单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22621 - 22640 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22621 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing demonstrates complex resistance landscape in CLL and MCL treated with BTK and BCL2 inhibitors
2022-01-25, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2021006211
PMID:34861696
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研究论文 | 本研究通过单细胞DNA测序分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者在接受Bruton酪氨酸激酶（BTK）抑制剂和B细胞淋巴瘤2（BCL2）抑制剂治疗后产生的抗药性基因组景观 | 首次报道了BCL2抗药性突变在套细胞淋巴瘤（MCL）患者中的出现，并揭示了CLL和MCL在靶向治疗下的复杂克隆抗药性机制 | 研究样本仅限于8名患者，可能不足以全面代表所有CLL和MCL患者的抗药性情况 | 探究CLL和MCL患者在接受BTK和BCL2抑制剂治疗后的基因组抗药性机制 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）和套细胞淋巴瘤（MCL）患者 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞DNA测序 | NA | DNA | 8名患者 |
| 22622 | 2024-08-08 |
Matrix factorization for biomedical link prediction and scRNA-seq data imputation: an empirical survey
2022-01-17, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab479
PMID:34864871
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综述 | 本文综述了矩阵分解方法在生物医学链接预测和单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据插补中的应用 | 本文系统地比较了15个真实数据集上的代表性矩阵分解方法，并提供了选择不同生物医学矩阵完成任务的矩阵分解方法的一般指南 | NA | 评估矩阵分解方法在不同场景下的性能，并为生物医学链接预测和scRNA-seq数据插补提供改进方向 | 生物医学链接预测和单细胞RNA测序数据插补 | 生物信息学 | NA | 矩阵分解 | 矩阵分解方法 | 生物医学数据，单细胞RNA测序数据 | 15个真实数据集 |
| 22623 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of mouse left ventricle reveals cellular diversity and intercommunication
2022-01-01, Physiological genomics
IF:2.5Q2
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了小鼠左心室的细胞景观，揭示了细胞多样性和细胞间通信网络 | 首次详细描述了小鼠左心室的单细胞转录组特征，并揭示了细胞亚型及其潜在功能 | NA | 探索小鼠左心室的细胞多样性和细胞间通信，寻找心血管疾病的治疗靶点 | 小鼠左心室的细胞景观 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | t-分布随机邻域嵌入 (tSNE) | 转录组数据 | 小鼠左心室的细胞 |
| 22624 | 2024-08-08 |
Single-Cell Sequencing for Everybody
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1944-5_15
PMID:34870822
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研究论文 | 本文描述了Smart-seq2协议，用于单细胞全长mRNA测序，适用于多种细胞类型，且成本相对较低 | 介绍了Smart-seq2协议，该协议易于优化并适用于标准分子生物学实验室 | NA | 帮助新手研究人员选择最佳的单细胞测序协议 | 单细胞全长mRNA测序协议 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | mRNA序列 | 多种细胞类型 |
| 22625 | 2024-08-08 |
Enhanced single-cell RNA-seq workflow reveals coronary artery disease cellular cross-talk and candidate drug targets
2022-01, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
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研究论文 | 本文开发了一种增强的单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工作流程，用于揭示冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 本文设计了一个用户友好的、可重复的工作流程，并开发了一个交互式网络应用程序PlaqView，以促进对心血管单细胞数据集的进一步探索和分析 | NA | 开发和应用scRNA-seq分析工作流程，以研究动脉粥样硬化斑块微环境并发现潜在的治疗方法 | 冠状动脉疾病中的细胞间对话和候选药物靶点 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq | NA | 单细胞数据 | 使用了Wirka等人之前发表的人类冠状单细胞数据集 |
| 22626 | 2024-08-08 |
Serglycin Is Involved in Adipose Tissue Inflammation in Obesity
2022-01-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100231
PMID:34872979
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研究论文 | 本研究探讨了serglycin在饮食诱导的肥胖相关脂肪组织炎症中的作用 | 首次揭示了serglycin在调节肥胖诱导的脂肪炎症中的作用 | NA | 研究serglycin表达对饮食诱导的脂肪组织炎症的影响 | serglycin在肥胖条件下对脂肪组织炎症的影响 | NA | 肥胖 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用C57BL/6J遗传背景的小鼠进行8周高脂高蔗糖饮食实验 |
| 22627 | 2024-08-08 |
Robotic high-throughput biomanufacturing and functional differentiation of human pluripotent stem cells
2021-12-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.11.004
PMID:34861164
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研究论文 | 本文介绍了一种机器人平台，用于高效生产人类诱导多能干细胞（hiPSCs）并实现其功能性分化 | 开发了一种全自动的机器人平台，用于在化学定义条件下进行hiPSC的培养和分化，实现了高吞吐量和标准化生产 | NA | 建立一个集成平台，用于高效细胞制造，以支持疾病模型、药物筛选和细胞治疗 | 人类诱导多能干细胞（hiPSCs）及其功能性分化 | 生物技术 | NA | 单细胞转录组学、质谱流式细胞术、代谢分析、电生理学 | NA | 细胞 | 最多90种不同患者和疾病特异性细胞系 |
| 22628 | 2024-08-08 |
Mouse and human share conserved transcriptional programs for interneuron development
2021-Dec-10, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj6641
PMID:34882453
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research paper | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了人类胎儿脑中纹状体和皮质γ-氨基丁酸能神经元的起源结构——神经节隆起的细胞多样性 | 发现人类和啮齿类动物在中间神经元发育过程中共享保守的转录程序 | NA | 探究遗传变异如何通过影响特定细胞类型的发育而导致神经发育障碍 | 人类和啮齿类动物的中间神经元发育 | digital pathology | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22629 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies a key role for Hhip in murine coronal suture development
2021-12-08, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27402-5
PMID:34880220
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析胚胎期野生型小鼠冠状缝合线，定义其细胞群体结构，并探讨Hhip在冠状缝合线发育中的关键作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了小鼠冠状缝合线的细胞群体结构，并揭示了Hhip在调控缝合线发育中的重要作用 | NA | 研究Hhip在小鼠冠状缝合线发育中的作用 | 小鼠冠状缝合线的细胞群体结构及Hhip的表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 胚胎期E16.5和E18.5的野生型小鼠冠状缝合线样本 |
| 22630 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing reveals the dynamic process and novel markers in porcine spermatogenesis
2021-Dec-07, Journal of animal science and biotechnology
IF:6.3Q1
DOI:10.1186/s40104-021-00638-3
PMID:34872612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了150天龄猪睾丸中约16,966个细胞的转录组，揭示了猪精子发生过程中的动态变化和新标记物。 | 首次通过单细胞RNA测序分析了猪睾丸中雄性生殖细胞和体细胞的转录组，并发现了四个精子细胞亚群及两个新的细胞表面标记物。 | NA | 研究猪精子发生过程中的转录组动态变化和新标记物。 | 猪睾丸中的生殖细胞和体细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 约16,966个睾丸细胞 |
| 22631 | 2024-08-08 |
Representation learning of RNA velocity reveals robust cell transitions
2021-12-07, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2105859118
PMID:34873054
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Velocity Autoencoder（VeloAE）的表示学习方法，用于学习RNA速度的低维表示，从而稳健地估计细胞过渡 | 提出了一种新的表示学习方法VeloAE，用于处理高维RNA速度数据中的不稳定和不准确问题 | NA | 旨在提高RNA速度技术在量化细胞过渡和揭示异质细胞群中瞬态细胞动力学的准确性和稳定性 | RNA速度数据和细胞过渡 | 生物信息学 | NA | RNA速度 | Autoencoder | 转录组数据 | 多个实验数据集 |
| 22632 | 2024-08-08 |
An efficient scRNA-seq dropout imputation method using graph attention network
2021-Dec-07, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-021-04493-x
PMID:34876032
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研究论文 | 本文提出了一种基于图注意力网络的自动编码器结构网络GNNImpute，用于单细胞RNA测序数据中的dropout事件插补 | GNNImpute利用图注意力卷积聚合多层次相似细胞信息，并在非欧几里得空间的scRNA-seq数据上进行卷积操作，能准确有效地插补dropout并减少dropout噪声 | NA | 开发一种有效的单细胞RNA测序数据dropout插补方法 | 单细胞RNA测序数据中的dropout事件 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | 图注意力网络 | 基因表达数据 | 分析了四个真实数据集 |
| 22633 | 2024-08-08 |
Delineation of colorectal cancer ligand-receptor interactions and their roles in the tumor microenvironment and prognosis
2021-12-07, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03162-0
PMID:34876143
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研究论文 | 本研究通过分析结直肠癌中单细胞RNA测序数据，揭示了配体-受体相互作用的模式及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 本研究通过深入分析现有的配体-受体对，为结直肠癌亚型分类提供了新思路，为结直肠癌患者提供了一种新的风险筛查工具，并发现了潜在的配体-受体对目标和治疗途径 | NA | 研究配体-受体相互作用在结直肠癌中的模式及其对肿瘤微环境和临床价值的影响 | 结直肠癌中的配体-受体相互作用及其在肿瘤微环境和预后中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 55,539个单细胞RNA测序样本来自29名结直肠癌患者和1411名结直肠癌患者的三个批量RNA-seq数据集 |
| 22634 | 2024-08-08 |
Traditional chinese medicine syndromes classification associates with tumor cell and microenvironment heterogeneity in colorectal cancer: a single cell RNA sequencing analysis
2021-Dec-07, Chinese medicine
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s13020-021-00547-7
PMID:34876190
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析结直肠癌中肿瘤细胞和微环境的异质性与中医证候分类的相关性 | 首次探讨了结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的关系，并揭示了不同证候分类下的肿瘤细胞特征基因和基因共表达网络 | 研究样本量较小，仅涉及11个原发性结直肠癌肿瘤，可能影响结果的普遍性 | 探讨结直肠癌中肿瘤异质性与中医证候分类的相关性和意义 | 结直肠癌中的肿瘤细胞和微环境异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 11个原发性结直肠癌肿瘤，共662个细胞 |
| 22635 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomic identified HIF1A as a target for attenuating acute rejection after heart transplantation
2021-12-06, Basic research in cardiology
IF:7.5Q1
DOI:10.1007/s00395-021-00904-5
PMID:34870762
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，探索了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞的代谢变化，并发现HIF1A作为潜在的治疗靶点 | 首次揭示了心脏移植后急性排斥反应中免疫细胞代谢的变化，并确定了HIF1A作为调节免疫代谢的新治疗靶点 | 研究主要基于小鼠模型，需要在人体中进一步验证HIF1A抑制剂的效果 | 探索心脏移植后急性排斥反应的新治疗靶点 | 心脏移植后的急性排斥反应及免疫细胞代谢 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 共分析了46,040个细胞，包括20种免疫细胞亚型 |
| 22636 | 2024-08-08 |
Single cell sequencing analysis identifies genetics-modulated ORMDL3+ cholangiocytes having higher metabolic effects on primary biliary cholangitis
2021-Dec-06, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-021-01154-2
PMID:34872583
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研究论文 | 本研究通过构建计算框架整合GWAS和scRNA-seq数据，揭示了遗传因素调控的胆管细胞亚群在原发性胆管炎中的作用 | 首次将遗传信息与单细胞测序数据整合，解析遗传因素对原发性胆管炎风险的影响 | NA | 研究遗传因素对原发性胆管炎中肝脏细胞及其免疫微环境的影响 | 原发性胆管炎中的胆管细胞 | 数字病理学 | 原发性胆管炎 | scRNA-seq | NA | 基因组数据 | NA |
| 22637 | 2024-08-08 |
Azvudine is a thymus-homing anti-SARS-CoV-2 drug effective in treating COVID-19 patients
2021-12-06, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00835-6
PMID:34873151
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研究论文 | 本文研究了阿兹夫定（FNC）作为一种胸腺归巢抗SARS-CoV-2药物，对COVID-19患者的治疗效果 | 发现FNC不仅抑制HIV-1 RNA依赖的RNA聚合酶，还能有效抑制SARS-CoV-2和HCoV-OC43冠状病毒，并具有胸腺归巢特性 | 临床试验样本量较小，且为单臂试验，需要进一步的大规模双盲随机对照试验来验证其疗效和安全性 | 评估阿兹夫定作为COVID-19治疗药物的有效性和安全性 | COVID-19患者和SARS-CoV-2感染的猕猴 | NA | COVID-19 | NA | NA | NA | 临床试验涉及31名COVID-19患者 |
| 22638 | 2024-08-08 |
Gene biomarker prediction in glioma by integrating scRNA-seq data and gene regulatory network
2021-12-04, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-01115-6
PMID:34863158
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和基因调控网络，探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 提出了一种算法框架，通过整合单细胞基因表达谱和基因调控关系来探索胶质瘤的分子机制 | NA | 探索胶质瘤的分子机制并预测基因生物标志物 | 胶质瘤的分子机制和基因生物标志物 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个胶质瘤样本中的恶性细胞 |
| 22639 | 2024-08-08 |
Ground tissue circuitry regulates organ complexity in maize and Setaria
2021-Dec-03, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj2327
PMID:34855479
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了玉米根部的细胞分辨率图谱，揭示了组织形成转录因子SHORT-ROOT (SHR)的替代配置及其在皮质层扩展中的作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术详细解析了玉米根部皮质层的形成机制 | 研究主要集中在玉米和Setaria两种植物上，可能不适用于其他植物种类 | 探讨植物根部皮质层的形成及其在生理功能中的作用 | 玉米和Setaria植物的根部皮质层 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及玉米和Setaria植物的多个皮质层细胞 |
| 22640 | 2024-08-08 |
An adaptive method of defining negative mutation status for multi-sample comparison using next-generation sequencing
2021-12-02, BMC medical genomics
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12920-021-00880-8
PMID:34856988
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研究论文 | 本文提出了一种自适应方法，用于在多样本比较中通过下一代测序（NGS）定义负突变状态 | 本文提出的自适应突变特异性负（MSN）方法，能够更准确地区分负突变状态和未知状态，相较于传统的通用最小覆盖（UMC）方法，能产生更多的可用数据 | NA | 开发一种新的方法，用于在多样本比较的下一代测序数据中区分未知和负突变状态 | 癌症基因组学研究中的多样本比较 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | 测序数据 | 模拟数据集包含不同肿瘤细胞分数的样本，以及一个真实的双平台单细胞测序数据集 |