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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2241 - 2260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2241 | 2025-10-06 |
Single-molecule RNA-FISH analysis reveals stochasticity in reactivation of latent HIV-1 regulated by Nuclear Orphan Receptors NR4A and cMYC
2024-Apr-19, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4166090/v1
PMID:38699331
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研究论文 | 通过单分子RNA-FISH技术研究HIV-1潜伏病毒再激活的随机性及其受核孤儿受体NR4A和cMYC调控的机制 | 首次使用单分子RNA-FISH技术揭示HIV-1前病毒再激活具有细胞间高度变异的随机性特征，并发现cMYC和NR4A3作为调控该过程的外在因子 | 研究主要基于细胞系和有限的原代CD4 T细胞样本，需要更大规模的临床验证 | 研究HIV-1潜伏病毒再激活的机制及其调控因素 | HIV-1潜伏感染的细胞系和艾滋病病毒抑制患者的原代CD4 T细胞 | 分子生物学 | 艾滋病 | 单分子RNA-FISH, FISH-Quant分析, 单细胞RNA-seq | NA | 图像数据, 基因表达数据 | 细胞系和原代CD4 T细胞（具体数量未明确说明） | NA | 单分子RNA-FISH, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2242 | 2025-10-06 |
Redox signalling regulates breast cancer metastasis via phenotypic and metabolic reprogramming due to p63 activation by HIF1α
2024-04, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-023-02522-5
PMID:38238426
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示氧化还原信号通过HIF1α激活p63调控乳腺癌转移的表型和代谢重编程机制 | 首次发现GPx2敲低通过HIF1α-p63轴驱动混合上皮-间质转化状态，揭示其在原发灶和转移灶中不同的代谢适应性 | 研究基于PyMT乳腺肿瘤模型，结果在人类乳腺癌中的普适性需要进一步验证 | 阐明氧化还原信号调控乳腺癌转移的细胞亚群和转录调控机制 | PyMT乳腺肿瘤模型中的肿瘤细胞亚群及其肺转移灶 | 单细胞转录组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，伪时间轨迹分析 | NA | 单细胞转录组数据 | PyMT/GPx2 KD原发肿瘤及配对肺转移灶样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2243 | 2025-10-06 |
Revealing the role of necroptosis microenvironment: FCGBP + tumor-associated macrophages drive primary liver cancer differentiation towards cHCC-CCA or iCCA
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01908-3
PMID:38017206
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了FCGBP+肿瘤相关巨噬细胞通过调控坏死性凋亡微环境驱动原发性肝癌向cHCC-CCA或iCCA分化的机制 | 首次识别FCGBP+SPP1+肿瘤相关巨噬细胞是调控坏死性凋亡微环境的关键细胞，并发现S100A6在癌前细胞向iCCA和cHCC-CCA进展中的重要作用 | 样本量较小（34个单细胞样本和3个空间转录组样本），主要基于生物信息学分析，实验验证相对有限 | 探究坏死性凋亡微环境在原发性肝癌分化中的作用机制 | 原发性肝癌患者组织样本，包括HCC、iCCA和cHCC-CCA | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 免疫组织化学 | Seurat, monocle2, AUCell, geneSwitches, SpaCET, CellChat | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 图像数据 | 34个单细胞样本（4例HCC患者和3例iCCA患者），3个空间转录组样本（各1例HCC、iCCA和cHCC-CCA） | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2244 | 2025-10-06 |
Apoptosis-related prognostic biomarkers and potential targets for acute kidney injury based on machine learning algorithm and in vivo experiments
2024-04, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01896-4
PMID:37789227
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研究论文 | 本研究通过机器学习算法和体内实验识别了三个与细胞凋亡相关的急性肾损伤诊断生物标志物 | 首次结合WGCNA、差异表达分析和机器学习算法鉴定出CBFB、EGF和COL1A1三个核心凋亡相关基因作为AKI诊断标志物，并构建了诊断模型 | 研究样本来源和数量未明确说明，诊断模型需要在更大临床样本中进一步验证 | 开发急性肾损伤的精确诊断生物标志物和治疗方法 | 急性肾损伤患者和AKI小鼠模型 | 机器学习 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，加权基因共表达网络分析，差异表达分析，逻辑回归分析，CIBERSORT免疫浸润分析 | 逻辑回归，ROC曲线分析 | 基因表达数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2245 | 2025-10-06 |
Recent advances in differential expression analysis for single-cell RNA-seq and spatially resolved transcriptomic studies
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad011
PMID:37022699
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综述 | 本文系统综述了单细胞RNA测序和空间转录组学数据中差异表达分析的最新进展与挑战 | 首次针对多条件、多样本实验设计下的scRNA-seq和SRT数据差异表达分析工具进行系统性梳理，并提供方法选择与开发指导 | 未进行实证方法比较，主要提供理论框架和综述性指导 | 探讨单细胞和空间转录组数据中差异表达分析的特殊挑战与发展方向 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)和空间解析转录组学(SRT)数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2246 | 2025-10-06 |
An improved hierarchical variational autoencoder for cell-cell communication estimation using single-cell RNA-seq data
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elac056
PMID:36752035
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研究论文 | 提出一种改进的层次变分自编码器模型，利用单细胞RNA-seq数据自动估计细胞间通讯 | 结合层次变分自编码器和传递熵方法，无需依赖先验知识即可自动推断细胞间通讯关系 | 仅在人皮肤疾病和黑色素瘤数据集上进行了验证，需要更多数据集验证通用性 | 开发新方法准确估计肿瘤微环境中的细胞间通讯 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间通讯关系 | 生物信息学 | 皮肤疾病, 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | 层次变分自编码器(HiVAE) | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2247 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA-seq data clustering by deep information fusion
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad017
PMID:37208992
|
研究论文 | 提出一种基于深度信息融合的单细胞RNA-seq数据聚类方法scDeepFC | 通过深度信息融合网络同时利用基因属性信息和细胞拓扑结构，结合ZINB模型处理dropout事件 | NA | 解决单细胞转录组数据聚类和插补的计算挑战 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA-seq | 深度自编码器, 图卷积网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2248 | 2025-10-06 |
Integrating single-cell RNA sequencing data to genome-wide association analysis data identifies significant cell types in influenza A virus infection and COVID-19
2024-03-20, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad025
PMID:37340787
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序数据和全基因组关联分析数据，识别与甲型流感病毒感染和COVID-19相关的显著细胞类型 | 首次将流感GWAS数据与scRNA-seq数据整合分析，识别不同人群中的疾病相关细胞类型 | 需要更多后续研究的关注和验证 | 揭示与流感疾病相关的细胞类型，为理解发病机制提供线索 | 甲型流感病毒和COVID-19 | 生物信息学 | 呼吸道传染病 | 单细胞RNA测序, 全基因组关联分析 | RolyPoly, LDSC-cts | 基因组数据, 单细胞转录组数据 | 约70,000个细胞 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2249 | 2025-10-06 |
Molecular Signatures of Glomerular Neovascularization in a Patient with Diabetic Kidney Disease
2024-Feb-01, Clinical journal of the American Society of Nephrology : CJASN
IF:8.5Q1
DOI:10.2215/CJN.0000000000000276
PMID:37533147
|
研究论文 | 通过空间转录组学技术分析糖尿病肾病患者肾活检样本中肾小球新生血管的分子特征 | 首次使用三维免疫荧光成像和空间转录组学揭示糖尿病肾病中肾小球周围新生血管的分子特征，突破了传统病理学评估的局限 | 仅基于单个病例分析，样本量有限，需要更大规模研究验证 | 探索糖尿病肾病中肾小球新生血管的分子机制 | 66岁女性糖尿病肾病患者 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 空间转录组学，三维免疫荧光成像 | NA | 基因表达数据，影像数据 | 1例患者肾活检样本 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2250 | 2025-10-06 |
Development and experimental validation of a machine learning-based disulfidptosis-related ferroptosis score for hepatocellular carcinoma
2024-02, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01900-x
PMID:37875647
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研究论文 | 开发并实验验证了一种基于机器学习的双硫死亡相关铁死亡评分系统，用于肝细胞癌研究 | 首次构建双硫死亡相关铁死亡(DRF)评分系统，并通过单细胞水平分析和体外实验验证KIF20A功能 | 研究主要基于生物信息学分析，需要更多实验验证 | 探索双硫死亡相关铁死亡基因在肝细胞癌中的作用机制 | 肝细胞癌患者 | 机器学习 | 肝细胞癌 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 体外实验 | Pearson分析, 差异分析, uniCox回归, lasso, ranger, 多变量Cox回归 | 基因表达数据 | 肝细胞癌患者队列 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 2251 | 2025-10-06 |
Myeloid-specific ablation of Basp1 ameliorates diet-induced NASH in mice by attenuating pro-inflammatory signaling
2024-02-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000537
PMID:37505219
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析发现Basp1是NASH中髓系细胞炎症信号的关键调控因子 | 首次发现Basp1在NASH肝脏中特异性高表达，并通过髓系特异性敲除证实其在NASH发病机制中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床意义需要进一步验证 | 探究髓系细胞在NASH发病机制中的作用及潜在治疗靶点 | 小鼠髓系细胞（巨噬细胞和树突状细胞）及人类NASH肝脏样本 | 生物医学研究 | 非酒精性脂肪性肝炎 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA测序数据 | 小鼠模型及人类肝脏样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2252 | 2025-10-06 |
A Strategy based on Bioinformatics and Machine Learning Algorithms Reveals Potential Mechanisms of Shelian Capsule against Hepatocellular Carcinoma
2024, Current pharmaceutical design
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学和机器学习算法揭示了射莲胶囊抗肝细胞癌的潜在作用机制 | 首次整合生物信息学分析和多种机器学习算法系统研究射莲胶囊抗肝癌的多层次作用机制 | 研究主要基于数据库分析和计算模拟，缺乏实验验证 | 探索射莲胶囊治疗肝细胞癌的潜在药理机制 | 射莲胶囊的活性成分和肝细胞癌相关基因 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 生物信息学分析,机器学习算法,单细胞RNA测序,分子对接 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),多种机器学习算法 | 基因表达数据,化合物数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,微阵列芯片 | NA | NA |
| 2253 | 2025-10-06 |
leptin b and its regeneration enhancer illustrate the regenerative features of zebrafish hearts
2024-01, Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists
IF:2.0Q3
DOI:10.1002/dvdy.556
PMID:36495292
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研究论文 | 本研究利用leptin b及其组织再生增强子元件解析斑马鱼心脏再生过程中非心肌细胞的异质性 | 首次将lepb作为再生特异性标志物来识别损伤激活的内皮细胞亚群，并发现lepb+内皮细胞作为信号中心与其他心脏细胞相互作用 | 研究仅限于斑马鱼模型，未在哺乳动物中进行验证 | 解析斑马鱼心脏再生的细胞和分子机制 | 斑马鱼心脏再生过程中的非心肌细胞（内皮细胞、心外膜和心外膜来源细胞） | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，染色质可及性分析，转基因品系 | NA | 单细胞转录组数据，染色质可及性数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2254 | 2025-10-06 |
Melanoma differentiation associated gene-9/syndecan binding protein promotes hepatocellular carcinoma
2023-12-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32797
PMID:36120720
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研究论文 | 本研究通过构建肝细胞特异性过表达MDA-9的转基因小鼠模型，揭示MDA-9通过NF-κB和Spp1信号通路促进肝细胞癌发展的机制 | 首次构建肝细胞特异性MDA-9过表达转基因小鼠模型，并发现MDA-9通过NF-κB-Spp1轴驱动肝癌发生的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类肝癌中的验证尚不充分 | 探究MDA-9基因在肝细胞癌发生发展中的作用机制 | 转基因小鼠模型（Alb/MDA-9）和野生型对照小鼠的肝细胞及非实质细胞 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 转基因技术 | 转基因小鼠模型 | 基因表达数据 | 转基因小鼠与野生型对照小鼠 | NA | RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2255 | 2025-10-06 |
Deep analysis of CD4 T cells in the rhesus CNS during SIV infection
2023-Dec, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1011844
PMID:38060615
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序深入分析SIV感染期间恒河猴中枢神经系统中的CD4 T细胞分布和功能 | 首次系统揭示CCR5+ CD4 T细胞在中枢神经系统不同区域（包括脑实质和边界组织）的分布特征及其在SIV感染中的功能状态 | 样本量较小（10只恒河猴），ART方案模拟的是依从性不佳的情况，可能无法完全反映临床实际情况 | 探究SIV感染期间中枢神经系统中CD4 T细胞的分布、功能和病毒存在情况 | SIVmac251感染的恒河猴 | 免疫学 | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 10只SIV感染的恒河猴（4只急性期，6只慢性期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2256 | 2025-10-06 |
Unified Mouse and Human Kidney Single-Cell Expression Atlas Reveal Commonalities and Differences in Disease States
2023-11-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000217
PMID:37639336
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研究论文 | 本研究构建了统一的小鼠和人类肾脏单细胞表达图谱，揭示了疾病状态的共性和差异 | 首次系统性地比较了18种不同小鼠肾脏疾病模型的单细胞和批量基因表达数据，并直接对比了小鼠糖尿病肾病模型与人类患者的单细胞表达特征 | 小鼠糖尿病肾病模型与人类患者在单细胞水平的基因表达变化重叠较小 | 系统分析小鼠肾脏疾病模型的基因表达特征，并与人类疾病状态进行比较 | 18种小鼠肾脏疾病模型和人类糖尿病肾病患者的肾脏组织 | 单细胞组学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量基因表达分析 | 张量分解分析 | 基因表达数据 | 36个单细胞RNA测序样本, 42个批量基因表达样本, 近300,000个细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 2257 | 2025-10-06 |
CD4 T cell Responses in the CNS during SIV infection
2023-Aug-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.08.24.554055
PMID:37662237
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研究论文 | 本研究通过SIV感染模型探索了CD4 T细胞在中枢神经系统中的分布、应答及抗逆转录病毒治疗后的恢复情况 | 首次系统揭示了CCR5+ CD4 T细胞在脑实质及邻近CNS组织中的分布特征，并通过单细胞RNA测序证实了病毒感染期间CNS内CD4 T细胞的功能参与 | 研究样本量较小（仅10只恒河猴），且ART方案模拟的是非最佳依从性情况 | 探究SIV感染过程中CD4 T细胞在中枢神经系统的分布、应答机制及治疗后的恢复情况 | SIVmac251感染的恒河猴 | 免疫学 | HIV/艾滋病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10只SIV感染的恒河猴（4只急性期，6只慢性期） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2258 | 2025-10-06 |
Emergence of highly profibrotic and proinflammatory Lrat+Fbln2+ HSC subpopulation in alcoholic hepatitis
2023-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32793
PMID:36181700
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在酒精性肝炎小鼠模型中鉴定出一个高纤维化和促炎的Lrat+Fbln2+肝星状细胞亚群 | 首次发现并描述了在酒精性肝炎中出现的Lrat+Fbln2+肝星状细胞亚群，该亚群具有高度纤维化、促炎和免疫调节特性 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证相对有限 | 识别酒精性肝炎中胶原蛋白1α1表达细胞的亚群，特别是肝星状细胞和门静脉成纤维细胞的作用 | 小鼠酒精性肝炎模型和人类酒精性肝炎患者样本 | 单细胞生物学 | 酒精性肝炎 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 原位杂交, 流式细胞分选 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫组织化学图像, 原位杂交数据 | Col1a1-GFP转基因小鼠，接受酒精性肝炎、CCl4和胆管结扎处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2259 | 2025-10-06 |
Role of mitochondria-bound HK2 in rheumatoid arthritis fibroblast-like synoviocytes
2023, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2023.1103231
PMID:37529037
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研究论文 | 本研究探讨线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的关键作用 | 首次揭示线粒体定位的HK2通过调控细胞侵袭和迁移能力影响RA病理进程，并提出靶向线粒体HK2解离的新治疗策略 | 研究主要基于体外细胞实验和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 阐明线粒体结合型HK2在类风湿关节炎成纤维样滑膜细胞表型调控中的分子机制 | 类风湿关节炎患者的成纤维样滑膜细胞和关节炎小鼠模型 | 分子生物学 | 类风湿关节炎 | 共聚焦显微镜、腺病毒感染、单细胞RNA测序、基因表达分析 | NA | 基因表达数据、细胞表型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2260 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示白血病抑制因子诱导的脂肪来源细胞向心脏细胞转变的动态过程 | 首次在单细胞分辨率下解析ADC向心脏细胞转变的异质性和细胞动力学，发现Nrf2信号通路的瞬时变化是心肌生成起始的关键 | 研究主要关注LIF诱导的转变过程，其他因子可能的影响尚未探索 | 探究脂肪来源细胞向心脏细胞转变的机制和细胞异质性 | 脂肪来源细胞(ADCs)及其向心脏细胞的转变过程 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | 伪时间分析 | 单细胞转录组数据 | 39,432个单细胞转录组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |