单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27353 篇文献，本页显示第 22461 - 22480 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22461 | 2024-08-08 |
Mesenchymal stem cell treatment improves outcome of COVID-19 patients via multiple immunomodulatory mechanisms
2021-12, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-021-00573-y
PMID:34702946
|
研究论文 | 本研究通过随机单盲安慰剂对照的II期临床试验，验证了间充质干细胞（MSCs）治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | 本研究首次通过单细胞RNA测序分析，揭示了MSCs治疗COVID-19患者时，能够调动一种新型VNN2造血干细胞/祖细胞样（HSPC-like）细胞，并调节多种免疫细胞的功能 | NA | 验证间充质干细胞治疗COVID-19患者的临床效果及其免疫调节机制 | COVID-19患者 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 血液 | 每个组29名患者 |
| 22462 | 2024-08-08 |
[Protective macrophages : New insights into the role of synovial macrophages in inflammatory joint diseases]
2021-Dec, Zeitschrift fur Rheumatologie
IF:0.9Q4
DOI:10.1007/s00393-021-01112-1
PMID:34705071
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研究论文 | 本文探讨了滑膜巨噬细胞在炎症性关节疾病中的保护作用和抗炎功能 | 利用单细胞测序和高级显微技术，揭示了巨噬细胞在组织稳态和组织再生中的多功能性，并发现了在滑膜组织中具有保护和抗炎作用的特殊上皮样巨噬细胞群体 | NA | 研究巨噬细胞在慢性炎症疾病中的作用，特别是其在类风湿性关节炎中的保护功能 | 巨噬细胞及其在炎症性关节疾病中的作用 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22463 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-sequencing analysis of the ciliary epithelium and contiguous tissues in the mouse eye
2021-12, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2021.108811
PMID:34717927
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠眼中睫状上皮及其邻近组织的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 约一半的测序细胞来自邻近的视网膜，而非专门分离的睫状体 | 研究睫状上皮及其邻近组织的细胞类型和转录组特征 | 小鼠眼中的睫状上皮及其邻近组织 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 10,024个细胞 |
| 22464 | 2024-08-08 |
Miscell: An efficient self-supervised learning approach for dissecting single-cell transcriptome
2021-Nov-19, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2021.103200
PMID:34712916
|
研究论文 | 本文开发了Miscell，一种使用深度神经网络作为潜在特征编码器的自监督学习方法，用于从单细胞转录组中挖掘信息 | Miscell在多种聚类指标上实现了至少可比或更好的性能，并能通过深度学习方法量化基因对细胞簇的影响，识别细胞类型特异性标记 | NA | 开发一种高效的自监督学习方法，用于解析单细胞转录组 | 单细胞转录组数据 | 机器学习 | NA | 深度神经网络 | 深度学习模型 | 转录组数据 | 三个异质性数据集 |
| 22465 | 2024-08-08 |
Erratum to: Assessing heterogeneity in spatial data using the HTA index with applications to spatial transcriptomics and imaging
2021-Nov-18, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab692
PMID:34718412
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22466 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome reveals the intra-tumoral heterogeneity and regulators underlying tumor progression in metastatic pancreatic ductal adenocarcinoma
2021-Nov-03, Cell death discovery
IF:6.1Q1
DOI:10.1038/s41420-021-00663-1
PMID:34732701
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和调控肿瘤进展的关键因素 | 首次通过单细胞RNA测序技术全面描绘了转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性及其分子机制 | NA | 旨在全面描绘转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和揭示其分子机制 | 转移性胰腺导管腺癌的肿瘤内异质性和分子机制 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 6236个来自5个肝转移性胰腺导管腺癌病变的单个细胞 |
| 22467 | 2024-08-08 |
NRG1/ErbB signalling controls the dialogue between macrophages and neural crest-derived cells during zebrafish fin regeneration
2021-11-03, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26422-5
PMID:34732706
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研究论文 | 本文通过结合三重转基因斑马鱼胚胎的活体成像和单细胞RNA测序，详细绘制了斑马鱼幼体再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了NRG1/ErbB信号通路在调控巨噬细胞与神经嵴来源细胞间对话中的关键作用 | 本文首次详细绘制了斑马鱼再生尾鳍的细胞图谱，并揭示了foxd3阳性神经嵴来源细胞在再生过程中的作用及NRG1/ErbB信号通路的关键调控作用 | NA | 研究斑马鱼尾鳍再生过程中细胞多样性及特定细胞群的作用 | 斑马鱼尾鳍再生过程中的细胞类型及其相互作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞图谱 | 三重转基因斑马鱼胚胎 |
| 22468 | 2024-08-08 |
Dissecting mammalian spermatogenesis using spatial transcriptomics
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109915
PMID:34731600
|
研究论文 | 使用空间转录组学技术Slide-seq，生成小鼠和人睾丸的空间基因表达图谱，揭示了精子发生过程中的细胞类型定位和基因表达模式 | 首次利用Slide-seq技术在近单细胞分辨率下捕捉小鼠和人睾丸的空间基因表达模式，并开发了一种计算框架来精确地定位睾丸细胞类型 | NA | 揭示哺乳动物精子发生过程中的空间基因表达模式及其在糖尿病诱导的男性不育中的潜在机制 | 小鼠和人的睾丸组织 | 空间转录组学 | 糖尿病 | Slide-seq | NA | 基因表达数据 | 小鼠和人的睾丸组织样本 |
| 22469 | 2024-08-08 |
Patch-seq of mouse DRG neurons reveals candidate genes for specific mechanosensory functions
2021-11-02, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109914
PMID:34731626
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研究论文 | 本文通过结合机械敏感电流记录和单细胞RNA测序，研究了小鼠DRG神经元的机械感觉功能相关候选基因 | 本文首次将机械敏感电流记录与单细胞转录组测序相结合，实现了机械电特性与转录组定义的神经元群体之间的一一对应 | 本文的敲降实验排除了Tmem120a和Tmem150c作为感觉神经元中机械敏感电流的介导因子，但未进一步验证其他候选基因 | 揭示特定机械感觉功能的分子机制 | 小鼠DRG神经元的机械感觉功能 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种机械感觉神经元亚型 |
| 22470 | 2024-08-08 |
Pancreatic beta cell neogenesis: Debates and updates
2021-11-02, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2021.10.007
PMID:34731654
|
研究论文 | 本文探讨了成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性再生来源 | Gribben等人（2021）通过谱系追踪和单细胞RNA测序方法，报告了Ngn3表达的导管细胞可以作为成年胰腺中新β细胞的前体 | NA | 寻找成年胰腺中胰岛素产生β细胞的内源性可再生来源 | 成年胰腺中的β细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22471 | 2024-08-08 |
Integrative analysis methods for spatial transcriptomics
2021-11, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-021-01272-7
PMID:34711969
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22472 | 2024-08-08 |
Skin inflammation activates intestinal stromal fibroblasts and promotes colitis
2021-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI147614
PMID:34720087
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人类和小鼠的炎症性肠病（IBD）中的成纤维细胞，揭示了肠道炎症促进部分肠道基质成纤维细胞分化为具有先天抗菌宿主防御活性的前脂肪细胞，并且这一过程在皮肤炎症时加剧 | 首次揭示了皮肤炎症通过激活肠道基质成纤维细胞和改变粪便微生物组，促进过度的反应性脂肪生成和增加结肠炎症，这一发现为皮肤炎症与IBD之间的关联提供了新的机制解释 | NA | 探索皮肤炎症与炎症性肠病之间的关联机制 | 人类和小鼠的成纤维细胞 | NA | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和小鼠的成纤维细胞样本 |
| 22473 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis revealed that IL4I1 promoted ovarian cancer progression
2021-10-30, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-021-03123-7
PMID:34717685
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析揭示了IL4I1在卵巢癌进展中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析，构建了包含10个预后特异性基因的风险评分模型，并验证了IL4I1在卵巢癌进展中的重要作用 | NA | 探讨卵巢癌的遗传异质性及其对预后的影响 | 卵巢癌及其相关基因IL4I1 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO Cox回归算法 | RNA测序数据 | 2397个恶性上皮基因，2个验证队列 |
| 22474 | 2024-08-08 |
A preliminary study of KAT2A on cGAS-related immunity in inflammation amplification of systemic lupus erythematosus
2021-10-30, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04323-1
PMID:34718330
|
研究论文 | 本研究探讨了KAT2A在系统性红斑狼疮（SLE）炎症放大中与cGAS相关免疫的作用 | 首次探索了KAT2A在SLE中的作用及其与cGAS通路的关系，并揭示了KAT2A调控cGAS的机制 | NA | 研究KAT2A在SLE炎症放大中的作用及其与cGAS相关免疫的模式 | 系统性红斑狼疮患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | 免疫学 | 系统性红斑狼疮 | RNA测序、单细胞RNA测序、RT-PCR、Western blot、免疫荧光、免疫组织化学、ELISA、质谱 | NA | RNA、蛋白质 | 涉及SLE患者的外周血单个核细胞 |
| 22475 | 2024-08-08 |
Ectopic expression of Irx3 and Irx5 in the paraventricular nucleus of the hypothalamus contributes to defects in Sim1 haploinsufficiency
2021-Oct-29, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abh4503
PMID:34705510
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了下丘脑室旁核（PVH）神经元的分子特征，并探讨了Irx3和Irx5基因异位表达在Sim1单倍体不足中的作用。 | 首次揭示了Irx3和Irx5基因在PVH神经元中的异位表达对Sim1单倍体不足引起的缺陷的贡献。 | NA | 研究Sim1单倍体不足引起的PVH神经元功能障碍的分子机制。 | 下丘脑室旁核神经元及其在能量稳态调控中的作用。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22476 | 2024-08-08 |
Over 1000 tools reveal trends in the single-cell RNA-seq analysis landscape
2021-10-29, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-021-02519-4
PMID:34715899
|
研究论文 | 本文更新了单细胞RNA测序（scRNA-seq）分析工具数据库的状态，并展示了该领域的演变趋势 | 本文首次记录了超过1000种scRNA-seq分析工具，并分析了该领域的演变和焦点变化 | NA | 研究scRNA-seq分析工具的发展趋势和领域焦点变化 | scRNA-seq分析工具及其在科学实践中的应用 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | 超过1000种工具 |
| 22477 | 2024-08-08 |
BAMboozle removes genetic variation from human sequence data for open data sharing
2021-10-28, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26152-8
PMID:34711808
|
研究论文 | 开发了一种名为BAMboozle的工具，用于从人类序列数据中移除敏感的遗传信息，以促进生命科学领域的开放数据共享 | BAMboozle工具能够有效地移除样本中的遗传序列变异，同时保留原始序列数据的其他重要方面，如基因表达特征和剪接动力学信息 | NA | 旨在解决人类遗传数据在开放共享时可能带来的重新识别风险问题 | 人类序列数据中的遗传变异信息 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq） | NA | 序列数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22478 | 2024-08-08 |
Characterization of hormone-producing cell types in the teleost pituitary gland using single-cell RNA-seq
2021-10-28, Scientific data
IF:5.8Q1
DOI:10.1038/s41597-021-01058-8
PMID:34711832
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型进行了特征描述 | 首次通过单细胞测序技术详细定义了雌性和雄性硬骨鱼脑下垂体中的15和16种不同细胞类型 | NA | 揭示硬骨鱼脑下垂体中激素产生细胞类型的特征及其调控机制 | 硬骨鱼脑下垂体的激素产生细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 2592个雌性样本和3804个雄性样本 |
| 22479 | 2024-08-08 |
Smoking Modulates Different Secretory Subpopulations Expressing SARS-CoV-2 Entry Genes in the Nasal and Bronchial Airways
2021-Oct-28, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-887718/v1
PMID:34729557
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研究论文 | 研究探讨了吸烟对鼻腔和支气管通道中表达SARS-CoV-2进入基因的分泌亚群的影响 | 首次全面分析了鼻腔和支气管样本中SARS-CoV-2进入基因（ACE2、TMPRSS2和CTSL）表达的相似性和差异性 | 研究仅基于肺部筛查或诊断工作中的个体样本，可能存在样本选择偏倚 | 探究吸烟如何影响鼻腔和支气管通道中SARS-CoV-2进入基因的表达 | 鼻腔和支气管通道中的SARS-CoV-2进入基因表达 | 数字病理学 | 肺部疾病 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 793个鼻腔样本和1,673个支气管样本 |
| 22480 | 2024-08-08 |
Myeloid cells in COVID-19 microenvironment
2021-10-27, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-021-00792-0
PMID:34707085
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综述 | 本文综述了COVID-19患者外周血、肺组织和脑脊液的单细胞测序结果，并描述了患者中髓系细胞的分化轨迹及其异常分化促进疾病进展的功能和机制 | NA | NA | 探讨髓系细胞在COVID-19微环境中的作用及其在疾病进展中的机制 | COVID-19患者的髓系细胞及其在疾病中的作用 | NA | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 外周血、肺组织和脑脊液的单细胞数据 | NA |