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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
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22641 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolism during SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2022-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.01.10.475725
PMID:35043114
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法,比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫反应和代谢差异 | 首次系统比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染的单细胞转录组数据,揭示了两种病毒感染的共同和独特免疫反应及代谢特征 | NA | 理解SARS-CoV-2和HIV-1感染的相似性和差异性,为疾病进展和疫苗及疗法开发提供依据 | SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 94,442个PBMCs样本,来自7名COVID-19患者和9名HIV-1患者 |
22642 | 2024-08-08 |
Expression of Lineage Transcription Factors Identifies Differences in Transition States of Induced Human Oligodendrocyte Differentiation
2022-01-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11020241
PMID:35053357
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研究论文 | 本文通过定量图像分析和单细胞转录组学方法,比较了不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 研究发现,与单独使用SOX10相比,SOX10与OLIG2和NKX6.2的组合能增加iOLs的数量并促进更复杂的形态和更高的髓鞘标记基因表达水平 | NA | 研究不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 人源诱导少突胶质细胞的分化过程 | 细胞生物学 | NA | 定量图像分析、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
22643 | 2024-08-08 |
Towards Tabula Gallus
2022-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020613
PMID:35054796
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研究论文 | Tabula Gallus项目旨在创建鸡体和鸡胚中每种细胞类型的地图 | 该项目将生成单细胞转录组数据的综合目录,并提供研究该物种生物学的工具,类似于其他正在进行的细胞图谱项目 | NA | 研究鸡和其他鸟类的基本科学,并最终增进对人类健康和疾病的理解 | 鸡体和鸡胚中的每种细胞类型 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
22644 | 2024-08-08 |
Combination of ultrasound-based mechanical disruption of tumor with immune checkpoint blockade modifies tumor microenvironment and augments systemic antitumor immunity
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003717
PMID:35039461
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研究论文 | 本文研究了超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤微环境和系统性抗肿瘤免疫的影响。 | 验证了新型高强度聚焦超声(M-HIFU)在增强抗肿瘤免疫中的作用,并探讨了与免疫检查点抑制剂(anti-PD-L1)联合使用的潜力。 | 研究主要在鼠类模型中进行,需要进一步的人体临床试验验证其效果。 | 探索通过超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗来增强系统性抗肿瘤免疫和抑制肿瘤生长的机制。 | 鼠类乳腺癌模型,包括三阴性(E0771)和人ErbB-2(HER2)表达(MM3MG-HER2)肿瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高强度聚焦超声(HIFU) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用C57BL/6或BALB/c小鼠进行实验 |
22645 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Computational Analysis Tools: Application in Cancer Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1896-7_23
PMID:35044670
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术及其在癌症研究中的应用,介绍了最新的scRNA-seq技术和平台,以及相关的计算分析工具 | scRNA-seq技术为研究人员提供了发现新生物学现象和理解组织复杂性的独特机会 | NA | 介绍scRNA-seq技术及其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术和计算分析工具 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
22646 | 2024-08-08 |
GRNUlar: A Deep Learning Framework for Recovering Single-Cell Gene Regulatory Networks
2022-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0437
PMID:35050715
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研究论文 | 提出了一种名为GRNUlar的深度学习框架,用于从单细胞RNA测序数据中恢复基因调控网络 | 开发了一个多任务学习框架来捕捉转录因子与它们调控的基因之间的复杂依赖关系,并设计了一种展开算法技术来捕捉真实世界中基因调控网络的稀疏性 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中监督学习基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA |
22647 | 2024-08-08 |
A spatial and cellular distribution of rabies virus infection in the mouse brain revealed by fMOST and single-cell RNA sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.700
PMID:35051311
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研究论文 | 本研究利用荧光微光学断层成像(fMOST)和单细胞RNA测序(scRNA-seq)技术,揭示了狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 首次通过fMOST和scRNA-seq技术全面绘制了典型神经亲和性病毒在小鼠大脑中的空间和细胞感染图谱 | NA | 探索狂犬病毒在小鼠大脑中的感染分布及其发病机制 | 狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 数字病理学 | 狂犬病 | 荧光微光学断层成像(fMOST),单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 图像,RNA序列 | 小鼠样本 |
22648 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Aneurysmal Aortic Tissue in Patients with Marfan Syndrome Reveals Dysfunctional TGF-β Signaling
2021-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13010095
PMID:35052435
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了马方综合征患者升主动脉瘤组织中的细胞群变化和基因表达 | 首次揭示了马方综合征中升主动脉瘤组织中细胞群的变化,特别是平滑肌细胞的增殖和分化状态的改变,以及TGF-β信号通路的异常 | 样本量较小,仅包括3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 | 探究马方综合征中升主动脉瘤发展的分子和细胞机制 | 马方综合征患者的升主动脉瘤组织和非动脉瘤对照组组织 | 数字病理学 | 马方综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 |
22649 | 2024-08-08 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 本文介绍了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术,用于分析两种酵母物种的转录组 | mDrop-seq技术能够克服微生物细胞壁坚硬和RNA含量低的挑战,实现高通量单细胞RNA测序 | NA | 旨在开发一种能够量化不同酵母物种基因表达变异的高通量单细胞RNA测序技术 | 研究对象包括酵母菌Saccharomyces cerevisiae和Candida albicans | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了74,814个细胞 |
22650 | 2024-08-08 |
Dissecting the Complexity of Early Heart Progenitor Cells
2021-Dec-26, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9010005
PMID:35050215
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综述 | 本文综述了早期心脏发育中细胞异质性的三个关键方面 | 利用单细胞方法提供了前所未有的细胞异质性细节,为解析其功能作用提供了新机会 | 尽管有数十年的研究,我们对原始心脏管形成的谱系分隔的全面复杂性仍知之甚少 | 探讨早期心脏形态发生的关键方面,并讨论单细胞转录组学和表观基因组学等技术如何可能改变我们对心脏发育复杂性的理解 | 早期心脏发育中的心肌和内皮谱系分隔、信号引导的这些前体细胞分化以及原始心脏管中心肌细胞前体的转录异质性 | NA | 先天性心脏缺陷 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | NA | NA |
22651 | 2024-08-08 |
Decode the Stable Cell Communications Based on Neuropeptide-Receptors Network in 36746 Tumor Cells
2021-Dec-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10010014
PMID:35052689
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研究论文 | 本文通过系统性的单细胞转录组数据整合分析,研究了不同恶性肿瘤中神经肽介导的细胞通讯的相似性和变异性 | 首次在单细胞水平上阐明了神经肽及其受体的分子机制,并构建了细胞间的通讯网络 | 研究主要基于已知的神经肽和受体的相互作用,可能存在未知的相互作用未被纳入分析 | 旨在阐明不同癌症类型中神经肽-受体网络介导的稳定细胞通讯模式 | 36746个肿瘤细胞中的神经肽-受体网络 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 72个癌症数据集,涵盖24种癌症类型 |
22652 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Immune Characteristics of Myeloid Cells and Memory T Cells in Recovered COVID-19 Patients With Different Severities
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.781432
PMID:35046942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同严重程度的康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞(PBMCs)的免疫特征 | 首次提供了大规模的康复期COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱 | NA | 探究康复期COVID-19患者的免疫细胞特征 | 康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个样本,包含超过260,000个外周血单个核细胞 |
22653 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Bone Marrow Cells in Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745483
PMID:35046994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞,揭示了B细胞在疾病中的作用及其对造血功能的影响 | 首次大规模单细胞转录组测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞,并鉴定了B细胞与造血细胞相互作用的特定配体-受体对 | NA | 探讨B细胞在再生障碍性贫血中的作用及其对造血功能的影响 | 再生障碍性贫血患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个骨髓细胞,来自再生障碍性贫血患者和健康供体 |
22654 | 2024-08-08 |
A Ductal-Cell-Related Risk Model Integrating Single-Cell and Bulk Sequencing Data Predicts the Prognosis of Patients With Pancreatic Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763636
PMID:35047000
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据,开发了一种与导管细胞相关的风险模型,用于预测胰腺腺癌患者的预后 | 首次通过整合单细胞和批量测序数据,开发了一种新的风险评分模型,用于区分胰腺腺癌患者的高风险和低风险组 | 研究未提及免疫细胞浸润分数在两组间的显著差异 | 旨在通过整合单细胞和批量测序数据,提取导致不同预后的导管细胞特征 | 胰腺导管腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序(scRNA-seq) | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
22655 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk Transcriptome Data Integration Reveals Dysfunctional Cell Types and Aberrantly Expressed Genes in Hypertrophic Scar
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.806740
PMID:35047019
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了肥厚性瘢痕中的功能障碍细胞类型和异常表达基因 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据,详细分析了肥厚性瘢痕中的细胞组成、细胞间通讯和关键转录调控网络的变化 | NA | 研究肥厚性瘢痕的生物学特性,特别是细胞组成和转录调控网络的变化 | 肥厚性瘢痕中的细胞类型、细胞间通讯和转录调控网络 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
22656 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Mesenchymal Stromal Cells: Identification, Classification, and Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.787118
PMID:35047499
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综述 | 本文综述了骨髓间充质干细胞(BMSCs)的鉴定、分类及其分化机制的最新进展 | 通过谱系追踪和单细胞测序技术,揭示了BMSCs的新亚群及其在生理和病理条件下的作用,以及调控BMSCs命运的关键因子和机制 | BMSCs的鉴定和分类仍存在争议,限制了其在临床上的应用 | 探讨BMSCs的鉴定、分类及其在临床应用中的重要意义 | 骨髓间充质干细胞(BMSCs)及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
22657 | 2024-08-08 |
Calcium-Prolactin Secretion Coupling in Rat Pituitary Lactotrophs Is Controlled by PI4-Kinase Alpha
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.790441
PMID:35058881
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研究论文 | 本文研究了磷脂酰肌醇激酶(PIKs)在钙驱动的垂体催乳素(PRL)释放中的作用,特别是在垂体乳头细胞中的作用 | 揭示了PI4KA在钙分泌偶联中的关键作用,这是通过电压门控和PI(4, 5)P2依赖的钙信号传导途径实现的 | NA | 分析磷脂酰肌醇激酶在钙驱动的催乳素释放中的作用 | 垂体乳头细胞中的催乳素释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR分析、放射免疫测定、ELISA、Fura 2成像 | NA | RNA、激素、钙信号 | 单细胞水平的研究 |
22658 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Profiling Identifies Pathways Associated With CD8+ T-Cell Activation in Severe Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.790990
PMID:35058969
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析,结合转录组学分析,探讨了严重再生障碍性贫血(SAA)患者中CD8+ T细胞激活的关键通路 | 本研究首次揭示了SAA患者中CD8+ T细胞激活的新通路,并提供了潜在的治疗靶点 | NA | 揭示严重再生障碍性贫血患者中CD8+ T细胞激活的调控机制 | 严重再生障碍性贫血(SAA)患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA | SAA患者和健康捐赠者的血浆、骨髓上清液和CD8 T细胞 |
22659 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Phosphorylation-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.734287
PMID:35059393
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序数据和TCGA RNA-seq数据,分析了肝细胞癌患者中的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因的表达情况 | 发现了九种在肝细胞癌干细胞中高表达的蛋白激酶和磷酸化相关基因,这些基因与肝细胞癌患者的预后不良相关,并揭示了它们在细胞周期相关通路中的作用 | NA | 探讨蛋白激酶信号传导的潜在机制,以提高肝细胞癌治疗的效果 | 肝细胞癌患者的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 肝细胞癌患者 |
22660 | 2024-08-08 |
Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.002
PMID:35032503
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研究论文 | 本研究通过使用利多卡因的硬膜外注射治疗银屑病患者,发现利多卡因能显著降低患者的临床评分,并在咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型中显示出治疗效果。 | 首次揭示了利多卡因通过阻断病理性CGRP信号传导介导的感觉神经-树突状细胞通信来改善银屑病。 | 本研究为初步研究,样本量较小,需要进一步的大规模临床试验验证。 | 探索利多卡因对银屑病的治疗效果及其作用机制。 | 银屑病患者及咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型。 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本量未明确提及,大鼠模型使用咪喹莫特诱导的银屑病大鼠。 |