单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
22801 2024-08-08
Targeting S1PR1 May Result in Enhanced Migration of Cancer Cells in Bladder Carcinoma
2021-Sep-05, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过分析临床数据库、肿瘤纯度和免疫细胞浸润模拟以及膀胱癌的组织学表型数据库,结合单细胞测序技术,探讨了S1PR1在膀胱癌中的分布和功能 首次揭示了S1PR1在膀胱癌中的表达与细胞迁移能力的负相关性,并探讨了FTY-720对膀胱癌细胞转移能力的影响 研究主要基于数据库分析和单细胞测序,未进行体内实验验证 探究S1PR1在膀胱癌中的表达及其对患者预后的影响 膀胱癌组织、正常组织及膀胱癌细胞系 数字病理学 膀胱癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 多个临床数据库和单细胞测序数据
22802 2024-08-08
Single-cell Ribo-seq reveals cell cycle-dependent translational pausing
2021-09, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本文介绍了一种单细胞核糖体测序技术,该技术结合机器学习方法,能够在单个细胞水平上实现单密码子分辨率的翻译监测 本文开发了一种新的单细胞核糖体测序技术,显著提高了检测灵敏度,并结合机器学习实现了单密码子分辨率 尽管技术进步,但在非限制条件下检测到的现象仍需进一步验证和解释 研究细胞周期依赖的翻译暂停现象及其对细胞多样性的贡献 单细胞中的翻译过程及其与细胞周期的关系 基因组学 NA 单细胞核糖体测序 机器学习 序列数据 涉及多种细胞类型,包括稀有的初级肠内分泌细胞
22803 2024-08-08
Transcriptional progression during meiotic prophase I reveals sex-specific features and X chromosome dynamics in human fetal female germline
2021-09, PLoS genetics IF:4.0Q1
研究论文 本研究通过分析人类胎儿生殖细胞的单细胞转录组数据,揭示了女性减数分裂前期的转录进展及其性别特异性特征和X染色体动态变化 首次比较了人类卵母细胞和精母细胞在减数分裂前期的不同阶段,并揭示了性别间的保守和特异性特征 NA 研究人类女性减数分裂前期的转录进展及其性别特异性特征和X染色体动态变化 人类胎儿生殖细胞的单细胞转录组数据 生物学 NA 单细胞转录组学 NA 转录组数据 NA
22804 2024-08-08
Temporal multi-omics identifies LRG1 as a vascular niche instructor of metastasis
2021-Sep, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究利用内皮细胞的批量和单细胞转录组学以及血清蛋白质组学,追踪了肺转移手术模型中转移性血管微环境的演变 首次揭示了主要肿瘤如何系统性地重新编程身体的血管内皮,以扰乱内环境稳定并为转移性生长预处理血管微环境,并识别出LRG1作为转移的早期指导因子 NA 研究肿瘤细胞与血管壁细胞相互作用的分子本质,并探索其对转移的影响 内皮细胞的基因表达和分泌组,以及LRG1在转移中的作用 数字病理学 肺癌 转录组学,蛋白质组学 NA 基因表达数据,蛋白质数据 NA
22805 2024-08-08
Single-Cell Cloning of Breast Cancer Cells Secreting Specific Subsets of Extracellular Vesicles
2021-Aug-31, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本文开发了一种高通量单细胞技术,用于映射外泌体分泌的动态变化,并研究了非转移性乳腺癌细胞分泌特定外泌体亚集的现象 首次展示了外泌体分泌的特异性是一种可遗传的特性,并揭示了CD81CD63EV分泌在肿瘤形成中的抑制作用 NA 研究外泌体分泌在单细胞水平上的异质性及其在疾病中的作用 乳腺癌细胞及其分泌的外泌体 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 细胞 使用了乳腺癌细胞系和人类非转移性乳腺癌肿瘤样本
22806 2024-08-08
Development of metastasis-associated seven gene signature for predicting lung adenocarcinoma prognosis using single-cell RNA sequencing data
