单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28099 篇文献，本页显示第 22761 - 22780 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22761 | 2024-08-08 |
Advancement of Single-Cell Sequencing in Medulloblastoma
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1952-0_7
PMID:34978689
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研究论文 | 本文介绍了单细胞测序技术在脑癌中的应用及其进展 | 单细胞测序技术从手动方法发展到自动化，为肿瘤学领域提供了新的见解 | NA | 探讨单细胞测序技术在脑癌研究中的应用 | 单细胞测序技术及其在脑癌中的应用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组和多组学数据 | 小规模和商业平台 |
| 22762 | 2024-08-08 |
Correction: SDImpute: A statistical block imputation method based on cell-level and gene-level information for dropouts in single-cell RNA-seq data
2022-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009770
PMID:34986151
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correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22763 | 2024-08-08 |
Role of synovial fibroblast subsets across synovial pathotypes in rheumatoid arthritis: a deconvolution analysis
2022-01, RMD open
IF:5.1Q1
DOI:10.1136/rmdopen-2021-001949
PMID:34987094
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研究论文 | 本研究通过整合已发表的单细胞RNA测序数据和未发表的内部数据，评估了不同滑膜成纤维细胞亚群对早期未治疗关节炎中滑膜病理类型的贡献及其与临床特征的关系 | 本研究揭示了滑膜病理类型与滑膜成纤维细胞亚型之间的先前未探索的关联，为个性化治疗提供了新的见解 | NA | 评估滑膜成纤维细胞亚群在早期未治疗关节炎中对滑膜病理类型的贡献及其与临床特征的关系 | 滑膜成纤维细胞亚群及其在不同滑膜病理类型中的分布和作用 | 数字病理学 | 风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 87名早期未治疗关节炎患者 |
| 22764 | 2024-08-08 |
Decoding gene regulation in the fly brain
2022-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04262-z
PMID:34987221
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研究论文 | 本文通过单细胞染色质可及性分析和单细胞转录组数据整合，研究了果蝇大脑中细胞类型水平的基因调控网络 | 本文利用DeepFlyBrain揭示了增强子结构，为理解神经元调控多样性提供了新的视角，并可用于设计特定时间点的细胞类型的遗传驱动线 | NA | 研究果蝇大脑中细胞类型水平的基因调控网络 | 果蝇大脑中的神经元和胶质细胞类型及其基因调控网络 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组分析，三维形态分类，电子显微镜连接组映射 | DeepFlyBrain | 单细胞染色质可及性数据，单细胞转录组数据 | 240,919个单细胞，跨越9个发育时间点 |
| 22765 | 2024-08-08 |
CRISPRi links COVID-19 GWAS loci to LZTFL1 and RAVER1
2022-Jan, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2021.103806
PMID:34998241
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研究论文 | 本研究利用CRISPRi技术分析了与COVID-19疾病严重程度相关的基因组位点对LZTFL1和RAVER1基因表达的影响 | 首次通过CRISPRi技术验证了COVID-19 GWAS位点对LZTFL1和RAVER1基因表达的调控作用 | 研究主要集中在肺上皮细胞，可能无法完全代表所有受影响的细胞类型 | 确定与COVID-19疾病严重程度相关的遗传变异如何影响邻近基因的表达 | COVID-19疾病严重程度相关的遗传变异及其对LZTFL1和RAVER1基因表达的影响 | 基因组学 | COVID-19 | CRISPRi | NA | RNA-seq | 涉及人类和猴子的肺单核/细胞样本 |
| 22766 | 2024-08-08 |
Landscape of cancer-associated fibroblasts identifies the secreted biglycan as a protumor and immunosuppressive factor in triple-negative breast cancer
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.2020984
PMID:35003899
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研究论文 | 研究癌症相关成纤维细胞（CAFs）在三阴性乳腺癌（TNBC）中的作用，并鉴定出分泌型蛋白biglycan作为促肿瘤和免疫抑制因子 | 首次在TNBC中详细探讨了CAFs与肿瘤细胞及免疫细胞的相互作用，并发现了biglycan作为新的促肿瘤和免疫抑制因子 | 研究主要集中在CAFs和biglycan的作用，对其他潜在的免疫调节因子的探索有限 | 探讨CAFs在TNBC中的作用及潜在的介导因子 | 癌症相关成纤维细胞（CAFs）、三阴性乳腺癌（TNBC）、biglycan蛋白 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序、质谱分析 | NA | RNA、细胞培养介质 | 包括来自正常和肿瘤样本的初级成纤维细胞，以及TNBC队列中的CAFs |
| 22767 | 2024-08-08 |
Differential analysis of binarized single-cell RNA sequencing data captures biological variation
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab118
PMID:34988441
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研究论文 | 本文提出使用二值化表达谱来识别单细胞RNA测序数据中的生物变异效应 | 采用二值化表达数据来更准确地表示生物变异，并揭示转录本的相对丰度 | NA | 识别单细胞RNA测序数据中的生物变异 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 16个公开可用和模拟的数据集 |
