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当前共找到 38777 篇文献，本页显示第 2241 - 2260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2241 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and bulk transcriptomic analysis identifies epithelial cell-related biomarkers and immune subtypes in focal segmental glomerulosclerosis
2026-Mar-24, International urology and nephrology
IF:1.8Q3
DOI:10.1007/s11255-026-05101-8
PMID:41872652
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和bulk转录组数据，鉴定了局灶节段性肾小球硬化症中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据系统分析FSGS中上皮细胞相关的分子改变，并构建了具有高诊断准确性的三基因标志物 | 分析基于公共数据集，需要进一步的实验验证来确认其机制相关性 | 鉴定FSGS中上皮细胞相关的生物标志物和免疫亚型，以改善诊断和患者分层 | 局灶节段性肾小球硬化症患者 | 生物信息学 | 肾脏疾病 | RNA-seq | 随机森林, 支持向量机 | 转录组数据 | 多个公共数据集（GSE200818, GSE200828, GSE176465, GSE133288, GSE108109） | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2242 | 2026-03-25 |
Adipose tissue microvascular is linked to insulin resistance and lipidome alterations in treated HIV
2026-Mar-24, AIDS (London, England)
DOI:10.1097/QAD.0000000000004491
PMID:41873969
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研究论文 | 本研究探讨了接受当代抗逆转录病毒治疗的HIV感染者中，皮下脂肪组织微血管重塑与胰岛素抵抗及血浆脂质组改变之间的关联 | 首次在长期接受当代ART且病毒抑制的HIV感染者中，结合单细胞RNA测序分析脂肪组织细胞组成与无靶向血浆脂质组学，揭示了微血管重塑与胰岛素抵抗相关脂质特征的联系 | 研究为横断面观察性设计，无法确定因果关系；样本量相对有限（n=127），且女性比例较低（23%） | 探究HIV感染者脂肪组织细胞组成如何影响循环脂质，并阐明其与胰岛素抵抗的关联 | 接受长期当代抗逆转录病毒治疗且病毒抑制的HIV感染者 | 单细胞组学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序，无靶向脂质组学分析 | 逻辑回归和线性回归模型 | 单细胞RNA测序数据，血浆脂质组学数据 | 127名HIV感染者（含59名进行单细胞RNA测序的腹部皮下脂肪组织样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2243 | 2026-03-25 |
Cytokine-driven PANoptosis of alveolar macrophages mediated by STAT1 underlies acute lung injury in hypervirulent Klebsiella pneumoniae infection
2026-Mar-24, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mbio.03958-25
PMID:41874176
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研究论文 | 本研究揭示了高毒力肺炎克雷伯菌感染通过STAT1依赖的PANoptosis导致肺泡巨噬细胞死亡，进而引发急性肺损伤的机制 | 首次发现高毒力肺炎克雷伯菌感染可诱导肺泡巨噬细胞发生PANoptosis（一种协同的细胞死亡过程），并阐明STAT1转录因子在此过程中的核心调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，人体内的机制验证尚需进一步研究；STAT1信号通路与其他细胞死亡通路的交互作用有待深入探索 | 探究高毒力肺炎克雷伯菌感染导致急性肺损伤的免疫病理机制 | 小鼠肺泡巨噬细胞、高毒力肺炎克雷伯菌 | 免疫学、感染性疾病 | 急性肺损伤、肺炎、败血症 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq）、细胞通讯分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠模型（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2244 | 2026-03-25 |
Novel protein biomarkers for risk stratification and personalized medicine
2026-Mar-24, Nephrology, dialysis, transplantation : official publication of the European Dialysis and Transplant Association - European Renal Association
DOI:10.1093/ndt/gfag068
PMID:41874429
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研究论文 | 本研究探讨了尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为反映肾小管损伤与修复的药效学生物标志物，在慢性肾脏病中分别对应内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂的治疗反应 | 首次将尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为机制导向的药效学生物标志物，分别用于评估内皮素受体拮抗剂和钠-葡萄糖协同转运蛋白2抑制剂在慢性肾脏病中的治疗反应，并揭示了其与不同病因、糖尿病状态及血糖控制的异质性关联 | 研究基于两个独立的临床试验人群，可能存在队列特异性偏差；生物标志物的长期预后价值及临床转化应用仍需进一步验证 | 评估尿液簇集蛋白和表皮生长因子作为慢性肾脏病治疗中机制特异性药效学生物标志物的可行性 | 慢性肾脏病患者 | 临床医学 | 慢性肾脏病 | 单细胞RNA测序 | NA | 尿液生物标志物测量数据、血清生物标志物数据、单细胞RNA测序数据 | 来自SONAR和DAPA-CKD两个随机临床试验的人群 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2245 | 2026-03-25 |
DyGFormer:Transformer With Resistance-Distance Bias for Semi-Supervised Cell-Type Identification
2026-Mar-23, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3676606
PMID:41870934
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研究论文 | 本文提出了一种名为DyGFormer的半监督模型，用于单细胞空间转录组数据中的细胞类型识别，该模型通过结合几何空间先验、自注意力机制和基于电阻距离的位置偏置来提升分类性能 | 提出了DyGFormer模型，该模型引入了基于电阻距离的相对位置偏置、邻居交互历史编码器以及基于三元组的度量监督，能够自适应学习细胞间连接权重并稳定跨层邻居交互 | 未在摘要中明确说明 | 开发一种半监督学习方法，以克服单细胞空间转录组数据中存在的测序噪声、平台异质性、标签覆盖不均和标注预算有限等障碍，实现准确的细胞类型识别 | 单细胞空间转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞空间转录组学 | Transformer | 空间转录组数据 | 多个单细胞分辨率空间数据集（如NanoString/CosMx和MERFISH） | NanoString, MERFISH | 空间转录组学 | CosMx, MERFISH | NA |
| 2246 | 2026-03-25 |
Single-cell transcriptomics reveals a new marine parasite: Characterization and distribution of Rozellomyces from the Gulf of Alaska
2026-Mar-23, Mycologia
IF:2.6Q2
DOI:10.1080/00275514.2026.2631200
PMID:41871174
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学在阿拉斯加湾发现并描述了一种新的海洋寄生虫Rozellomyces，揭示了其在生态系统中的多样性和分布 | 首次利用单细胞转录组学技术从阿拉斯加湾分离并鉴定出一种新的Rozellomycota门寄生虫，建立了新属，并基于宏数据库分析其地理分布 | 研究仅基于单一分离株，可能未完全代表该寄生虫的多样性；地理分布分析依赖于数据库中的ASV数据，可能存在偏差 | 探索海洋生态系统中寄生虫的多样性、分布及其生态角色，特别是针对Rozellomycota门这一研究不足的谱系 | 从阿拉斯加湾分离的Rozellomycota门寄生虫（新属Rozellomyces）及其宿主硅藻 | 微生物学 | NA | 单细胞转录组学，系统基因组学分析（基于238个基因），扩增子序列变异（ASV）分析 | NA | 转录组数据，序列数据 | 单一分离株（来自阿拉斯加湾），结合metaPR数据库中的ASV数据 | NA | NA | NA | NA |
| 2247 | 2026-03-25 |
Giant cell tumor of bone inhibits osteoblastogenesis via WNT5B
2026-Mar-23, Journal of bone and mineral metabolism
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s00774-026-01713-3
PMID:41872383
|
研究论文 | 本研究揭示了骨巨细胞瘤通过表达WNT5B抑制成骨细胞生成，从而拮抗骨形成 | 首次发现骨巨细胞瘤通过WNT5B抑制成骨细胞分化，扩展了对该肿瘤骨破坏机制的理解 | 研究主要基于体外细胞系实验，缺乏体内验证；样本来源有限，仅使用单一细胞系 | 探究骨巨细胞瘤对骨形成的影响机制 | 人骨巨细胞瘤细胞系（NCC-GCTB1-C1）和人脂肪来源干细胞（ADSCs） | 数字病理学 | 骨巨细胞瘤 | 单细胞RNA测序，空间转录组分析，CRISPR/Cas9基因敲除 | NA | RNA测序数据，空间转录组数据 | 使用人骨巨细胞瘤细胞系和人脂肪来源干细胞进行共培养实验 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | 10x Visium | 10x Visium FFPE（针对骨巨细胞瘤石蜡切片进行空间转录组分析） |
| 2248 | 2026-03-25 |
Tissue-restricted secondary TCR engagement drives the transition from stem-like to CD200+ Egr2hi arthritogenic Th17 cells
2026-Mar-23, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-026-02447-0
PMID:41872507
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和T细胞受体分析，揭示了关节炎致病性T17细胞的异质性及其向高度致病状态转变的关键调控机制 | 首次发现关节组织中限制性的次级TCR信号是驱动T17细胞从干细胞样状态向CD200+ Egr2hi高度致病状态选择性转变的关键决定因素，而非炎症信号的默认进程 | 研究基于小鼠自身免疫性关节炎模型，其在人体中的普适性仍需验证 | 探究自身免疫性关节炎中致病性T17细胞的异质性、发育轨迹及其增强致病性的机制 | 关节组织中的CD4 T细胞，特别是白介素-17产生的辅助T细胞和调节性T细胞 | 单细胞组学 | 自身免疫性关节炎 | 单细胞RNA测序，谱系追踪，T细胞受体库分析 | NA | 单细胞转录组数据，TCR序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2249 | 2026-03-25 |
kUncited referencesCo-localization analysis of spatial transcriptomics in ligand-receptor pairs from tumor microenvironment
2026-Mar-21, Critical reviews in oncology/hematology
DOI:10.1016/j.critrevonc.2026.105288
PMID:41871724
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综述 | 本文综述了基于空间转录组学的共定位分析在肿瘤微环境中配体-受体对研究中的应用、计算方法和未来前景 | 系统性地整合了空间原位信息以提升配体-受体对分析的准确性，并探讨了人工智能技术在该领域的应用潜力 | 作为一篇综述文章，未提出新的实验方法或模型，主要基于现有文献进行总结和展望 | 探讨空间转录组学共定位分析在识别肿瘤微环境中细胞间相互作用（特别是配体-受体对）中的应用价值 | 肿瘤微环境中的细胞间相互作用及配体-受体对 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | NA | 空间基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2250 | 2026-03-25 |
Human Single-cell Atlas Analysis Reveals Heterogeneous Endothelial Signaling
2026-Mar-20, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzag025
PMID:41863304
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研究论文 | 本研究通过整合超过三百万个单细胞RNA-seq数据，系统分析了15种人体组织中内皮细胞的异质性及其在细胞间通讯中的作用 | 首次在血管类型和组织微环境的双重背景下，系统研究内皮细胞异质性，并利用主题建模识别了组织特异性的细胞间通讯模式 | 研究依赖于现有单细胞RNA-seq数据集，可能受数据质量和覆盖范围的限制，且未进行实验验证 | 探究内皮细胞在不同组织和血管类型中的异质性及其微环境调控机制 | 人体15种组织中的内皮细胞 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA-seq | 主题建模 | 单细胞RNA-seq数据 | 超过三百万个单细胞，来自15种人体组织 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2251 | 2026-03-25 |
Gene regulatory network determinants of rapid recall in human memory CD4+ T cells
2026-Mar-20, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.117103
PMID:41865369
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研究论文 | 本文利用单核多组学测序技术，研究了人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络机制 | 首次结合单核多组学测序（基因表达与染色质可及性）来动态分析CD4 T细胞激活响应，并识别出记忆相关转录因子（如MAF、PRDM1、RUNX2、SMAD3和KLF6）在快速回忆中的调控作用 | 未在摘要中明确提及具体局限性 | 探究人类记忆CD4+ T细胞快速回忆反应的基因调控网络决定因素 | 人类记忆CD4+ T细胞 | 单细胞组学 | 免疫介导疾病 | 单核多组学测序（基因表达与染色质可及性）、染色质免疫沉淀测序、单细胞RNA测序 | 基因调控网络重建 | 单细胞多组学数据 | NA | NA | 单核多组学测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2252 | 2026-03-25 |
Heterogeneity of lymphoid cells in PBMCs in the acute phase of SFTS: Single-cell transcriptome profiling
2026-Mar-19, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.39.20250250
PMID:40685857
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和生物信息学分析，探讨了SFTS急性期淋巴细胞功能异常的机制以及糖皮质激素治疗对淋巴样细胞的影响 | 首次在SFTS急性期患者中应用单细胞转录组测序技术，系统性地揭示了淋巴样细胞的异质性及其在疾病进程中的作用，并评估了糖皮质激素治疗的免疫调节效果 | 样本量较小（仅16名参与者），且研究设计为观察性，未能进行随机对照试验以验证糖皮质激素治疗的最佳方案 | 阐明SFTS急性期免疫功能障碍的机制，并评估糖皮质激素治疗对淋巴样细胞功能的影响 | 健康志愿者和急性SFTS患者的外周血单个核细胞中的淋巴样细胞 | 数字病理学 | 病毒感染性疾病 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 16名参与者（3名健康志愿者和13名急性SFTS患者） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 捕获mRNA的3'端转录本 |
| 2253 | 2026-03-25 |
IFN-I-Mediated Transcriptional Reprogramming Drives Myeloid-Skewed Hematopoiesis in Sickle Cell Anemia
2026-Mar-19, American journal of hematology
IF:10.1Q1
DOI:10.1002/ajh.70277
PMID:41853894
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验，揭示了镰状细胞贫血中I型干扰素信号驱动造血干细胞向髓系分化的转录重编程机制 | 首次发现镰状细胞贫血中I型干扰素信号异常激活导致造血干细胞转录重编程，并揭示其对G-CSF的意外响应性 | 研究主要基于体外实验和单细胞测序数据，体内验证和临床转化仍需进一步探索 | 阐明镰状细胞贫血中病理性髓系生成和慢性炎症的内在机制 | 镰状细胞贫血患者的造血干细胞和多能祖细胞 | 单细胞组学 | 镰状细胞贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2254 | 2026-03-20 |
Single-cell RNA sequencing uncovers neutrophil clusters associated with autoimmune neuroinflammation
2026-Mar-18, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-026-03772-9
PMID:41851894
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2255 | 2026-03-25 |
Integrated single-cell and spatial analysis reveals context-dependent myeloid-T cell interactions in response to immune checkpoint blockade in head and neck cancer
2026-Mar-16, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2300
PMID:41837744
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间组学数据，系统评估了头颈癌患者在接受免疫检查点阻断治疗后的肿瘤浸润免疫细胞间相互作用 | 结合Visium空间转录组学和CosMx SMI单细胞空间组学技术，首次揭示了头颈癌中髓系细胞与T细胞相互作用的上下文依赖性，并识别了新的ICB响应标记物 | 样本量相对有限（23例单细胞数据，8例空间数据），且主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证 | 评估头颈癌患者免疫检查点阻断治疗后的细胞间相互作用，以识别响应标记物和治疗靶点 | 头颈鳞状细胞癌患者的肿瘤浸润免疫细胞 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 蛋白质组学 | 生物信息学分析 | 单细胞RNA和蛋白质数据, 空间RNA-seq数据 | 23例患者的522,399个单细胞，以及8例接受ICB治疗患者的空间RNA-seq数据 | 10x Genomics, NanoString | 空间转录组学, 单细胞空间组学 | 10x Visium, CosMx SMI | Visium spot-based空间转录组学, CosMx SMI单细胞空间组学（包含64-plex蛋白质面板和1000基因RNA面板） |
| 2256 | 2026-03-25 |
Selective Impact on Regulatory T cell with Sustained Functional Phenotype by the IL-2 Mutein VIS171 in a Nonhuman Primate Model
2026-Mar-16, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2026.03.007
PMID:41850490
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研究论文 | 本研究评估了IL-2突变体VIS171在非人灵长类动物模型中，与雷帕霉素联用，选择性扩增调节性T细胞（Tregs）并维持其功能表型的能力 | VIS171被设计为延长半衰期并增强对高表达三聚体IL-2受体的Tregs的选择性结合和扩增，结合雷帕霉素使用，在非人灵长类模型中实现了对Tregs的稳健、选择性和持久性扩增，同时不影响细胞毒性T淋巴细胞（CTLs） | 研究仅基于非人灵长类动物模型，未涉及人类临床试验，且样本量有限，长期效应和安全性需进一步验证 | 评估VIS171在非人灵长类动物中扩增Tregs并增强移植耐受性的策略 | 非人灵长类动物（恒河猴）的免疫细胞群体，特别是调节性T细胞（Tregs） | 免疫学 | 移植耐受 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2257 | 2026-03-25 |
Unannotated noncoding transcripts as a source of intratumor heterogeneity in malignant cell states
2026-Mar-16, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-025-3273-6
PMID:41870780
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA-seq数据，发现未注释的非编码转录本作为恶性细胞状态中肿瘤内异质性的来源 | 首次鉴定出数千个代表未注释转录本3'末端的poly(A)位点峰，并揭示其表达与恶性细胞状态的广泛关联，提出表观遗传激活这些转录本是肿瘤内异质性的新机制 | 研究主要基于3'标签单细胞RNA-seq数据，可能未全面覆盖所有转录本类型；功能实验仅针对两个非编码UPTs进行验证，需进一步扩展 | 探究肿瘤内异质性的分子机制，特别是未注释非编码转录本在恶性细胞状态多样性中的作用 | 12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq数据，包括肺癌细胞系和肿瘤样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA-seq, 多组学数据整合 | NA | 单细胞RNA-seq数据, 多组学数据 | 覆盖12种常见癌症类型的单细胞RNA-seq队列 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 3'标签单细胞RNA-seq |
| 2258 | 2026-03-25 |
Spatial transcriptomics reveals altered communities and drivers of aberrant epithelia and pro-fibrotic fibroblasts in interstitial lung diseases
2026-Mar-11, Cell genomics
IF:11.1Q1
DOI:10.1016/j.xgen.2025.101066
PMID:41576947
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研究论文 | 本研究利用单核RNA测序和空间转录组学技术，揭示了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化，并识别了纤维化过程中的关键分子驱动因素 | 通过整合单核RNA测序和空间转录组学数据，首次全面描绘了间质性肺疾病中远端肺的细胞网络变化，并识别了异常上皮细胞和促纤维化成纤维细胞共定位的致病生态位 | NA | 探究间质性肺疾病中肺纤维化的细胞和分子机制 | 间质性肺疾病患者的远端肺组织 | 空间转录组学 | 间质性肺疾病 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | NA | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2259 | 2026-03-25 |
AGPAT3 reshapes tumor cell vulnerability to IFNγ-mediated ferroptosis and enhances immunotherapy efficacy through lipid remodeling
2026-Mar-10, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2025-013305
PMID:41807033
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研究论文 | 本研究揭示了IFN-γ通过IRF1上调AGPAT3表达，驱动脂质重塑并增强肿瘤细胞对铁死亡的敏感性，从而提升免疫检查点抑制剂疗效 | 首次发现IFN-γ-IRF1-AGPAT3轴通过脂质重塑调控铁死亡敏感性，并构建了基于铁死亡相关基因的机器学习模型预测免疫治疗反应 | 未明确AGPAT3在不同肿瘤类型中的普适性，且临床样本验证需进一步扩大 | 探究铁死亡在增强免疫检查点抑制剂疗效中的作用机制 | 肿瘤细胞、单细胞RNA测序数据集、临床患者样本 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序、脂质组学、转录组学、ChIP-seq、CUT&Tag分析 | 机器学习预测模型 | 基因表达数据、脂质组数据、转录组数据 | 大规模单细胞RNA测序数据集及临床患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2260 | 2026-03-25 |
scGPT: end-to-end protocol for fine-tuned retinal cell type annotation
2026-03, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-025-01220-1
PMID:40665101
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研究论文 | 本文提供了一个针对单细胞RNA测序数据中细胞类型分类的scGPT模型微调完整指南 | 提出了一套端到端的scGPT微调协议，实现了自动化数据处理、模型微调和评估，并在视网膜数据集上达到99.5%的F1分数 | 需要用户具备基本的生物信息学知识，对Python和Linux有最低要求 | 解决单细胞研究中高分辨率细胞类型注释的挑战，特别是针对大规模数据集和罕见细胞群体 | 单细胞RNA测序数据中的视网膜细胞类型 | 单细胞分析 | NA | 单细胞RNA测序 | Transformer (scGPT) | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |