA | NA | NA | NA |
| 22912 | 2024-10-09 |
Exploring public cancer gene expression signatures across bulk, single-cell and spatial transcriptomics data with signifinder Bioconductor package
2024-Sep, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqae138
PMID:39363890
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研究论文 | 本文介绍了一个名为signifinder的R Bioconductor包，用于在批量、单细胞和空间转录组数据中探索和使用公共癌症基因表达特征 | 开发了signifinder包，整合了批量、单细胞和空间转录组数据中的癌症基因表达特征，提供了一个全面的框架来解释高分辨率数据并解决肿瘤复杂性 | NA | 探索癌症机制、定义亚型、预测预后和评估治疗效果 | 癌症基因表达特征在批量、单细胞和空间转录组数据中的应用 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22913 | 2024-10-09 |
A Bioinformatics-Based Study on Methylation Alterations of the FBLN1 Gene in Hippocampal Tissue of Alzheimer's Disease Model DKO and DTG Mice
2024-Aug-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms25169036
PMID:39201719
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研究论文 | 本研究探讨了阿尔茨海默病模型DKO和DTG小鼠海马组织中FBLN1基因的甲基化变化 | 首次通过单细胞测序和实验方法验证了FBLN1基因在阿尔茨海默病中的异常甲基化状态及其与疾病的相关性 | 样本量较小，仅限于DKO和DTG小鼠模型 | 研究阿尔茨海默病中海马组织FBLN1基因的甲基化变化及其与疾病的关系 | DKO和DTG小鼠海马组织中的FBLN1基因 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序、RT-PCR、Western blotting、Reduced Representation Bisulfite Sequencing | NA | 基因组DNA、mRNA、蛋白质 | DKO、DTG和CBAC57小鼠 | NA | NA | NA | NA |
| 22914 | 2024-10-09 |
Simple aneuploidy evades p53 surveillance and promotes niche factor-independent growth in human intestinal organoids
2024-Aug-01, Molecular biology of the cell
IF:3.1Q3
DOI:10.1091/mbc.E24-04-0166
PMID:38985518
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研究论文 | 本文研究了简单非整倍体在人类肠道类器官中逃避p53监控并促进非微环境因子依赖性生长的机制 | 发现简单非整倍体细胞能够逃避p53监控，并可能促进癌症起始结肠干细胞的非微环境因子依赖性生长 | NA | 探讨非整倍体在癌症早期演化中的作用 | 人类结肠类器官中的非整倍体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 非整倍体诱导的人类结肠类器官 | NA | NA | NA | NA |
| 22915 | 2024-10-09 |
Brief Report: Comprehensive Clinicogenomic Profiling of Small Cell Transformation From EGFR-Mutant NSCLC Informs Potential Therapeutic Targets
2024-Feb, JTO clinical and research reports
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jtocrr.2023.100623
PMID:38357092
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研究论文 | 本研究对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了临床和基因组特征的回顾性分析，并探讨了潜在的治疗靶点 | 首次对EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者进行了全面的临床基因组分析，并揭示了潜在的治疗靶点 | 研究样本量较小，需要进一步的大规模研究来验证结果 | 探讨EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的临床和基因组特征，并寻找潜在的治疗靶点 | EGFR突变型非小细胞肺癌转化为小细胞肺癌的患者 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS）、单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据、临床数据 | 34例患者 | NA | NA | NA | NA |
| 22916 | 2024-10-09 |
MerTK-dependent efferocytosis by monocytic-MDSCs mediates resolution of post-lung transplant injury
2024-Jan-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.18.576261
PMID:38328174
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研究论文 | 研究探讨了MerTK依赖的单核细胞来源的髓系抑制细胞（M-MDSCs）在肺移植后缺血再灌注损伤（IRI）中的作用 | 首次揭示了MerTK在M-MDSCs中的作用，通过吞噬凋亡细胞促进肺IRI的恢复 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探讨MerTK在M-MDSCs中的作用，以促进肺移植后IRI的恢复 | 肺移植患者和小鼠模型中的M-MDSCs | 数字病理学 | 肺移植相关疾病 | 单细胞RNA测序、流式细胞术 | NA | RNA序列数据 | 包括肺移植患者和小鼠模型的多个样本 | NA | NA | NA | NA |
| 22917 | 2024-10-09 |
The single-cell transcriptome of mTECs and CD4+ thymocytes under adhesion revealed heterogeneity of mTECs and a network controlled by Aire and lncRNAs
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1376655
PMID:39328409
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研究论文 | 研究了在粘附过程中，自身免疫调节因子（Aire）基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞单细胞转录组的影响 | 揭示了mTECs在转录组水平上的异质性，并发现Aire和长链非编码RNAs（lncRNAs）在调控mTECs和胸腺细胞网络中的作用 | NA | 探讨Aire基因缺陷对胸腺髓质上皮细胞和胸腺细胞在粘附过程中的影响 | 胸腺髓质上皮细胞（mTECs）和CD4+胸腺细胞 | 基因表达 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 野生型（WT）和Aire缺陷型（Aire-deficient）mTECs与WT单阳性（SP）CD4胸腺细胞共培养的单细胞库 | NA | NA | NA | NA |
| 22918 | 2024-10-09 |
The Role of Polycystic Kidney Disease-Like Homologs in Planarian Nervous System Regeneration and Function
2024, Integrative organismal biology (Oxford, England)
DOI:10.1093/iob/obae035
PMID:39364443
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研究论文 | 研究了多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 首次全面研究了涡虫基因组中所有基因在感觉神经元中的表达和功能，并开发了用于机械感觉刺激的自动化设置 | 对数十种神经元亚型的功能了解仍然有限 | 探讨多囊肾病样同源基因在涡虫神经系统再生和功能中的作用 | 涡虫的感觉神经元及其在机械刺激和食物检测中的功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涡虫的无性和雌雄同体品系 | NA | NA | NA | NA |
| 22919 | 2024-10-09 |
Prognosis of colorectal cancer, prognostic index of immunogenic cell death associated genes in response to immunotherapy, and potential therapeutic effects of ferroptosis inducers
2024, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2024.1458270
PMID:39372411
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研究论文 | 本研究利用生物信息学和医学大数据整合了来自Gene Expression Omnibus (GEO)和The Cancer Genome Atlas (TCGA)的数据集，全面概述了免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因在结直肠癌(CRC)中的表达 | 研究揭示了ICD相关基因在CRC中的分子通路和基因网络，并探讨了细胞死亡诱导剂（包括铁死亡诱导剂）的治疗潜力及其在精准医学中的应用 | NA | 阐明ICD在结直肠癌中的分子机制及其在治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)中的免疫原性细胞死亡(ICD)相关基因 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 差异表达分析、共识聚类、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO和TCGA的多个结直肠癌样本 | NA | NA | NA | NA |
| 22920 | 2024-10-09 |
Comprehensive Analysis of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq Reveals Transcriptional Signatures of Macrophages in Intrahepatic Cholestasis of Pregnancy
2024, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S471374
PMID:39372590
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和批量RNA测序分析了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征 | 首次揭示了妊娠期肝内胆汁淤积症中巨噬细胞的转录特征，并发现了炎症状态的倾向 | NA | 探究妊娠期肝内胆汁淤积症中免疫细胞和免疫基因的调控机制 | 妊娠期肝内胆汁淤积症中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 妊娠期肝内胆汁淤积症 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |