单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22641 - 22660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22641 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of salt-induced hypertensive mouse aortae reveals cellular heterogeneity and state changes
2021-12, Experimental & molecular medicine
DOI:10.1038/s12276-021-00704-w
PMID:34862465
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞异质性和状态变化 | 首次系统描述了高血压进展中血管细胞的组成和反应，并揭示了细胞组成和细胞间通讯在高血压进展中的显著变化 | NA | 研究高血压进展中血管细胞的组成和反应 | 高盐饮食诱导的高血压小鼠主动脉中的细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | C57BL/6J小鼠的主动脉弓样本 |
| 22642 | 2024-08-08 |
Inferring Differential Networks by Integrating Gene Expression Data With Additional Knowledge
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.760155
PMID:34858477
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研究论文 | 本研究提出了一种名为加权联合稀疏惩罚D-trace模型（WJSDM）的框架，通过整合多平台基因表达数据和多种先验生物学知识来推断差异基因网络 | 本研究的创新点在于采用非参数正态图形模型处理含有缺失值的基因表达数据，并提出加权组桥惩罚方法整合多平台基因表达数据和多种现有生物学知识 | 本研究的主要限制在于依赖于高吞吐量基因表达数据的积累，以及单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据的稀疏性和高噪声率 | 研究目的是通过计算方法推断两种不同状态或细胞类型之间的基因网络变化 | 研究对象包括卵巢癌和前列腺癌的基因表达数据，以及循环肿瘤细胞的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 卵巢癌，前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 加权联合稀疏惩罚D-trace模型（WJSDM） | 基因表达数据 | 涉及卵巢癌和前列腺癌的基因表达数据及循环肿瘤细胞的单细胞RNA测序数据 |
| 22643 | 2024-08-08 |
Cancer-specific type-I interferon receptor signaling promotes cancer stemness and effector CD8+ T-cell exhaustion
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1997385
PMID:34858725
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研究论文 | 本文研究了癌症特异性I型干扰素受体信号在头颈部鳞状细胞癌中的作用，发现其促进癌症干细胞性和效应CD8+ T细胞耗竭 | 首次揭示了癌症特异性I型干扰素受体信号在癌症干细胞性和免疫检查点受体配体高表达中的作用 | 研究仅限于头颈部鳞状细胞癌，可能不适用于其他类型的癌症 | 探讨I型干扰素信号在癌症中的双重功能及其对免疫反应的影响 | 头颈部鳞状细胞癌患者及同基因肿瘤模型 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 组织微阵列，单细胞RNA序列数据 | 195名头颈部鳞状细胞癌患者 |
| 22644 | 2024-08-08 |
Topical Application of Temperature-Sensitive Gel Containing Caerin 1.1 and 1.9 Peptides on TC-1 Tumour-Bearing Mice Induced High-Level Immune Response in the Tumour Microenvironment
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.754770
PMID:34858827
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研究论文 | 本研究展示了含有caerin 1.1和1.9肽的温度敏感凝胶局部应用于TC-1肿瘤携带小鼠，显著改善肿瘤微环境并增强免疫反应 | 本研究首次证明了caerin 1.1和1.9肽凝胶能够通过局部应用显著减少肿瘤重量，并增强肿瘤微环境中的免疫激活 | NA | 开发能够增强肿瘤浸润淋巴细胞对肿瘤和慢性病毒感染相关病变的免疫激活的局部药物 | TC-1肿瘤携带小鼠 | NA | 肿瘤 | 单细胞转录组分析, TMT10plex标记蛋白质组定量 | NA | 蛋白质, 转录组 | TC-1肿瘤携带小鼠 |
| 22645 | 2024-08-08 |
The Identification of a Tumor Infiltration CD8+ T-Cell Gene Signature That Can Potentially Improve the Prognosis and Prediction of Immunization Responses in Papillary Renal Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.757641
PMID:34858833
