单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27986 篇文献，本页显示第 22681 - 22700 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22681 | 2024-08-08 |
An integrated brain-specific network identifies genes associated with neuropathologic and clinical traits of Alzheimer's disease
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab522
PMID:34953465
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研究论文 | 本研究开发了一种基于阿尔茨海默病大脑基因网络的方法，用于预测与阿尔茨海默病相关的基因，并通过独立遗传、转录组、蛋白质组数据以及神经病理学和临床数据进行系统验证 | 构建的网络在预测阿尔茨海默病相关基因方面优于现有网络，并揭示了细胞类型特异性的早期病理关联 | NA | 旨在识别与阿尔茨海默病相关的风险基因 | 阿尔茨海默病的遗传风险基因 | 遗传学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 基因网络 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、神经病理学数据、临床数据 | 使用了来自Mount Sinai脑库研究、宗教秩序研究、记忆和衰老项目以及巴尔的摩衰老纵向研究的数据 |
| 22682 | 2024-08-08 |
Understanding of mouse and human bladder at single-cell resolution: integrated analysis of trajectory and cell-cell interactive networks based on multiple scRNA-seq datasets
2022-Jan, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13170
PMID:34951074
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研究论文 | 本研究通过整合多个单细胞RNA测序数据集，详细解析了小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的轨迹和细胞间相互作用网络 | 创建了迄今为止最大的整合膀胱数据集，并发现了多种基因的伪时间模式以及细胞间信号传导的特定模式 | NA | 详细解析小鼠和人类膀胱在单细胞水平上的生物学特性 | 小鼠和人类膀胱的单细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 共收集了超过50,000个细胞，包括16,688个小鼠膀胱细胞和22,080个人类膀胱细胞 |
| 22683 | 2024-08-08 |
Lineage recording in human cerebral organoids
2022-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01344-8
PMID:34969984
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研究论文 | 本文介绍了iTracer技术，一种结合报告条形码和可诱导的CRISPR-Cas9疤痕的谱系记录器，用于研究人脑类器官发育中的克隆性和谱系动态 | iTracer技术能够直接测量谱系关系，并兼容单细胞和空间转录组学 | NA | 探索脑类器官发育过程中的克隆性和谱系动态 | 人脑类器官 | 干细胞研究 | NA | CRISPR-Cas9, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22684 | 2024-08-08 |
eNOS controls angiogenic sprouting and retinal neovascularization through the regulation of endothelial cell polarity
2021-Dec-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-021-04042-y
PMID:34971428
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研究论文 | 本研究探讨了eNOS在血管新生过程中的作用，特别是在内皮细胞极性调控中的角色 | 首次详细阐述了eNOS通过调节内皮细胞极性影响血管新生和视网膜新生血管化的机制 | NA | 研究eNOS在血管新生和视网膜新生血管化中的作用 | 内皮细胞的极性和血管新生 | 数字病理学 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | eNOS敲除小鼠的视网膜内皮细胞 |
| 22685 | 2024-08-08 |
TREM2-independent oligodendrocyte, astrocyte, and T cell responses to tau and amyloid pathology in mouse models of Alzheimer disease
2021-12-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110158
PMID:34965428
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，广泛分析了三种不同阿尔茨海默病（AD）小鼠模型中的13种细胞类型，重点研究了微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 研究发现了少突胶质细胞在不同疾病模型中出现的两种不同的转录状态，并确定了它们的空间分布。此外，研究还探讨了Trem2缺失在合并病理背景下的影响。 | NA | 研究非神经元细胞在神经退行性疾病中的反应，以及这些反应如何影响疾病的发病机制和进展。 | 微胶质细胞、少突胶质细胞、星形胶质细胞和T细胞对tau和淀粉样病理的反应。 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 三种不同阿尔茨海默病小鼠模型中的13种细胞类型 |
| 22686 | 2024-08-08 |
Conjoint analysis of circulating tumor cells and solid tumors for exploring potential prognostic markers and constructing a robust novel predictive signature for breast cancer
2021-Dec-25, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-021-02415-8
PMID:34953500
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研究论文 | 本研究通过分析循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据，探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个新的预测模型 | 首次在分子水平上研究循环肿瘤细胞的异质性，并利用这些信息构建了一个18基因的风险评分模型，用于预测乳腺癌患者的预后和治疗反应 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据和批量测序数据，可能存在样本量不足的问题 | 探索乳腺癌的潜在预后标志物并构建一个稳健的新预测模型 | 循环肿瘤细胞和实体瘤的基因表达数据 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 涉及乳腺癌患者的循环肿瘤细胞和实体瘤样本 |
| 22687 | 2024-08-08 |
Spatially Resolved Expression of Transposable Elements in Disease and Somatic Tissue with SpatialTE
