单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28174 篇文献，本页显示第 22641 - 22660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22641 | 2024-08-08 |
Inter-tissue convergence of gene expression during ageing suggests age-related loss of tissue and cellular identity
2022-01-31, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.68048
PMID:35098922
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研究论文 | 研究分析了小鼠大脑皮层、肺、肝和肌肉在发育和衰老过程中的基因表达变化，发现衰老过程中基因表达出现逆转现象，导致不同组织间的基因表达趋向一致 | 首次提出并验证了衰老过程中不同组织基因表达趋向一致的现象，即DiCo（divergence followed by convergence） | NA | 探讨衰老过程中基因表达的变化及其对组织和细胞身份的影响 | 小鼠的大脑皮层、肺、肝和肌肉组织 | 基因表达 | NA | 转录组分析 | NA | 转录组数据 | 16只小鼠 |
| 22642 | 2024-08-08 |
A Rapid Adaptable Method for Isolation of Endothelial Cells from Human Adipose Tissue
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_18
PMID:35099741
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research paper | 本文介绍了一种从人类脂肪组织中快速分离内皮细胞的可靠且灵活的方法 | 该方法可以用于各种分析，包括单细胞RNA测序、体外培养和下游应用 | NA | 研究旨在开发一种有效的方法来分离和研究脂肪组织中的内皮细胞 | 人类脂肪组织中的内皮细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22643 | 2024-08-08 |
Isolation of Cardiac Endothelial Cells for Transcriptomic Analysis of the Zebrafish and Mouse Heart
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2059-5_23
PMID:35099746
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研究论文 | 本文描述了一种使用酶解和机械解离以及荧光激活细胞分选（FACS）从斑马鱼和老鼠心脏中分离高质量心脏内皮细胞的协议 | 该方法能够获得高活性和纯度的心脏内皮细胞，适用于下游转录分析应用 | NA | 研究心脏内皮细胞的转录组分析 | 斑马鱼和老鼠的心脏内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及幼体和成体斑马鱼心脏以及健康和缺血成年老鼠心脏的内皮细胞 |
| 22644 | 2024-08-08 |
CD73+ Epithelial Progenitor Cells That Contribute to Homeostasis and Renewal Are Depleted in Eosinophilic Esophagitis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.018
PMID:35108658
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研究论文 | 研究探讨了CD73+CD104+细胞在嗜酸性食管炎（EoE）中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | 首次研究了CD73+CD104+细胞在EoE中的生物学意义，并探讨了其在EoE上皮更新和稳态中的作用 | NA | 探讨CD73+CD104+细胞在EoE中的作用及其对上皮更新和稳态的影响 | CD73+CD104+细胞在EoE中的数量和功能 | 数字病理学 | 嗜酸性食管炎 | 流式细胞术，免疫组织化学，定量逆转录聚合酶链反应，单细胞RNA测序，荧光激活细胞分选 | NA | 细胞 | EoE和非EoE患者的食管活检样本，患者来源和永生化细胞系来源的食管类器官 |
| 22645 | 2024-08-08 |
CD4+ T cells in classical Hodgkin lymphoma express exhaustion associated transcription factors TOX and TOX2: Characterizing CD4+ T cells in Hodgkin lymphoma
2022, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2022.2033433
PMID:35111387
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和T细胞受体可变基因片段使用分析，比较了经典霍奇金淋巴瘤（cHL）中CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞的特征 | 发现CD4+CD26- T细胞虽经历抗原暴露但未克隆扩增，表达与耗竭相关的转录因子TOX和TOX2，以及免疫检查点和趋化因子 | NA | 研究经典霍奇金淋巴瘤中CD4+ T细胞的特征及其与肿瘤细胞生存的关系 | 经典霍奇金淋巴瘤中的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 | 免疫学 | 霍奇金淋巴瘤 | RNA测序 | NA | RNA | 来自cHL淋巴结细胞悬液的CD4+CD26-和CD4+CD26+ T细胞 |
| 22646 | 2024-08-08 |