2021-07-01, Mathematical biosciences and engineering : MBE
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序数据,开发了一种与转移相关的七个基因特征,用于预测肺腺癌患者的预后 首次基于单细胞RNA测序数据开发了与转移相关的七个基因特征,用于预测肺腺癌患者的总体生存率,并揭示了其潜在的分子机制 NA 开发一种新的基因特征,用于预测肺腺癌患者的预后 肺腺癌患者的单细胞RNA测序数据 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 Cox比例风险回归模型和LASSO回归分析 RNA测序数据 训练组236例,测试组232例,整个TCGA-LUAD队列468例
22807 2024-08-08
Transcriptional, Epigenetic, and Functional Reprogramming of Monocytes From Non-Human Primates Following Chronic Alcohol Drinking
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了非人灵长类动物在慢性酒精饮用后单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程 首次在非人灵长类动物模型中详细分析了慢性酒精饮用对单核细胞亚群的影响及其表观遗传变化 研究仅限于女性猕猴,且样本量未明确提及 探究慢性酒精饮用对单核细胞的转录、表观遗传和功能重编程的影响 非人灵长类动物的单核细胞 NA NA scRNA-Seq NA 细胞 NA
22808 2024-08-08
Stem Cells in Myelodysplastic Syndromes and Acute Myeloid Leukemia: First Cousins or Unrelated Entities?
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
综述 本文综述了骨髓增生异常综合征(MDS)向急性髓系白血病(AML)转化的代谢、表型和遗传特征,以及从MDS干细胞(MDS-SCs)到白血病干细胞(LSCs)的动态演变 探讨了MDS-SCs和LSCs的分子标记物CD123和CLL1的过度表达及其在治疗上的应用潜力,以及单细胞测序揭示的MDS向AML进展中的非线性克隆进化 NA 探讨MDS和AML中干细胞的特性及其在疾病进展中的作用 MDS干细胞(MDS-SCs)和白血病干细胞(LSCs) NA 血液病 单细胞测序 NA 细胞 NA
22809 2024-08-08
Reduced CCR6+IL-17A+Treg Cells in Blood and CCR6-Dependent Accumulation of IL-17A+Treg Cells in Lungs of Patients With Allergic Asthma
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究探讨了过敏性哮喘患者中调节性T细胞(Treg)亚群的特征及其在疾病发病机制中的作用 首次揭示了CCR6+IL-17A+Treg细胞在过敏性哮喘患者肺部积累的机制,并探讨了这些细胞在疾病病理中的潜在作用 研究主要基于流式细胞术和单细胞RNA测序,未涉及更广泛的临床试验或长期随访 探究过敏性哮喘中特定Treg细胞亚群的作用及其机制 过敏性哮喘患者和健康个体的Treg细胞亚群 免疫学 过敏性哮喘 流式细胞术,单细胞RNA测序 NA 细胞 包括过敏性哮喘患者和健康个体的血液及肺组织样本
22810 2024-08-08
A Novel Intercellular Communication-Associated Gene Signature for Prognostic Prediction and Clinical Value in Patients With Lung Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本研究旨在识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因(ICAGs),并开发基于这些基因的风险评分和机器学习模型以预测肺腺癌的复发 本研究首次识别了八个具有预后潜力的ICAGs,并基于这些基因和临床信息开发了预测肺腺癌复发的最佳机器学习模型 NA 识别肺腺癌中的关键细胞间通讯相关基因,并开发预后预测模型 肺腺癌患者 数字病理学 肺腺癌 单细胞RNA测序 机器学习模型 基因表达数据 八个公开可用的数据集
22811 2024-08-08
LR Hunting: A Random Forest Based Cell-Cell Interaction Discovery Method for Single-Cell Gene Expression Data
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
研究论文 本文提出了一种基于随机森林的细胞间相互作用发现方法LR Hunting,用于单细胞基因表达数据 LR Hunting方法首先使用随机森林数据插补技术连接不同细胞类型的数据,并通过多次计算生成聚合的插补最小深度指数,以识别所有LR配对组合中的显著相互作用 NA 解析细胞间相互作用和细胞间通讯 单细胞RNA测序数据中的配体-受体基因相互作用 生物信息学 乳腺癌 单细胞RNA测序 随机森林 基因表达数据 使用小鼠细胞转录组和表位测序数据集以及三阴性乳腺癌单细胞RNA测序数据集进行验证
22812 2024-08-08
Ribosome Proteins Represented by RPL27A Mark the Development and Metastasis of Triple-Negative Breast Cancer in Mouse and Human
2021, Frontiers in cell and developmental biology IF:4.6Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据,分析了正常小鼠乳腺组织和乳腺癌组织的基因表达模式,发现RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌细胞中显著上调,并探讨了其在乳腺癌发展和转移中的作用。 首次揭示了RPL27A和RPL15基因在三阴性乳腺癌中的关键作用,并提出了这些基因作为潜在治疗靶点的可能性。 研究主要基于小鼠和人类样本的单细胞RNA测序数据,可能需要进一步的临床试验验证这些发现。 探索三阴性乳腺癌的新诊断和治疗靶点。 三阴性乳腺癌的发展和转移机制。 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 四组正常小鼠乳腺组织和四组小鼠乳腺癌组织,以及人类原发性和转移性三阴性乳腺癌组织
22813 2024-08-08
The Role of Hemoglobin Subunit Delta in the Immunopathy of Multiple Sclerosis: Mitochondria Matters
2021, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文通过微阵列分析、单细胞测序分析和体外研究,探讨了线粒体应激在多发性硬化症患者外周血单个核细胞中的作用,特别是血红蛋白δ亚基(HBD)的表达及其在免疫调节治疗中的变化。 首次详细研究了HBD在多发性硬化症中的表达及其在免疫调节治疗中的调控作用,揭示了HBD在氧化应激中的细胞保护作用。 需要进一步研究以阐明HBD在多发性硬化症患者氧化应激中的分子机制。 探讨线粒体应激在多发性硬化症发病机制中的作用,特别是血红蛋白δ亚基(HBD)的表达及其调控。 多发性硬化症患者的外周血单个核细胞(PBMCs)。 NA 多发性硬化症 微阵列分析、单细胞测序分析 NA 基因表达数据 包括健康捐赠者、未治疗的多发性硬化症患者以及接受不同免疫调节治疗的多发性硬化症患者的外周血单个核细胞。
22814 2024-08-08
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Migration of Osteoclasts in Giant Cell Tumor of Bone
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞的迁移情况 首次通过单细胞转录组分析揭示了骨巨细胞瘤中破骨细胞迁移的相关基因和信号通路 研究仅基于一名患者的样本,可能存在样本量不足的问题 深入理解骨巨细胞瘤的肿瘤微环境,特别是破骨细胞的迁移机制 骨巨细胞瘤中的破骨细胞迁移 数字病理学 骨肿瘤 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 一名骨巨细胞瘤患者的8,033个细胞
22815 2024-08-08
Editorial: Integrative Analysis of Genome-Wide Association Studies and Single-Cell Sequencing Studies
2021, Frontiers in genetics IF:2.8Q2
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
22816 2024-08-08
Single-cell profiling of infiltrating B cells and tertiary lymphoid structures in the TME of gastric adenocarcinomas
