单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
22841 2024-08-08
Stiffness is associated with hepatic stellate cell heterogeneity during liver fibrosis
2022-02-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
研究论文 本文研究了肝纤维化过程中肝脏硬度的分布及其对肝星状细胞(HSC)异质性的影响,并探讨了硬度如何通过特定的粘附分子途径放大纤维化反应。 首次揭示了硬度在整体器官、小叶和细胞水平上的异质性,并通过特定的粘附分子途径驱动纤维化反应的放大循环。 NA 理解肝纤维化中硬度的分布及其对肝星状细胞异质性的影响,并识别硬度放大纤维化反应的机制。 肝纤维化中的肝脏硬度分布、肝星状细胞异质性及纤维化反应的放大机制。 数字病理学 肝病 磁共振弹性成像、原子力显微镜、单细胞RNA测序 NA 图像 使用四氯化碳(CCl)诱导的肝纤维化小鼠模型与健康对照组进行比较,以及从健康和CCl处理的小鼠中提取的初级肝星状细胞进行单细胞RNA测序。
22842 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomics Reveals Discrete Steps in Regulatory T Cell Development in the Human Thymus
2022-01-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
研究论文 本文通过结合单细胞转录组学和流式细胞术,揭示了人类胸腺中调节性T细胞发育的三个主要阶段 首次详细描述了人类胸腺中调节性T细胞发育的三个主要阶段,并提出了每个阶段的特征基因和表面标记 文中提到循环成熟的效应调节性T细胞的发育起源尚不明确,这可能会在使用胸腺组织作为稳定细胞来源进行细胞疗法时引起注意 阐明人类胸腺中调节性T细胞的发育过程,为细胞疗法提供更成熟的细胞来源 人类胸腺中的调节性T细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞转录组学, 流式细胞术 NA 基因表达数据 具体样本数量未提及
22843 2024-08-08
A census of the lung: CellCards from LungMAP
2022-01-10, Developmental cell IF:10.7Q1
研究论文 本文通过整合单细胞RNA测序和遗传谱系追踪等技术的新数据,创建了一个全面的肺细胞普查,包括细胞类型的身份、功能、标记、发育谱系、异质性、再生潜力、疾病关联和关键实验工具。 首次利用最新的单细胞RNA测序技术,对肺细胞进行全面普查,提供了详细的细胞类型信息和功能属性。 NA 旨在通过创建一个全面的肺细胞普查,促进呼吸健康的研究和支持。 人类肺部的细胞类型及其功能和属性。 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 文本 NA
22844 2024-08-08
Ubiquitin-conjugating enzyme V variant 1 enables cellular responses toward fibroblast growth factor signaling in endothelium
2022-01, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology IF:4.4Q2
研究论文 本文探讨了泛素结合酶V变体1(UBE2V1)在调节内皮细胞中成纤维细胞生长因子信号传导的作用 首次详细研究了UBE2V1在血管生成中的作用,特别是在成纤维细胞生长因子2诱导的血管生成中的关键作用 主要集中在体外和体内实验,可能需要更多临床数据支持 阐明UBE2V1在调节内皮细胞行为和血管生成中的作用 内皮细胞(ECs)和人类脐静脉内皮细胞(HUVECs) NA NA scRNA-seq NA RNA-seq数据 多种细胞类型,特别是内皮细胞
22845 2024-08-08
Cytokine and Nitric Oxide-Dependent Gene Regulation in Islet Endocrine and Nonendocrine Cells
2022, Function (Oxford, England)
研究论文 本文探讨了细胞因子及一氧化氮在胰岛内分泌和非内分泌细胞中的基因调控作用 提出细胞因子信号在生理上有保护β细胞免受多种环境压力的作用,并通过单细胞RNA测序验证了这一假设 NA 研究细胞因子和一氧化氮在胰岛内分泌细胞中的保护作用及其机制 小鼠胰岛细胞 NA 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠胰岛细胞在18小时细胞因子暴露后的单细胞RNA测序数据
22846 2024-08-08
LRRK2 correlates with macrophage infiltration in pan-cancer
2022-01, Genomics IF:3.4Q2
研究论文 本文探讨了LRRK2在泛癌水平上的致癌作用,并通过单细胞RNA测序和体外实验验证了其与生存事件的相关性 首次在泛癌水平上研究LRRK2对肿瘤微环境中巨噬细胞招募的影响,并提供了基于干扰LRRK2表达和活性的治疗策略 NA 研究LRRK2在泛癌中的作用及其对患者生存概率的影响 LRRK2在不同癌症类型中的作用及其对巨噬细胞功能的影响 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA RNA 具体样本数量未在摘要中提及
22847 2024-08-08
Metabolic detection and systems analyses of pancreatic ductal adenocarcinoma through machine learning, lipidomics, and multi-omics
2021-Dec-24, Science advances IF:11.7Q1
研究论文 本文介绍了一种利用机器学习和脂质组学进行胰腺导管腺癌(PDAC)检测的微创方法 通过贪婪算法和质谱特征选择优化了17种特征代谢物作为检测特征,并开发了一种基于液相色谱-质谱的靶向检测方法 NA 旨在开发一种用于胰腺导管腺癌早期检测的有效液体检测方法 胰腺导管腺癌(PDAC) 机器学习 胰腺癌 液相色谱-质谱 机器学习(ML) 代谢物 1033名不同阶段的PDAC患者
22848 2024-08-08
Adult mouse and human organoids derived from thyroid follicular cells and modeling of Graves' hyperthyroidism
2021-12-21, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文报道了从成年小鼠和人类甲状腺滤泡细胞中建立的三维(3D)类器官,并展示了这些类器官模拟格雷夫斯病甲状腺功能亢进的能力。 首次成功从成年甲状腺组织中建立三维类器官,并展示了其模拟人类自身免疫疾病的能力。 NA 研究甲状腺滤泡细胞类器官的建立及其在模拟人类自身免疫疾病中的应用。 成年小鼠和人类的甲状腺滤泡细胞。 数字病理学 甲状腺疾病 单细胞RNA测序,透射电子显微镜 NA 细胞 NA
22849 2024-08-08
Single-cell transcriptomic analysis reveals the critical molecular pattern of UV-induced cutaneous squamous cell carcinoma
2021-12-21, Cell death & disease IF:8.1Q1
研究论文 本文通过单细胞转录组测序技术分析了紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌(cSCC)的关键分子模式 首次在单细胞水平上揭示了紫外线诱导的cSCC的关键分子模式,并发现S100A9和FABP5可能作为未来cSCC治疗的新靶点 NA 揭示紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌的分子机制 紫外线诱导的皮肤鳞状细胞癌及其邻近皮肤样本和健康皮肤组织 数字病理学 皮肤癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 350个细胞,来自6个紫外线诱导的cSCC样本、匹配的邻近皮肤样本和3个健康皮肤组织
22850 2024-08-08
Author Correction: Cellular basis of omentum activation and expansion revealed by single-cell RNA sequencing using a parabiosis model
2021-Dec-21, Scientific reports IF:3.8Q1
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
22851 2024-08-08
Single-cell transcriptomic analysis of zebrafish cranial neural crest reveals spatiotemporal regulation of lineage decisions during development
2021-12-21, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术分析了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的时空调控,揭示了神经嵴细胞谱系决策的时空动态变化 首次通过单细胞RNA测序技术结合计算分析,揭示了斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中谱系决策的时空调控机制 NA 探究神经嵴细胞在斑马鱼胚胎发育过程中的谱系决策及其时空调控机制 斑马鱼头部神经嵴细胞在迁移过程中的单细胞转录组 发育生物学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 多个迁移阶段的斑马鱼头部神经嵴细胞
22852 2024-08-08
MultiMAP: dimensionality reduction and integration of multimodal data
2021-12-20, Genome biology IF:10.1Q1
研究论文 介绍了一种名为MultiMAP的新算法,用于多模态数据降维和整合 MultiMAP能够整合任意数量的数据集,利用非所有数据集共有的特征,不限于线性映射,允许用户指定每个数据集的影响,并且对大型数据集具有极高的可扩展性 NA 开发和评估一种新的多模态数据降维和整合算法 单细胞转录组学、染色质可及性、甲基化和空间数据 生物信息学 NA NA NA 多模态数据 NA
22853 2024-08-08
Single-Cell Transcriptomics Links Loss of Human Pancreatic β-Cell Identity to ER Stress
2021-12-19, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本文通过结合β细胞系追踪和单细胞转录组学技术,研究了人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 本文首次展示了内质网稳态与β细胞表型之间的紧密关系,并强化了β细胞身份改变作为功能性β细胞质量损失机制的概念 NA 探讨人胰岛细胞中β细胞身份改变的机制 人胰岛细胞 数字病理学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组 初级人胰岛细胞
22854 2024-08-08
Influence of Estrogen Treatment on ESR1+ and ESR1- Cells in ER+ Breast Cancer: Insights from Single-Cell Analysis of Patient-Derived Xenograft Models
2021-Dec-19, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析,探讨了雌激素治疗对ER+乳腺癌中ESR1+和ESR1-细胞的影响 首次展示了雌激素对同一乳腺癌肿瘤中不同细胞类型的差异性影响 NA 探究雌激素治疗对ER+乳腺癌细胞的影响及其分子机制 ER+乳腺癌中的ESR1+和ESR1-细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA RNA 使用了雌激素刺激(SC31)和雌激素抑制(GS3)的患者来源异种移植(PDX)模型