2021-Dec-20, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413623
PMID:34948421
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialTE的工具，用于分析空间转录组学数据中的转座子表达，并展示了其在体细胞和疾病组织中的应用 | SpatialTE工具能够分析空间转录组学数据中的转座子表达，这是由于转座子的高度重复性质在以往的研究中未被充分探讨 | NA | 研究转座子在空间上的表达模式及其在基因调控中的作用 | 转座子在体细胞和疾病组织中的表达 | NA | 肌萎缩侧索硬化症（ALS） | 空间转录组学（ST） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22688 | 2024-08-08 |
Integrated single-cell sequencing of 5-hydroxymethylcytosine and genomic DNA using scH&G-seq
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.101016
PMID:34950891
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA测序（scH&G-seq）的详细协议，用于同时量化单个细胞中的5hmC和基因组DNA，以在单细胞分裂分辨率下重建谱系树 | scH&G-seq技术能够同时量化单个细胞中的5-羟甲基胞嘧啶和基因组DNA，结合基因组变异数据，准确重建更大的谱系树 | NA | 开发一种新的单细胞测序技术，用于在单细胞分裂分辨率下重建细胞谱系 | 5-羟甲基胞嘧啶（5hmC）和基因组DNA | 基因组学 | NA | scH&G-seq | NA | DNA | 单个细胞 |
| 22689 | 2024-08-08 |
Profiling Glioblastoma Cases with an Expression of DCX, OLIG2 and NES
2021-Dec-08, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222413217
PMID:34948016
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研究论文 | 本研究通过免疫组织化学和单细胞RNA测序分析了17例胶质母细胞瘤中DCX、NES和OLIG2的表达模式 | 首次详细分析了DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用，并结合单细胞RNA测序数据进行了深入探讨 | 研究结果未能明确证明DCX参与胶质母细胞瘤细胞的迁移 | 探讨DCX在胶质母细胞瘤细胞迁移中的作用 | 胶质母细胞瘤中的DCX、NES和OLIG2表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 免疫组织化学, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 基因表达数据 | 17例胶质母细胞瘤样本 |
| 22690 | 2024-08-08 |
Immunotherapy for Hepatocellular Carcinoma: New Prospects for the Cancer Therapy
2021-Dec-07, Life (Basel, Switzerland)
DOI:10.3390/life11121355
PMID:34947886
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综述 | 本文综述了肝细胞癌（HCC）的免疫治疗新进展，包括免疫检查点抑制剂、树突状细胞疫苗、溶瘤病毒等方法 | 介绍了单细胞RNA测序技术在识别免疫细胞群及其相互作用中的应用，以提高HCC患者对免疫治疗反应的可能性 | 目前免疫治疗策略在临床上尚未普遍引发强烈的抗肿瘤反应 | 探讨肿瘤浸润免疫细胞的种类及其在HCC发展中的作用，并讨论免疫治疗策略的最新进展 | 肝细胞癌及其免疫治疗 | NA | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22691 | 2024-08-08 |
Therapeutic Effect of IL-38 on Experimental Autoimmune Uveitis: Reprogrammed Immune Cell Landscape and Reduced Th17 Cell Pathogenicity
2021-12-01, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.62.15.31
PMID:34967854
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研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素(IL)-38对实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)的影响及其潜在机制 | 首次揭示了IL-38通过重编程免疫细胞景观和减少Th17细胞致病性来治疗EAU的效果 | NA | 阐明IL-38对EAU的影响及其机制 | 实验性自身免疫性葡萄膜炎(EAU)小鼠模型 | NA | 自身免疫性疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 细胞 | 正常小鼠、EAU小鼠及IL-38治疗的小鼠的颈淋巴结 |
| 22692 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals Developmental Relationships and Specific Markers of Mouse Periodontium Cellular Subsets
2021-Aug, Frontiers in dental medicine
IF:1.5Q3
DOI:10.3389/fdmed.2021.679937
PMID:34966906
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，揭示了小鼠牙周组织细胞亚群的发育关系及特定标记物 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术，揭示了牙周组织细胞的异质性及其与牙囊细胞的关系，并鉴定了区分牙骨质细胞和牙槽骨成骨细胞的特定基因 | NA | 探讨牙周组织细胞的发育关系及其细胞间相互作用 | 小鼠牙周组织的细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括PTHrP-mCherry牙囊细胞（P6）和2.3kb Col1a1启动子驱动的GFP牙周细胞（P25） |
| 22693 | 2024-08-08 |
scGET: Predicting Cell Fate Transition During Early Embryonic Development by Single-cell Graph Entropy
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2020.11.008
PMID:34954425
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研究论文 | 本研究提出了一种名为scGET的计算方法，通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据探索基因间的关联，用于预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | scGET方法通过将基因表达数据转换为局部网络熵，利用单细胞图熵（SGE）值定量描述细胞群体间基因调控网络的稳定性和关键性，从而在单细胞水平上检测细胞命运或谱系承诺的关键信号 | NA | 研究目的是开发一种新的计算方法来预测早期胚胎发育中的细胞命运转变 | 研究对象是早期胚胎发育过程中的细胞命运转变 | 机器学习 | NA | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 五个scRNA-seq数据集 |
