单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
22681 2024-08-08
Deciphering mouse uterine receptivity for embryo implantation at single-cell resolution
2021-Nov, Cell proliferation IF:5.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,解析了小鼠子宫对胚胎植入的接受性 首次在单细胞分辨率下解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性,揭示了不同细胞类型的基因表达变化 NA 旨在解析小鼠子宫对胚胎植入的接受性 小鼠子宫的接受性 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 预接受期和接受期的小鼠子宫样本
22682 2024-08-08
A scoping review on the potentiality of PD-L1-inhibiting microRNAs in treating colorectal cancer: Toward single-cell sequencing-guided biocompatible-based delivery
2021-Nov, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
综述 本文通过综述探讨了PD-L1抑制性微小RNA在治疗结直肠癌中的潜在治疗价值,并探讨了基于单细胞测序的生物相容性递送系统 提出基于单细胞测序的生物相容性递送系统,以提高微小RNA递送的特异性,减少传统纳米颗粒的毒性,并改善肿瘤微环境 NA 探讨PD-L1抑制性微小RNA在结直肠癌治疗中的潜在价值 PD-L1抑制性微小RNA及其在结直肠癌细胞中的作用 数字病理学 结直肠癌 单细胞测序 NA 文本 NA
22683 2024-08-08
Systematic review on the current knowledge and use of single-cell RNA sequencing in head and neck cancer
2021-Nov, APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica IF:2.2Q3
综述 本文系统回顾了利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术在头颈鳞状细胞癌(HNSCC)中的应用和知识现状 scRNA-seq技术能够在单细胞水平上对肿瘤组织进行遗传学特征分析 需要进一步的研究来继续发展和应用scRNA-seq技术 回顾scRNA-seq在HNSCC中的应用,并探讨其在临床研究中的潜力 头颈鳞状细胞癌(HNSCC) 数字病理学 头颈癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 基因数据 共涉及20名患者
22684 2024-08-08
The histone acetyltransferase HBO1 promotes efficient tip cell sprouting during angiogenesis
2021-10-15, Development (Cambridge, England)
研究论文 研究探讨了组蛋白乙酰转移酶HBO1在血管生成中促进尖端细胞发芽的作用 发现HBO1和H3K14ac的缺失影响了发育中的发芽血管生成和病理性内皮细胞过度生长 NA 研究HBO1在血管生成中的作用及其对内皮细胞基因表达的影响 内皮细胞(ECs)和其在血管生长与重塑中的动态基因表达变化 NA NA 单细胞RNA测序 NA RNA Hbo1缺陷的视网膜内皮细胞
22685 2024-08-08
Mitochondrial respiratory chain function promotes extracellular matrix integrity in cartilage
2021-10, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 研究使用单细胞RNA测序分析揭示线粒体呼吸链功能对成熟软骨中细胞外基质(ECM)稳态的重要性 首次揭示线粒体呼吸链功能与ECM稳态之间的关联,并展示了这种功能障碍对ECM结构和机械稳定性的影响 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类或其他物种中验证 探讨线粒体呼吸链功能与软骨中ECM稳态之间的关系 软骨组织中的线粒体呼吸链功能和ECM稳态 生物学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-Seq),质谱/基质分析,原子力显微镜 NA 基因表达数据 涉及1个月大的突变小鼠的股骨头软骨
22686 2024-08-08
The transcriptional characteristics of mast cells derived from skin tissue in type 2 diabetes patients at the single-cell level
2021-Oct, Acta histochemica IF:2.3Q4
研究论文 本研究旨在探讨2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征 首次在单细胞水平上描述了2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞的特征基因 样本量较小,仅包括两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者 探索2型糖尿病患者皮肤组织中肥大细胞在单细胞水平的转录特征,为研究异常葡萄糖代谢下的肥大细胞行为提供实验数据 2型糖尿病患者和非糖尿病患者的皮肤组织中的肥大细胞 数字病理学 2型糖尿病 单细胞RNA测序 NA 单细胞cDNA文库 共8888个细胞,来自两名2型糖尿病患者和一名非糖尿病创伤患者的皮肤组织
22687 2024-08-08
Transitions in development - an interview with Tom Nowakowski
2021-10-01, Development (Cambridge, England)
访谈 本文是对加州大学旧金山分校助理教授Tom Nowakowski的访谈,他利用单细胞测序技术研究神经发育 NA NA 了解Tom Nowakowski的职业发展及其作为研究组长的未来计划 Tom Nowakowski的职业生涯和研究方向 NA NA 单细胞测序 NA NA NA
22688 2024-08-08
Synthesized HMGB1 peptide attenuates liver inflammation and suppresses fibrosis in mice
2021-Sep-27, Inflammation and regeneration IF:5.0Q1
研究论文 本文评估了合成HMGB1肽对CCl诱导的肝硬化小鼠模型的治疗效果,发现其能减轻肝脏炎症并抑制纤维化 提出了一种新的无细胞治疗方法,使用HMGB1肽诱导抗炎巨噬细胞,用于治疗肝硬化 体外分析未能证实HMGB1肽对单核细胞/巨噬细胞的直接影响 评估HMGB1肽对肝纤维化的治疗效果 CCl诱导的肝硬化小鼠模型 NA 肝病 单细胞RNA测序 NA 组织 小鼠
22689 2024-08-08
Single cell RNA-seq data and bulk gene profiles reveal a novel signature of disease progression in multiple myeloma
2021-Sep-25, Cancer cell international IF:5.3Q1
研究论文 本文通过分析单细胞RNA测序数据和批量基因表达谱,揭示了多发性骨髓瘤(MM)发展过程中的新型分子特征 本文建立了一个20基因的特征,作为MM的独立生物标志物,并成功预测了接受硼替佐米治疗患者的临床结果 NA 揭示多发性骨髓瘤发展的分子机制 多发性骨髓瘤细胞的转录组 数字病理学 多发性骨髓瘤 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 597个细胞
22690 2024-08-08
Single-cell transcriptomics reveal DHX9 in mature B cell as a dynamic network biomarker before lymph node metastasis in CRC
2021-Sep-24, Molecular therapy oncolytics IF:5.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了成熟B细胞中的DHX9在结直肠癌(CRC)淋巴结转移前的动态网络生物标志物作用 首次发现DHX9在成熟B细胞中作为CRC淋巴结转移前的关键动态网络生物标志物 NA 开发预测性生物标志物,以检测CRC淋巴结转移前成熟B细胞的关键转变点 结直肠癌患者的邻近组织中的成熟B细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞转录组学 动态网络生物标志物(DNB)方法 转录组数据 725个来自结直肠癌的B细胞
22691 2024-08-08
Reconstructing and counting genomic fragments through tagmentation-based haploid phasing
2021-09-23, Scientific reports IF:3.8Q1
研究论文 本文通过基于标签化的单倍体分型技术,展示了通过新型生物信息学算法重建和计数基因组片段的概念 提出了一种新的生物信息学算法,用于检测基因组的离散性质,以准确确定基因拷贝数变化 该方法依赖于样本,调用敏感性因样本的倍性而异,并对测序数据中的噪声敏感 提高单细胞测序中基因拷贝数变化的准确性,以更好地追踪和理解肿瘤发生 癌症细胞的异质性和基因拷贝数变化 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因组数据 NA
22692 2024-08-08
Epicardial differentiation drives fibro-fatty remodeling in arrhythmogenic cardiomyopathy
2021-Sep-22, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本文利用人诱导多能干细胞(hiPSC)衍生的心脏培养物、单细胞RNA测序(scRNA-seq)和移植的人ACM心脏研究了ACM中纤维脂肪重塑的心外膜贡献 首次揭示了TFAP2A通过促进上皮间质转化(EMT)介导心外膜分化,从而在ACM中驱动纤维脂肪重塑的关键作用 NA 探讨心律失常性心肌病(ACM)中心外膜对纤维脂肪重塑的贡献及其分子机制 人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞、单细胞RNA测序数据和ACM患者移植心脏 数字病理学 心律失常性心肌病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 细胞 来自ACM患者和健康供体的人诱导多能干细胞衍生的心外膜细胞及ACM患者移植心脏样本
22693 2024-08-08
CCR2 deficiency alters activation of microglia subsets in traumatic brain injury
2021-09-21, Cell reports IF:7.5Q1
研究论文 研究探讨了CCR2缺乏对创伤性脑损伤中微胶质细胞亚群激活的影响 使用无偏倚的单细胞RNA测序方法揭示了创伤性脑损伤和正常脑中的25种微胶质细胞、单核/巨噬细胞和树突状细胞亚群,并发现CCR2缺乏的创伤性脑损伤小鼠与野生型创伤性脑损伤小鼠相比,微胶质细胞亚群的转录谱发生改变 NA 定义创伤性脑损伤中微胶质细胞和巨噬细胞表型的异质性,并探索CCR2缺乏对这些细胞的影响 微胶质细胞和巨噬细胞在创伤性脑损伤中的作用 NA 创伤性脑损伤 单细胞RNA测序 NA RNA 野生型小鼠和CCR2缺乏小鼠
22694 2024-08-08
Integrative Transcriptome Profiling Reveals SKA3 as a Novel Prognostic Marker in Non-Muscle Invasive Bladder Cancer
2021-Sep-17, Cancers IF:4.5Q1
研究论文 本研究通过综合转录组分析,揭示了SKA3作为非肌肉浸润性膀胱癌的新型预后标志物 发现SKA3与非肌肉浸润性膀胱癌的病理生理和不良生存相关,并可能通过抑制其表达来降低膀胱癌进展的风险 NA 提高非肌肉浸润性膀胱癌患者临床结果的诊断准确性 非肌肉浸润性膀胱癌及其向肌肉浸润性膀胱癌的进展 数字病理学 膀胱癌 RNA测序 NA 转录组数据 涉及多个膀胱癌患者队列的公共数据集以及人类肿瘤组织的RNA测序数据
22695 2024-08-08
Inferring gene regulatory networks from single-cell RNA-seq temporal snapshot data requires higher-order moments
2021-Sep-10, Patterns (New York, N.Y.)
研究论文 本文探讨了从单细胞RNA测序(scRNA-seq)时间快照数据推断基因调控网络(GRN)的方法,强调了高阶统计量的重要性 提出了一种基于高阶统计量的方法来推断基因调控网络,并强调了数据预处理对保留这些统计量的重要性 目前的数据预处理可能无法保留这些统计量,且需要计算密集型的最小化解算器 开发一种新的方法来从scRNA-seq数据中推断基因调控网络 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 时间快照数据 NA
22696 2024-08-08
Adapting Gastrointestinal Organoids for Pathogen Infection and Single Cell Sequencing under Biosafety Level 3 (BSL-3) Conditions
2021-09-10, Journal of visualized experiments : JoVE
研究论文 本文提供了一个全面的协议,用于准备人肠道类器官以感染肠道病原体,并考虑感染侧(顶端 vs. 基底侧)进行单细胞RNA测序,以表征细胞类型特异性的宿主/病原体相互作用。 本文创新地提出了在生物安全三级(BSL-3)条件下,通过考虑感染侧来准备人肠道类器官以进行单细胞RNA测序的方法。 本文未明确提及研究的具体限制。 研究肠道病原体感染的细胞类型特异性宿主/病原体相互作用。 人肠道类器官及其对肠道病原体感染的反应。 NA NA 单细胞RNA测序 NA 细胞 未明确提及具体样本数量
22697 2024-08-08
Identifying Lung Cancer Cell Markers with Machine Learning Methods and Single-Cell RNA-Seq Data
2021-Sep-09, Life (Basel, Switzerland)
研究论文 本文提出了一种基于转录组轮廓的计算方法,用于区分非小细胞肺癌不同病理区域的细胞亚型,并包括一组定性分类标准(生物标志物)和各种规则 利用单细胞RNA测序技术和机器学习方法,识别非小细胞肺癌的细胞标志物 NA 探索非小细胞肺癌的发病机制并区分其细胞亚型 非小细胞肺癌的细胞亚型及其生物标志物 机器学习 肺癌 单细胞RNA测序 随机森林分类器和决策树 转录组数据 720个特征用于随机森林分类器,1880个特征用于决策树
22698 2024-08-08
Single-Cell Omics in Dissecting Immune Microenvironment of Malignant Gliomas-Challenges and Perspectives
2021-08-31, Cells IF:5.1Q2
研究论文 本文综述了单细胞技术在解析恶性胶质瘤免疫微环境中的应用,并探讨了其面临的挑战和未来展望 单细胞RNA测序和时间飞行细胞仪技术提供了前所未有的肿瘤微环境解析能力 NA 总结单细胞技术在恶性胶质瘤免疫微环境研究中的发现,并探讨其对设计有效免疫疗法的重要性 恶性胶质瘤的免疫微环境及其对肿瘤进展和治疗反应的影响 数字病理学 脑肿瘤 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、时间飞行细胞仪(CyTOF) NA 单细胞数据 NA
22699 2024-08-08
Loss of Ubiquitin Carboxy-Terminal Hydrolase L1 Impairs Long-Term Differentiation Competence and Metabolic Regulation in Murine Spermatogonial Stem Cells
2021-08-31, Cells IF:5.1Q2
研究论文 研究探讨了UCH-L1在鼠精原干细胞中的作用及其对长期分化能力和代谢调节的影响 首次揭示了UCH-L1缺失对精原干细胞稳态和代谢的影响,以及其对精原干细胞分化能力的潜在作用 NA 理解UCH-L1在鼠精原干细胞中的功能及其对精原干细胞分化和代谢的影响 鼠精原干细胞 NA NA 单细胞转录组分析 NA 转录组数据 NA
22700 2024-08-08
Pushing the Boundaries: Forensic DNA Phenotyping Challenged by Single-Cell Sequencing
2021-08-30, Genes IF:2.8Q2
研究论文 本文探讨了单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的应用 首次将单细胞测序技术应用于法医DNA表型分析,以改善混合物解卷积 单细胞测序在法医学中的应用尚不普遍 研究单细胞测序技术在法医DNA表型分析中的潜力 从尸检血液中分离的白细胞 数字病理学 NA 单细胞测序 NA DNA 20、10、5个细胞组以及20个单细胞
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