单细胞与空转测序相关文章

序号	推送日期	文章	类型	简述	创新点	不足	研究目的	研究对象	领域	病种	技术	模型	数据类型	样本量
2241	2025-03-17	Androgen deprivation induces double-null prostate cancer via aberrant nuclear export and ribosomal biogenesis through HGF and Wnt activation 2024-Feb-09, Nature communications IF:14.7Q1 DOI:10.1038/s41467-024-45489-4 PMID:38336745	研究论文	本文研究了雄激素剥夺疗法（ADT）如何通过异常的核输出和核糖体生物合成诱导双阴性前列腺癌（DNPC），并揭示了HGF/MET和Wnt/β-catenin信号通路的共激活在这一过程中的作用	揭示了当前ADT通过异常的HGF/MET信号激活进一步升高Wnt/β-catenin信号，从而诱导DNPC的机制，并提出了XPO1和核糖体蛋白作为潜在的治疗靶点	研究主要基于小鼠模型和临床样本，尚未在更大规模的人体试验中验证	探讨雄激素剥夺疗法（ADT）诱导双阴性前列腺癌（DNPC）的分子机制，并寻找潜在的治疗靶点	前列腺癌患者和小鼠模型	癌症研究	前列腺癌	单细胞RNA测序	小鼠模型	RNA测序数据	人类DNPC样本和小鼠模型
2242	2025-03-17	Brief literature review and comprehensive bioinformatics analytics unravel the potential mechanism of curcumin in the treatment of periodontitis 2023-07-08, BMC oral health IF:2.6Q1 DOI:10.1186/s12903-023-03181-x PMID:37422651	研究论文	本研究通过计算模拟揭示了姜黄素治疗牙周炎的潜在作用机制	通过单细胞分析和批量RNA测序数据的整合，结合分子对接和分子动力学模拟，揭示了姜黄素与CXCL1、FOS和CXCL8的结合模式	研究主要依赖于计算模拟，缺乏实验验证	揭示姜黄素治疗牙周炎的潜在机制	牙周炎	生物信息学	牙周炎	单细胞分析, 批量RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟	NA	基因表达数据	数据集GSE164241、GSE10334和GSE16134
2243	2025-03-16	Centromere protein U mediates the ubiquitination and degradation of RPS3 to facilitate temozolomide resistance in glioblastoma 2025-May, Drug resistance updates : reviews and commentaries in antimicrobial and anticancer chemotherapy IF:15.8Q1 DOI:10.1016/j.drup.2025.101214 PMID:40023134	研究论文	本研究揭示了CENPU在胶质母细胞瘤中对替莫唑胺（TMZ）耐药性的作用机制	首次发现CENPU通过促进RPS3的泛素化和降解来增强TMZ耐药性，并阐明了其分子机制	研究主要基于体外和动物模型，尚未在临床患者中进行验证	阐明TMZ耐药的机制并探索提高胶质母细胞瘤对TMZ敏感性的方法	胶质母细胞瘤（GBM）	肿瘤学	胶质母细胞瘤	转录组测序、免疫组化（IHC）、HE染色、单细胞测序、免疫荧光、慢病毒转导、共免疫沉淀、质谱分析、碱性彗星实验	NA	基因表达数据、组织病理学数据、单细胞测序数据	患者来源的GBM类器官、颅内和皮下胶质瘤小鼠模型
2244	2025-03-16	Divergent PTEN-p53 interaction upon DNA damage in a human thyroid organoid model with germline PTEN mutations 2025-Apr-01, Endocrine-related cancer IF:4.1Q2 DOI:10.1530/ERC-24-0216 PMID:39970536	研究论文	本文研究了在携带不同PTEN基因变异的甲状腺类器官模型中，电离辐射如何影响DNA损伤反应，特别是PTEN与p53的相互作用	首次揭示了不同PTEN基因变异在辐射诱导的DNA损伤反应中的差异，特别是PTEN M134R变异与甲状腺癌易感性的关联	研究仅基于体外类器官模型，未涉及体内环境或临床样本验证	探讨PTEN基因变异在甲状腺癌发生中的作用机制	携带不同PTEN基因变异的人类诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的甲状腺类器官	肿瘤生物学	甲状腺癌	CRISPR-Cas9基因编辑技术、RNA测序（RNA-seq）	甲状腺类器官模型	RNA测序数据	来自健康供体的hiPSC细胞系，携带PTEN WT/G132D和PTEN WT/M134R变异的类器官
2245	2025-03-16	Mycoplasma ovipnuemoniae impairs the immune response of sheep and suppresses neutrophil function by inhibiting S100A9 2025-Apr, Veterinary microbiology IF:2.4Q1 DOI:10.1016/j.vetmic.2025.110446 PMID:40022823	研究论文	本文研究了绵羊感染绵羊肺炎支原体（MO）后，肺部免疫反应和中性粒细胞功能的变化	首次系统分析了MO感染后绵羊肺组织中11种细胞类型的转录组变化，并构建了细胞间通讯模型和关键调控基因的差异表达图谱	研究主要基于体外实验，体内实验的验证可能不足	探讨MO感染对绵羊肺部免疫反应和中性粒细胞功能的影响	绵羊肺组织中的11种细胞类型	生物信息学	肺炎	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	细胞间通讯模型	RNA测序数据	感染MO 28天后的绵羊肺组织
2246	2025-03-16	Case report: single-cell transcriptome sequencing reveals the clonal origin of mature plasmacytoid dendritic cell proliferation in early T-cell precursor lymphoblastic leukemia 2025-Mar-14, Annals of hematology IF:3.0Q2 DOI:10.1007/s00277-025-06301-5 PMID:40085211	病例报告	本文报告了一例69岁男性患者，通过单细胞转录组测序技术揭示了成熟浆细胞样树突状细胞增殖（MPDCP）与早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病（T-ALL）的克隆起源	首次利用单细胞RNA测序技术揭示了T-ALL原始细胞与浆细胞样树突状细胞（pDC）之间的转录连续性，表明这两种细胞类型之间可能存在发育关系	需要进一步研究以确认这些发现并探索其临床意义	探讨MPDCP与淋巴系统恶性肿瘤的关联及其细胞发育关系	69岁男性患者，患有早期T细胞前体急性淋巴细胞白血病并伴有MPDCP	数字病理学	白血病	单细胞RNA测序	NA	RNA序列数据	1例患者
2247	2025-03-16	Mature Megakaryocytes Acquire Immune Characteristics in a Mouse Model of Aplastic Anemia 2025-Mar-14, Blood advances IF:7.4Q1 DOI:10.1182/bloodadvances.2024015621 PMID:40086077	研究论文	本文探讨了在免疫性骨髓衰竭小鼠模型中，成熟巨核细胞获得免疫特性的现象	揭示了成熟巨核细胞在免疫性骨髓衰竭中的新角色，包括其作为抗原呈递细胞的能力和对T细胞的激活作用	研究主要基于小鼠模型，人类样本的验证尚不充分	研究巨核细胞在免疫性骨髓衰竭中的功能和特性	小鼠模型中的巨核细胞和T细胞	血液学	再生障碍性贫血	单细胞RNA测序（scRNA-seq），电子显微镜	小鼠模型	基因表达数据，显微镜图像	小鼠模型中的巨核细胞和T细胞，以及再生障碍性贫血患者的样本
2248	2025-03-16	Mapping glioma progression: single-cell RNA sequencing illuminates cell-cell interactions and immune response variability 2025-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01903-x PMID:40072722	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了胶质瘤微环境的复杂性，特别是恶性胶质瘤细胞与巨噬细胞/单核细胞之间的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响	利用单细胞RNA测序技术深入分析了胶质瘤样本，识别了多种细胞亚群和巨噬细胞/单核细胞亚型，揭示了它们通过特定途径的相互作用，并开发了一个基于风险评分的预后模型	研究依赖于公开数据库的数据，可能受到数据质量和样本选择的限制	探索胶质瘤微环境中恶性细胞与免疫细胞的相互作用及其对肿瘤进展和治疗反应的影响	胶质瘤细胞和巨噬细胞/单核细胞	数字病理学	胶质瘤	单细胞RNA测序	预后模型	RNA-seq数据	来自TCGA和CGGA数据库的胶质瘤样本
2249	2025-03-16	Spatial transcriptomics of the epipharynx in long COVID identifies SARS-CoV-2 signalling pathways and the therapeutic potential of epipharyngeal abrasive therapy 2025-Mar-12, Scientific reports IF:3.8Q1 DOI:10.1038/s41598-025-92908-7 PMID:40074801	研究论文	本研究通过空间基因表达分析（Visium HD）探讨了咽部在长期COVID-19中的关键作用，特别是残留的SARS-CoV-2 RNA如何影响咽部的信号通路，并假设针对咽部的咽部磨擦疗法（EAT）可以通过调节局部炎症和基因表达来改善长期COVID症状	首次使用空间基因表达分析技术研究长期COVID-19患者咽部残留SARS-CoV-2 RNA的影响，并提出咽部磨擦疗法（EAT）作为潜在治疗方法	样本量较小，仅包括三名长期COVID-19患者和两名对照个体	探讨咽部在长期COVID-19中的作用及咽部磨擦疗法（EAT）的治疗潜力	长期COVID-19患者和对照个体的咽部组织	数字病理学	COVID-19	空间基因表达分析（Visium HD）	NA	基因表达数据	三名长期COVID-19患者和两名对照个体
2250	2025-03-16	Transcription factor networks and novel immune biomarkers reveal key prognostic and therapeutic insights in ovarian cancer 2025-Mar-12, Discover oncology IF:2.8Q2 DOI:10.1007/s12672-025-01788-w PMID:40074978	研究论文	本研究通过分析卵巢癌单细胞RNA测序数据，构建了一个基于转录因子调控网络的9基因风险模型，用于预测卵巢癌的预后和免疫治疗效果	首次利用单细胞RNA测序数据构建卵巢癌的转录因子调控网络，并开发了一个9基因风险模型，同时鉴定了三个新的免疫相关生物标志物	研究主要基于单细胞RNA测序数据，样本量可能有限，且需要进一步验证模型在其他独立队列中的有效性	研究卵巢癌肿瘤微环境中的转录因子调控网络，开发预后预测模型并探索新的免疫治疗靶点	卵巢癌肿瘤微环境中的免疫细胞和转录因子	数字病理学	卵巢癌	单细胞RNA测序（scRNA-seq），qPCR，免疫组化（IHC）	Lasso回归，ConsensusClusterPlus	单细胞RNA测序数据，免疫组化数据	未明确提及具体样本数量，但使用了138种GDSC数据库药物进行敏感性预测
2251	2025-03-16	Integrative whole slide image and spatial transcriptomics analysis with QuST and QuPath 2025-Mar-12, NPJ precision oncology IF:6.8Q1 DOI:10.1038/s41698-025-00841-9 PMID:40075141	研究论文	本文介绍了一种名为QuST的QuPath扩展工具，用于在单细胞水平上整合全切片图像（WSI）和空间转录组学（ST）分析	提出了QuST工具，首次在单细胞水平上整合WSI和ST分析，为疾病生物学研究提供了新的视角	面临训练模式准备和分辨率差异等挑战	增强对疾病的理解，特别是在数字病理学领域	全切片图像（WSI）和空间转录组学（ST）数据	数字病理学	NA	空间转录组学（ST）	NA	图像和转录组数据	NA
2252	2025-03-16	A dynamic transcriptional cell atlas of testes development after birth in Hu sheep 2025-Mar-12, BMC biology IF:4.4Q1 DOI:10.1186/s12915-025-02186-y PMID:40075363	研究论文	本研究利用单细胞RNA测序技术构建了胡羊出生后睾丸发育的动态转录细胞图谱	首次在大型动物中揭示了睾丸发育过程中精原细胞亚型和体细胞成熟的关键动态变化	研究仅限于胡羊，结果可能无法直接推广到其他物种	探索大型动物睾丸发育过程中的细胞动态变化和调控机制	胡羊睾丸细胞	生殖生物学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞转录组数据	近100,000个细胞，涵盖七个发育阶段（出生、青春期前、青春期和成年期）
2253	2025-03-16	Fatty acid metabolism shapes immune responses in chronic lymphocytic leukemia 2025-Mar-12, Biomarker research IF:9.5Q1 DOI:10.1186/s40364-025-00753-7 PMID:40075418	研究论文	本研究探讨了脂肪酸代谢在慢性淋巴细胞白血病（CLL）中的特征及其对免疫反应的影响，构建了相关的预后评分，并研究了脂肪酸代谢在CLL发展中的调控作用和机制	构建了基于脂肪酸代谢基因表达的预后风险评分，揭示了相关的免疫表型差异，并探索了脂肪酸氧化在CLL发展中的调控作用	研究主要基于RNA测序数据，缺乏对脂肪酸代谢在CLL中具体分子机制的深入实验验证	阐明脂肪酸代谢在CLL中的特征及其对免疫反应的影响，构建预后评分并探索其调控机制	慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者和健康对照	肿瘤免疫学	慢性淋巴细胞白血病	RNA测序（bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq）	Cox-LASSO回归	RNA测序数据	CLL患者和健康对照的RNA测序数据
2254	2025-03-16	Harnessing the power of traceable system C-GAP: homologous-targeting to fire up T-cell immune responses with low-dose irradiation 2025-Mar-12, Journal of nanobiotechnology IF:10.6Q1 DOI:10.1186/s12951-025-03281-6 PMID:40075499	研究论文	本研究开发了一种仿生纳米平台C-GAP，用于增强低剂量放疗的免疫治疗效果	C-GAP纳米平台具有同源和可追踪的靶向特性，能够实现肿瘤选择性积累，并通过低剂量放疗增强ROS生成，触发有效的免疫原性细胞死亡	NA	开发一种安全有效的放射免疫治疗方法	肿瘤细胞和CD8 T细胞	生物医学工程	癌症	单细胞RNA测序	NA	RNA测序数据	NA
2255	2025-03-16	IRF-1 promotes diabetic vasculopathy by mediating endothelial cell pyroptosis 2025-Mar-12, Annals of vascular surgery IF:1.4Q3 DOI:10.1016/j.avsg.2025.02.018 PMID:40086624	研究论文	本文探讨了IRF-1通过介导内皮细胞焦亡促进糖尿病血管病变的机制	首次揭示了IRF-1在糖尿病血管病变中的关键作用，特别是通过调节内皮细胞焦亡	研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证	探索糖尿病血管病变的分子机制，特别是内皮细胞焦亡的作用	糖尿病模型小鼠BKS-db/db和内皮细胞	生物医学	糖尿病	单细胞RNA测序（scRNA-seq）、免疫荧光、免疫组化（IHC）、苏木精-伊红（H&E）染色、Masson染色	NA	基因表达数据、组织图像	两组样本：非糖尿病动脉粥样硬化组和糖尿病动脉粥样硬化组
2256	2025-03-16	Integrated genetic analysis and single cell-RNA sequencing for brain image-derived phenotypes and Parkinson's disease 2025-Mar-11, Progress in neuro-psychopharmacology & biological psychiatry IF:5.3Q1 DOI:10.1016/j.pnpbp.2025.111317 PMID:40081564	研究论文	本研究通过整合遗传分析和单细胞RNA测序技术，揭示了脑图像衍生表型（IDPs）与帕金森病（PD）之间的遗传和生物学联系	首次全面分析了624个脑IDPs与PD之间的遗传相关性，并通过多种统计方法验证了因果关系，同时利用单细胞RNA测序技术确定了潜在的共享基因及其在脑组织中的表达图谱	研究主要依赖于GWAS汇总统计数据和单细胞RNA测序数据，可能受到数据来源和样本量的限制	揭示脑IDPs与PD之间的遗传和生物学联系	帕金森病患者及其脑图像衍生表型	数字病理学	帕金森病	GWAS, scRNA-seq	LDSC, MR, MAGMA, PLACO, FUMA, Metascape	基因组数据, 单细胞RNA测序数据	624个脑IDPs
2257	2025-03-16	From inflammation to remodelling: A novel BASP1+ monocyte subset as a catalyst for acute aortic dissection 2025-Mar-06, Journal of advanced research IF:11.4Q1 DOI:10.1016/j.jare.2025.03.003 PMID:40057028	研究论文	本文研究了BASP1+单核细胞亚群在急性主动脉夹层（AAD）发展中的作用及其机制	首次揭示了BASP1+单核细胞亚群在AAD中的关键作用及其通过特定信号通路促进炎症和血管重塑的机制	研究主要基于小鼠模型，人类样本的应用和验证仍需进一步研究	探讨BASP1+单核细胞亚群在AAD发展中的作用及其机制	人类外周血和主动脉组织中的单核细胞/巨噬细胞	生物医学	心血管疾病	scRNA-seq, 免疫荧光, 激光散斑成像, 超声成像, Co-IP, ChIP测序	BASP1-CreER/Lyz2-DreER-tdT报告小鼠	基因表达数据, 图像数据	人类外周血和主动脉组织样本, BASP1-CreER/Lyz2-DreER-tdT报告小鼠
2258	2025-03-16	Single-cell transcriptomics of clinical grade adipose-derived regenerative cells reveals consistency between donors independent of gender and BMI 2025-Mar-05, Stem cell research & therapy IF:7.1Q1 DOI:10.1186/s13287-025-04234-4 PMID:40038777	研究论文	本文通过单细胞转录组测序技术研究了临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs）的异质性，发现不同供体之间的ADRCs组成和质量具有高度一致性，不受性别和BMI的影响	首次通过单细胞RNA测序技术全面绘制了ADRCs的异质性图谱，并发现供体、性别和BMI对ADRCs组成的影响较小	研究仅基于两项细胞试验干预研究，样本量可能有限，且未探讨其他潜在影响因素	探讨供体、性别和BMI对脂肪来源再生细胞（ADRCs）组成和质量的影响	临床级脂肪来源再生细胞（ADRCs）	单细胞转录组学	NA	单细胞RNA测序	NA	单细胞RNA测序数据	两项细胞试验干预研究中的ADRCs样本
2259	2025-03-16	Single-Cell RNA Sequencing Reveals an Atlas of Meihua Pig Testis Cells 2025-Mar-05, Animals : an open access journal from MDPI IF:2.7Q1 DOI:10.3390/ani15050752 PMID:40076035	研究论文	本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了梅花猪睾丸细胞的转录组图谱，并鉴定了不同发育阶段的细胞类型及其潜在标记基因	首次在梅花猪中应用单细胞RNA测序技术，构建了睾丸发育过程中生殖细胞和体细胞的单细胞发育图谱，并鉴定了精原细胞的候选标记基因TKTL1	研究仅限于梅花猪，未涉及其他物种或更广泛的样本	解析梅花猪睾丸发育过程中的细胞异质性及其转录组特征	梅花猪睾丸细胞	单细胞组学	NA	单细胞RNA测序（scRNA-seq）	NA	单细胞RNA测序数据	13,839个梅花猪睾丸细胞
2260	2025-03-16	HOXA1 Contributes to Bronchial Epithelial Cell Cycle Progression by Regulating p21/CDKN1A 2025-Mar-05, International journal of molecular sciences IF:4.9Q2 DOI:10.3390/ijms26052332 PMID:40076953	研究论文	本研究探讨了HOXA1基因在支气管上皮细胞增殖和迁移中的作用，发现其通过调控p21/CDKN1A影响细胞周期进程	首次使用CRISPR/CAS9技术生成HOXA1敲除的支气管上皮细胞系，并通过单细胞RNA测序和流式细胞术揭示了HOXA1在细胞周期调控中的具体机制	研究仅限于体外细胞实验，未涉及体内模型或临床试验	研究HOXA1基因在支气管上皮细胞增殖和迁移中的作用	支气管上皮细胞	细胞生物学	慢性阻塞性肺病	CRISPR/CAS9, 单细胞RNA测序, 流式细胞术	NA	基因表达数据, 细胞周期数据	HOXA1敲除和野生型支气管上皮细胞系