| 22768 | 2024-08-08 |
Cross-Tissue Characterization of Heterogeneities of Mesenchymal Stem Cells and Their Differentiation Potentials
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.781021
PMID:34977025
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了来自四种组织的间充质干细胞（MSCs）的异质性及其分化潜能 | 首次在单细胞水平上比较了不同组织来源的MSCs，并识别了其亚群及其在不同诱导分化过程中的基因和转录因子 | NA | 优化MSCs在再生医学和自身免疫疾病治疗中的临床应用 | 间充质干细胞（MSCs）及其在不同组织中的异质性和分化潜能 | 再生医学 | 自身免疫疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 来自脐带、骨髓、滑膜组织和脂肪组织的MSCs样本 |
| 22769 | 2024-08-08 |
Midkine Prevents Calcification of Aortic Valve Interstitial Cells via Intercellular Crosstalk
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.794058
PMID:34977035
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析描述了主动脉瓣细胞的综合转录组景观和细胞间相互作用，并探讨了midkine通过细胞间对话防止主动脉瓣间质细胞钙化的机制 | 首次揭示了midkine通过MK途径与激活的主动脉瓣间质细胞和补体激活的主动脉瓣间质细胞相互作用，抑制钙化的机制 | NA | 阐明钙化主动脉瓣疾病进展的机制并开发治疗靶点 | 主动脉瓣间质细胞的钙化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22770 | 2024-08-08 |
A Single-Cell Transcriptome Atlas of the Human Retinal Pigment Epithelium
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.802457
PMID:34977041
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，对来自三个供体的9,302个人类视网膜色素上皮细胞进行了转录组图谱分析 | 首次报道了人类视网膜色素上皮细胞的多样性，并识别出两个具有显著基因表达模式和功能差异的亚群 | NA | 揭示人类视网膜色素上皮细胞的转录组特征，为理解视网膜生物学和疾病提供关键信息 | 人类视网膜色素上皮细胞 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 9,302个细胞，来自三个供体 |
| 22771 | 2024-08-08 |
Role of Calcium Signaling Pathway-Related Gene Regulatory Networks in Ischemic Stroke Based on Multiple WGCNA and Single-Cell Analysis
2021, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2021/8060477
PMID:34987704
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研究论文 | 本研究旨在通过多重加权基因共表达网络分析（WGCNA）和单细胞分析，探讨缺血性中风（IS）后相关通路的变化及基因表达的差异表达。 | 本研究首次结合多重WGCNA和单细胞分析，揭示了钙信号通路相关基因和转录因子在缺血性中风中的关键作用。 | NA | 探讨缺血性中风后相关通路的变化及基因表达的差异表达。 | 缺血性中风样本的转录组表达数据和脑血管组织的单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据。 | 数字病理学 | 中风 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | WGCNA | 基因表达数据 | 40个样本的微阵列表达谱 |
| 22772 | 2024-08-08 |
Heterogeneous Pancreatic Stellate Cells Are Powerful Contributors to the Malignant Progression of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.783617
PMID:34988078
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研究论文 | 研究探讨了胰腺星状细胞（PSC）在胰腺癌恶性进展中的作用及其亚型对肿瘤发展和治疗抵抗的影响 | 利用单细胞测序技术分析了PSC的群体异质性，并揭示了两种功能互补且可逆的PSC亚型与肿瘤发展的关系 | NA | 深入理解PSC的分化及其在胰腺癌治疗中的作用 | 胰腺星状细胞及其在胰腺癌中的作用 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未提及 |
| 22773 | 2024-08-08 |
CTLA4-Mediated Immunosuppression in Glioblastoma is Associated with the Infiltration of Macrophages in the Tumor Microenvironment
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S341981
PMID:34992419
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研究论文 | 本研究探讨了CTLA4在胶质母细胞瘤（GBM）中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 开发了一个预测模型来计算每个GBM病例的风险评分，并发现CTLA4表达与巨噬细胞在GBM肿瘤微环境中的浸润水平和功能正相关 | CTLA4抑制剂在GBM中的临床效果有限 | 全面评估CTLA4在GBM中的作用 | CTLA4在GBM中的免疫抑制作用及其与肿瘤微环境中巨噬细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 组织样本 | 471例GBM病例 |
| 22774 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals CXCLs Enriched Fibroblasts Within Odontogenic Keratocysts
2021, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S342951
PMID:34992422
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了牙源性角化囊肿中的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探讨了血管生成的潜在调控机制 | 首次揭示了CXCLs富集的成纤维细胞在牙源性角化囊肿中的重要作用，并发现静水压力可以部分调控这些细胞的CXCL12分泌 | 研究样本仅来自3名捐赠者，可能影响结果的普遍性 | 定义牙源性角化囊肿的细胞亚群，特别是与血管生成相关的细胞亚群，并探索血管生成的潜在调控机制 | 牙源性角化囊肿中的细胞亚群及其与血管生成的关系 | 数字病理学 | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 14,072个细胞来自3名捐赠者 |
