单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27504 篇文献，本页显示第 22741 - 22760 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22741 | 2024-08-08 |
Phytohormone-Based Regulation of Trichome Development
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.734776
PMID:34659303
|
综述 | 本文综述了植物激素对毛状体发育的调控作用 | 介绍了CRISPR-Cas9系统和单细胞转录组学等新技术在研究毛状体细胞系调控网络中的应用 | NA | 探讨植物激素对毛状体发育的调控机制 | 植物毛状体的发育 | NA | NA | CRISPR-Cas9系统, 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 22742 | 2024-08-08 |
From GWAS to Gene: Transcriptome-Wide Association Studies and Other Methods to Functionally Understand GWAS Discoveries
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.713230
PMID:34659337
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综述 | 本文综述了结合功能基因组学知识与全基因组关联研究（GWAS）的数据整合生物信息学方法，以识别遗传调控基因 | 介绍了转录组广泛关联研究（TWAS）作为一种基因基础的关联方法，能够减少多重检验负担，并讨论了不同TWAS方法的设计和生物学假设 | 文章未明确提及具体限制 | 探讨如何通过数据整合方法更好地理解GWAS发现与复杂疾病机制之间的关系 | 全基因组关联研究（GWAS）发现的非编码区域及其在复杂人类疾病和性状中的功能 | 基因组学 | NA | 全基因组关联研究（GWAS），转录组广泛关联研究（TWAS） | NA | 基因组数据 | NA |
| 22743 | 2024-08-08 |
Identification of Specific Cell Subpopulations and Marker Genes in Ovarian Cancer Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/1005793
PMID:34660776
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 揭示了卵巢癌中的特定细胞亚群和标记基因，为卵巢癌的异质性提供了新的见解 | NA | 分析卵巢癌细胞中的特定细胞亚群和标记基因 | 卵巢癌细胞 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 66个高级别浆液性卵巢癌细胞样本和568个卵巢癌样本及8个正常卵巢样本 |
| 22744 | 2024-08-08 |
Biallelic variants in ZFP36L2 cause female infertility characterised by recurrent preimplantation embryo arrest
2022-Sep, Journal of medical genetics
IF:3.5Q2
DOI:10.1136/jmedgenet-2021-107933
PMID:34611029
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研究论文 | 本文通过全外显子测序和功能验证，发现双等位变异在ZFP36L2基因中与反复的植入前胚胎发育停滞相关 | 首次发现ZFP36L2基因的双等位变异与反复的植入前胚胎发育停滞有关，为这类不孕症提供了新的遗传诊断靶点 | NA | 探究反复植入前胚胎发育停滞的遗传原因 | 100名经历反复植入前胚胎发育停滞的不孕女性 | NA | 不孕症 | 全外显子测序, Sanger测序, 生物信息学分析, 体外功能分析, 单细胞RNA测序 | NA | 基因序列 | 100名不孕女性 |
| 22745 | 2024-08-08 |
Satb1 expression in retinal ganglion cells of marmosets, macaques, and humans
2022-04, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25258
PMID:34622958
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研究论文 | 本研究利用针对转录因子Satb1的抗体，研究了狨猴、猕猴和人类视网膜中Satb1的表达情况 | 发现旧世界（人类和猕猴）和新世界（狨猴）灵长类动物视网膜神经节细胞中转录因子的表达并不保守，并将分子标记与特定细胞类型联系起来 | NA | 研究不同物种视网膜神经节细胞中Satb1的表达情况 | 狨猴、猕猴和人类的视网膜神经节细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 狨猴、猕猴和人类各一种 |
| 22746 | 2024-08-08 |
Integrating genetic and epigenetic factors in chronic myeloid leukemia risk assessment: toward gene expression-based biomarkers
2022-02-01, Haematologica
IF:8.2Q1
DOI:10.3324/haematol.2021.279317
PMID:34615339
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综述 | 本文综述了基因表达（GE）分析在慢性髓性白血病（CML）中的应用，探讨其作为个性化治疗风险评估工具的潜力 | 提出了一个四阶段方法来开发基于GE的CML生物标志物，并探讨了遗传和表观遗传因素在耐药性和急性转化中的作用 | 不同细胞类型、技术使用和基因组数据解释的复杂性对将GE数据转化为具有临床实用性的生物标志物提出了挑战 | 评估GE分析在CML中的临床信息价值，并探索其作为个性化CML治疗风险评估工具的潜力 | 慢性髓性白血病（CML）患者 | 数字病理学 | 白血病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自多种来源的患者材料 |
| 22747 | 2024-08-08 |
Clustering spatial transcriptomics data
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab704
PMID:34623423
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研究论文 | 本文开发了一种名为FICT的新方法，该方法结合了基因表达和邻域信息来分配细胞类型，以充分利用空间转录组数据并提高识别新型亚型的能力 | FICT方法的创新之处在于它同时考虑了基因表达和细胞邻域信息，从而提高了细胞类型和亚型的识别准确性 | NA | 开发一种新的方法来更有效地分析空间转录组数据，并提高细胞类型和亚型的识别能力 | 空间转录组数据中的细胞类型和亚型 | 生物信息学 | NA | 荧光原位杂交（FISH） | 概率函数 | 空间转录组数据 | 模拟数据和多个真实空间转录组数据 |
| 22748 | 2024-08-08 |
Alignment of single-cell trajectories by tuMap enables high-resolution quantitative comparison of cancer samples
2022-01-19, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2021.09.003
PMID:34624253
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研究论文 | 本文介绍了一种名为tuMap的算法，该算法利用高维单细胞数据对具有内在发育结构的癌症样本进行对齐，以实现与健康发育的比较 | tuMap算法能够生成tuMap伪时间轴，允许对癌症样本进行系统性和有意义的比较，并揭示与临床相关的关联 | NA | 开发一种算法以实现高分辨率的癌症样本定量比较 | 急性淋巴细胞白血病和骨髓性白血病的单细胞数据 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22749 | 2024-08-08 |
scMRA: a robust deep learning method to annotate scRNA-seq data with multiple reference datasets
2022-01-12, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab700
PMID:34623390
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMRA的深度学习方法，用于使用多个参考数据集注释单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据 | scMRA通过构建知识图谱和使用图形卷积网络作为判别器，能够有效地从多个参考数据集中转移知识到未标记的目标域，并能去除批次效应 | NA | 开发一种有效且高效的细胞类型识别方法，以整合积累的scRNA-seq数据，实现细胞类型和状态的共同本体 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 图形卷积网络 | scRNA-seq数据 | 多个数据集 |
| 22750 | 2024-08-08 |
CeDR Atlas: a knowledgebase of cellular drug response
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab897
PMID:34634794
|
研究论文 | 本文介绍了CeDR Atlas，一个报告细胞药物反应计算推断的知识库，涵盖多种组织中的数百种细胞类型 | 利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据和Connectivity Map资源（CMap）的高通量药物诱导基因表达分析，实现了细胞分辨率的药物反应精细映射 | NA | 研究不同细胞类型对药物反应的差异，以改善组合治疗、药物抗性和副作用的设计 | 人类、小鼠和细胞系的单细胞数据对象 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 超过582个单细胞数据对象，包括约140种表型和1250种组织-细胞组合类型 |
| 22751 | 2024-08-08 |
SMILE: mutual information learning for integration of single-cell omics data
2022-01-03, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab706
PMID:34623402
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研究论文 | 本文介绍了一种无监督深度学习算法SMILE，通过最大化互信息来学习单细胞数据的判别表示，用于整合多源单细胞转录组数据 | SMILE算法能够成功整合多源单细胞转录组数据，消除批次效应，并将来自不同组织的相似细胞类型投影到共享空间中 | NA | 开发一种新的算法来整合不同来源、类型和特征的单细胞组学数据 | 单细胞组学数据 | 机器学习 | NA | 深度学习 | 深度学习算法 | 单细胞转录组数据 | NA |
| 22752 | 2024-08-08 |
Joint-Tissue Integrative Analysis Identified Hundreds of Schizophrenia Risk Genes
2022-Jan, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-021-02572-x
PMID:34628600
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研究论文 | 本研究利用多组织基因表达数据和全基因组关联研究数据，通过转录组范围的关联研究（TWAS）和孟德尔随机化分析，识别了与精神分裂症遗传风险相关的144个基因 | 本研究首次发现这些基因在产前和产后脑组织中的表达趋势截然相反，并在中孕期胎儿脑部的单细胞RNA测序数据中揭示了这些基因在谷氨酸能兴奋性神经元和循环前体细胞中的富集 | 需要进一步使用先进的算法在大量脑组织和单细胞中以及不同发育阶段进行研究，以表征精神分裂症发病机制的转录组特征 | 识别与精神分裂症遗传风险相关的基因，并探讨其在疾病发病机制中的作用 | 精神分裂症风险基因及其在脑发育中的表达模式 | 基因组学 | 精神分裂症 | 全基因组关联研究（GWAS），转录组范围的关联研究（TWAS），孟德尔随机化（MR）分析，单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22753 | 2024-08-08 |
3D tumor angiogenesis models: recent advances and challenges
2021-Dec, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-021-03814-0
PMID:34613483
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综述 | 本文综述了3D肿瘤血管生成模型的最新进展和面临的挑战 | 介绍了基于组织工程的肿瘤模型、血管类器官模型和器官芯片等新型3D肿瘤血管模型系统 | 现有模型多依赖于正常内皮细胞，与具有独特（表观）遗传和代谢特征的肿瘤内皮细胞有显著差异 | 旨在改进肿瘤血管模型系统，以促进个性化医疗的发展 | 肿瘤血管生成机制及其临床应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 22754 | 2024-08-08 |
Transcriptional and functional divergence in lateral hypothalamic glutamate neurons projecting to the lateral habenula and ventral tegmental area
2021-12-01, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2021.09.020
PMID:34624220
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研究论文 | 本研究通过病毒示踪、单细胞测序、电生理学和体内钙成像技术，系统比较了投射到外侧缰核和腹侧被盖区的外侧下丘脑谷氨酸能神经元的功能差异 | 揭示了外侧下丘脑神经元在投射到不同脑区的功能异质性，表明奖励和厌恶在不同的传出通路中被不同处理 | NA | 解析外侧下丘脑特定神经元群的功能 | 外侧下丘脑谷氨酸能神经元投射到外侧缰核和腹侧被盖区的功能差异 | 神经科学 | NA | 病毒示踪、单细胞测序、电生理学、体内钙成像 | NA | 神经元活动数据 | NA |
| 22755 | 2024-08-08 |
Significance of intratumoral infiltration of B cells in cancer immunotherapy: From a single cell perspective
2021-12, Biochimica et biophysica acta. Reviews on cancer
DOI:10.1016/j.bbcan.2021.188632
PMID:34626740
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综述 | 本文综述了肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的作用，特别是从单细胞RNA测序的角度探讨其亚群、分化轨迹及与肿瘤微环境中的其他细胞的相互作用 | 利用单细胞RNA测序技术，高分辨率动态监测肿瘤微环境在免疫治疗中的变化，揭示B细胞在抗肿瘤免疫中的独特功能 | NA | 探讨肿瘤内浸润B细胞在癌症免疫治疗中的潜在临床应用价值，作为生物标志物和治疗靶点 | 肿瘤内浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 免疫学 | 恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | NA |
| 22756 | 2024-08-08 |
Curc-mPEG454, a PEGylated curcumin derivative, as a multi-target anti-fibrotic prodrug
2021-Dec, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2021.108166
PMID:34628270
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研究论文 | 本研究评估了PEG化姜黄素衍生物Curc-mPEG454在四氯化碳诱导的大鼠肝纤维化模型中的抗纤维化效果及其机制 | Curc-mPEG454不仅提高了姜黄素的血液浓度，还保留了其抗炎活性，并通过调节多种信号通路有效抑制了纤维化相关细胞的扩张 | NA | 评估Curc-mPEG454的抗纤维化效果并探索其作用机制 | Curc-mPEG454在四氯化碳诱导的大鼠肝纤维化模型中的作用 | NA | 肝纤维化 | RNA测序(RNA-seq), 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | RNA | 使用50 mg/kg和100 mg/kg Curc-mPEG454处理的大鼠 |
| 22757 | 2024-08-08 |
Tumor-propagating side population cells are a dynamic subpopulation in undifferentiated pleomorphic sarcoma
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.148768
PMID:34618689
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研究论文 | 本研究利用未分化多形性肉瘤（UPS）的小鼠模型，追踪了肉瘤侧群（SP）细胞与非SP细胞之间的谱系关系，并探讨了SP细胞的肿瘤传播潜力及其在肿瘤生长和自我更新中的作用。 | 首次证明了肉瘤中的肿瘤传播细胞（TPCs）的表型是动态的，非SP细胞可以转化为具有增强肿瘤传播潜力的SP细胞。 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人类肉瘤中验证这些发现。 | 探讨肉瘤中肿瘤传播细胞的动态特性及其对肿瘤生长和自我更新的影响。 | 未分化多形性肉瘤（UPS）中的侧群（SP）细胞和非SP细胞。 | 数字病理学 | 肉瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠模型中的SP细胞和非SP细胞 |
| 22758 | 2024-08-08 |
Human nasal wash RNA-Seq reveals distinct cell-specific innate immune responses in influenza versus SARS-CoV-2
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152288
PMID:34618691
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的先天免疫反应差异 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的不同反应 | 研究样本仅限于成人，且未涵盖所有可能的细胞类型和亚型 | 探讨流感与SARS-CoV-2感染在鼻腔上皮细胞和免疫细胞中的先天免疫反应差异 | 人鼻洗液细胞在流感与SARS-CoV-2感染中的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 成人鼻洗液细胞样本 |
| 22759 | 2024-08-08 |
Cell cycle heterogeneity directs spontaneous 2C state entry and exit in mouse embryonic stem cells
2021-11-09, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.09.003
PMID:34624246
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研究论文 | 本文研究了小鼠胚胎干细胞中自发进入和退出二细胞样状态的过程 | 揭示了细胞周期在调节核仁和核周异染色质组装中通过影响2C基因Dux表达，从而介导二细胞样状态与多能状态之间双向过渡的机制 | NA | 理解小鼠胚胎干细胞中二细胞样状态与多能状态之间的双向过渡机制 | 小鼠胚胎干细胞中的二细胞样细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量二细胞样细胞 |
| 22760 | 2024-08-08 |
CTRP4 ablation impairs associative learning and memory
2021-11, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100733RR
PMID:34610176
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研究论文 | 本研究探讨了C1q/TNF相关蛋白4（CTRP4）在中枢神经系统中的功能，特别是其在海马依赖的联想学习和记忆中的作用。 | 首次揭示了CTRP4在海马依赖的联想学习和记忆中的作用，并发现这种作用具有性别依赖性。 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来研究需要进一步验证这些发现是否适用于其他物种。 | 揭示CTRP4在中枢神经系统中的额外功能，特别是其在联想学习和记忆中的作用。 | Ctrp4敲除（KO）小鼠的行为和基因表达。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | Ctrp4 KO小鼠和野生型（WT）同窝小鼠 |