单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 22881 - 22900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22881 | 2024-08-08 |
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11090940
PMID:34575089
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研究论文 | 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法，用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型，并包括一组定性分类标准（生物标志物）和各种规则 | 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法，识别非小细胞肺癌的细胞标志物 | NA | 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 | 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | 随机森林分类器和决策树 | 转录组数据 | 720个特征用于随机森林分类器，1880个特征用于决策树 |
| 22882 | 2024-08-08 |
Single-Cell Omics in Dissecting Immune Microenvironment of Malignant Gliomas-Challenges and Perspectives
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092264
PMID:34571910
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研究论文 | 本文综述了单细胞技术在解析恶性胶质瘤免疫微环境中的应用，并探讨了其面临的挑战和未来展望 | 单细胞RNA测序和时间飞行细胞仪技术提供了前所未有的肿瘤微环境解析能力 | NA | 总结单细胞技术在恶性胶质瘤免疫微环境研究中的发现，并探讨其对设计有效免疫疗法的重要性 | 恶性胶质瘤的免疫微环境及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、时间飞行细胞仪（CyTOF） | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22883 | 2024-08-08 |
Loss of Ubiquitin Carboxy-Terminal Hydrolase L1 Impairs Long-Term Differentiation Competence and Metabolic Regulation in Murine Spermatogonial Stem Cells
2021-08-31, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092265
PMID:34571914
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研究论文 | 研究探讨了UCH-L1在鼠精原干细胞中的作用及其对长期分化能力和代谢调节的影响 | 首次揭示了UCH-L1缺失对精原干细胞稳态和代谢的影响，以及其对精原干细胞分化能力的潜在作用 | NA | 理解UCH-L1在鼠精原干细胞中的功能及其对精原干细胞分化和代谢的影响 | 鼠精原干细胞 | NA | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22884 | 2024-08-08 |
Pushing the Boundaries: Forensic DNA Phenotyping Challenged by Single-Cell Sequencing
2021-08-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12091362
PMID:34573344
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的应用 | 首次将单细胞测序技术应用于法医DNA表型分析，以改善混合物解卷积 | 单细胞测序在法医学中的应用尚不普遍 | 研究单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的潜力 | 从尸检血液中分离的白细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 20、10、5个细胞组以及20个单细胞 |
| 22885 | 2024-08-08 |
Modeling Notch-Induced Tumor Cell Survival in the Drosophila Ovary Identifies Cellular and Transcriptional Response to Nuclear NICD Accumulation
2021-08-27, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10092222
PMID:34571871
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研究论文 | 本文通过建立果蝇卵巢肿瘤模型，研究了核内NICD积累对肿瘤细胞存活的影响及其细胞和转录反应。 | 开发了一种新的肿瘤模型，利用bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，揭示了NICD积累对肿瘤生长和细胞存活的分子机制。 | NA | 旨在理解NICD积累在肿瘤发生过程中的影响及其分子机制。 | 果蝇卵巢肿瘤细胞及其对NICD积累的响应。 | 数字病理学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 使用了bulk RNA测序和单细胞RNA测序技术，具体样本数量未明确。 |
| 22886 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Cisplatin-Treated Adult Stria Vascularis Identifies Cell Type-Specific Regulatory Networks and Novel Therapeutic Gene Targets
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.718241
PMID:34566577
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究顺铂处理后的成年鼠血管纹细胞，识别细胞类型特异性的调控网络和新的治疗基因靶点。 | 本文首次结合顺铂处理和单细胞RNA测序技术，揭示了血管纹细胞在顺铂暴露下的转录变化，并识别了独特的基因调控网络和可药物干预的基因靶点。 | NA | 旨在建立内耳电位功能障碍模型，进行转录分析和治疗测试。 | 成年鼠血管纹细胞在顺铂处理后的转录变化和治疗基因靶点。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 成年鼠 |
| 22887 | 2024-08-08 |
Inhibition of BCL9 Modulates the Cellular Landscape of Tumor-Associated Macrophages in the Tumor Immune Microenvironment of Colorectal Cancer
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.713331
PMID:34566638
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研究论文 | 研究通过单细胞测序探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）细胞景观的影响 | 首次提出TAM-to-NK评分，评估肿瘤微环境中单核细胞/TAM细胞与NK样非功能细胞的动态平衡 | NA | 探讨BCL9抑制对结直肠癌肿瘤微环境中TAMs细胞类型平衡和转录差异的影响 | 结直肠癌肿瘤相关巨噬细胞（TAMs） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22888 | 2024-08-08 |
Gene Signatures of NEUROGENIN3+ Endocrine Progenitor Cells in the Human Pancreas
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.736286
PMID:34566896
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术深入探索人类胰腺中NEUROGENIN3+（NEUROG3+）内分泌前体细胞的分子程序 | 首次在人类中直接利用单细胞RNA测序技术研究NEUROG3+细胞，并揭示了其独特的基因特征和调控网络 | NA | 探索人类胰腺中NEUROG3+细胞的分子程序，以促进糖尿病治疗中β细胞再生的疗法开发 | 人类胰腺中的NEUROG3+内分泌前体细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11,174个胰腺细胞中的10个NEUROG3+上皮细胞 |
| 22889 | 2024-08-08 |
Unraveling the Heterogeneity and Ontogeny of Dendritic Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711329
PMID:34566965
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术揭示树突状细胞（DCs）的异质性和发育过程的最新进展 | 利用scRNA-seq技术深入探讨了DCs的重新分类和发育，以及在疾病中DCs的异质性和多功能性 | NA | 探讨树突状细胞的异质性和发育过程 | 树突状细胞（DCs） | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | NA |
| 22890 | 2024-08-08 |
AdImpute: An Imputation Method for Single-Cell RNA-Seq Data Based on Semi-Supervised Autoencoders
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.739677
PMID:34567089
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于半监督自编码器的单细胞RNA测序数据插补方法AdImpute | AdImpute方法使用另一种插补方法的结果作为自编码器的插补权重，并通过带有插补权重的成本函数学习数据的潜在信息，实现更准确的插补 | NA | 开发一种更准确的单细胞RNA测序数据插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 自编码器 | RNA测序数据 | 模拟数据集和真实数据集 |
| 22891 | 2024-08-08 |
The Stromal and Immune Landscape of Nasopharyngeal Carcinoma and Its Implications for Precision Medicine Targeting the Tumor Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.744889
PMID:34568077
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综述 | 本文综述了鼻咽癌（NPC）的基质和免疫景观，并探讨了针对肿瘤微环境（TME）的精准医疗方法 | 利用单细胞测序技术解析了NPC浸润细胞的基质组成和功能动态，为精准治疗提供了新的视角 | 缺乏对TME的深入理解，限制了治疗的发展和优化 | 详细描绘NPC的基质景观，并提出基于微环境的精准治疗方法 | 鼻咽癌的肿瘤微环境及其对治疗的影响 | NA | 鼻咽癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22892 | 2024-08-08 |
LEARNING GENERAL TRANSFORMATIONS OF DATA FOR OUT-OF-SAMPLE EXTENSIONS
2020-Sep, IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing : [proceedings]. IEEE International Workshop on Machine Learning for Signal Processing
DOI:10.1109/mlsp49062.2020.9231660
PMID:34557339
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研究论文 | 本文提出了一种新的神经网络模型NTNet，用于从数据中隔离出代表转换本身的信号，以便将其应用于新的数据分布 | NTNet能够隔离数据转换信号，并将其应用于训练过程中未见的新数据分布，从而实现数据转换的泛化 | NA | 解决生成模型如GAN在训练过程中无法泛化数据转换到新分布的问题 | NTNet模型在合成和生物医学单细胞RNA测序数据上的应用 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NTNet | 数据 | 超过一打合成和生物医学单细胞RNA测序数据集 |
| 22893 | 2024-08-08 |
Accurate Estimation of Single-Cell Differentiation Potency Based on Network Topology and Gene Ontology Information
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3112951
PMID:34529570
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研究论文 | 本文提出了一种新的中心性度量方法NCG，结合网络拓扑属性和基因本体功能相似性分数来估计单细胞的分化潜能 | NCG度量方法结合了网络拓扑特性和基因功能信息，提高了单细胞分化潜能估计的可靠性和鲁棒性 | NA | 开发一种新的方法来准确估计单细胞的分化潜能 | 单细胞的分化潜能 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因本体信息 | NA |
| 22894 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing profiling of mouse endothelial cells in response to pulmonary arterial hypertension
2022-08-24, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvab296
PMID:34528097
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了小鼠肺动脉高压条件下内皮细胞的转录组变化 | 揭示了肺动脉高压诱导的内皮细胞转录组变化，并发现了新的潜在治疗靶点 | NA | 旨在以单细胞分辨率表征肺动脉高压中的内皮细胞动态 | 小鼠肺内皮细胞 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自内皮细胞系追踪小鼠模型的肺内皮细胞，分别在对照和SU5416/低氧诱导的肺动脉高压条件下 |
| 22895 | 2024-08-08 |
Multiomic Analysis Reveals Comprehensive Tumor Heterogeneity and Distinct Immune Subtypes in Multifocal Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2022-05-02, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-1157
PMID:34526363
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研究论文 | 本研究通过多组学分析揭示了多灶性肝内胆管癌的全面肿瘤异质性和独特的免疫亚型 | 首次详细描述了多灶性肝内胆管癌的免疫基因组和表观基因组异质性，并基于此提出了免疫分类方法 | 研究样本量相对较小，且需要进一步的独立队列验证 | 旨在通过多组学分析揭示多灶性肝内胆管癌的免疫基因组和表观基因组异质性，以指导治疗决策 | 多灶性肝内胆管癌的肿瘤异质性和免疫反应 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 全外显子测序、批量和单细胞RNA测序、甲基化微阵列、多重免疫染色 | NA | 基因组数据、转录组数据、表观基因组数据 | 66个肿瘤样本来自16名患者 |
| 22896 | 2024-08-08 |
Network-based analysis revealed significant interactions between risk genes of severe COVID-19 and host genes interacted with SARS-CoV-2 proteins
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab372
PMID:34535795
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研究论文 | 本研究通过开发的用户友好型软件Network Calculator，采用基于网络的方法，揭示了严重COVID-19风险基因与SARS-CoV-2蛋白相互作用的主机基因之间的显著相互作用 | 本研究首次通过网络分析方法，识别了严重COVID-19风险基因与SARS-CoV-2相互作用的主机基因之间的网络关系，并发现了关键基因HNRNPK | NA | 探索严重COVID-19的风险基因是否通过与SARS-CoV-2蛋白相互作用的主机基因相互作用来发挥其调控作用 | 严重COVID-19的风险基因与SARS-CoV-2蛋白相互作用的主机基因 | 生物信息学 | COVID-19 | 网络分析 | NA | RNA-seq数据 | 13个风险基因和28个SARS-CoV-2相互作用的主机基因 |
| 22897 | 2024-08-08 |
Enhancing discoveries of molecular QTL studies with small sample size using summary statistic imputation
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab370
PMID:34545927
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研究论文 | 本文提出了一种名为xQTLImp的计算框架，用于在小样本量的分子QTL研究中填补缺失的分子QTL关联 | xQTLImp框架通过利用已知的关联统计和连锁不平衡（LD）信息，在局部区域和全基因组范围内提高了填补准确性和新QTL的发现能力 | NA | 解决小样本量分子QTL研究中因样本限制和成本导致的分子性状-变异关联缺失问题 | 分子QTL研究中的缺失关联填补 | NA | NA | NA | 多元高斯模型 | 多组学数据 | 小样本量 |
| 22898 | 2024-08-08 |
Identifying transcriptional programs underlying cancer drug response with TraCe-seq
2022-01, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01005-3
PMID:34531539
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研究论文 | 本文开发了一种名为TraCe-seq的方法，通过单细胞RNA测序技术追踪癌细胞克隆对不同治疗的早期适应性转录程序，并评估了下一代双表皮生长因子受体（EGFR）降解剂与标准EGFR激酶抑制剂在EGFR突变肺癌细胞中的效果 | TraCe-seq方法能够以克隆分辨率捕获复杂细胞群体中细胞的起源、命运及对不同治疗的早期适应性转录程序 | NA | 研究预存的转录程序如何影响治疗反应 | EGFR突变肺癌细胞对不同EGFR抑制剂的反应 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22899 | 2024-08-08 |
Cellular heterogeneity and immune microenvironment revealed by single-cell transcriptome in venous malformation and cavernous venous malformation
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.004
PMID:34536440
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了静脉畸形（VM）和海绵状静脉畸形（CVM）的细胞异质性和免疫微环境 | 首次揭示了VM和CVM在细胞组成和信号通路上的差异，并识别了多种免疫细胞类型及其在疾病发展中的作用 | 研究样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探究VM和CVM的分子差异及其与疾病发展的关系 | 静脉畸形（VM）和海绵状静脉畸形（CVM）的细胞和免疫微环境 | 数字病理学 | 静脉畸形 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 35,245个细胞，来自两个VM样本和三个CVM样本 |
| 22900 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in YRDC cause a developmental disorder with progeroid features
2021-Dec, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-021-02347-3
PMID:34545459
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研究论文 | 本文报道了一个因YRDC基因双等位变异导致的新生儿严重早衰表型的病例，并通过全外显子测序和功能分析揭示了该变异对YRDC功能的影响及其对tRNA修饰和端粒维持的影响。 | 本文首次报道了YRDC基因的双等位变异与发育障碍和早衰特征的关联，并开发了一种新的高灵敏度3-D Q-FISH分析方法来研究YRDC对端粒维持的影响。 | 本文主要基于单一病例的研究，需要更多的病例来验证YRDC变异与早衰表型的普遍性和相关性。 | 研究YRDC基因变异与发育障碍和早衰表型的关联及其分子机制。 | 一个具有严重早衰表型的新生儿及其衍生的成纤维细胞。 | NA | 发育障碍 | 全外显子测序，3-D Q-FISH分析，单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据，转录组数据 | 单一病例 |