| 22775 | 2024-08-08 |
Prognostic Significance of NLR About NETosis and Lymphocytes Perturbations in Localized Renal Cell Carcinoma With Tumor Thrombus
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.771545
PMID:34993135
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研究论文 | 本文探讨了中性粒细胞与淋巴细胞比率（NLR）在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 首次证明了中性粒细胞相关的NETosis和系统性淋巴细胞扰动在伴有肿瘤血栓的局部肾细胞癌患者中的肿瘤进展作用，并指出NLR≥4是一个独立的预后风险因素。 | NA | 研究NLR在伴有肿瘤血栓的非转移性肾细胞癌中的预后意义，特别是与NETosis和淋巴细胞扰动的关系。 | 214名接受手术治疗的伴有肿瘤血栓的肾细胞癌患者。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | RNA测序, TCR测序, 单细胞RNA测序 | NA | 临床数据, 基因表达数据 | 214名患者 |
| 22776 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Molecular Anatomy of Sheep Hair Follicle Heterogeneity and Wool Curvature
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.800157
PMID:34993204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术揭示了羊毛囊的分子结构及其与羊毛弯曲度的关系 | 首次在羊中应用单细胞RNA测序技术，揭示了羊毛囊的细胞组成和分子机制，并阐明了羊毛弯曲度的潜在分子机制 | NA | 探究羊毛囊发育的分子机制及其与羊毛弯曲度的关系 | 羊的毛囊细胞及其转录组 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 15,830个单细胞转录组 |
| 22777 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing Analysis and Weighted Co-Expression Network Analysis Based on Public Databases Identified That TNC Is a Novel Biomarker for Keloid
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.783907
PMID:35003102
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析和加权共表达网络分析，基于公共数据库识别出TNC作为瘢痕瘤的新型生物标志物 | 首次识别出Tenascin-C (TNC)作为瘢痕瘤的敏感生物标志物，并通过伪时间分析探讨了其在成纤维细胞分化中的潜在作用 | 研究样本量较小，且仅基于公共数据库和中心数据进行验证，可能影响结果的普遍性 | 旨在识别瘢痕瘤的生物标志物，为设计新的靶向治疗提供依据 | 瘢痕瘤的生物标志物及成纤维细胞分化过程中的潜在作用 | 数字病理学 | 瘢痕瘤 | 单细胞RNA测序分析，加权共表达网络分析 | NA | RNA测序数据 | 16名瘢痕瘤患者及其邻近正常组织 |
| 22778 | 2024-08-08 |
Molecular Subtypes Based on Cell Differentiation Trajectories in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma: Differential Prognosis and Immunotherapeutic Responses
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.791621
PMID:35003112
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研究论文 | 本研究基于单细胞测序分析识别的HNSCC细胞分化相关基因，全面分析了866例HNSCC病例的分子亚型及其免疫、代谢和干细胞特性，并开发了HNSCC细胞分化评分（HCDscore）以量化个体样本的独特异质性。 | 本研究首次将HNSCC分为三个基于HDRGs的分子亚型：活跃基质型（Cluster-A）、活跃代谢型（Cluster-B）和活跃免疫型（Cluster-C），并展示了HCDscore与免疫微环境、亚型、致癌生物过程、遗传变异和预后的相关性。 | NA | 旨在研究头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞分化轨迹及其临床相关性。 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | 机器学习 | 多组学数据 | 866例HNSCC病例 |
| 22779 | 2024-08-08 |
Statistical methods for analysis of single-cell RNA-sequencing data
2021, MethodsX
IF:1.6Q2
DOI:10.1016/j.mex.2021.101580
PMID:35004214
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研究论文 | 本文提出了一种新的统计方法，用于分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中的独特分子标识符（UMI）计数数据 | 该方法考虑了导致严重丢失事件的生物过程，在模型中对观察到的UMI基因计数进行建模 | NA | 研究单细胞RNA测序数据分析中的统计方法 | 单细胞RNA测序数据中的UMI计数数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22780 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Identify Transcription Factor BACH1 as a Master Regulator Gene in Vascular Cells During Aging
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.786496
PMID:35004685
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研究论文 | 本研究通过分析已发表的单细胞RNA测序数据，揭示了转录因子BACH1在血管细胞衰老中的主要调控作用 | 首次识别BACH1为血管细胞衰老的主调控基因，并阐明了其在氧化应激下加剧内皮细胞衰老的机制 | 研究主要基于已发表的数据，未涉及实验验证 | 探索衰老心脏血管的细胞和分子特性，并证明转录因子BACH1在内皮细胞衰老中的作用及其机制 | 猴子和老鼠的心脏血管细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括猴子的冠状动脉和大动脉以及老鼠的心脏 |