单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
22821 2024-08-08
Low Expression of YTH Domain-Containing 1 Promotes Microglial M1 Polarization by Reducing the Stability of Sirtuin 1 mRNA
2021, Frontiers in cellular neuroscience IF:4.2Q2
研究论文 本文研究了m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用,发现YTH域包含蛋白1(YTHDC1)的低表达通过降低Sirtuin 1 mRNA的稳定性促进小胶质细胞M1极化 首次揭示了YTHDC1在视网膜小胶质细胞炎症反应调节中的关键作用 NA 探讨m6A修饰在视网膜小胶质细胞激活中的作用 视网膜小胶质细胞在葡萄膜炎中的变化 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA 小鼠视网膜细胞
22822 2024-08-08
Quantifying Genomic Imprinting at Tissue and Cell Resolution in the Brain
2020-Sep-04, Epigenomes IF:2.5Q3
综述 本文综述了在组织和细胞水平上量化基因组印记的方法,特别强调了检测亲本来源依赖性表达的方法及其在脑研究中的应用 介绍了单细胞多组学方法,这些方法结合了DNA甲基化、组蛋白修饰和染色质构象等特征,有望深入理解个体脑细胞中的基因组印记 NA 旨在更好地理解印记基因的功能,特别是构建详细的亲本来源依赖性表达和相关表观遗传特征图谱 印记基因在正常和病理脑中的作用 NA 脑疾病 RNA测序 NA RNA NA
22823 2024-08-08
Deciphering functional tumor states at single-cell resolution
2022-12-17, The EMBO journal
综述 本文综述了通过单细胞测序方法识别肿瘤状态的不同研究,以及促进和维持这些功能状态及其转换的机制 讨论了肿瘤可塑性和转换状态的理解如何用于开发改善癌症治疗的新策略 NA 深入理解肿瘤功能异质性和揭示肿瘤脆弱性 肿瘤细胞的不同状态及其基因调控网络 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因调控网络 NA
22824 2024-08-08
Microglia activation, classification and microglia-mediated neuroinflammatory modulators in subarachnoid hemorrhage
2022-Jul, Neural regeneration research IF:5.9Q1
综述 本文综述了蛛网膜下腔出血中微胶质细胞激活、分类及其介导的神经炎症调节因子的研究进展 介绍了单细胞转录组学在微胶质细胞研究中的最新进展,并总结了基于转录组的微胶质细胞分类及其对微胶质细胞激活和神经炎症的启示 NA 旨在理解蛛网膜下腔出血后的疾病过程,特别是微胶质细胞激活的调节因子和促炎/抗炎细胞因子及趋化因子 微胶质细胞及其介导的神经炎症在蛛网膜下腔出血中的作用 NA 蛛网膜下腔出血 单细胞转录组学 NA 转录组 NA
22825 2024-08-08
Parallel Single-Cell Multiomics Analysis of Neonatal Skin Reveals the Transitional Fibroblast States that Restrict Differentiation into Distinct Fates
2022-07, The Journal of investigative dermatology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过并行多组学分析新生小鼠皮肤中的单细胞转座酶可及染色质测序和单细胞RNA测序,揭示了纤维母细胞群可以根据转录组特征分为乳头状和网状谱系,并探讨了染色质可及性与基因表达之间的关系。 本文首次通过单细胞转座酶可及染色质测序分析了新生纤维母细胞谱系标记,发现尽管纤维母细胞群具有谱系特异性的转录组特征,但所有纤维母细胞群中均存在可及染色质,这表明染色质可及性并不总是转化为基因表达。 NA 研究新生纤维母细胞的异质性及其在皮肤再生中的作用,特别是分子机制调控细胞状态和命运。 新生小鼠皮肤中的纤维母细胞。 数字病理学 NA 单细胞转座酶可及染色质测序,单细胞RNA测序 NA 转录组数据,染色质可及性数据 新生小鼠皮肤样本
22826 2024-08-08
Single-cell transcriptomic landscapes of a rare human laryngeal chondrosarcoma
2022-Apr, Journal of cancer research and clinical oncology IF:2.7Q3
研究论文 本研究通过单细胞转录组测序分析了一例罕见的人喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 首次系统研究了喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制,并通过单细胞测序技术揭示了肿瘤异质性和肿瘤微环境组成 仅基于一例病例进行研究,可能存在样本量不足的问题 探索喉软骨肉瘤的细胞类型组成和分子机制 一例74岁男性患者的喉软骨肉瘤及其周围软骨组织 数字病理学 喉癌 单细胞测序 NA 转录组数据 5455个单细胞
22827 2024-08-08
Early Tumor-Immune Microenvironmental Remodeling and Response to First-Line Fluoropyrimidine and Platinum Chemotherapy in Advanced Gastric Cancer
2022-04-01, Cancer discovery IF:29.7Q1
研究论文 本文通过结合全外显子测序、批量RNA和单细胞转录组学,研究了HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者在接受一线氟嘧啶和铂类化疗前后肿瘤免疫微环境的变化,并定义了与化疗反应相关的特征。 首次详细描述了化疗对肿瘤免疫微环境的具体影响,包括自然杀伤细胞的招募、肿瘤相关巨噬细胞的减少等,并提出了未来治疗策略的候选方法。 研究未观察到早期治疗采样中的显著基因组变化,且样本量未明确提及。 探讨标准化疗对肿瘤免疫微环境的影响,并识别与化疗反应相关的特征。 HER2阳性和HER2阴性晚期胃癌患者。 数字病理学 胃癌 全外显子测序, 批量RNA测序, 单细胞转录组学 NA 基因组数据, 转录组数据 NA
22828 2024-08-08
Allosteric inhibition of SHP2 uncovers aberrant TLR7 trafficking in aggravating psoriasis
2022-03-07, EMBO molecular medicine IF:9.0Q1
研究论文 研究揭示了SHP2在银屑病中的作用及其通过调节TLR7转运影响炎症的机制 首次发现SHP2通过调节TLR7的转运在银屑病中起关键作用,并验证了SHP2抑制剂SHP099的治疗潜力 NA 探究SHP2在银屑病中的作用及其分子机制 SHP2在银屑病患者和模拟银屑病小鼠模型中的表达及作用 数字病理学 银屑病 单细胞RNA测序 NA RNA 包括银屑病患者和模拟银屑病的小鼠模型
22829 2024-08-08
MACA: marker-based automatic cell-type annotation for single-cell expression data
2022-03-04, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了一种名为MACA的新工具,用于自动注释单细胞转录组数据中的细胞类型 MACA通过测试四种细胞类型评分方法和两个公共细胞标记数据库,在六个单细胞研究中表现出色,提高了注释的准确性和速度 NA 开发一种新的工具,用于提高单细胞转录组数据中细胞类型注释的准确性和效率 单细胞转录组数据中的细胞类型 生物信息学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 约29万个细胞
22830 2024-08-08
Single-cell transcriptome analysis defines mesenchymal stromal cells in the mouse incisor dental pulp
2022-03, Gene expression patterns : GEP IF:1.0Q4
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了小鼠切牙牙髓中的间充质基质细胞的转录组特征 首次揭示了牙髓中不同细胞簇的转录组特征和细胞异质性 NA 深入理解牙髓中的细胞类型及其转录组特征 小鼠切牙牙髓中的间充质基质细胞 数字病理学 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组 5至6天龄的小鼠切牙牙髓细胞
22831 2024-08-08
PTGES3 is a Putative Prognostic Marker in Breast Cancer
2022-03, The Journal of surgical research IF:1.8Q2
研究论文 本研究分析了COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达模式,特别是PTGES3的表达与乳腺癌预后的关联 首次详细描述了PTGES3在乳腺癌中的表达模式及其作为预后标志物的潜力 NA 探讨COX/前列腺素通路酶在乳腺癌中的表达及其作为预后标志物的可能性 乳腺癌组织中COX/前列腺素通路酶的表达 数字病理学 乳腺癌 Cox回归Kaplan-Meier生存分析 NA 基因表达数据 使用了Cancer Genome Atlas数据和Clinical Proteomic Tumor Analysis Consortium数据库中的样本
22832 2024-08-08
Transcriptional differences between JAK2-V617F and wild-type bone marrow cells in patients with myeloproliferative neoplasms
2022-03, Experimental hematology IF:2.5Q3
研究论文 研究JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录差异及其对骨髓增生性肿瘤患者的影响 首次联合单细胞RNA测序和JAK2基因分型,揭示了JAK2-V617F突变在骨髓细胞中的转录效应 NA 探究JAK2-V617F突变对骨髓细胞转录组的影响 骨髓细胞中的JAK2-V617F突变 数字病理学 骨髓增生性肿瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 8名新诊断的原发性血小板增多症或真性红细胞增多症患者
22833 2024-08-08
MEK inhibition suppresses metastatic progression of KRAS-mutated gastric cancer
2022-Mar, Cancer science IF:4.5Q1
研究论文 本文通过开发基于胃癌的器官样模型,研究了MEK抑制剂trametinib在抑制KRAS突变胃癌转移进展中的作用 首次揭示了MEK抑制剂trametinib通过抑制肿瘤和微环境的MAPK信号传导,有效抑制KRAS突变胃癌的转移进展 NA 阐明致癌基因诱导的胃癌进展机制,并探索MEK抑制剂在抑制胃癌转移中的应用 胃癌细胞及其微环境 数字病理学 胃癌 空间转录组学分析 器官样模型 基因表达数据 使用GAN小鼠来源的肿瘤细胞进行实验
22834 2024-08-08
Lipid-loaded tumor-associated macrophages sustain tumor growth and invasiveness in prostate cancer
2022-02-07, The Journal of experimental medicine IF:12.6Q1
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了人类前列腺癌中肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)的转录组图谱,发现了一类与脂质代谢失调相关的TAMs亚群,该亚群与前列腺癌进展和较短的无病生存期正相关 首次揭示了脂质积累的TAMs在前列腺癌进展中的作用机制,并提出了通过阻断Marco来减少脂质积累的治疗策略 研究主要基于模型动物和体外实验,需要在临床试验中进一步验证 探讨肿瘤相关巨噬细胞在前列腺癌进展中的作用机制及潜在治疗策略 前列腺癌中的肿瘤相关巨噬细胞及其与脂质代谢的关系 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 人类前列腺癌样本
22835 2024-08-08
Human embryonic genome activation initiates at the one-cell stage
2022-02-03, Cell stem cell IF:19.8Q1
研究论文 本研究通过高分辨率单细胞RNA测序技术,深入分析了人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达,揭示了胚胎基因激活(EGA)在人类一细胞阶段的早期启动 本研究首次揭示了人类胚胎基因激活在一细胞阶段的早期启动,比之前认为的时间更早,并发现了数百个剪接转录本的低幅度上调 NA 探讨人类胚胎基因激活的确切时间和基因表达特征 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎的基因表达 NA NA 高分辨率单细胞RNA测序 NA RNA 人类中期II卵母细胞和双原核一细胞胚胎
22836 2024-08-08
Kidney-Targeted Renalase Agonist Prevents Cisplatin-Induced Chronic Kidney Disease by Inhibiting Regulated Necrosis and Inflammation
2022-02, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过特定递送肾调节素激动剂肽RP81至肾近端小管,探讨其对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 采用纳米粒子递送系统,实现了肾特异性递送肾调节素激动剂肽,有效减少了顺铂诱导的慢性肾脏病 NA 探讨肾特异性递送肾调节素激动剂肽对顺铂诱导的慢性肾脏病的预防作用 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者 NA 慢性肾脏病 单细胞RNA测序分析,Western blotting NA RNA 小鼠模型及接受顺铂化疗的头颈部鳞状细胞癌患者
22837 2024-08-08
Novel insights into adipose tissue heterogeneity
2022-02, Reviews in endocrine & metabolic disorders IF:6.9Q1
综述 本文综述了脂肪组织的细胞组成及其通过单细胞RNA测序展现的异质性 探讨了脂肪组织中脂肪细胞和间质血管部分(SVF)细胞的深刻多样性及其对整体功能的影响 当前数据有限,对脂肪组织异质性和可塑性的生物学相关性理解尚不全面 旨在建立脂肪组织细胞异质性的图谱,以增进对其功能的理解 脂肪组织的细胞组成及其异质性 NA 代谢性疾病 单细胞/核RNA测序 NA RNA序列数据 NA
22838 2024-08-08
Reversing T-cell Exhaustion in Cancer: Lessons Learned from PD-1/PD-L1 Immune Checkpoint Blockade
2022-02, Cancer immunology research IF:8.1Q1
研究论文 本文讨论了通过PD-1/PD-L1免疫检查点阻断疗法逆转肿瘤中CD8 T细胞耗竭的机制及其对癌症免疫治疗发展的影响 通过单细胞RNA测序和表观遗传学分析揭示了肿瘤微环境中CD8 T细胞的异质性及其在免疫检查点阻断后的不同反应能力 NA 重新评估免疫检查点阻断疗法的作用机制和作用位点 CD8 T细胞在肿瘤微环境中的状态及其对免疫治疗的反应 NA 癌症 单细胞RNA测序,表观遗传学分析 NA RNA NA
22839 2024-08-08
Cell type specificity of glucocorticoid signaling in the adult mouse hippocampus
2022-02, Journal of neuroendocrinology IF:3.3Q2
研究论文 本文利用公开的单细胞RNA测序数据,研究了成年小鼠海马体中糖皮质激素信号的细胞类型特异性 首次在细胞类型水平上分析了糖皮质激素受体和盐皮质激素受体的信号传导特异性 NA 探讨糖皮质激素在成年小鼠海马体中的细胞类型特异性信号传导 成年小鼠海马体中的糖皮质激素受体和盐皮质激素受体 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA测序数据 NA
22840 2024-08-08
Single-Cell Sequencing to Unveil the Mystery of Embryonic Development
2022-02, Advanced biology IF:3.2Q3
research paper 本文综述了单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用及其技术原理 单细胞测序技术为理解胚胎发育的分子路线图提供了有力工具 单细胞测序是高度跨学科的,需要在特定生物学背景下对其多样性及其优缺点有全面的理解 探讨单细胞测序技术在胚胎发育研究中的应用 胚胎发育过程中的细胞命运决定 生物技术 NA 单细胞测序 NA 细胞 NA
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