2021, Oncoimmunology IF:6.5Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序、10× Genomics V(D)J分析、多重免疫荧光技术和OSCmap分析,对胃腺癌(gADC)肿瘤微环境(TME)中的免疫细胞进行了综合分析 首次在gADC组织中发现大量黏膜相关淋巴组织(MALT)-B细胞,并发现这些细胞具有成熟的淋巴结构(mTLSs),且在mTLSs中的免疫细胞类型和密度均高于正常淋巴结构 NA 旨在表征胃腺癌肿瘤微环境中免疫细胞的谱系 胃腺癌肿瘤微环境中的免疫细胞 数字病理学 胃癌 单细胞RNA测序, 10× Genomics V(D)J分析, 多重免疫荧光技术, OSCmap分析 NA 单细胞转录组数据 49,765个单细胞,来自4名胃腺癌患者
22817 2024-08-08
Integrative Analysis Identified MCT4 as an Independent Prognostic Factor for Bladder Cancer
2021, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本文通过综合分析确定了MCT4作为膀胱癌独立预后因子的地位 首次研究了MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关联,并构建了基于多变量Cox分析的列线图 研究样本量相对较小,可能需要更大规模的研究来验证结果 研究MCT4表达与膀胱癌患者总体生存率之间的关系 膀胱癌患者及MCT4表达 数字病理学 膀胱癌 单细胞RNA测序, 免疫组织化学染色 Cox回归模型 mRNA表达数据, 蛋白质表达数据 49,869个膀胱癌细胞和15,827个正常膀胱黏膜细胞,以及89名接受根治性膀胱切除术的膀胱癌患者
22818 2024-08-08
Residual homing of α4β7-expressing β1+PI16+ regulatory T cells with potent suppressive activity correlates with exposure-efficacy of vedolizumab
2022-08, Gut IF:23.0Q1
研究论文 研究探讨了抗α4β7整合素抗体vedolizumab在治疗炎症性肠病(IBD)中的非线性暴露-疗效特性及其机制 发现了vedolizumab治疗中一种具有显著调节特性的'抵抗'α4β7表达β1+PI16+调节T细胞亚群 NA 确定vedolizumab在治疗炎症性肠病中非线性暴露-疗效特性的机制 超过500个样本,来自300多名受试者的T细胞 免疫学 炎症性肠病 单细胞RNA测序 NA RNA 超过500个样本,来自300多名受试者
22819 2024-08-08
IL-37 regulates allergic inflammation by counterbalancing pro-inflammatory IL-1 and IL-33
2022-03, Allergy IF:12.6Q1
研究论文 本研究探讨了IL-37通过平衡促炎性IL-1和IL-33的作用来调节过敏性炎症的机制 首次揭示了IL-37在过敏性哮喘中的抑制作用及其机制 研究主要集中在小鼠模型和体外细胞实验,需要进一步的人体临床研究验证 旨在识别IL-37控制过敏性炎症的机制 IL-37的目标细胞、基因表达变化以及在哮喘患者中的表达/生产比率 NA 哮喘 单细胞RNA测序、激光捕获显微切割、微阵列基因表达分析 NA 基因表达数据 包括野生型、IL-1R1和IL-33缺陷的小鼠模型,以及哮喘患者的痰液和鼻分泌物样本
22820 2024-08-08
Rheumatoid arthritis, systemic lupus erythematosus and primary Sjögren's syndrome shared megakaryocyte expansion in peripheral blood
2022-03, Annals of the rheumatic diseases IF:20.3Q1
研究论文 本研究旨在识别类风湿关节炎(RA)、系统性红斑狼疮(SLE)和原发性干燥综合征(pSS)等自身免疫疾病在周围血中的共同转录谱和免疫细胞组成 发现了在这些自身免疫疾病中,巨核细胞(MK)的扩张是一个共同特征,这为理解这些疾病的病理机制提供了新的视角 NA 识别类风湿关节炎、系统性红斑狼疮和原发性干燥综合征等自身免疫疾病在周围血中的共同转录谱和免疫细胞组成 类风湿关节炎、系统性红斑狼疮、原发性干燥综合征和多重自身免疫疾病患者的周围血单个核细胞(PBMCs) NA 类风湿关节炎, 系统性红斑狼疮, 原发性干燥综合征 RNA测序, 流式细胞术 NA RNA 119名未经治疗的患者(41名RA,38名pSS,28名SLE和12名多重自身免疫)和20名健康对照
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