Notch-Regulated c-Kit-Positive Liver Sinusoidal Endothelial Cells Contribute to Liver Zonation and Regeneration
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2022.01.019
PMID:35114417
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研究论文 | 本研究探讨了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生过程中的作用及其机制 | 首次鉴定并研究了c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的具体作用及其通过Wnt2依赖性方式调节肝细胞再生的机制 | NA | 研究c-kit阳性肝窦内皮细胞在肝再生中的作用及其机制 | c-kit阳性肝窦内皮细胞及其在肝再生中的作用 | NA | 肝病 | 定量逆转录聚合酶链反应, 免疫荧光染色, 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用部分肝切除小鼠模型进行研究 |
| 22647 | 2024-08-08 |
Functional New Transcription Factors (TFs) Associated with Cervical Cancer
2022, Journal of healthcare engineering
DOI:10.1155/2022/8381559
PMID:35126951
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研究论文 | 本研究旨在发现与宫颈癌发生相关的新转录因子（TFs） | 揭示了EMX2作为宫颈癌中的肿瘤抑制因子，并发现PDZRN3可能是EMX2在宫颈癌中的潜在靶点 | NA | 发现与宫颈癌发生相关的新转录因子 | 宫颈癌中的转录因子及其潜在靶点 | NA | 宫颈癌 | RNA-seq, 微阵列, 实时PCR | NA | 基因表达数据 | 10个宫颈癌数据集 |
| 22648 | 2024-08-08 |
Allosteric inhibition reveals SHP2-mediated tumor immunosuppression in colon cancer by single-cell transcriptomics
2022-Jan, Acta pharmaceutica Sinica. B
DOI:10.1016/j.apsb.2021.08.006
PMID:35127377
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术探讨了SHP2在结直肠癌肿瘤微环境中的免疫抑制作用 | 首次揭示了SHP2通过调节STING-TBK1-IRF3介导的I型干扰素信号通路在肿瘤微环境中发挥免疫抑制作用 | 研究仅基于小鼠MC38异种移植模型，可能与人类结直肠癌存在差异 | 探讨SHP2在结直肠癌中的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 | 结直肠癌中的SHP2及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 小鼠MC38异种移植模型中的肿瘤微环境细胞 |
| 22649 | 2024-08-08 |
Prudent application of single-cell RNA sequencing in understanding cellular features and functional phenotypes in cancer studies
2021-Dec-31, Chinese journal of cancer research = Chung-kuo yen cheng yen chiu
|
研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在癌症研究中理解细胞特征和功能表型的应用 | scRNA-seq提供了一种无偏见的方法来揭示不同细胞子集的特征，并有助于揭示复杂系统中的异质性 | 研究者需要注意组织解离、细胞捕获和转录物测量中的潜在缺陷，这些可能影响细胞组成评估和细胞功能注释 | 提高对组织稳态和癌症生物学的理解 | 单细胞RNA测序技术在癌症研究中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22650 | 2024-08-08 |
ZERO-INFLATED QUANTILE RANK-SCORE BASED TEST (ZIQRANK) WITH APPLICATION TO SCRNA-SEQ DIFFERENTIAL GENE EXPRESSION ANALYSIS
2021-Dec, The annals of applied statistics
DOI:10.1214/21-aoas1442
PMID:35116085
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研究论文 | 本文提出了一种基于零膨胀分位数秩得分检验（ZIQRank）的方法，用于单细胞RNA测序数据中的差异基因表达分析 | ZIQRank方法同时处理了单细胞RNA测序数据的多模态和零膨胀特性，通过两部分分位数回归模型进行零计数的逻辑建模和多个预设分位数的秩得分检验，提高了检测差异表达基因的准确性 | NA | 开发一种新的统计方法，用于提高单细胞RNA测序数据中差异基因表达分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的差异基因表达 | 生物信息学 | 脑瘤 | scRNA-seq | 两部分分位数回归模型 | 基因表达数据 | 涉及人类胶质母细胞瘤肿瘤和鼠肠道类器官细胞的数据 |
| 22651 | 2024-08-08 |
Mitochondrial inhibitors circumvent adaptive resistance to venetoclax and cytarabine combination therapy in acute myeloid leukemia
2021-11, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-021-00264-y
PMID:35122057
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研究论文 | 本文定义了一个'MitoScore'特征，识别AML患者体内高线粒体氧化磷酸化，并研究了线粒体抑制剂如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 发现了AML细胞对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性与线粒体氧化磷酸化、电子传递链复合体及TP53通路的变化有关，并提出了使用线粒体抑制剂来延迟复发的新策略 | NA | 研究如何克服AML对venetoclax和cytarabine联合治疗的适应性抗药性 | 急性髓系白血病（AML）细胞及其对特定治疗的抗药性 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22652 | 2024-08-08 |
Gradient of Developmental and Injury Response transcriptional states defines functional vulnerabilities underpinning glioblastoma heterogeneity
2021-02, Nature cancer
IF:23.5Q1
DOI:10.1038/s43018-020-00154-9
PMID:35122077
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析了来自26名患者的69,000多个胶质母细胞瘤干细胞（GSCs），揭示了GSCs在转录水平上的高度异质性，并发现这种异质性可能与正常神经发育和炎症伤口反应的转录状态有关。 | 首次通过单细胞RNA测序和CRISPR-Cas9基因敲除筛选，揭示了胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性与其功能脆弱性之间的关系。 | 研究主要集中在细胞培养和基因敲除筛选上，可能未能完全反映肿瘤在体内的复杂环境。 | 探究胶质母细胞瘤干细胞的转录异质性及其对肿瘤功能的影响。 | 胶质母细胞瘤干细胞（GSCs）及其转录状态。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序，CRISPR-Cas9 | NA | 转录组数据 | 69,000多个GSCs来自26名患者 |
| 22653 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis of Chronic Antibody-Mediated Rejection After Renal Transplantation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.767618
PMID:35111153
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了慢性抗体介导的排斥反应（cABMR）患者外周血单核细胞的转录组图谱 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细揭示了cABMR中T细胞和B细胞的基因表达变化及其与炎症反应的关系 | 研究仅限于外周血单核细胞的分析，未涉及肾脏组织中的细胞 | 探讨慢性抗体介导的排斥反应后肾移植患者免疫细胞的转录组变化及其机制 | 慢性抗体介导的排斥反应患者的外周血单核细胞 | 数字病理学 | 肾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | cABMR患者和对照组的外周血单核细胞样本 |
| 22654 | 2024-08-08 |
High Throughput scRNA-Seq Provides Insights Into Leydig Cell Senescence Induced by Experimental Autoimmune Orchitis: A Prominent Role of Interstitial Fibrosis and Complement Activation
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.771373
PMID:35111154
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研究论文 | 本文通过高通量单细胞RNA测序研究了实验性自身免疫性睾丸炎（EAO）诱导的莱迪细胞衰老，并探讨了间质纤维化和补体激活在其中的作用 | 首次揭示了EAO环境下莱迪细胞衰老的机制，特别是补体激活和间质纤维化在其中的重要作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨慢性炎症环境下莱迪细胞的衰老机制 | 莱迪细胞在实验性自身免疫性睾丸炎中的衰老过程 | 数字病理学 | NA | scRNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型 |
| 22655 | 2024-08-08 |
The ALDH Family Contributes to Immunocyte Infiltration, Proliferation and Epithelial-Mesenchymal Transformation in Glioma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.756606
PMID:35116021
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研究论文 | 本研究探讨了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用，通过大量RNA测序和单细胞RNA测序分析，发现该家族与肿瘤细胞增殖、迁移及免疫环境调控有关。 | 首次深入研究了醛脱氢酶家族在胶质瘤中的具体作用，特别是在肿瘤细胞增殖、迁移和免疫环境调控方面。 | 研究主要基于数据分析，缺乏体内外实验验证。 | 探讨醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对患者预后的影响。 | 醛脱氢酶家族在胶质瘤中的作用及其对肿瘤细胞增殖、迁移的影响。 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 训练集包含癌症基因组图谱数据，验证集包括中国胶质瘤基因组图谱和基因表达综合数据库的数据。 |
| 22656 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Reveals Neutrophil Heterogeneity and Functional Multiplicity in the Early Stage of Severe Burn Patients
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.792122
PMID:35116026
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了健康捐赠者和早期烧伤患者循环中性粒细胞（PMNs）的转录组图谱，揭示了PMNs的异质性和功能多样性 | 首次详细分析了早期严重烧伤阶段PMNs的异质性和功能多样性，并发现了先前未描述的转录因子 | NA | 旨在阐明早期严重烧伤阶段PMNs异质性对病理生理学及相关机制的影响 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞 | 数字病理学 | 烧伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 健康捐赠者和早期烧伤患者的循环中性粒细胞被分为五个亚群 |
| 22657 | 2024-08-08 |
Single Cell RNA Sequencing in Autoimmune Inflammatory Rheumatic Diseases: Current Applications, Challenges and a Step Toward Precision Medicine
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.822804
PMID:35118101
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在自身免疫性炎症性风湿病研究中的当前应用、挑战及其在精准医学发展中的潜在作用 | scRNA-seq技术能够分析单个细胞的整个转录组，揭示复杂的细胞网络，为开发更精准和个性化的治疗方法提供指标 | 自身免疫性炎症性风湿病的复杂性和患者的高度异质性使得完全理解其病理机制变得困难，且现有的治疗选择有限，长期效果不佳甚至有毒性 | 深入研究风湿病和药物抵抗的细胞和分子机制，识别新的治疗靶点，并推动基于分层和知情治疗决策的使用 | 自身免疫性炎症性风湿病 | 数字病理学 | 风湿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22658 | 2024-08-08 |
A Systematic Review on PD-1 Blockade and PD-1 Gene-Editing of CAR-T Cells for Glioma Therapy: From Deciphering to Personalized Medicine
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.788211
PMID:35126356
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综述 | 本文综述了PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，旨在探讨这两种方法的优缺点，并提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 提出了基于单细胞测序的第四代CAR-T细胞，能够覆盖患者来源的新抗原，并抑制相关的抑制性免疫检查点分子，从而改善抗肿瘤免疫反应。 | NA | 探讨PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞在胶质瘤治疗中的应用，提出改善胶质瘤患者预后的新策略。 | 胶质瘤治疗中的PD-1阻断和PD-1基因编辑的CAR-T细胞。 | 免疫疗法 | 胶质瘤 | 单细胞测序 | CAR-T细胞 | 基因编辑 | 动物模型 |
| 22659 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Lung Cancer: Revealing Phenotype Shaping of Stromal Cells in the Microenvironment
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.802080
PMID:35126365
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在肺癌肿瘤微环境中基质细胞研究中的最新进展 | 单细胞RNA测序技术提供了前所未有的基因表达谱分辨率，使得能够在单细胞水平上进行基因表达的定量分析 | NA | 深入理解肿瘤微环境中的基质成分，以促进肺癌的诊断和治疗 | 肺癌肿瘤微环境中的基质细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22660 | 2024-08-08 |
Comprehensive Analysis of Immune-Related Prognosis of TK1 in Hepatocellular Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.786873
PMID:35127491
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研究论文 | 本研究利用TCGA数据库分析了TK1在肝细胞癌中的表达及其对患者生存的影响，并探讨了TK1与免疫细胞浸润的关系及其在肝细胞癌中的预后价值 | 首次揭示了TK1表达与肝细胞癌中免疫细胞浸润的关联，并建立了基于TK1相关免疫基因的预后风险评分模型 | 研究主要基于TCGA数据库，可能存在样本量和临床数据的局限性 | 探讨TK1在肝细胞癌中的免疫相关预后价值及其与免疫细胞浸润的关系 | 肝细胞癌患者及HepG2细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序分析 | COX回归分析 | mRNA和蛋白质 | TCGA数据库中的肝细胞癌患者样本 |