| 22694 | 2024-08-08 |
GranatumX: A Community-engaging, Modularized, and Flexible Webtool for Single-cell Data Analysis
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.07.005
PMID:34973417
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研究论文 | 介绍了一种名为GranatumX的下一代软件环境，用于单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据分析 | GranatumX允许生物学家在基于Web的图形环境中访问最新的scRNA-seq生物信息学方法，并为软件开发者提供了一个快速推广其工具的平台 | NA | 开发一个社区参与、模块化和灵活的Web工具，用于单细胞数据分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 数据分析 | NA |
| 22695 | 2024-08-08 |
Inhibition of Podocytes DPP4 Activity Is a Potential Mechanism of Lobeliae Chinensis Herba in Treating Diabetic Kidney Disease
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.779652
PMID:34950037
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研究论文 | 本文研究了传统中药半夏泻心汤（LCH）通过抑制足细胞中的DPP4活性来治疗糖尿病肾病（DKD）的潜在机制 | 首次通过单细胞测序数据和网络药理学方法，筛选出LCH中12种活性成分，并预测这些成分通过分子对接抑制DPP4活性，从而延缓足细胞增殖 | NA | 探讨半夏泻心汤治疗糖尿病肾病的机制 | 糖尿病肾病中的足细胞和DPP4活性 | NA | 糖尿病肾病 | 单细胞测序, 网络药理学, 分子对接 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 22696 | 2024-08-08 |
Dissecting the Landscape of Activated CMV-Stimulated CD4+ T Cells in Humans by Linking Single-Cell RNA-Seq With T-Cell Receptor Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.779961
PMID:34950144
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体测序分析了人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群的异质性和潜在功能 | 首次详细分析了CMV再激活的CD4+ T细胞亚群的表型和TCR谱系，为理解CD4+ T细胞在CMV感染中的功能和相互作用提供了线索 | NA | 解析CMV感染中激活的CD4+ T细胞的景观 | 人类外周血中CMVpp65再激活的CD4+ T细胞亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, T细胞受体测序 | NA | RNA, TCR序列 | 来自人类外周血的CD4+ T细胞亚群 |
| 22697 | 2024-08-08 |
Single-Cell Regulatory Network Inference and Clustering Identifies Cell-Type Specific Expression Pattern of Transcription Factors in Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.676515
PMID:34955748
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了成年小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并构建了细胞类型特异性的表达图谱 | 首次在单细胞水平上揭示了小鼠坐骨神经中不同细胞类型的转录因子表达模式，并创建了细胞类型特异性的表达图谱 | NA | 旨在识别复杂组织中的细胞类型，并进行大规模的细胞类型特异性基因表达分析 | 成年小鼠坐骨神经中的不同细胞类型及其转录因子表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 238个转录因子在9种不同细胞类型中表达 |
| 22698 | 2024-08-08 |
Retinal Organoids Long-Term Functional Characterization Using Two-Photon Fluorescence Lifetime and Hyperspectral Microscopy
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.796903
PMID:34955757
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研究论文 | 本文介绍了一种基于双光子显微镜的活体成像技术，用于非侵入性地监测和表征视网膜类器官的长期发育 | 使用荧光寿命成像显微镜（FLIM）和超光谱成像技术监测视网膜类器官的代谢轨迹和分子结构变化 | 组织产物的异质性和主观组织选择降低了类器官实验的可重复性 | 提高类器官质量控制，监测视网膜类器官的长期发育 | 视网膜类器官的代谢和分子结构变化 | 数字病理学 | NA | 双光子显微镜，荧光寿命成像显微镜（FLIM），超光谱成像 | NA | 图像 | 多个细胞系和生产批次的视网膜类器官 |
| 22699 | 2024-08-08 |
Airway Basal Cells Mediate Hypoxia-Induced EMT by Increasing Ribosome Biogenesis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.783946
PMID:34955855
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研究论文 | 研究探讨了气道基底细胞在缺氧诱导的上皮间质转化（EMT）中的作用，特别是通过增加核糖体生物发生 | 首次揭示了气道基底细胞通过增强核糖体生物发生来介导缺氧诱导的EMT过程 | NA | 探究缺氧在气道上皮细胞中诱导EMT的机制 | 小鼠气管上皮细胞（MTECs）及其在缺氧条件下的反应 | NA | 呼吸系统疾病 | 流式细胞术，免疫荧光检测，实时荧光定量PCR | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 22700 | 2024-08-08 |
Galectin-9/TIM-3 as a Key Regulator of Immune Response in Gliomas With Chromosome 1p/19q Codeletion
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.800928
PMID:34956239
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研究论文 | 本研究探讨了1p/19q共缺失的胶质瘤中Galectin-9/TIM-3作为免疫反应关键调节因子的生物学功能变化 | 发现1p/19q共缺失通过下调Galectin-9和TIM-3的表达水平，促进胶质瘤的抗肿瘤免疫反应 | NA | 揭示1p/19q共缺失胶质瘤中与免疫反应紧密相关的生物学功能变化 | 1p/19q共缺失的胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质瘤 | RNA测序, t-SNE算法, CIBERSORT分析 | NA | RNA序列数据, 单细胞测序数据 | 来自The Cancer Genome Atlas和中国胶质瘤基因组图谱数据库的胶质瘤患者临床病理和RNA测序数据 |