单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 22761 - 22780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22761 | 2024-08-08 |
Autophagy protects murine preputial glands against premature aging, and controls their sebum phospholipid and pheromone profile
2022-05, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2021.1966716
PMID:34491140
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研究论文 | 本文研究了自噬在保护小鼠包皮腺免受过早衰老中的作用，并探讨了其对皮脂磷脂和信息素谱的调控 | 首次揭示了自噬在小鼠包皮腺衰老防护中的作用及其对皮脂成分的调控机制 | NA | 探究自噬在小鼠包皮腺衰老防护及其对皮脂和信息素成分调控中的作用 | 小鼠包皮腺 | NA | NA | 高分辨率液相色谱-质谱法（HPLC-MS），单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | NA | NA |
| 22762 | 2024-08-08 |
Visualization and Analysis of Single Cell RNA-Seq Data by Maximizing Correntropy Based Non-Negative Low Rank Representation
2022-04, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2021.3110766
PMID:34495855
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研究论文 | 本文介绍了一种名为MccNLRR的新型scRNA-seq数据分析模型，用于处理高技术噪声和数据丢失问题 | 采用最大相关熵准则作为有效的损失函数，对高噪声和大数据异常值更为鲁棒，同时利用低秩表示捕捉数据的全局和局部结构 | NA | 探索单细胞RNA测序技术在生物问题分析中的应用 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | MccNLRR | 数据 | NA |
| 22763 | 2024-08-08 |
Resident vascular endothelial progenitor definition and function: the age of reckoning
2022-02, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-021-09817-2
PMID:34499264
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综述 | 本文综述了近年来对血管内皮祖细胞在体内的定义和功能的研究进展 | 利用单细胞测序技术深入理解内皮细胞在稳态和病理状态下的特性 | 对体内能够产生ECFC的内皮细胞群体的了解仍然有限 | 描述和分析体内祖细胞群体的研究，特别是通过小鼠研究反映ECFC的自更新和干细胞能力 | 血管内皮祖细胞的定义和功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22764 | 2024-08-08 |
Murine AGM single-cell profiling identifies a continuum of hemogenic endothelium differentiation marked by ACE
2022-01-20, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2020007885
PMID:34517413
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了小鼠AGM区域中造血内皮细胞（HE）的分化过程，并揭示了ACE在其分化中的标志性作用 | 首次通过全长的单细胞RNA测序揭示了HE分化的连续性，并发现ACE在HE分化中的特异性标记作用 | NA | 旨在解析胚胎中造血干细胞形成的分子和细胞途径，以促进体外造血干细胞的生成和扩展 | 小鼠AGM区域的造血内皮细胞及其分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 使用Runx1b和Gfi1/1b转基因报告小鼠模型分离的HE细胞 |
| 22765 | 2024-08-08 |
scAPAdb: a comprehensive database of alternative polyadenylation at single-cell resolution
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab795
PMID:34508354
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研究论文 | 本文介绍了一个名为scAPAdb的综合数据库，该数据库提供了单细胞分辨率下的替代多聚腺苷酸化（APA）信息 | scAPAdb是首个提供单细胞分辨率APA信息的数据库，填补了现有APA数据库在这一领域的空白 | NA | 旨在为研究单细胞水平上APA异构体使用和APA介导的基因调控提供有价值的资源 | 单细胞分辨率下的APA信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 数据库 | 超过360个scRNA-seq实验，涵盖六种物种，包括人类、小鼠和其他几种植物物种 |
| 22766 | 2024-08-08 |
VeloViz: RNA velocity-informed embeddings for visualizing cellular trajectories
2022-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab653
PMID:34500455
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研究论文 | 本文介绍了VeloViz工具，该工具利用RNA速度分析信息创建单细胞转录组数据的2D和3D嵌入，以可视化细胞轨迹 | VeloViz通过考虑RNA速度分析预测的未来转录状态，能够更可靠地捕捉和展示细胞轨迹，即使在缺失中间细胞状态的情况下 | NA | 开发一种新的方法来可视化从RNA速度分析推断的细胞状态变化，以更好地理解细胞轨迹 | 单细胞转录组数据及其通过RNA速度分析推断的细胞状态变化 | 生物信息学 | NA | RNA速度分析 | NA | 转录组数据 | 使用真实和模拟数据进行验证 |
| 22767 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq reveals the transcriptional landscape in ischemic stroke
2022-01, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X211026770
PMID:34496660
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了缺血性中风中的转录组图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了小鼠MCAO模型中脑细胞群的细胞类型特异性基因表达模式及其在不同通路中的功能 | NA | 探索缺血性中风的疾病机制及基于细胞亚型特异性分子的药物发现 | 缺血性中风中的脑细胞群及其基因表达模式 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠MCAO模型中的脑细胞群 |
| 22768 | 2024-08-08 |
Cancer stem cells in hepatocellular carcinoma - from origin to clinical implications
2022-01, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-021-00508-3
PMID:34504325
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综述 | 本文综述了肝细胞癌中癌症干细胞（CSC）的起源及其临床意义 | 探讨了肝CSC的异质性和独特的免疫生物学特性，为新的研究方向和潜在疗法提供了机会 | NA | 总结当前对肝CSC标记物和肝细胞癌中干细胞调控因子的认识，并描述肝CSC领域的最新进展 | 肝细胞癌中的癌症干细胞 | NA | 肝细胞癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 22769 | 2024-08-08 |
Delineating chromatin accessibility re-patterning at single cell level during early stage of direct cardiac reprogramming
2022-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2021.09.002
PMID:34509499
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC-seq技术，探讨了心脏重编程早期阶段染色质可及性的重塑模式及其对转录组重塑的影响 | 首次揭示了Smad3作为双模态转录因子在心脏重编程中的作用，并发现了心脏基因在重编程轨迹中的顺式调控相互作用的全球重构 | NA | 探讨心脏重编程早期阶段染色质景观的改变如何驱动转录组重塑 | 心脏成纤维细胞向诱导心肌细胞（iCMs）的直接转化过程中的染色质可及性变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞ATAC-seq | NA | 基因组数据 | 早期重编程的诱导心肌细胞（iCMs） |
| 22770 | 2024-08-08 |
The Role of Innate Immune Cells in Nonalcoholic Fatty Liver Disease
2022, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000518407
PMID:34515137
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研究论文 | 本文探讨了先天免疫细胞在非酒精性脂肪肝病（NAFLD）和非酒精性脂肪肝炎（NASH）中的作用 | 利用单细胞RNA测序等新技术揭示了肝脏中巨噬细胞群体的显著异质性，并探讨了肝脏驻留的Kupffer细胞和招募的单核细胞源性巨噬细胞在调节肝脏炎症和NASH发病机制中的不同功能 | NA | 研究先天免疫细胞在NAFLD和NASH中的功能 | 先天免疫细胞如中性粒细胞和巨噬细胞在NAFLD和NASH中的作用 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22771 | 2024-08-08 |
PsiNorm: a scalable normalization for single-cell RNA-seq data
2021-12-22, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab641
PMID:34499096
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研究论文 | 本文提出了一种名为PsiNorm的单细胞RNA测序数据标准化方法，基于幂律帕累托分布参数估计的样本间标准化方法 | PsiNorm是一种简单且高度可扩展的标准化方法，不需要参考样本，适用于监督分类设置中的新样本数据标准化 | NA | 开发一种新的单细胞RNA测序数据标准化方法，以解决现有方法在计算资源和时间上的高需求问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22772 | 2024-08-08 |
Redundant mechanisms driven independently by RUNX1 and GATA2 for hematopoietic development
2021-12-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2020003969
PMID:34492681
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研究论文 | 本文通过研究zebrafish的runx1突变体，揭示了在缺乏功能性runx1的情况下，cd41-GFP+造血前体细胞仍能从造血内皮中出现并定植于突变胚胎的造血组织中，且gata2b在runx1-/-胚胎中的表达增加，表明RUNX1和GATA2在造血干细胞生成中具有冗余作用 | 发现RUNX1和GATA2在造血干细胞生成中具有冗余作用，相互作为对方的保障机制 | NA | 探究在缺乏功能性runx1的情况下，造血干细胞生成的补偿机制 | zebrafish的runx1突变体及造血前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用3个新的zebrafish runx1-/-品系 |
| 22773 | 2024-08-08 |
scDeepSort: a pre-trained cell-type annotation method for single-cell transcriptomics using deep learning with a weighted graph neural network
2021-12-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab775
PMID:34500471
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研究论文 | 介绍了一种名为scDeepSort的预训练细胞类型注释工具，该工具利用加权图神经网络（GNN）的深度学习模型进行单细胞转录组学研究 | scDeepSort是首个尝试使用预训练GNN模型对scRNA-seq数据进行细胞类型注释的方法，无需额外的参考资料，如标记基因或RNA-seq profiles | NA | 开发一种高效的单细胞转录组数据细胞类型注释方法 | 人类和小鼠的单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | 加权图神经网络（GNN） | 转录组数据 | 涉及56个人类和32个小鼠组织的764,741个细胞 |
| 22774 | 2024-08-08 |
Evaluation of tumor microenvironmental immune regulation and prognostic in lung adenocarcinoma from the perspective of purinergic receptor P2Y13
2021-12, Bioengineered
IF:4.2Q2
DOI:10.1080/21655979.2021.1971029
PMID:34494914
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研究论文 | 本研究通过ESTIMATE评分系统和CIBERSORT方法分析了TCGA数据库中598个RNA转录本的肿瘤微环境评分，探讨了肺腺癌中肿瘤浸润免疫细胞与P2Y13受体的关系及其对预后的影响 | 首次探讨了P2Y13受体在肺腺癌肿瘤微环境中的作用及其作为预后标志物的潜力 | NA | 研究P2Y13受体在肺腺癌中的表达及其对肿瘤微环境和预后的影响 | 肺腺癌患者的肿瘤微环境和P2Y13受体的表达 | 数字病理学 | 肺腺癌 | RNA测序, 免疫组化 | NA | RNA转录本 | 598个RNA转录本, 人类肺腺癌组织 |
| 22775 | 2024-08-08 |
Characterisation of Ppy-lineage cells clarifies the functional heterogeneity of pancreatic beta cells in mice
2021-12, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-021-05560-x
PMID:34498099
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研究论文 | 本研究通过使用Ppy-Cre驱动小鼠和PP特异性单克隆抗体，探讨了Ppy谱系细胞与β细胞之间的关联，并通过单细胞转录组分析和Ca2+成像评估了内分泌细胞的分子特征和β细胞的葡萄糖反应性 | 发现Ppy谱系细胞对四种主要类型的内分泌细胞（包括β细胞）有贡献，且Ppy谱系β细胞表现出不同的功能和基因表达特征 | NA | 阐明小鼠胰腺β细胞的功能异质性 | 胰腺Ppy谱系细胞和β细胞 | NA | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），Ca2+成像 | NA | 单细胞RNA序列 | 涉及Ppy-Cre驱动小鼠和实验性糖尿病模型小鼠 |
| 22776 | 2024-08-08 |
Vertical sleeve gastrectomy triggers fast β-cell recovery upon overt diabetes
2021-12, Molecular metabolism
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.molmet.2021.101330
PMID:34500108
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了垂直袖状胃切除术（VSG）在晚期糖尿病db/db小鼠模型中对β细胞功能恢复的影响 | 首次在单细胞水平上研究了VSG对晚期2型糖尿病（T2D）患者β细胞恢复的可能性，并揭示了VSG诱导的β细胞转录组内在变化及其功能改善 | 研究仅在db/db小鼠模型中进行，尚未在人类T2D患者中验证VSG的效果 | 探讨垂直袖状胃切除术在晚期2型糖尿病中恢复β细胞功能的作用及其机制 | 晚期糖尿病db/db小鼠模型 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 晚期糖尿病db/db小鼠 |
| 22777 | 2024-08-08 |
Molecular Profiling of Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Autopsies Uncovers Novel Disease Mechanisms
2021-12, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2021.08.009
PMID:34506752
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研究论文 | 本研究利用多尺度下一代RNA测序方法（包括批量、单核和空间转录组学）评估COVID-19快速尸检组织，以提供前所未有的分子分辨率，揭示COVID-19诱导的损伤。 | 通过比较感染与未感染组织，发现了四个主要的调控通路，并提出了潜在的新治疗靶点。 | 研究样本量较小，需要扩展到更大的数据集以进一步理解COVID-19的病理生理机制。 | 旨在通过先进的分子技术评估COVID-19尸检组织，以识别通路和效应器，并在单细胞水平上绘制多样化的受体，从而帮助解析驱动个体患者临床过程差异的因素。 | COVID-19患者的快速尸检组织。 | 数字病理学 | COVID-19 | 下一代RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及不同症状的两名患者尸检组织 |
| 22778 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiling Reveals Metabolic Reprogramming as a Resistance Mechanism in BRAF-Mutated Multiple Myeloma
2021-12-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-2040
PMID:34518309
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BRAF突变的多发性骨髓瘤中，通过代谢重编程作为对精准医疗产生抗性的机制。 | 研究发现癌症细胞能够通过转录状态改变、表观遗传适应和代谢重塑快速适应精准治疗，从而暴露出新的脆弱性。 | NA | 研究BRAF突变的多发性骨髓瘤细胞是否能通过快速适应BRAF抑制剂治疗来确保其生存，以此作为精准医疗抗性的模型。 | BRAF突变的多发性骨髓瘤患者和细胞系 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、RNA-seq、H3K27ac染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、代谢通量分析 | NA | RNA | 3名BRAF突变的多发性骨髓瘤患者和1名健康捐赠者的1,495个细胞 |
| 22779 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Heterogeneity of Infiltrating Immune Cell Profiles in the Hepatic Cystic Echinococcosis Microenvironment
2021-11-16, Infection and immunity
IF:2.9Q2
DOI:10.1128/IAI.00297-21
PMID:34491790
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的异质性 | 首次在单细胞水平上揭示了肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的转录异质性，并提供了潜在的诊断和免疫治疗靶点 | 研究样本仅来自四名肝包虫病患者，可能影响结果的普遍性 | 探究肝包虫病病变微环境中浸润免疫细胞的组成和异质性 | 从四名肝包虫病患者中分离出的81,865个免疫细胞 | 数字病理学 | 寄生虫病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81,865个免疫细胞 |
| 22780 | 2024-08-08 |
Overexpression of transposable elements is associated with immune evasion and poor outcome in colorectal cancer
2021-11, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2021.08.003
PMID:34492588
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研究论文 | 本研究探讨了转座子元素（TE）在结直肠癌（CRC）中的过度表达与免疫逃逸及不良预后的关联 | 揭示了TE驱动免疫逃逸的新机制，并强调TE表达作为CRC患者预后的重要因素 | NA | 探究结直肠癌中高免疫细胞浸润与不良预后之间的机制 | 结直肠癌肿瘤中的转座子元素表达及其对免疫逃逸和预后的影响 | NA | 结直肠癌 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 使用The Cancer Genome Atlas的RNA测序数据 |