22855 2024-08-08
Heterologous prime-boost immunizations with chimpanzee adenoviral vectors elicit potent and protective immunity against SARS-CoV-2 infection
2021-Dec-18, Cell discovery IF:13.0Q1
研究论文 本文描述了基于黑猩猩腺病毒血清型6和68(AdC6和AdC68)载体疫苗候选物的开发,并评估了其在小鼠中的免疫原性、保护效果和免疫细胞特征。 研究发现异源初免-加强免疫策略能诱导更高滴度的保护性抗体和更多的刺突特异性记忆CD8 T细胞。 NA 开发针对SARS-CoV-2的安全有效疫苗,以应对COVID-19全球大流行。 基于黑猩猩腺病毒载体的疫苗候选物在小鼠中的免疫反应和保护效果。 疫苗学 COVID-19 单细胞RNA测序 NA 免疫细胞特征 小鼠
22856 2024-08-08
Investigating immune and non-immune cell interactions in head and neck tumors by single-cell RNA sequencing
2021-12-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术研究了头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中非免疫细胞和免疫细胞的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 首次全面展示了HNSCC微环境中细胞内在机制和细胞间通讯的单细胞视图 NA 旨在开发更有效的治疗方法,通过研究HNSCC中非免疫和免疫细胞群体的异质性、细胞群体特征及细胞间相互作用 6例人乳头瘤病毒(HPV)阳性和12例HPV阴性的HNSCC患者肿瘤及匹配的外周血样本 数字病理学 头颈部肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 134,606个细胞
22857 2024-08-08
Integrated single-cell transcriptome analysis reveals heterogeneity of esophageal squamous cell carcinoma microenvironment
2021-12-17, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了食管鳞状细胞癌(ESCC)微环境的异质性 揭示了ESCC微环境中大多数细胞类型的异质性,特别是成纤维细胞和免疫细胞亚群,并发现了具有预后价值和生物学意义的肿瘤特异性CST1肌成纤维细胞亚群 NA 研究食管鳞状细胞癌微环境的异质性及其对癌症生物学和治疗反应的影响 食管鳞状细胞癌(ESCC)微环境中的细胞类型 数字病理学 食管癌 单细胞转录组测序 NA 转录组 62,161个细胞来自11名ESCC患者的血液、邻近非恶性组织和匹配的肿瘤样本
22858 2024-08-08
Preparation of mouse pancreatic tumor for single-cell RNA sequencing and analysis of the data
2021-12-17, STAR protocols IF:1.3Q4
研究论文 本文描述了一种有效的鼠胰腺肿瘤分离协议,用于单细胞RNA测序分析细胞群体 提供了使用Common Workflow Language (CWL)管道在用户友好的科学数据分析平台中处理数据和聚类异质细胞群体的方法 NA 研究鼠胰腺肿瘤的细胞群体 鼠胰腺肿瘤的单细胞悬液 数字病理学 胰腺肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA NA
22859 2024-08-08
From nasal to basal: single-cell sequencing of the bursa of Fabricius highlights the IBDV infection mechanism in chickens
2021-Dec-16, Cell & bioscience
研究论文 本研究通过单细胞测序技术,详细阐述了传染性法氏囊病病毒(IBDV)在鸡体内的感染机制,特别是通过鼻腔进入并影响法氏囊细胞的过程 研究首次揭示了IBDV通过鼻腔后部感染鸡,并通过血液循环到达法氏囊,对不同类型的法氏囊细胞(如B细胞、上皮细胞、树突状细胞和成纤维细胞)的感染反应进行了详细分析 NA 旨在确定病毒通过鼻腔的入口点,并阐明为什么鸟类容易受到RNA病毒的感染 传染性法氏囊病病毒(IBDV)在鸡体内的感染机制 数字病理学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞数据 具体样本数量未在摘要中明确提及
22860 2024-08-08
Diet and Gut Microbiota Interaction-Derived Metabolites and Intrahepatic Immune Response in NAFLD Development and Treatment
2021-Dec-13, Biomedicines IF:3.9Q1
研究论文 本文综述了饮食与肠道微生物代谢物在非酒精性脂肪肝病(NAFLD)发展及治疗中对肝内免疫反应的影响 首次总结了饮食-肠道微生物代谢物与肝内免疫激活在NAFLD发展和进展中的相互作用,并讨论了通过靶向肠道微生物和重要分子信号通路的潜在治疗选项 NA 探讨NAFLD的病理机制及潜在治疗靶点 非酒精性脂肪肝病(NAFLD)及其发展过程中的肠道微生物代谢物和肝内免疫反应 NA 非酒精性脂肪肝病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA NA 全球约25%的人口受影响
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