单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22621 - 22640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22621 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq unravels alterations of the human spermatogonial stem cell compartment in patients with impaired spermatogenesis
2021-09-21, Cell reports. Medicine
DOI:10.1016/j.xcrm.2021.100395
PMID:34622232
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了在精子发生受损的患者中，人类精原干细胞隔室的改变 | 发现了精原干细胞隔室中的主要改变，包括最未分化精原细胞数量的增加和转录因子表达的改变 | NA | 探索正常和受损精子发生中人类生殖细胞功能的调控机制 | 人类精原干细胞隔室在精子发生受损患者中的改变 | 数字病理学 | 男性不育 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 超过30,000个细胞 |
| 22622 | 2024-08-08 |
Smooth muscle cells in atherosclerosis: clones but not carbon copies
2021, JVS-vascular science
DOI:10.1016/j.jvssci.2021.02.002
PMID:34617064
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综述 | 本文综述了血管平滑肌细胞（SMCs）在动脉粥样硬化中的作用及其表型多样性和命运调控机制 | 通过命运图谱和单细胞转录组学研究，揭示了SMCs在动脉粥样硬化病变中的选择性扩张和投资，以及其表型和功能的深刻多样性变化 | 仍需探讨SMCs寡克隆扩张的调控机制，单细胞转录组学在确定SMCs功能和贡献中的可靠性，以及SMCs克隆性和表型可塑性对治疗策略的影响 | 总结近期在SMCs投资和表型多样性及分子机制方面的进展，并讨论相关未解问题 | 血管平滑肌细胞在动脉粥样硬化中的作用和机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 22623 | 2024-08-08 |
Differential expression profile of gluten-specific T cells identified by single-cell RNA-seq
2021, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0258029
PMID:34618841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了未治疗乳糜泻患者血液中通过四聚体染色法分离的麸质特异性T细胞的表达谱 | 首次使用单细胞RNA测序研究四聚体染色法分离的T细胞，揭示了麸质特异性T细胞独特的转录组特征 | NA | 探究麸质特异性T细胞在乳糜泻发病机制中的作用 | 未治疗乳糜泻患者血液中的麸质特异性CD4+ T细胞 | NA | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22624 | 2024-08-08 |
Integration of scRNA-Seq and Bulk RNA-Seq to Analyse the Heterogeneity of Ovarian Cancer Immune Cells and Establish a Molecular Risk Model
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.711020
PMID:34621670
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，分析了卵巢癌免疫细胞的异质性，并建立了一个分子风险模型。 | 利用scRNA-seq和批量RNA-seq数据整合分析，首次建立了基于卵巢癌免疫细胞异质性的双基因风险模型。 | 研究主要基于公共数据库中的数据，未提及临床样本的验证。 | 旨在通过分析卵巢癌免疫细胞的异质性，建立一个准确的预后风险评估模型。 | 卵巢癌免疫细胞及其分子特征。 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 整合了两个scRNA-seq数据集（GSE154600和GES158937），共20个细胞集群。 |
| 22625 | 2024-08-08 |
Case Report: Multi-Omics Analysis and CAR-T Treatment of a Chronic Myeloid Leukemia Blast Crisis Case 5 Years After the Discontinuation of TKI
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.739871
PMID:34621680
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病例报告 | 报道了一例在酪氨酸激酶抑制剂停用5年后突然发生慢性髓性白血病淋巴母细胞危象的病例，并通过多组学分析和CAR-T细胞治疗进行了研究 | 首次报道了在长期无治疗缓解后突然发生淋巴母细胞危象的慢性髓性白血病病例，并发现除了BCR-ABL1外的其他基因异常可能参与疾病进展 | 病例报告仅基于单一病例，可能缺乏广泛的代表性 | 探讨慢性髓性白血病在酪氨酸激酶抑制剂停用后突然发生淋巴母细胞危象的分子特征及治疗策略 | 慢性髓性白血病病例及其分子特征和治疗反应 | NA | 慢性髓性白血病 | DNA测序、RNA测序、单细胞转录组测序 | NA | 基因组数据、转录组数据 | 单一病例 |
| 22626 | 2024-08-08 |
Fluorescent Multiplex Immunohistochemistry Coupled With Other State-Of-The-Art Techniques to Systematically Characterize the Tumor Immune Microenvironment
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.673042
PMID:34621785
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研究论文 | 本文综述了利用荧光多重免疫组织化学与其他先进技术系统地表征肿瘤免疫微环境的方法 | 介绍了空间转录组学分析和多重免疫组织化学面板的开发，以识别肿瘤微环境中的特定细胞类型 | 文章未明确提及具体的技术限制 | 探讨肿瘤免疫微环境的研究方法及其在临床应用中的潜力 | 肿瘤免疫微环境中的免疫细胞及其在肿瘤进展和治疗反应中的作用 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 荧光多重免疫组织化学, 空间转录组学 | NA | 组织切片 | HER2+ 乳腺癌样本, 管腔B型乳腺癌肿瘤样本 |
| 22627 | 2024-08-08 |
NMDARs Drive the Expression of Neuropsychiatric Disorder Risk Genes Within GABAergic Interneuron Subtypes in the Juvenile Brain
2021, Frontiers in molecular neuroscience
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fnmol.2021.712609
PMID:34630033
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术，探讨了NMDA型谷氨酸受体亚基基因在MGE来源的特定类型中间神经元中的转录调控作用及其对神经发育障碍的影响 | 首次揭示了NMDAR在特定类型中间神经元中的转录调控作用，并关联到神经精神障碍的风险基因表达 | 对分子机制的调控细节理解尚不充分 | 探究NMDAR信号在中间神经元亚型中的系统性作用，寻找可能的MGE特异性遗传靶点 | MGE来源的PV+、SST+和NGFC型皮层及海马中间神经元 | 神经科学 | 神经精神障碍 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 22628 | 2024-08-08 |
Connexin 43-Mediated Gap Junction Communication Regulates Ameloblast Differentiation via ERK1/2 Phosphorylation
2021, Frontiers in physiology
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fphys.2021.748574
PMID:34630166
|
研究论文 | 本文研究了连接蛋白43（Cx43）通过间隙连接通信调节成釉细胞分化的机制，特别是通过ERK1/2磷酸化途径。 | 本文首次揭示了Cx43通过间隙连接活动调节TGF-β1介导的ERK信号传导和牙釉质形成的作用，并探讨了Cx43作为钙通道在慢钙内流和ERK1/2磷酸化中的功能。 | NA | 阐明Cx43在牙釉质形成中的作用及其分子机制。 | Cx43在牙齿发育中的表达和功能，以及其在oculodentodigital dysplasia（ODDD）病理性机制中的作用。 | NA | 口腔疾病 | 单细胞RNA测序分析，免疫染色 | NA | RNA序列，蛋白质表达 | 包括Cx43突变的小鼠模型和不同细胞密度的细胞培养实验。 |
| 22629 | 2024-08-08 |
An NMF-based approach to discover overlooked differentially expressed gene regions from single-cell RNA-seq data
2020-Mar, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqz020
PMID:34632380
|
研究论文 | 本文提出了一种基于非负矩阵分解的方法，用于从单细胞RNA测序数据中发现被忽视的差异表达基因区域 | 该方法通过非负矩阵分解技术，量化差异表达水平，并与基于注释的方法进行比较，以发现先前未注释的差异表达转录本 | NA | 旨在发现单细胞RNA测序数据中被忽视的差异表达基因区域，以更好地理解细胞状态的调控机制 | 人类神经干细胞、小鼠胚胎干细胞和原始内胚层细胞、人类胚胎植入前细胞 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 包括人类神经干细胞、小鼠胚胎干细胞和原始内胚层细胞、人类胚胎植入前细胞的多个数据集 |
| 22630 | 2024-08-08 |
Jointly Embedding Multiple Single-Cell Omics Measurements
2019-Sep-03, Algorithms in bioinformatics : ... International Workshop, WABI ..., proceedings. WABI (Workshop)
DOI:10.4230/LIPIcs.WABI.2019.10
PMID:34632462
|
研究论文 | 本文提出了一种无监督流形对齐算法MMD-MA，用于整合来自同一细胞群体的不同测量数据 | MMD-MA算法通过优化目标函数，将来自多个领域的单细胞数据点对齐到学习到的潜在空间中，无需任何跨数据模态的对应信息 | NA | 开发一种算法，能够整合多种单细胞测序技术数据 | 单细胞基因表达、DNA可及性、染色质组织、甲基化和成像数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | MMD-MA算法 | 基因表达数据、甲基化数据 | 涉及单细胞基因表达和甲基化数据的实际数据集 |
| 22631 | 2024-08-08 |
Lineage tracing and single-cell analysis reveal proliferative Prom1+ tumour-propagating cells and their dynamic cellular transition during liver cancer progression
2022-08, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324321
PMID:34588223
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研究论文 | 本研究通过体内谱系追踪和单细胞RNA测序揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化 | 结合体内谱系追踪和单细胞RNA测序技术，首次揭示了Prom1+肝细胞癌细胞的异质性和动态变化，以及其在肝细胞癌进展中的机制作用 | NA | 研究肝细胞癌中Prom1+细胞的异质性和特性 | 肝细胞癌中的Prom1+细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Prom1C-L/+; Rosa26tdTomato/+和Prom1C-L/+; Rosa26DTA/+小鼠模型进行研究 |
| 22632 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of prostaglandin E2-induced human decidual cell in vitro differentiation: a minimal ancestral deciduogenic signal†
2022-01-13, Biology of reproduction
IF:3.1Q2
DOI:10.1093/biolre/ioab183
PMID:34591094
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研究论文 | 研究探讨了前列腺素E2（PGE2）在体外诱导人类基蜕膜细胞分化中的作用 | 首次通过单细胞转录组学分析PGE2介导的蜕膜化过程，并提出PGE2作为体外蜕膜化的替代方法 | NA | 验证PGE2和孕激素能否激活蜕膜细胞的核心基因调控网络 | 人类子宫内膜成纤维细胞的蜕膜化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22633 | 2024-08-08 |
Regeneration Roadmap: database resources for regenerative biology
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab870
PMID:34591960
|
research paper | 本文构建了一个名为Regeneration Roadmap的数据库，用于系统地收集和标准化再生生物学研究中产生的大量数据 | 首次开发了一个开放且全面的数据库，收集并标准化了再生研究中的大量数据，如高通量测序数据 | NA | 促进再生研究，为延迟衰老提供潜在策略 | 再生相关的基因、批量和单细胞转录组学、表观基因组学和药物基因组学数据 | NA | NA | 高通量测序 | NA | 基因、转录组学、表观基因组学和药物基因组学数据 | 2.38 million data entries across 11 species and 36 tissues |
| 22634 | 2024-08-08 |
Crafting a blueprint for single-cell RNA sequencing
2022-01, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2021.08.016
PMID:34580023
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研究论文 | 本文讨论了基于液滴的单细胞RNA测序（scRNA-Seq）技术在实验设计中的关键考虑因素和实用建议 | 提供了针对scRNA-Seq实验设计的实用技巧，以确保最佳结果 | 未明确提及 | 最大化scRNA-Seq技术的潜力 | 单细胞RNA测序技术的关键考虑因素 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA序列 | 未明确提及 |
| 22635 | 2024-08-08 |
The transcriptomic revolution and radiation biology
2022, International journal of radiation biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1080/09553002.2021.1987562
PMID:34586968
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review | 本文简要回顾了功能基因组学的起源和演变，重点介绍了实验技术、数据分析和可视化方法，并强调了功能基因组学在辐射生物学中的应用 | 文章探讨了非编码RNA、基因组的替代阅读和单细胞转录组学等创新领域，这些领域可能有助于塑造未来辐射生物学和肿瘤学的研究 | NA | 回顾功能基因组学的发展，并探讨其在辐射生物学和肿瘤学中的应用 | 功能基因组学技术及其在辐射生物学中的应用 | NA | NA | 功能基因组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22636 | 2024-08-08 |
IL13 Acts Directly on Gastric Epithelial Cells to Promote Metaplasia Development During Chronic Gastritis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2021.09.012
PMID:34587523
|
研究论文 | 本研究探讨了白细胞介素13（IL13）在慢性胃炎中促进胃上皮细胞化生的机制 | 首次鉴定了六种独特的IL13产生免疫细胞亚群，并揭示了IL13直接作用于胃上皮细胞诱导化生表型的机制 | NA | 旨在识别产生IL13的免疫细胞，确定胃上皮细胞对IL13的反应，并确立IL13在化生发展中的作用 | 慢性胃炎中的免疫细胞和细胞因子如何调节化生细胞变化的机制 | NA | 胃癌 | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用TxA23、TxA23×Il4ra-/-和TxA23×Il13-Yfp小鼠模型，以及人胃类器官进行实验 |
| 22637 | 2024-08-08 |
High-throughput single-cell RNA sequencing
2022-01, Trends in plant science
IF:17.3Q1
DOI:10.1016/j.tplants.2021.09.003
PMID:34598882
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22638 | 2024-08-08 |
MLG: multilayer graph clustering for multi-condition scRNA-seq data
2021-12-16, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab823
PMID:34581807
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研究论文 | 本文介绍了一种多层图聚类方法（MLG），用于整合多条件单细胞RNA测序数据的多维降维 | MLG方法通过生成多层共享最近邻细胞图，提高了信噪比，并在大规模基准测试实验中表现出优于当前最佳实践的聚类准确性 | NA | 开发一种新的方法来整合多条件单细胞RNA测序数据的多维降维 | 多条件单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | 多层图聚类（MLG） | 单细胞转录组数据 | 多种数据集 |
| 22639 | 2024-08-08 |
Neuropeptide repertoire and 3D anatomy of the ctenophore nervous system
2021-12-06, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2021.09.005
PMID:34587474
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研究论文 | 本文研究了栉水母神经系统的神经肽组和三维结构 | 首次通过机器学习工具NeuroPID预测了129个新的假定神经肽前体，并验证了其中16个在特定神经结构中的定位，揭示了栉水母神经细胞类型的分子身份 | NA | 揭示栉水母神经系统的分子机制和结构特征 | 栉水母Mnemiopsis leidyi的神经肽组和神经系统 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 机器学习模型 | 转录组数据 | NA |
| 22640 | 2024-08-08 |
Cancer stem cells in gliomas: evolving concepts and therapeutic implications
2021-12-01, Current opinion in neurology
IF:4.1Q2
DOI:10.1097/WCO.0000000000000994
PMID:34581301
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综述 | 本文综述了癌症干细胞（CSCs）在胶质瘤中的作用及其治疗意义 | 近期研究发现CSCs具有更深层次的复杂性，包括发育起源、可塑性、细胞状态及其与微环境的相互作用 | CSCs的治疗靶向尚未完全实现 | 探讨CSCs的复杂本质及其在恶性脑肿瘤发病机制和治疗抵抗中的作用 | 癌症干细胞（CSCs）及其在胶质瘤中的作用 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 使用小鼠和患者来源的模型进行研究 |