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组数据筛选与肿瘤浸润CD8+ T细胞相关的差异表达基因，构建并验证了一个与肿瘤浸润CD8+ T细胞相关的预后基因签名，用于评估乳头状肾细胞癌（papRCC）的预后和免疫治疗反应。 | 本研究构建了一个新的基因签名，能够评估乳头状肾细胞癌的预后和免疫治疗反应，为该疾病的治疗提供了潜在的治疗靶点。 | NA | 评估肿瘤浸润CD8+ T细胞在乳头状肾细胞癌中的作用，以及其在预后评估和免疫治疗反应中的应用。 | 乳头状肾细胞癌（papRCC）中的肿瘤浸润CD8+ T细胞及其相关的基因表达。 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 621个细胞死亡抑制RNA基因 |
| 22646 | 2024-08-08 |
The Transcriptional Differences of Avian CD4+CD8+ Double-Positive T Cells and CD8+ T Cells From Peripheral Blood of ALV-J Infected Chickens Revealed by Smart-Seq2
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.747094
PMID:34858872
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研究论文 | 本研究使用Smart-Seq2 scRNA-seq技术比较了ALV-J感染鸡的外周血单个核细胞中CD8和CD4CD8双阳性T细胞亚群的转录差异 | 首次比较了鸡外周血单个核细胞中表达CD8受体的T细胞亚群的差异，并揭示了CD8 αα T细胞在应对ALV-J感染中的重要作用 | NA | 研究鸡外周血单个核细胞中不同T细胞亚群在ALV-J感染中的转录差异 | 鸡的CD8 T细胞和CD4CD8双阳性T细胞 | 数字病理学 | 禽类疾病 | Smart-Seq2 scRNA-seq | NA | 转录组数据 | ALV-J感染鸡的外周血单个核细胞 |
| 22647 | 2024-08-08 |
Revisit the Cellular Transmission and Emerging Techniques in Understanding the Mechanisms of Proteinopathies
2021, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2021.781722
PMID:34867177
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研究论文 | 本文重新探讨了Aβ和α-synuclein在细胞间传递机制及其在神经退行性疾病中的作用，并总结了近期从不同角度进行的单细胞转录组测序研究 | 利用单细胞RNA测序技术深入解析了神经系统中的基因表达模式和信号通路 | NA | 探讨Aβ和α-synuclein的细胞间传递机制及其在神经退行性疾病中的作用 | Aβ和α-synuclein的病理聚集和传播机制 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22648 | 2024-08-08 |
Identification of Genetic Predisposition in Noncirrhotic Portal Hypertension Patients With Multiple Renal Cysts by Integrated Analysis of Whole-Genome and Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.775470
PMID:34868264
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研究论文 | 本研究通过综合分析全基因组和单细胞RNA测序数据，探索非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者中的潜在候选变异/基因 | 本研究首次整合全基因组测序和公开的单细胞RNA测序数据，优先筛选与非肝硬化性门脉高压伴多囊肾相关的潜在候选基因 | 研究样本量较小，且依赖于公开的单细胞RNA测序数据 | 探索非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者的潜在遗传影响因素和/或决定因素 | 非肝硬化性门脉高压伴多囊肾患者 | 基因组学 | 非肝硬化性门脉高压 | 全基因组测序（WGS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，单细胞RNA测序数据 | 8,295名肝硬化伴门脉高压患者和267名非肝硬化性门脉高压患者 |
| 22649 | 2024-08-08 |
Vascular Regulation of Hematopoietic Stem Cell Homeostasis, Regeneration, and Aging
2021, Current stem cell reports
IF:2.3Q4
DOI:10.1007/s40778-021-00198-2
PMID:34868826
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综述 | 本文综述了骨髓微环境中血管内皮细胞在调节造血干细胞活性、健康和应激反应中的中心作用 | 近期动态成像研究结合单细胞RNA测序和功能性检测，增进了对支持造血干细胞的细胞类型及其在稳态、再生和衰老期间调控干细胞命运的协同机制的理解 | NA | 旨在理解造血干细胞与骨髓血管微环境之间的空间互作和分子机制，以开发改善血液疾病和促进健康造血的治疗方法 | 造血干细胞及其在骨髓微环境中的调节机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22650 | 2024-08-08 |
Identification of Prognostic Biomarkers Originating From the Tumor Stroma of Betel Quid-Associated Oral Cancer Tissues
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.769665
PMID:34869001
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研究论文 | 本研究通过基因集富集分析和免疫组织化学等方法，揭示了槟榔相关口腔癌组织中肿瘤基质来源的预后生物标志物。 | 首次在槟榔相关口腔癌中识别出肿瘤基质来源的TGFBI和HYAL1作为独立的预后生物标志物。 | 研究样本仅限于台湾地区的槟榔使用者，可能限制了结果的普遍性。 | 识别槟榔相关口腔癌中的预后生物标志物，以改善口腔癌的控制。 | 槟榔相关口腔癌组织中的肿瘤基质细胞及其分子标志物。 | 数字病理学 | 口腔癌 | 基因集富集分析 | Cox比例风险模型 | 转录组数据 | 40例台湾口腔癌组织样本 |
| 22651 | 2024-08-08 |
Deconvolution of Bulk Gene Expression Profiles with Single-Cell Transcriptomics to Develop a Cell Type Composition-Based Prognostic Model for Acute Myeloid Leukemia
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.762260
PMID:34869351
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学数据，利用CIBERSORT算法构建了一个基于细胞类型组成的急性髓系白血病（AML）预后模型，称为CTC评分。 | 首次基于AML患者外周血或骨髓抽吸物的细胞类型组成（CTCs）建立预后模型。 | NA | 开发一种基于细胞类型组成的AML预后模型，以辅助临床制定个性化治疗方案。 | 急性髓系白血病（AML）患者的预后评估。 | 数字病理学 | 白血病 | CIBERSORT算法 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | 两个公共数据集（GSE6891和TCGA-LAML）中的患者数据，以及一个AML单细胞RNA测序数据集（GSE116256）。 |
| 22652 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Defines the Regulation of Spermatogenesis by Sertoli-Cell Androgen Signaling
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.763267
PMID:34869354
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，分析了野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸中的细胞类型和转录变化，揭示了Sertoli细胞中雄激素信号调控精子发生的分子机制 | 本研究首次通过单细胞转录组测序技术，揭示了Sertoli细胞中雄激素受体信号调控精子发生的细胞特异性靶点和相关基因及信号通路 | NA | 探索Sertoli细胞中雄激素受体信号调控精子发生的分子和细胞过程 | 野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸中的细胞类型和转录变化 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组 | 野生型和Sertoli细胞缺乏雄激素受体的小鼠睾丸样本 |
| 22653 | 2024-08-08 |
Integrative Single-Cell RNA-Seq and ATAC-Seq Analysis of Peripheral Mononuclear Cells in Patients With Ankylosing Spondylitis
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.760381
PMID:34880858
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq），探讨了强直性脊柱炎（AS）发病相关的关键基因及其机制 | 发现了与AS进展相关的病原基因NFKB来源于CD8+ T细胞，并揭示了NFKB异常调控FOS、JUN和JUNB的可能机制 | NA | 构建遗传学研究与生物靶向治疗之间的桥梁 | 强直性脊柱炎患者的外周单核细胞 | 数字病理学 | 强直性脊柱炎 | 单细胞转座酶可及染色质测序（scATAC-seq），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列，染色质可及性数据 | 强直性脊柱炎患者和正常对照的外周单核细胞中鉴定出18种细胞类型 |
| 22654 | 2024-08-08 |
Identification of KLF6/PSGs and NPY-Related USF2/CEACAM Transcriptional Regulatory Networks via Spinal Cord Bulk and Single-Cell RNA-Seq Analysis
2021, Disease markers
DOI:10.1155/2021/2826609
PMID:34880956
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研究论文 | 本研究通过脊髓bulk和单细胞RNA-Seq分析，识别了KLF6/PSGs和NPY相关的USF2/CEACAM转录调控网络 | 本研究首次通过单细胞分析识别了USF2/CEACAM1&5和KLF6/PSG3&5转录调控网络 | NA | 进一步理解脊髓发育的转录特征 | 新生小鼠脊髓的V2a中间神经元 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq) | Seurat包 | 单细胞RNA测序数据 | 共筛选了949个细胞 |
| 22655 | 2024-08-08 |
Roseburia intestinalis: A Beneficial Gut Organism From the Discoveries in Genus and Species
2021, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2021.757718
PMID:34881193
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综述 | 本文综述了Roseburia intestinalis这一厌氧、革兰氏阳性、略弯曲的杆状鞭毛细菌在肠道中的作用及其在多种疾病治疗中的潜在价值 | 近期在初级培养技术、培养组学、单细胞测序和代谢组学技术上的进步提高了对Roseburia intestinalis的研究，揭示了其在人类健康和疾病治疗中的益处 | NA | 探讨Roseburia intestinalis在人类疾病治疗中的潜在作用 | Roseburia intestinalis及其在肠道炎症、能量稳态和多种疾病中的作用 | NA | 炎症性肠病, 2型糖尿病, 抗磷脂综合征, 动脉粥样硬化 | 初级培养技术, 培养组学, 单细胞测序, 代谢组学 | NA | NA | NA |
| 22656 | 2024-08-08 |
Unambiguous detection of SARS-CoV-2 subgenomic mRNAs with single cell RNA sequencing
2023-Feb-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.11.22.469642
PMID:34845443
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研究论文 | 本文比较了不同单细胞RNA测序方法在检测和定量SARS-CoV-2亚基因组mRNA（sgmRNA）方面的能力，并提出了一种新的数据处理策略scCoVseq。 | 提出了scCoVseq方法，该方法能够明确地定量分配给sgmRNA或基因组RNA（gRNA）的读数，并发现10X 5'结合扩展的R1测序策略能最大化sgmRNA的检测。 | NA | 研究SARS-CoV-2亚基因组mRNA在单细胞水平上的表达，以支持高分辨率研究冠状病毒RNA合成的动态。 | SARS-CoV-2的亚基因组mRNA（sgmRNA） | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 22657 | 2024-08-08 |
Identification of Vulnerable Interneuron Subtypes in 15q13.3 Microdeletion Syndrome Using Single-Cell Transcriptomics
2022-04-15, Biological psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1016/j.biopsych.2021.09.012
PMID:34838304
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据，识别了15q13.3微缺失综合征中易受影响的中间神经元亚型 | 提出并验证了一种预测CNV基因对大脑发育影响的新策略，并通过分析单细胞转录组数据和在小鼠模型中验证，揭示了Klf13基因在特定发育阶段的表达模式及其对神经元发育的影响 | NA | 研究15q13.3微缺失综合征对大脑发育的影响机制 | 15q13.3微缺失综合征中的中间神经元亚型 | NA | 神经发育障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 包含皮质中间神经元的单细胞转录组数据，以及Df(h15q13.3)/+和Klf13+/-胚胎的小鼠模型 |
| 22658 | 2024-08-08 |
Super-resolved spatial transcriptomics by deep data fusion
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01075-3
PMID:34845373
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研究论文 | 本文介绍了一种结合空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据来推断更高分辨率表达图谱的方法 | 利用深度生成模型，该方法能够表征微米尺度解剖特征的转录组，并能仅从组织学图像预测空间基因表达 | NA | 提高空间转录组学的空间分辨率 | 空间基因表达数据和组织切片的组织学图像数据 | 数字病理学 | NA | 深度生成模型 | 深度生成模型 | 图像数据 | NA |
| 22659 | 2024-08-08 |
Redefining intestinal immunity with single-cell transcriptomics
2022-04, Mucosal immunology
IF:7.9Q1
DOI:10.1038/s41385-021-00470-y
PMID:34848830
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研究论文 | 本文讨论了单细胞转录组学在重塑我们对肠道免疫系统理解方面的作用 | 利用单细胞转录组学技术，深入解析了肠道免疫系统的复杂性，包括早期肠道发育、与邻近微生物群的相互作用、肠道免疫细胞的多样性、肠道内的区域化以及与非免疫细胞的相互作用 | NA | 探讨单细胞转录组学在肠道免疫系统研究中的应用 | 肠道免疫系统及其与微生物群和非免疫细胞的相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 22660 | 2024-08-08 |
Generation and characterization of stable pig pregastrulation epiblast stem cell lines
2022-04, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00592-9
PMID:34848870
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研究论文 | 本文介绍了从猪胚胎E10前原肠胚外胚层（pgEpiSCs）成功建立和维持稳定的多能干细胞系的培养方法 | 首次成功建立了稳定的猪前原肠胚外胚层干细胞系，并通过化学抑制WNT相关信号通路及FGF/ERK、JAK/STAT3和Activin/Nodal途径维持其多能性特征 | NA | 开发用于建立和维持猪多能干细胞系的新型体外培养介质，并探索其在生物学研究和再生医学中的应用潜力 | 猪胚胎E10前原肠胚外胚层细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞转录组分析、Hi-C分析 | NA | 细胞 | 超过240次传代的多能干细胞系 |