单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27435 篇文献，本页显示第 22481 - 22500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22481 | 2024-08-08 |
scEnhancer: a single-cell enhancer resource with annotation across hundreds of tissue/cell types in three species
2022-01-07, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkab1032
PMID:34761274
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为scEnhancer的单细胞增强子资源数据库，涵盖了三种物种中数百种组织/细胞类型的14527776个增强子和63658600个增强子-基因相互作用 | 利用单细胞测序技术scATAC-seq在单细胞水平上注释增强子和启动子，并通过无监督学习方法和顺式调控网络算法识别增强子-基因连接 | NA | 旨在为单细胞水平上增强子对目标基因的调控功能分析提供一个全面的资源 | 单细胞增强子及其与基因的相互作用 | 生物信息学 | NA | scATAC-seq | 无监督学习方法 | 单细胞数据 | 1196906个单细胞 |
| 22482 | 2024-08-08 |
Dysregulated Immunometabolism Is Associated with the Generation of Myeloid-Derived Suppressor Cells in Staphylococcus aureus Chronic Infection
2022, Journal of innate immunity
IF:4.7Q2
DOI:10.1159/000519306
PMID:34763332
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和功能代谢分析，深入探讨了慢性金黄色葡萄球菌感染中髓源抑制细胞（MDSCs）的生成和维持机制 | 首次揭示了MDSCs不仅在骨髓中产生，还在金黄色葡萄球菌感染的小鼠的骨髓外部位产生，并发现MDSCs的高糖酵解活性和高葡萄糖消耗率对其终末分化至关重要 | NA | 探讨慢性金黄色葡萄球菌感染中MDSCs的生成和维持机制 | 髓源抑制细胞（MDSCs）及其在慢性金黄色葡萄球菌感染中的代谢特征 | NA | 慢性感染 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 金黄色葡萄球菌感染的小鼠 |
| 22483 | 2024-08-08 |
CCR2 Signaling Restricts SARS-CoV-2 Infection
2021-12-21, mBio
IF:5.1Q1
DOI:10.1128/mBio.02749-21
PMID:34749524
|
研究论文 | 本文通过研究SARS-CoV-2感染的小鼠模型，发现CCR2信号通路在早期限制肺部病毒负荷中起关键作用 | 首次揭示CCR2信号通路通过促进经典单核细胞浸润和单核细胞衍生细胞的扩增，对SARS-CoV-2感染起到保护作用 | NA | 研究SARS-CoV-2感染中的固有免疫机制，特别是CCR2信号通路的作用 | SARS-CoV-2感染的小鼠模型 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | 小鼠 |
| 22484 | 2024-08-08 |
Computational workflow for functional characterization of COVID-19 through secondary data analysis
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100873
PMID:34746856
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研究论文 | 本文介绍了一种计算异构数据集成和挖掘协议，用于通过结合多个模型系统的转录组签名、蛋白质-蛋白质相互作用、单细胞RNA-seq标记和表型-基因型关联来识别功能特征复合体，以更好地理解疾病病理生理学和结果。 | 该研究提出了一种新的计算方法，通过整合多种数据类型来识别功能特征复合体，这种方法在标准转录组分析的基础上提供了更深入的分子机制洞察。 | NA | 旨在通过次级数据分析来功能性地表征COVID-19，并揭示其背后的分子机制。 | COVID-19的功能特征及其相关分子机制。 | 生物信息学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA |
| 22485 | 2024-08-08 |
Isolation of human fetal intestinal cells for single-cell RNA sequencing
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100890
PMID:34746860
|
研究论文 | 本文介绍了一种从人类胎儿肠道样本中分离上皮和非上皮细胞的方法，用于单细胞RNA测序 | 该方法能够产生一个完整的人类发育过程中肠道细胞的图谱 | NA | 开发一种高效的方法来分离人类胎儿肠道细胞，以进行单细胞RNA测序 | 人类胎儿肠道细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 多个胎儿肠道样本 |
| 22486 | 2024-08-08 |
Dissociation of human oral mucosal tissue for single-cell applications
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100908
PMID:34746866
|
研究论文 | 本文描述了一种用于制备和分离人类颊部和牙龈口腔黏膜组织的高存活率单细胞悬浮液的协议 | 提出了一种新的方法来分离口腔黏膜组织中的多种细胞类型，同时保持高细胞存活率 | NA | 开发一种有效的口腔黏膜组织单细胞分离方法 | 人类颊部和牙龈的口腔黏膜组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22487 | 2024-08-08 |
Processing human lymph node samples for single-cell assays
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100914
PMID:34746869
|
研究论文 | 本文描述了一种高效且温和的人体淋巴结样本处理方法，用于生成适合单细胞分析的单细胞悬浮液 | 该协议避免了酶促或机械应力，优化了生成适合单细胞RNA测序等精细分析的单细胞悬浮液 | NA | 为了更好地理解恶性与非恶性细胞之间的细胞异质性和复杂相互作用 | 人体淋巴结样本 | 数字病理学 | 非霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞悬浮液 | NA |
| 22488 | 2024-08-08 |
Single-cell Transcriptional Changes in Neurodegenerative Diseases
2021-12-15, Neuroscience
IF:2.9Q2
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序和单核RNA测序技术在神经退行性疾病分子变化研究中的最新进展和发现 | 利用单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，提供了脑细胞在单细胞水平上的细胞和分子细节，增进了对中枢神经系统的理解 | NA | 探讨神经退行性疾病的分子变化及其机制 | 神经退行性疾病中的单细胞转录变化 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序，单核RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22489 | 2024-08-08 |
A multi-omic single-cell landscape of human gynecologic malignancies
2021-12-02, Molecular cell
IF:14.5Q1
DOI:10.1016/j.molcel.2021.10.013
PMID:34739872
|
研究论文 | 本文通过单细胞分辨率下的转录组（scRNA-seq）和染色质可及性（scATAC-seq）分析，揭示了人类卵巢和子宫内膜肿瘤的复杂细胞异质性及其调控机制。 | 本文首次展示了恶性细胞通过获取先前未注释的调控元件来驱动癌症标志性通路，并强调了肿瘤内异质性的重要性。 | NA | 旨在解析驱动癌细胞转录程序的调控机制，以深入理解肿瘤生物学。 | 人类卵巢和子宫内膜肿瘤。 | 数字病理学 | 妇科恶性肿瘤 | scRNA-seq, scATAC-seq | NA | 转录组数据, 染色质可及性数据 | 立即手术切除的人类卵巢和子宫内膜肿瘤样本。 |
| 22490 | 2024-08-08 |
Interneuron origin and molecular diversity in the human fetal brain
2021-12, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-021-00940-3
PMID:34737447
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位测序技术，揭示了人类胎儿脑中不同类型中间神经元前体细胞的分子特征 | 首次详细描述了人类胎儿脑中中间神经元前体细胞的分子多样性及其起源 | NA | 解析人类胎儿脑中中间神经元的起源和多样性 | 人类胎儿脑中的中间神经元前体细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 原位测序 | NA | RNA | NA |
| 22491 | 2024-08-08 |
Transcription factor SOX4 facilitates BMP2-regulated gene expression during invasive trophoblast differentiation
2021-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100925RR
PMID:34739154
|
研究论文 | 本文研究了转录因子SOX4在BMP2调控侵袭性滋养层细胞分化中的作用 | 发现了SOX4作为BMP2诱导的直接靶基因，并揭示了SOX4在BMP2调控的转录网络中的新机制 | NA | 阐明BMP2在滋养层细胞侵袭和螺旋动脉重塑中的分子机制 | 早期胎盘发育中的滋养层细胞分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 第一孕期胎盘和蜕膜组织的单细胞RNA测序数据 |
| 22492 | 2024-08-08 |
Integrated molecular analysis identifies a conserved pericyte gene signature in zebrafish
2021-12-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200189
PMID:34751773
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析斑马鱼幼体中pdgfrb阳性细胞，以分子层面表征斑马鱼中的周细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了斑马鱼细胞表达小鼠周细胞基因的直系同源基因，并整合小鼠周细胞单细胞RNA测序数据，发现了一组核心的保守周细胞基因 | NA | 旨在通过分子分析确定斑马鱼周细胞的基因特征，并开发新的工具以在体内观察这些细胞 | 斑马鱼幼体中的周细胞 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 涉及斑马鱼野生型和pdgfrb突变型幼体的细胞样本 |
| 22493 | 2024-08-08 |
Gene signatures with therapeutic value: emerging perspective for personalized immunotherapy in renal cancer
2021-12, Immunotherapy
IF:2.7Q3
DOI:10.2217/imt-2021-0187
PMID:34753298
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综述 | 本文综述了肾癌个性化免疫治疗中具有预测和预后潜力的基因标志物的最新进展 | 利用单细胞测序和多维空间转录组学技术识别了临床相关的肾癌亚型，并探讨了基于免疫细胞、非编码RNA及代谢和RNA修饰途径的基因标志物的潜力 | 免疫治疗的高成本、缺乏预测性生物标志物及毒性副作用限制了其更广泛的应用 | 探讨肾癌个性化免疫治疗中具有预测和预后潜力的基因标志物 | 肾癌及其治疗中的基因标志物 | NA | 肾癌 | 单细胞测序、多维空间转录组学 | NA | 基因数据 | NA |
| 22494 | 2024-08-08 |
Complex infections in vivax malaria: the more you look, the more you find
2021-12, Trends in parasitology
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.pt.2021.10.002
PMID:34756507
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术研究了人类疟原虫Plasmodium vivax引起的复杂多克隆感染 | 开发了用于P. vivax感染的单细胞测序（SCS）的创新方法，提供了关于P. vivax宿主体内多样性和进化的新见解 | NA | 研究P. vivax引起的复杂多克隆感染 | 人类疟原虫Plasmodium vivax | NA | 疟疾 | 单细胞测序（SCS） | NA | NA | NA |
| 22495 | 2024-08-08 |
Besca, a single-cell transcriptomics analysis toolkit to accelerate translational research
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab102
PMID:34761219
|
研究论文 | 本文介绍了一个名为Besca的单细胞转录组分析工具包，旨在加速转化研究 | Besca工具包不仅提供标准的单细胞RNA测序分析流程，还包括两个互补模块，利用层次化细胞签名和监督机器学习自动进行细胞注释，并提供协调的命名法 | NA | 旨在通过高度标准化和稳健的软件工作流程，利用单细胞RNA测序技术加速转化研究 | 单细胞RNA测序数据及其在批量RNA测序数据中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 监督机器学习 | 转录组数据 | 多个多样化的单细胞RNA测序数据集，包括来自高度异质性肿瘤组织的样本 |
| 22496 | 2024-08-08 |
Correction: Single-cell RNA-seq reveals transcriptomic heterogeneity mediated by host-pathogen dynamics in lymphoblastoid cell lines
2021-Nov-11, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.75422
PMID:34762045
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22497 | 2024-08-08 |
Modeling the ACVR1R206H mutation in human skeletal muscle stem cells
2021-11-10, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.66107
PMID:34755602
|
研究论文 | 本研究通过分析ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的影响，探讨了ACVR1在骨骼肌修复中的作用 | 首次使用来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞（Hu-MuSCs）和诱导多能干细胞（iPSCs）衍生的肌肉干细胞/祖细胞（iMPCs）进行单细胞转录组分析，揭示了ACVR1突变对骨骼肌修复的影响 | NA | 阐明ACVR1突变如何影响骨骼肌修复 | ACVR1R206H突变在人体骨骼肌干细胞中的作用 | NA | 异位骨化 | 单细胞转录组分析 | NA | 细胞 | 来自尸体的原发性FOP人体肌肉干细胞和诱导多能干细胞衍生的肌肉干细胞/祖细胞 |
| 22498 | 2024-08-08 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
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研究论文 | 研究探讨了细胞因子oncostatin M（OSM）在慢性瘙痒中的作用及其机制 | 首次揭示了OSM作为瘙痒神经调节剂的作用，并提出OSM信号转导作为抗瘙痒治疗的新靶点 | NA | 探究慢性瘙痒的分子成分和机制 | 慢性瘙痒及相关皮肤病 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 22499 | 2024-08-08 |
Optimization of library preparation based on SMART for ultralow RNA-seq in mice brain tissues
2021-Nov-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08132-w
PMID:34758728
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研究论文 | 本文介绍了一种针对极低输入RNA测序的高灵敏度文库构建协议 | 使用Maxima H Minus反转录酶和rN修饰的TSO，以及所有m7G帽化的RNA模板，提高了测序灵敏度和低丰度基因检测能力 | NA | 优化文库准备方法，提高极低输入RNA测序的灵敏度和低丰度基因检测能力 | 小鼠脑组织中的极低输入RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从低至0.5 pg的总RNA样本中成功制备RNA-seq文库，并鉴定出超过2000个基因 |
| 22500 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals opposing roles of Shp2 in Myc-driven liver tumor cells and microenvironment
2021-11-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109974
PMID:34758313
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research paper | 本研究揭示了Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中扮演相反角色 | 首次展示了Myc驱动的肝细胞癌在Shp2缺失的小鼠中加剧，并依赖于Shp2维持的Ras-Erk信号通路 | NA | 探讨Myc驱动的肝癌发生机制 | Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的作用 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和肝细胞癌患者样本 |