单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22661 - 22680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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| 22661 | 2024-08-08 |
Integration and gene co-expression network analysis of scRNA-seq transcriptomes reveal heterogeneity and key functional genes in human spermatogenesis
2021-09-27, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-98267-3
PMID:34580317
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研究论文 | 本研究通过整合多个正常生精过程的scRNA-seq数据集，分析了超过33,000个睾丸细胞的单细胞转录组，以揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 本研究首次整合多个scRNA-seq数据集，通过加权基因共表达网络分析揭示了精子发生过程中不同阶段的关键基因，为男性不育提供了新的见解 | NA | 揭示人类精子发生过程中的细胞异质性和关键功能基因 | 人类精子发生过程中的睾丸细胞 | 数字病理学 | 男性不育 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 超过33,000个睾丸细胞 |
| 22662 | 2024-08-08 |
Nuclei Isolation from Adult Mouse Kidney for Single-Nucleus RNA-Sequencing
2021-09-20, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/62901
PMID:34605813
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研究论文 | 本文介绍了一种从成年小鼠肾脏中分离细胞核并进行单核RNA测序的方法 | 该方法避免了传统酶解组织分离方法的局限，如需要新鲜组织、引入转录应激反应以及过度代表肾皮质细胞等问题 | NA | 旨在改进肾脏研究中单细胞转录组学的标准化方法 | 成年小鼠肾脏细胞核 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序 | NA | RNA | 从包含皮质、外髓和内髓的中央小鼠肾脏部分分离的细胞核 |
| 22663 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptomes Reveal Characteristics of MicroRNAs in Gene Expression Noise Reduction
2021-06, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2021.05.002
PMID:34606979
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，揭示了微小RNA（miRNA）在减少小鼠细胞mRNA水平基因表达噪声中的作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序数据分析，证明了miRNA在减少基因表达噪声中的作用，并构建了后转录调控的物理模型，通过合成基因电路观察，展示了miRNA目标加速降解与转录激活对抵抗外部波动的贡献 | NA | 探究miRNA在减少基因表达噪声中的作用及其机制 | 小鼠细胞中的miRNA及其目标基因 | 基因表达调控 | NA | 单细胞RNA测序 | 物理模型 | RNA表达谱 | NA |
| 22664 | 2024-08-08 |
Inferring Copy Number from Triple-Negative Breast Cancer Patient Derived Xenograft scRNAseq Data Using scCNA
2021, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1740-3_16
PMID:34590283
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研究论文 | 本文描述了一种从三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型中分离单细胞悬液，并使用scRNAseq技术进行单细胞RNA测序，以获取推断的拷贝数变异轮廓的方法 | 本文采用scCNA技术从单细胞RNA测序数据中推断拷贝数变异，有助于深入理解肿瘤内异质性 | NA | 研究旨在通过单细胞分辨率的数据分析，增强对肿瘤内异质性的理解，并识别遗传脆弱性，开发有效疗法 | 三阴性乳腺癌患者来源的异种移植模型的单细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | scRNAseq | NA | 转录组数据 | 从TNBC患者来源的异种移植模型中分离的单细胞悬液 |
| 22665 | 2024-08-08 |
Immune Cell Landscape of Patients With Diabetic Macular Edema by Single-Cell RNA Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.754933
PMID:34594230
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱 | 首次构建了糖尿病黄斑水肿患者的免疫细胞图谱，并证实了外周血中先天免疫失调的存在 | NA | 确定糖尿病黄斑水肿患者外周免疫细胞的表型和功能 | 糖尿病黄斑水肿患者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞数据 | 57,650个外周血单个核细胞（24,919个健康对照，32,731个糖尿病黄斑水肿患者） |
| 22666 | 2024-08-08 |
Characterization of Organ-Specific Regulatory B Cells Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.711980
PMID:34594327
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq）技术，对小鼠不同器官（脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔）的B细胞进行分析，以更好地定义这些细胞的表型 | 本研究首次鉴定了19个在调节性B细胞（Breg）中显著表达的共同基因，并分析了这些细胞中的转录因子活性，揭示了七个器官特异性的Breg细胞亚群 | 研究主要集中在小鼠模型上，未来需要进一步在人类样本中验证这些发现 | 旨在深入了解调节性B细胞（Breg）在不同器官中的异质性及其功能 | 小鼠不同器官（脾脏、肝脏、肠系膜淋巴结、骨髓和腹腔）的B细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），单细胞B细胞受体测序（scBCR-seq） | NA | 基因表达数据 | 多个小鼠器官的B细胞样本 |
| 22667 | 2024-08-08 |
A Systematic Review of the Tumor-Infiltrating CD8+ T-Cells/PD-L1 Axis in High-Grade Glial Tumors: Toward Personalized Immuno-Oncology
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.734956
PMID:34603316
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综述 | 本文通过系统综述探讨了高级别胶质瘤中肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴的临床意义及其对患者抗癌治疗反应率的影响 | 通过单细胞测序技术分析肿瘤微环境中细胞的抑制性免疫检查点表达模式，为基于数据的免疫检查点抑制剂治疗提供新策略 | 综述主要基于已发表的研究，可能存在样本选择偏倚和研究质量不一的问题 | 旨在阐明肿瘤浸润性CD8+ T细胞/PD-L1轴在高级别胶质瘤中的临床意义及其对患者治疗反应的影响 | 高级别胶质瘤患者及其肿瘤浸润性CD8+ T细胞和PD-L1表达 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22668 | 2024-08-08 |
Multiomics Analysis Reveals the Prognostic Non-tumor Cell Landscape in Glioblastoma Niches
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.741325
PMID:34603399
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研究论文 | 本研究旨在全面描述原发性胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的特征及其预后影响 | 研究首次详细描述了胶质母细胞瘤微环境中非恶性细胞的预后效应，并发现了不同细胞类型在免疫反应中的作用 | NA | 揭示胶质母细胞瘤微环境中非肿瘤细胞的预后效应 | 胶质母细胞瘤微环境中的非肿瘤细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 基因表达谱分析 | NA | 基因表达数据 | 967例胶质母细胞瘤样本 |
| 22669 | 2024-08-08 |
Tumor-Infiltrating PD-1hiCD8+-T-Cell Signature as an Effective Biomarker for Immune Checkpoint Inhibitor Therapy Response Across Multiple Cancers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.695006
PMID:34604032
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研究论文 | 本文构建了一种基于PD-1hiCD8+ T细胞转录组特征的生物标志物，用于预测多种癌症对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | 首次利用RNA测序数据量化PD-1hiCD8+ T细胞，并验证其在多种癌症类型中的应用 | NA | 开发一种有效的生物标志物，用于预测患者对免疫检查点抑制剂治疗的反应 | PD-1hiCD8+ T细胞在肿瘤浸润免疫细胞中的作用 | 数字病理学 | 多种癌症 | RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 581个临床样本和204个鼠模型 |
| 22670 | 2024-08-08 |
The Dynamic Changes of Transcription Factors During the Development Processes of Human Biparental and Uniparental Embryos
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.709498
PMID:34604214
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地研究了早期胚胎发育过程中转录因子的表达谱，揭示了人类双亲和单亲胚胎发育过程中转录因子的动态变化 | 首次系统地研究了单亲胚胎发育过程中转录因子的作用，并发现了多种特定类型的转录因子 | NA | 研究转录因子在人类双亲和单亲胚胎发育过程中的作用 | 转录因子在早期胚胎发育中的表达和功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种类型的胚胎样本 |
| 22671 | 2024-08-08 |
SH2 Domain-Containing Phosphatase 2 Inhibition Attenuates Osteoarthritis by Maintaining Homeostasis of Cartilage Metabolism via the Docking Protein 1/Uridine Phosphorylase 1/Uridine Cascade
2022-03, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.41988
PMID:34569725
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研究论文 | 本研究探讨了SH2域包含的磷酸酶2（SHP-2）在骨关节炎（OA）中的作用及其机制 | 首次揭示了SHP-2在骨关节炎中的作用，并阐明了其通过调节docking protein 1/uridine phosphorylase 1/uridine级联反应维持软骨代谢平衡的机制 | NA | 识别特定参与骨关节炎的蛋白酪氨酸磷酸酶（PTPs）并研究其作用机制 | 人骨关节炎软骨中的107个PTP基因表达，SHP-2酶活性，以及SHP-2抑制剂对骨关节炎进展的影响 | NA | 骨关节炎 | 单细胞测序，tandem mass tag labeling-based global proteomic analysis，稳定同位素标记氨基酸细胞培养标记的酪氨酸磷蛋白组分析 | NA | 基因表达数据，酶活性数据，蛋白质表达数据 | 人骨关节炎软骨样本，IL-1β处理后的原代软骨细胞，以及经过SHP-2抑制剂或celecoxib处理的DMM小鼠和IL-1β刺激的小鼠原代软骨细胞 |
| 22672 | 2024-08-08 |
Integrating single-cell datasets with ambiguous batch information by incorporating molecular network features
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab366
PMID:34553223
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研究论文 | 本文介绍了一种基于网络的集成方法SCORE，用于整合具有模糊批次信息的单细胞RNA测序数据集 | SCORE方法通过纳入经过筛选的分子网络特征来推断细胞状态，并生成统一的流程，以整合单细胞RNA测序数据集 | NA | 开发一种新的方法来整合具有不同组织来源、发育阶段和/或少量重叠的单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 网络模型 | 基因表达数据 | 多个真实单细胞数据集 |
| 22673 | 2024-08-08 |
Consensus-based clustering of single cells by reconstructing cell-to-cell dissimilarity
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab379
PMID:34553226
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研究论文 | 本研究介绍了一种新的单细胞聚类方法SD-h，通过最优合成常用的距离度量来为不同数据集生成适用的距离度量，并基于此进行层次聚类以更准确地进行细胞类型聚类 | 提出了新的单细胞聚类方法SD-h，通过合成多种距离度量来适应不同数据集，提高了聚类准确性 | NA | 开发一种新的单细胞聚类方法，以提高细胞类型识别的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 层次聚类 | 基因表达数据 | 九个常用的scRNA-seq数据集 |
| 22674 | 2024-08-08 |
High-throughput single-cell RNA-seq data imputation and characterization with surrogate-assisted automated deep learning
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab368
PMID:34553763
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研究论文 | 本文提出了一种名为SEDIM的自动深度学习模型，用于单细胞RNA测序数据中的基因表达水平插补，无需手动调整神经网络架构 | SEDIM通过构建离线代理模型加速架构搜索的计算效率，并在插补和聚类性能上显著优于其他基准方法 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的基因稀疏性问题，并自动设计深度神经网络架构以提高插补性能 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达水平 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA |
| 22675 | 2024-08-08 |
scDEA: differential expression analysis in single-cell RNA-sequencing data via ensemble learning
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab402
PMID:34571530
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研究论文 | 本文提出了一种基于集成学习的单细胞RNA测序数据差异表达分析方法scDEA | scDEA通过集成12种不同的差异表达分析方法的P值，生成更稳定和准确的结果 | NA | 开发一种新的差异表达分析方法，以提高单细胞RNA测序数据分析的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成学习 | 基因表达数据 | NA |
| 22676 | 2024-08-08 |
The spatially resolved transcriptional profile of acute T cell-mediated rejection in a kidney allograft
2022-01, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2021.09.004
PMID:34555393
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研究论文 | 研究使用GeoMX数字空间分析平台分析肾移植中急性T细胞介导排斥反应的空间转录组特征 | 通过空间转录组学揭示了T细胞介导排斥反应中不同区域与移植反应相关的先前未被重视的变异性 | NA | 探索肾移植中T细胞介导排斥反应的转录组特征及其临床相关性 | 肾移植中的T细胞介导排斥反应和正常肾组织的转录组特征 | 数字病理学 | 肾病 | GeoMX Digital Space Profiling | NA | 转录组数据 | 包括一个慢性活动性T细胞介导排斥反应的肾移植患者和两个正常肾组织对照的活检样本 |
| 22677 | 2024-08-08 |
High throughput screening of novel AAV capsids identifies variants for transduction of adult NSCs within the subventricular zone
2021-Dec-10, Molecular therapy. Methods & clinical development
DOI:10.1016/j.omtm.2021.07.001
PMID:34553001
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研究论文 | 本研究通过高通量筛选177种脑室内注射的条形码AAV变体，利用RNA测序技术，鉴定出两种合成 capsid，能有效转导活跃和静止的成年神经干细胞 | 本研究首次鉴定出能高效转导成年神经干细胞的AAV变体，特别是AAV1_P5的进一步优化，实现了30%-60%的神经干细胞标记 | NA | 开发新的遗传修饰方法以重新激活成年神经干细胞的内在脑修复能力 | 成年哺乳动物大脑中的神经干细胞 | 基因治疗 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 177种AAV变体 |
| 22678 | 2024-08-08 |
T cell dysfunction in glioblastoma: a barrier and an opportunity for the development of successful immunotherapies
2021-12-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000988
PMID:34569985
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研究论文 | 本文探讨了胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的问题，并分析了其在中枢神经系统免疫治疗中的挑战与机遇。 | 通过单细胞RNA测序等全面无偏倚技术，揭示了胶质母细胞瘤中肿瘤浸润T细胞的转录状态，发现其缺乏典型抗原驱动耗竭的特征，提示需要更好的肿瘤衍生抗原展示。 | 需要进一步研究胶质母细胞瘤肿瘤浸润T细胞功能障碍的自然史，确定这些细胞是否源自中枢神经系统驻留T细胞，以及如何进行治疗性操纵。 | 探索胶质母细胞瘤中T细胞功能障碍的机制，并为开发有效的免疫治疗策略提供新思路。 | 胶质母细胞瘤中的T细胞功能障碍及其在中枢神经系统免疫治疗中的作用。 | 免疫学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22679 | 2024-08-08 |
Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107532
PMID:34549820
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性，揭示了Smad4调控的成年期星形胶质细胞生成 | 首次揭示了成年期间脑星形胶质细胞的生成及其调控机制，并发现了Smad4在体内外星形胶质细胞增殖和神经球形成中的关键作用 | NA | 探索成年小鼠间脑星形胶质细胞的分子多样性及其调控机制 | 成年小鼠间脑星形胶质细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 7个基因表达簇的星形胶质细胞 |
| 22680 | 2024-08-08 |
Developmental programming and lineage branching of early human telencephalon
2021-11-02, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2020107277
PMID:34558085
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研究论文 | 本文通过scRNA-seq和严格验证，揭示了人类端脑神经元在早期发育过程中的发展路线图 | 首次详细描述了人类端脑背侧和腹侧的放射状胶质细胞（RGs）如何通过中间前体细胞（IPCs_div）和早期有丝分裂后神经元（eNBs）分化成不同类型的神经元 | NA | 阐明人类端脑神经元在早期发育过程中的生成机制 | 人类端脑的背侧和腹侧神经元及其亚型 | 神经科学 | NA | scRNA-seq | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确提及具体样本数量 |