单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22481 - 22500 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22481 | 2024-08-08 |
Structural and compositional diversity in the kainate receptor family
2021-10-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109891
PMID:34706237
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研究论文 | 本文研究了kainate受体家族的结构和组成多样性 | 首次解析了GluK1同聚体的结构，并利用单细胞RNA测序数据和单分子荧光技术研究了KAR亚单位的组合多样性和受体复合物的组成 | NA | 探讨kainate受体家族的亚单位组合和结构多样性 | kainate受体家族的亚单位及其组合 | NA | NA | 单细胞RNA测序，单分子荧光技术 | NA | RNA序列，荧光图像 | NA |
| 22482 | 2024-08-08 |
[A review on integration methods for single-cell data]
2021-Oct-25, Sheng wu yi xue gong cheng xue za zhi = Journal of biomedical engineering = Shengwu yixue gongchengxue zazhi
DOI:10.7507/1001-5515.202104073
PMID:34713670
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综述 | 本文综述了单细胞数据整合的基本原理、方法及其应用 | 探讨了现有方法的优缺点，并对未来的发展进行了展望 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序实验中无法全面捕捉所有细胞和基因信息的问题 | 单细胞RNA测序数据和多模态单细胞数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22483 | 2024-08-08 |
Integrating single cell sequencing with a spatial quantitative systems pharmacology model spQSP for personalized prediction of triple-negative breast cancer immunotherapy response
2021-Oct, Immunoinformatics (Amsterdam, Netherlands)
DOI:10.1016/j.immuno.2021.100002
PMID:34708216
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研究论文 | 本文通过整合三阴性乳腺癌患者的全外显子测序和单细胞RNA测序数据，构建空间定量系统药理学模型（spQSP），用于个性化预测免疫治疗反应 | 首次将单细胞测序数据与空间定量系统药理学模型结合，用于预测个体化免疫治疗效果 | NA | 开发一种新的方法来预测三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 三阴性乳腺癌患者的免疫治疗反应 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 定量系统药理学模型 | 基因组数据 | NA |
| 22484 | 2024-08-08 |
Identification of Key eRNAs for Spinal Cord Injury by Integrated Multinomial Bioinformatics Analysis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.728242
PMID:34708039
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研究论文 | 本研究通过多组学生物信息学分析，探讨了脊髓损伤（SCI）中关键增强子RNA（eRNAs）、转录因子（TFs）、信号通路和小分子抑制剂的作用。 | 构建了13个差异表达转录因子、6个差异表达增强子RNA、7个差异表达目标基因的调控网络，并发现了与SCI相关的潜在药物Trichostatin A。 | NA | 研究脊髓损伤中关键增强子RNA的作用及其调控机制。 | 脊髓损伤中的关键增强子RNA、转录因子、信号通路和小分子抑制剂。 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 微阵列数据分析、CIBERSORT算法、基因集变异分析（GSVA）、单细胞RNA测序（scRNA-seq）、染色质免疫沉淀测序（ChIP-seq）、转座酶可及染色质测序（ATAC-seq） | NA | 微阵列数据、scRNA-seq数据、ChIP-seq数据、ATAC-seq数据 | 27名健康志愿者和25名慢性期脊髓损伤患者的周围血单核细胞（PBMC）样本 |
| 22485 | 2024-08-08 |
Blood Immune Cell Composition Associated with Obesity and Drug Repositioning Revealed by Epigenetic and Transcriptomic Conjoint Analysis
2021, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2021.714643
PMID:34712134
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研究论文 | 本研究通过表观遗传学和转录组联合分析，探讨了肥胖相关的血液免疫细胞组成，并识别了用于肥胖管理的新型潜在药物。 | 本研究首次通过表观遗传学和转录组联合分析，揭示了肥胖患者中CD8+ T细胞和NK细胞的显著降低，并发现了11种具有肥胖控制潜力的药物。 | 研究样本量较小，仅包括35个肥胖样本和37个对照样本，可能影响结果的普遍性。 | 分析肥胖中的免疫细胞组成，并识别新型有效药物用于肥胖管理。 | 肥胖患者和健康对照的血液免疫细胞组成及药物靶点表达。 | 表观遗传学 | 肥胖 | DNA甲基化分析，mRNA表达微阵列，单细胞RNA测序，qPCR | NA | DNA甲基化数据，mRNA表达数据 | 72个样本（35个肥胖样本和37个对照样本） |
| 22486 | 2024-08-08 |
TNFSF13 Is a Novel Onco-Inflammatory Marker and Correlates With Immune Infiltration in Gliomas
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.713757
PMID:34712225
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨了TNFSF13（APRIL）在胶质瘤中的表达及其与患者预后和靶向治疗的关系 | 首次证实TNFSF13与胶质瘤中的免疫浸润和炎症反应相关，并可能作为新的诊断标志物和免疫治疗靶点 | NA | 探索TNFSF13作为胶质瘤的新诊断标志物和治疗靶点的潜力 | TNFSF13在胶质瘤中的表达及其与免疫浸润和炎症反应的关系 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22487 | 2024-08-08 |
Immune Response in Severe and Non-Severe Coronavirus Disease 2019 (COVID-19) Infection: A Mechanistic Landscape
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.738073
PMID:34721400
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研究论文 | 本文通过综合分析单细胞RNA测序数据，探讨了COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | 揭示了低密度中性粒细胞和巨核细胞在淋巴细胞和髓系细胞间对话中的关键作用，并提供了淋巴细胞和髓系细胞相互作用的详细机制见解 | NA | 阐明COVID-19感染中免疫重塑和严重反应的机制 | COVID-19患者的免疫细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自四个已发表研究的数据，包括轻度/中度和重度感染的患者 |
| 22488 | 2024-08-08 |
Phased differentiation of γδ T and T CD8 tumor-infiltrating lymphocytes revealed by single-cell transcriptomics of human cancers
2021, Oncoimmunology
IF:6.5Q1
DOI:10.1080/2162402X.2021.1939518
PMID:34721945
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，首次揭示了人类癌症中γδ T细胞与T CD8细胞的分化差异 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，展示了γδ T细胞在癌症中的分化情况，并发现其在肿瘤微环境中的分化与健康血液中的情况不同 | NA | 探讨γδ T细胞在人类癌症中的分化情况及其与免疫检查点疗法的关联 | γδ T细胞和T CD8细胞在人类癌症中的分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 约150个已发表的单细胞RNA测序数据集及人类肿瘤和小鼠模型的表型验证数据 |
| 22489 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing in Multiple Pathologic Types of Renal Cell Carcinoma Revealed Novel Potential Tumor-Specific Markers
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.719564
PMID:34722263
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，在多种病理类型的肾细胞癌中发现了新的潜在肿瘤特异性标记物 | 本研究首次在不同病理类型的肾细胞癌中识别出多种新的肿瘤特异性标记物，并验证了其在肿瘤细胞中的高表达 | 研究样本量较小，仅包括三种病理类型的肾细胞癌 | 研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肾细胞癌的潜在肿瘤特异性标记物，以指导临床治疗 | 研究对象包括三种病理类型的肾细胞癌及正常肾脏组织 | 数字病理学 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共30,263个高质量单细胞转录组信息 |
| 22490 | 2024-08-08 |
A Comprehensive Characterization of Monoallelic Expression During Hematopoiesis and Leukemogenesis via Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.702897
PMID:34722498
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，系统地研究了骨髓单个核细胞中的单等位基因表达（MAE），构建了MAE图谱，并探讨了其在造血和白血病发生中的作用 | 首次系统地研究了造血和白血病发生过程中的常染色体MAE、细胞类型特异性MAE和随机MAE，增加了对MAE特征和功能的认识 | NA | 探讨单等位基因表达在造血和白血病发生中的作用和机制 | 骨髓单个核细胞中的单等位基因表达 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 1,020个常染色体MAE，74个细胞类型特异性MAE，114个随机MAE |
| 22491 | 2024-08-08 |
Classical Dichotomy of Macrophages and Alternative Activation Models Proposed with Technological Progress
2021, BioMed research international
IF:2.6Q3
DOI:10.1155/2021/9910596
PMID:34722776
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研究论文 | 本文探讨了巨噬细胞在种植牙科中的炎症调节作用及其激活/极化状态的基础，并提出了基于先进技术的替代激活模型。 | 通过应用CyTOF、scRNA-seq和HSI等先进技术，提出了替代激活模型，有助于巨噬细胞的分型和功能基因的划分。 | NA | 探索巨噬细胞的激活模型及其在种植牙科中的应用。 | 巨噬细胞及其在种植牙科中的作用。 | 数字病理学 | NA | CyTOF, scRNA-seq, HSI | NA | 图像, 基因序列 | NA |
| 22492 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing unveils distinct immune microenvironments with CCR6-CCL20 crosstalk in human chronic pancreatitis
2022-09, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2021-324546
PMID:34702715
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术，分析了慢性胰腺炎患者胰腺组织中的免疫微环境，特别是CCR6-CCL20信号通路的作用 | 首次揭示了慢性胰腺炎中不同病因患者胰腺免疫细胞的独特特征和CCR6-CCL20轴的免疫对话 | 研究样本仅限于接受胰腺切除术的患者，可能无法完全代表所有慢性胰腺炎患者的情况 | 旨在通过单细胞测序技术揭示慢性胰腺炎中胰腺免疫反应的关键信号分子 | 慢性胰腺炎患者的胰腺免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺炎 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 包括不同病因的慢性胰腺炎患者和非慢性胰腺炎器官捐赠者的胰腺组织 |
| 22493 | 2024-08-08 |
Profiling of lung SARS-CoV-2 and influenza virus infection dissects virus-specific host responses and gene signatures
2022-06, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.01881-2021
PMID:34675048
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研究论文 | 本文利用NanoString GeoMX平台对固定石蜡包埋组织进行靶向转录组学分析，深入研究了COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部转录组图谱 | 本文展示了空间转录组学在识别组织内新基因特征方面的强大能力，为SARS-CoV-2的发病机制提供了新的见解 | NA | 更好地定义肺部对SARS-CoV-2感染的宿主反应，理解病毒发病机制，并验证临床研究中提出的潜在COVID-19生物标志物 | COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部转录组 | 数字病理学 | COVID-19 | NanoString GeoMX平台 | NA | 转录组数据 | COVID-19、大流行H1N1流感及未感染对照患者的肺部组织样本 |
| 22494 | 2024-08-08 |
Cell-Type-Specific Impact of Glucocorticoid Receptor Activation on the Developing Brain: A Cerebral Organoid Study
2022-05, The American journal of psychiatry
DOI:10.1176/appi.ajp.2021.21010095
PMID:34698522
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研究论文 | 本研究使用诱导多能干细胞（hiPSC）衍生的脑类器官模型，探讨了糖皮质激素受体（GR）激活对发育中大脑的细胞类型特异性影响。 | 首次在脑类器官模型中详细研究了GR激活对不同细胞类型的影响，并验证了其在人类神经元中的响应特征。 | 研究主要集中在体外模型，未来需要进一步的体内研究以验证这些发现。 | 探讨产前糖皮质激素暴露对发育中大脑的影响及其细胞类型特异性机制。 | 糖皮质激素受体（GR）激活对脑类器官中不同细胞类型的影响。 | 数字病理学 | 神经发育疾病 | 单细胞转录组学 | 脑类器官 | 转录组数据 | 使用了来自不同来源组织和性别的三个独立hiPSC系的脑类器官 |
| 22495 | 2024-08-08 |
Co-varying neighborhood analysis identifies cell populations associated with phenotypes of interest from single-cell transcriptomics
2022-03, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01066-4
PMID:34675423
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研究论文 | 本文介绍了一种名为共变邻域分析（CNA）的无偏方法，用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | CNA方法比基于聚类的方法更灵活，能够更敏感和准确地识别与疾病相关的细胞状态 | NA | 开发一种新的统计方法，用于从单细胞转录组数据中识别与样本属性相关的细胞群体 | 单细胞转录组数据中的细胞群体及其与样本属性的关联 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22496 | 2024-08-08 |
Multiplexed droplet single-cell sequencing (Mux-Seq) of normal and transplant kidney
2022-03, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1111/ajt.16871
PMID:34687145
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研究论文 | 本文介绍了多重液滴单细胞测序（Mux-Seq）在正常和移植肾脏组织中的应用 | Mux-Seq方法能够减少实验批次偏差和变异，即使在样本输入非常小的情况下 | NA | 研究移植排斥反应中免疫和实质细胞的特征，以及正常和移植肾脏的组织反应 | 正常和移植肾脏组织中的细胞类型 | 数字病理学 | 移植排斥反应 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | RNA | 六个正常肾脏和两个移植肾脏的组织样本 |
| 22497 | 2024-08-08 |
Pericyte Control of Blood Flow Across Microvascular Zones in the Central Nervous System
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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综述 | 本文综述了大脑微血管区域血流控制的当前知识，涉及命名问题和基于活体光学成像及单细胞转录组学的新进展 | 强调了壁细胞形态、基因表达和收缩动力学的重要区别，这些区别解释了动脉、过渡和毛细血管区域对血管活性介质反应的观察差异 | 仍有许多未解决问题，包括活体内激活不同周细胞类型的血管活性介质、周细胞-内皮细胞通讯在从毛细血管向动脉传递信号中的作用，以及神经系统疾病如何影响这些机制 | 探讨大脑微血管区域血流控制机制 | 大脑血管中的周细胞及其对血流控制的影响 | NA | NA | 活体光学成像、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 22498 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics sheds light on the identity and metabolism of developing leaf cells
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab489
PMID:34687312
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了在两种不同环境条件下生长的拟南芥幼叶细胞的转录组，揭示了发育中的叶片中不同细胞群的特征和代谢活动 | 本研究首次揭示了拟南芥幼叶中14种细胞群的单细胞转录组图谱，并提出了细胞类型特异性标记 | NA | 探索发育中的叶片中不同细胞群的转录组特征和代谢活动 | 拟南芥幼叶细胞 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 超过1,800个高质量叶片细胞 |
| 22499 | 2024-08-08 |
Specialized Mechanosensory Epithelial Cells in Mouse Gut Intrinsic Tactile Sensitivity
2022-02, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2021.10.026
PMID:34688712
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研究论文 | 本文研究了小鼠肠道中特化的机械感觉上皮细胞，探讨了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用。 | 首次揭示了Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用，并展示了其在调节肠道生理功能中的重要性。 | NA | 探究Piezo2+ EECs在肠道内在触觉敏感性中的作用及其对肠道生理功能的调节。 | 小鼠肠道中的特化感觉肠内分泌细胞（EECs）及其表达的Piezo2机械门控离子通道。 | NA | NA | 单细胞RNA测序、光遗传学、光-电生理学、器官浴槽和体内研究。 | NA | 单细胞RNA测序数据、光遗传学激活数据、电生理数据。 | 使用了转基因小鼠模型，具体样本数量未详细说明。 |
| 22500 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing and bioinformatics as tools to decipher cancer heterogenicity and mechanisms of drug resistance
2022-01, Biochemical pharmacology
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.bcp.2021.114811
PMID:34673017
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术和生物信息学分析在解析癌症异质性和药物抗性机制中的作用 | 单细胞RNA测序技术和相关的生物信息学聚类及差异表达分析为癌症研究提供了新的工具，能够在单细胞分辨率下剖析肿瘤 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在解析癌症异质性和细胞系依赖性药物抗性中的作用 | 癌症异质性和药物抗性机制 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |