单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 22881 - 22900 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22881 | 2024-08-08 |
Current Epigenetic Insights in Kidney Development
2021-08-21, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081281
PMID:34440455
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综述 | 本文综述了与肾脏发育相关的表观遗传机制，包括主要基因和信号通路，以及单细胞RNA测序技术在肾脏发育研究中的应用 | 结合单细胞RNA测序和单细胞表观基因组学技术，有助于进一步理解胚胎和成人肾脏发育中早期细胞谱系特化的表观遗传修饰 | NA | 探讨表观遗传机制在肾脏发育中的作用 | 肾脏发育中的表观遗传机制 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22882 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of Hepatic Stellate Cells in Fibrogenesis of the Liver: Insights from Single-Cell Transcriptomic Analysis in Liver Injury
2021-08-19, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10082129
PMID:34440898
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析（scRNA-seq）探讨了肝星状细胞（HSC）在肝损伤中的纤维化机制 | 发现了多个HSC亚群，其中一个亚群表达高水平的细胞周期调控基因，并揭示了HSC向肌成纤维细胞转化的动态过程 | NA | 阐明肝星状细胞激活的机制及其在肝损伤中的纤维化过程 | 肝星状细胞及其在肝损伤中的功能异质性 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 使用了LRAT-Cre:Rosa26mT/mG小鼠模型，通过流式细胞仪分离出激活的GFP阳性HSC细胞群，共鉴定出8个HSC亚群 |
| 22883 | 2024-08-08 |
EmptyNN: A neural network based on positive and unlabeled learning to remove cell-free droplets and recover lost cells in scRNA-seq data
2021-Aug-13, Patterns (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.patter.2021.100311
PMID:34430929
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研究论文 | 介绍了一种名为EmptyNN的新型细胞识别算法，该算法基于正未标记学习训练神经网络，用于改进条形码过滤，以区分无细胞和含细胞的液滴 | EmptyNN算法能够准确移除无细胞液滴并恢复丢失的细胞群集，其性能优于当前最先进的细胞识别算法 | NA | 提高基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）的质量控制分析 | 基于液滴的单细胞RNA测序数据中的无细胞和含细胞液滴 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 神经网络 | RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22884 | 2024-08-08 |
Clinical Perspectives of Single-Cell RNA Sequencing
2021-08-06, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom11081161
PMID:34439827
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在癌症精准医疗中的应用及其临床意义 | 单细胞基因组学能够解决肿瘤内异质性和微环境成分对治疗反应和抵抗的影响 | 单细胞基因组学在临床相关性的探索上仍处于早期阶段，需要进一步创新以广泛应用于临床 | 探索单细胞RNA测序技术在癌症精准医疗中的应用 | 癌症细胞的异质性和微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22885 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on the Therapeutic Potentiality of PD-L1-Inhibiting MicroRNAs for Triple-Negative Breast Cancer: Toward Single-Cell Sequencing-Guided Biomimetic Delivery
2021-08-04, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes12081206
PMID:34440380
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综述 | 本文是一篇系统综述，旨在探讨PD-L1抑制性微小RNA（miRs）在三阴性乳腺癌（TNBC）治疗中的潜在应用，特别是基于单细胞测序引导的仿生递送策略。 | 本文提出了基于单细胞测序技术的仿生递送策略，以提高miR递送的特异性、效力和减少传统方法的毒性，为患者提供个性化癌症治疗。 | NA | 旨在全面且无偏见地综合当前关于PD-L1抑制性miRs恢复对TNBC发展和肿瘤微环境影响的证据。 | 研究对象为三阴性乳腺癌（TNBC）及其肿瘤微环境。 | NA | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22886 | 2024-08-08 |
Regulatory Mechanisms of Retinal Photoreceptors Development at Single Cell Resolution
2021-Aug-04, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms22168357
PMID:34445064
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综述 | 本文综述了人眼视网膜光感受器细胞的类型，总结了单细胞分辨率下其发育调控机制的最新发现，并展望了该领域的未来发展 | 利用单细胞测序技术研究光感受器发育的新方法 | NA | 探讨视网膜光感受器细胞发育的调控机制 | 视网膜光感受器细胞 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22887 | 2024-08-08 |
miQC: An adaptive probabilistic framework for quality control of single-cell RNA-sequencing data
2021-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009290
PMID:34428202
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研究论文 | 本文提出了一种名为miQC的自适应概率框架，用于单细胞RNA测序数据的质量控制 | miQC通过联合模型同时考虑线粒体DNA编码基因的读取比例和检测到的基因数量，以概率框架预测低质量细胞，相较于传统方法更具数据驱动性 | NA | 开发一种新的数据驱动质量控制方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的低质量细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 混合模型 | 基因表达数据 | NA |
| 22888 | 2024-08-08 |
Regulation of CTLA-4 and PD-L1 Expression in Relapsing-Remitting Multiple Sclerosis Patients after Treatment with Fingolimod, IFNβ-1α, Glatiramer Acetate, and Dimethyl Fumarate Drugs
2021-Jul-27, Journal of personalized medicine
IF:3.0Q1
DOI:10.3390/jpm11080721
PMID:34442365
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研究论文 | 研究评估了多发性硬化症患者在接受不同药物治疗后，外周血单个核细胞中CTLA-4和PD-L1基因表达的变化 | 使用单细胞RNA测序数据评估多发性硬化症患者不同细胞类型中CTLA-4和PD-L1的基因表达 | NA | 研究CTLA-4和PD-L1表达在多发性硬化症治疗中的变化及其对疾病发展的影响 | 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞 | NA | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22889 | 2024-08-08 |
Dynamic Network Biomarker of Pre-Exhausted CD8+ T Cells Contributed to T Cell Exhaustion in Colorectal Cancer
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.691142
PMID:34434188
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研究论文 | 本研究通过动态网络生物标志物（DNB）分析了结直肠癌（CRC）患者中单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据集中的CD8+ T细胞发育轨迹和前耗竭T细胞特征 | 首次使用DNB方法识别出结直肠癌中前耗竭T细胞亚群的生物标志物，并揭示了这些标志物与患者总体生存率的关联 | NA | 探究结直肠癌中T细胞耗竭的机制，并为靶向免疫治疗提供线索 | 结直肠癌患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | 动态网络生物标志物（DNB） | RNA | 来自结直肠癌患者的样本 |
| 22890 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics of Glioblastoma Reveals a Unique Tumor Microenvironment and Potential Immunotherapeutic Target Against Tumor-Associated Macrophage
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.710695
PMID:34434898
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序分析，揭示了胶质母细胞瘤中独特的肿瘤微环境及针对肿瘤相关巨噬细胞的潜在免疫治疗靶点。 | 首次在单细胞水平上描述了人胶质母细胞瘤的免疫景观，并定义了胶质母细胞瘤中肿瘤相关巨噬细胞的新分类方案。 | 研究主要集中在肿瘤相关巨噬细胞的激活状态和转录特征，未涉及其他免疫细胞类型。 | 阐明胶质母细胞瘤中免疫细胞的相对比例及其来源和状态，并识别潜在的免疫治疗靶点。 | 胶质母细胞瘤中的肿瘤相关巨噬细胞及其在不同亚型中的特征。 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 共分析了16,201个细胞 |
| 22891 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals the Suppressive Role of Retinal Neurons in Microglia Activation Under Diabetes Mellitus
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.680947
PMID:34434927
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了糖尿病视网膜病变中视网膜神经元对小胶质细胞激活的抑制作用 | 首次通过单细胞转录组测序分析了糖尿病视网膜病变早期细胞特异性分子变化及细胞间相互作用网络 | NA | 解析糖尿病视网膜病变早期阶段的细胞和分子机制 | 非人灵长类糖尿病视网膜的六种主要细胞类型 | NA | 糖尿病视网膜病变 | scRNA-seq | NA | 转录组 | 非人灵长类糖尿病视网膜样本 |
| 22892 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Peripheral Blood Reveals Immune Cell Signatures in Alzheimer's Disease
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.645666
PMID:34447367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了阿尔茨海默病（AD）患者和正常对照组的外周血单个核细胞，揭示了AD中免疫细胞亚群的特征性改变 | 首次在单细胞水平上揭示了AD患者外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | NA | 探索阿尔茨海默病中外周免疫细胞的分子基础和适应性免疫组库特征 | 阿尔茨海默病患者和正常对照组的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞转录组和免疫组库测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 36,849个外周血单个核细胞 |
| 22893 | 2024-08-08 |
deepMNN: Deep Learning-Based Single-Cell RNA Sequencing Data Batch Correction Using Mutual Nearest Neighbors
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.708981
PMID:34447413
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研究论文 | 提出了一种基于深度学习的单细胞RNA测序数据批次校正方法deepMNN | deepMNN通过在主成分分析子空间中搜索互最近邻对，并构建批次校正网络来去除批次效应，具有更好的性能和更快的运行速度 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的批次效应问题 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 基因表达数据 | 多个批次的大规模数据集 |
| 22894 | 2024-08-08 |
Roles of the Immune/Methylation/Autophagy Landscape on Single-Cell Genotypes and Stroke Risk in Breast Cancer Microenvironment
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/5633514
PMID:34457116
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研究论文 | 本研究旨在通过综合分析免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 本研究构建了基于BCRRS和BCPRS的风险预测模型，并利用临床数据评估其预测能力，同时通过scRNA-seq分析单细胞基因型，揭示了IMAAGs对乳腺癌肿瘤微环境的潜在调控作用 | NA | 研究免疫/甲基化/自噬景观对乳腺癌预后和单细胞基因型的影响 | 乳腺癌的复发风险评分（BCRRS）和预后风险评分（BCPRS），以及单细胞基因型 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNA-seq | 神经网络 | 基因数据 | 基于TCGA-BRCA队列的6个预后IMAAGs，以及TNBC样本的单细胞基因型 |
| 22895 | 2024-08-08 |
Cancer biology deciphered by single-cell transcriptomic sequencing
2022-03, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-021-00868-1
PMID:34405376
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综述 | 本文综述了单细胞转录组测序在解析肿瘤生态系统及其在肿瘤发生、癌症干细胞模型、治疗抵抗和癌症转移中的应用 | 单细胞转录组测序技术使得能够详细剖析肿瘤生态系统，并在单细胞分辨率上促进对肿瘤发生的理解 | NA | 探讨单细胞RNA测序在近期癌症研究中的主要应用 | 癌症细胞及其微环境 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组 | NA |
| 22896 | 2024-08-08 |
Comparative description of the mRNA expression profile of Na+ /K+ -ATPase isoforms in adult mouse nervous system
2022-02, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25234
PMID:34415061
|
研究论文 | 研究分析了成年小鼠神经系统中Na+/K+-ATPase异构体的mRNA表达谱 | 首次在单细胞水平上分析了不同脑区和神经元群体中Na+/K+-ATPase异构体的表达模式 | NA | 为了更好地理解这些疾病的病理机制，确定不同Na+/K+-ATPase亚基在大脑和特定细胞类型中的表达模式 | 成年小鼠神经系统中的Na+/K+-ATPase异构体的mRNA表达 | 数字病理学 | 神经系统疾病 | scRNA-Seq | NA | mRNA | 使用了两个来自成年小鼠神经系统的scRNA-Seq数据库 |
| 22897 | 2024-08-08 |
Heat-inactivated Escherichia coli promotes hematopoietic regeneration after irradiation with IL-1β
2022-02, Cytotherapy
IF:3.7Q2
DOI:10.1016/j.jcyt.2021.07.003
PMID:34426082
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研究论文 | 本文研究了热灭活的大肠杆菌（HIEC）与IL-1β联合使用对辐射后造血再生的促进作用及其潜在机制 | 首次探讨了HIEC与IL-1β联合使用对辐射后造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的再生促进作用 | NA | 研究HIEC与IL-1β联合使用对辐射后造血再生的促进作用及其潜在机制 | 造血干细胞和祖细胞（HSPCs） | NA | NA | 单细胞RNA测序, RT-PCR, 蛋白质印迹 | NA | 细胞 | 辐射致死的小鼠 |
| 22898 | 2024-08-08 |
UBCH5 Family Members Differentially Impact Stabilization of Mutant p53 via RNF128 Iso1 During Barrett's Progression to Esophageal Adenocarcinoma
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.08.003
PMID:34416429
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研究论文 | 研究探讨了UBCH5家族成员在Barrett's食管进展至食管腺癌过程中通过RNF128 Iso1对突变型p53稳定性的不同影响。 | 发现UBE2D1（UBCH5A）和RNF128 Iso1在异常增生Barrett's食管和食管腺癌中形成不活跃的E2-E3复合体，稳定突变型p53，为治疗提供了新策略。 | NA | 研究突变型p53在Barrett's食管进展至食管腺癌中的稳定性及其调控机制。 | UBCH5家族成员、RNF128 Iso1、突变型p53。 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 配对的正常食管和Barrett's食管组织样本 |
| 22899 | 2024-08-08 |
Spatiotemporal Immune Landscape of Colorectal Cancer Liver Metastasis at Single-Cell Level
2022-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-21-0316
PMID:34417225
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术，分析了结直肠癌肝转移的时空免疫景观，并开发了计算工具scMetabolism来量化单细胞代谢活性 | 首次揭示了结直肠癌肝转移微环境中M2样巨噬细胞的代谢活化状态，并探讨了新辅助化疗对此状态的影响 | NA | 描述结直肠癌肝转移的免疫演化过程，并揭示肿瘤如何响应新辅助化疗 | 结直肠癌肝转移的免疫微环境及M2样巨噬细胞的代谢活性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组学数据 | 97个匹配样本 |
| 22900 | 2024-08-08 |
Multiomic analysis reveals decidual-specific transcriptional programing of MAIT cells
2021-12, American journal of reproductive immunology (New York, N.Y. : 1989)
DOI:10.1111/aji.13495
PMID:34411378
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研究论文 | 本研究通过多组学方法揭示了妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序 | 首次详细描述了妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序，并探讨了其在母胎界面组织修复机制中的潜在作用 | 实验仅限于体外激活和基因表达分析，未涉及体内功能验证 | 探究妊娠期子宫内膜MAIT细胞的转录程序及其功能 | 子宫内膜MAIT细胞及其转录因子表达 | 免疫学 | 妊娠相关疾病 | CITE-seq, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 包括子宫内膜基底层和壁层的单核细胞以及对照的PBMCs |