单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 22861 - 22880 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22861 | 2024-08-08 |
SCSit: A high-efficiency preprocessing tool for single-cell sequencing data from SPLiT-seq
2021, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2021.08.021
PMID:34471500
|
research paper | 本文介绍了一种名为SCSit的高效预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SCSit工具能够直接识别组合条形码和细胞类型的UMI，获取更多标记读取，并通过精确的插入和删除对齐显著增强保留的数据 | NA | 开发一种高效的预处理工具，用于SPLiT-seq单细胞测序数据的预处理和分类 | SPLiT-seq单细胞测序数据 | digital pathology | NA | SPLiT-seq | NA | single-cell sequencing data | NA |
| 22862 | 2024-08-08 |
Upregulation of THBS1 is Related to Immunity and Chemotherapy Resistance in Gastric Cancer
2021, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S329208
PMID:34475782
|
研究论文 | 本文研究了血栓调节蛋白1（THBS1）在胃癌（GC）中的表达及其与免疫浸润和化疗抵抗的关系 | 首次详细探讨了THBS1表达与胃癌中免疫浸润的关系，并分析了其与药物敏感性的关联 | 研究主要基于数据库分析和免疫组化染色，可能缺乏直接的实验验证 | 探讨THBS1在胃癌中的表达及其对预后和化疗抵抗的影响 | 胃癌患者的THBS1表达及其与免疫浸润和药物敏感性的关系 | 数字病理学 | 胃癌 | Oncomine, TIMER, TGCA, GEO, IHC染色, GSEA, ESTIMATE算法, 单细胞转录组分析, TIMER2数据库, CIBERSORT算法, CellMiner数据库 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22863 | 2024-08-08 |
Expression Characteristics and Clinical Correlations of BRD1 in Colorectal Cancer Samples
2021 Jan-Dec, Technology in cancer research & treatment
IF:2.7Q3
DOI:10.1177/15330338211039678
PMID:34482774
|
研究论文 | 本研究探讨了BRD1基因在结直肠癌中的表达特征及其与临床的相关性 | 首次详细研究了BRD1基因在结直肠癌细胞中的表达及其作为治疗靶点的潜力 | 研究样本量有限，且仅基于单细胞转录组测序数据和免疫组化分析 | 探讨BRD1基因在结直肠癌中的表达及其作为生物标志物的潜力 | BRD1基因在结直肠癌中的表达及其临床相关性 | NA | 结直肠癌 | 免疫组化 | NA | 转录组数据 | 临床标本及GSE17536数据集 |
| 22864 | 2024-08-08 |
A Novel Single Cell RNA-seq Analysis of Non-Myeloid Circulating Cells in Late Sepsis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.696536
PMID:34484194
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术分析了晚期脓毒症患者非髓系循环细胞的转录组特征 | 首次详细分析了晚期脓毒症患者淋巴系来源的白细胞的转录组，并识别了多种循环免疫细胞亚型的独特转录组模式 | 样本量较小，仅包括四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者 | 通过单细胞RNA测序技术深入理解晚期脓毒症的病理机制 | 晚期脓毒症患者的非髓系循环细胞 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 四名晚期脓毒症患者和五名健康受试者的外周血单个核细胞 |
| 22865 | 2024-08-08 |
Transcriptome Profiling Reveals B-Lineage Cells Contribute to the Poor Prognosis and Metastasis of Clear Cell Renal Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.731896
PMID:34485161
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术鉴定了透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞，并发现这些B细胞与ccRCC的不良预后和转移有关 | 首次识别出ccRCC中促进转移的B细胞亚群，并发现这些亚群与特定基因的上调有关，为治疗ccRCC的远处转移提供了新的潜在治疗靶点 | NA | 探索ccRCC中B细胞的作用及其与疾病预后和转移的关系 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）中的B细胞 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、流式细胞术 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22866 | 2024-08-08 |
The Application of Single-Cell RNA Sequencing in Mammalian Meiosis Studies
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.673642
PMID:34485276
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在哺乳动物减数分裂研究中的应用 | scRNA-seq技术能够更有效地检测转录变异，特别是识别具有细微差异的细胞类型和阶段 | scRNA-seq技术存在挑战和局限性，如数据分析的复杂性和成本问题 | 探讨scRNA-seq在减数分裂研究中的优势及其在未来的应用前景 | 哺乳动物的减数分裂过程及其分子机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22867 | 2024-08-08 |
Epigenetic promoter alterations in GI tumour immune-editing and resistance to immune checkpoint inhibition
2022-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324420
PMID:34433583
|
研究论文 | 研究通过表观遗传学改变的替代启动子使用，探讨其在胃癌及其他胃肠道肿瘤中对肿瘤免疫微环境的影响及其与免疫检查点抑制剂治疗反应的关系 | 使用了一种新的生物信息学算法（proActiv）来量化替代启动子负担（APB），并通过单细胞RNA测序分析肿瘤内免疫微环境 | NA | 研究表观遗传学改变在胃癌及其他胃肠道肿瘤中的作用，以及其对肿瘤免疫微环境和免疫治疗反应的影响 | 胃癌及其他胃肠道肿瘤 | 数字病理学 | 胃肠道肿瘤 | 短读RNA测序 | NA | RNA | 多个胃肠道肿瘤治疗队列 |
| 22868 | 2024-08-08 |
Bottom-up proteomic analysis of human adult cardiac tissue and isolated cardiomyocytes
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.08.008
PMID:34437879
|
研究论文 | 本文介绍了一种从冷冻保存的人类心脏组织中分离心肌细胞的方法，并描述了用于自下而上蛋白质组分析的样品制备流程 | 首次描述了从冷冻保存的人类心脏组织中分离心肌细胞的方法，并提供了用于蛋白质组分析的样品制备流程 | NA | 促进未来针对人类心脏的细胞类型特异性分析 | 人类成年心脏组织和分离的心肌细胞 | 蛋白质组学 | NA | 自下而上蛋白质组分析 | NA | 蛋白质 | NA |
| 22869 | 2024-08-08 |
Therapeutic HNF4A mRNA attenuates liver fibrosis in a preclinical model
2021-12, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2021.08.011
PMID:34453962
|
研究论文 | 本研究探讨了通过mRNA递送技术恢复肝细胞功能以治疗肝纤维化和肝硬化的效果，特别是评估了人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | 首次提供了直接的临床前证据，证明HNF4A mRNA疗法适用于治疗肝脏纤维化。 | NA | 评估mRNA递送技术在治疗肝纤维化和肝硬化中的应用。 | 人肝细胞核因子α（HNF4A）mRNA在肝纤维化和肝硬化小鼠模型中的治疗效果。 | NA | 肝纤维化 | mRNA递送技术 | NA | 基因表达 | 多个小鼠模型，包括肝毒素和胆汁淤积诱导的肝纤维化模型。 |
| 22870 | 2024-08-08 |
Microglial 'fat shaming' in development and disease
2021-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2021.07.007
PMID:34455405
|
综述 | 本文综述了微胶质细胞在脑发育和疾病中的作用，特别是它们在神经退行性疾病中对脂质处理和运输的影响。 | 利用单细胞RNA测序方法，深入研究了微胶质细胞的异质性和对环境变化的转录反应。 | NA | 探讨微胶质细胞在脑发育和神经退行性疾病中的分子机制。 | 微胶质细胞在神经退行性疾病中的脂质积累和代谢。 | NA | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22871 | 2024-08-08 |
Coevolving JAK2V617F+relapsed AML and donor T cells with PD-1 blockade after stem cell transplantation: an index case
2021-11-23, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021004335
PMID:34432868
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序、T细胞受体测序、CITE-seq和scATAC-seq等高维度分析技术，研究了一例在造血干细胞移植后复发MPN患者中使用PD-1阻断剂后的免疫反应和白血病细胞变化。 | 首次综合运用多种单细胞技术分析PD-1阻断剂治疗后复发MPN患者的免疫反应和白血病细胞变化，为增强GVL反应的新疗法提供了理论基础。 | 研究仅基于一例复发MPN患者的数据，结果的普遍性和适用性有待进一步验证。 | 探讨PD-1阻断剂在造血干细胞移植后复发MPN患者中的治疗效果及其背后的细胞机制。 | 复发性MPN患者在接受PD-1阻断剂治疗前后的外周血单个核细胞。 | 数字病理学 | 血液肿瘤 | 单细胞RNA测序、T细胞受体测序、CITE-seq、scATAC-seq | NA | 单细胞数据 | 一例复发MPN患者在PD-1阻断剂治疗前后的6个时间点的外周血单个核细胞样本 |
| 22872 | 2024-08-08 |
Attenuated activation of pulmonary immune cells in mRNA-1273-vaccinated hamsters after SARS-CoV-2 infection
2021-10-15, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI148036
PMID:34449440
|
研究论文 | 研究了mRNA-1273疫苗在感染SARS-CoV-2的仓鼠中的免疫反应和保护效果 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析了mRNA-1273疫苗接种仓鼠肺组织中的免疫细胞反应 | 研究仅限于仓鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 评估mRNA-1273疫苗在仓鼠模型中的免疫反应和保护效果 | 仓鼠接种mRNA-1273疫苗后的免疫细胞和病毒复制情况 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22873 | 2024-08-08 |
An in vitro platform supports generation of human innate lymphoid cells from CD34+ hematopoietic progenitors that recapitulate ex vivo identity
2021-10-12, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.07.019
PMID:34453879
|
研究论文 | 本文开发了一种体外平台，能够从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞生成人类先天淋巴细胞（ILCs），并验证了其在体外生成的ILC亚型的身份。 | 本文首次系统性地探索了人类ILC的生成，并展示了通过特定细胞因子和Notch信号的组合可以生成不同的ILC亚型。 | NA | 开发一种可靠的体外平台，用于生成和研究人类先天淋巴细胞（ILCs）。 | 人类先天淋巴细胞（ILCs）及其亚型。 | NA | NA | NA | NA | 蛋白质表达、功能性检测、全局和单细胞转录组分析 | 从脐带血和骨髓中提取的CD34造血祖细胞 |
| 22874 | 2024-08-08 |
Restoring mammary gland structures and functions with autogenous cell therapy
2021-10, Biomaterials
IF:12.8Q1
|
研究论文 | 本文通过化学诱导方法将山羊耳成纤维细胞转化为具有泌乳功能的化学诱导乳腺上皮细胞，并研究了其在裸鼠中再生正常乳腺结构的能力 | 首次通过化学诱导方法实现了成纤维细胞直接转化为具有泌乳功能的乳腺上皮细胞，绕过了多能状态 | NA | 探索通过自体细胞疗法恢复乳腺结构和功能的新策略 | 山羊耳成纤维细胞和化学诱导乳腺上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22875 | 2024-08-08 |
Cellular origins and lineage relationships of the intestinal epithelium
2021-10-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00188.2021
PMID:34431400
|
研究论文 | 本文描述了肠道上皮细胞的分化和发展轨迹，重点介绍了基于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的方法及其在理解肠道上皮细胞系谱关系中的应用。 | 本文采用了最新的单细胞RNA测序技术，以更精细的方式解析了肠道上皮细胞的发展和系谱关系。 | 文章指出单细胞RNA测序技术虽然提供了详细的细胞类型和系谱信息，但其应用仍受限于技术和数据的解释。 | 研究肠道上皮细胞的起源和系谱关系，以更好地理解其在损伤和疾病中的扰动及治疗潜力。 | 肠道上皮细胞及其在稳态和损伤诱导再生模型中的动态变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22876 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Endothelial Cell Transcriptome Heterogeneity Under Homeostatic Laminar Flow
2021-10, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.121.316797
PMID:34433297
|
研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序和荧光显微镜分析了在稳态层流条件下人内皮细胞的RNA和蛋白质基因表达水平的异质性 | 首次揭示了稳态层流条件下内皮细胞RNA表达水平的整体异质性增加，而选定蛋白质的表达异质性并未紧密跟随RNA异质性的变化 | 研究仅分析了特定基因的RNA和蛋白质表达异质性，未涵盖所有内皮细胞基因 | 探讨内皮细胞在稳态层流条件下的转录组异质性及其对成熟血管功能的影响 | 人内皮细胞在稳态层流条件下的RNA和蛋白质基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22877 | 2024-08-08 |
Suppressive Monocytes Impair MAIT Cells Response via IL-10 in Patients with Severe COVID-19
2021-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100228
PMID:34452933
|
研究论文 | 本研究通过质谱流式细胞术全面分析了健康对照组和COVID-19患者的外周免疫细胞，发现重症COVID-19患者中HLA-DR单核细胞数量显著增加，而黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）数量大幅减少，且功能受损。 | 首次揭示了重症COVID-19患者中通过IFN/IL-10途径，抑制性HLA-DR单核细胞导致MAIT细胞功能障碍的免疫调节模式。 | 研究样本量相对较小，可能需要更大规模的研究来验证结果。 | 探讨重症COVID-19患者中免疫细胞反应的变化及其免疫调节机制。 | COVID-19患者（包括轻症、重症及无症状携带者）和健康对照组的外周免疫细胞。 | NA | COVID-19 | 质谱流式细胞术，单细胞转录组分析 | NA | 免疫细胞 | 23名轻症COVID-19患者，22名重症COVID-19患者，6名无症状COVID-19携带者，44名健康对照者 |
| 22878 | 2024-08-08 |
Foxm1 regulates neural progenitor fate during spinal cord regeneration
2021-09-06, EMBO reports
IF:6.5Q1
DOI:10.15252/embr.202050932
PMID:34427977
|
研究论文 | 研究通过批量和单细胞RNA测序分析了截肢前后分离的脊髓，揭示了Foxm1转录因子在脊髓再生中的新作用 | 发现了Foxm1在脊髓再生中调控神经前体细胞命运的新角色，而非控制细胞周期长度 | 组织特异性损伤反应的机制仍需进一步研究 | 探究脊髓再生过程中组织特异性反应的分子和细胞机制 | Xenopus蝌蚪的脊髓再生过程 | NA | NA | RNA测序 | NA | RNA | 截肢前后分离的脊髓样本 |
| 22879 | 2024-08-08 |
Quantitative lineage analysis identifies a hepato-pancreato-biliary progenitor niche
2021-09, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03844-1
PMID:34433966
|
研究论文 | 本文结合计算模型和遗传谱系追踪技术，精确重建了肝胰胆系统的谱系树，并揭示了一个多能祖细胞亚群在胰胆器官原基中的持续存在及其在发育中的作用 | 首次通过计算模型和遗传谱系追踪技术，精确重建了肝胰胆系统的谱系树，并定义了一个支持多能祖细胞亚群的特殊微环境 | 尚未完全阐明导致内胚层祖细胞分隔成肝、胆和胰腺结构的精确谱系层次和事件顺序 | 研究肝胰胆系统发育中的细胞可塑性及其对器官生长的影响 | 肝胰胆系统的祖细胞及其在器官发育中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | 计算模型 | 细胞 | NA |
| 22880 | 2024-08-08 |
A novel method for predicting cell abundance based on single-cell RNA-seq data
2021-Aug-25, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04187-4
PMID:34433409
|
研究论文 | 本文提出了一种名为DCap的新方法，用于基于单细胞RNA测序数据预测细胞丰度 | DCap方法通过非负最小二乘法考虑了批量RNA测序和单细胞RNA测序数据的测量噪声和计算误差，并通过加权迭代最小二乘法进行计算，从而减少了测量误差和不同样本中相同类型细胞表达基因数的差异导致的误差 | NA | 解决细胞类型丰度预测中的反卷积问题，并提供更好的疾病组织中细胞比例变化的研究 | 细胞类型丰度预测方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负最小二乘法 | RNA测序数据 | NA |