单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 22441 - 22460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22441 | 2024-08-08 |
Discovery and construction of prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on single-cell and bulk transcriptome analysis
2021-Sep, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-581
PMID:34733651
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量转录组分析，发现并构建了透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 本研究整合了单细胞和批量转录组数据，发现了两种具有不同生物学特性的透明细胞肾细胞癌亚型及两个潜在的生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | NA | 发现透明细胞肾细胞癌的新生物标志物并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 5,933个细胞 |
| 22442 | 2024-08-08 |
Identification of the distinctive role of DPT in dilated cardiomyopathy: a study based on bulk and single-cell transcriptomic analysis
2021-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2913
PMID:34733953
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，识别了DPT在扩张型心肌病中的独特作用 | 首次揭示了DPT在扩张型心肌病中的关键作用，并提出了DPT+成纤维细胞作为心脏重塑过程的新调节因子 | NA | 旨在通过批量和单细胞转录组分析，寻找扩张型心肌病中的潜在关键基因和调节因子 | 扩张型心肌病中的关键基因和调节因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | LASSO回归, SVM-RFE, PPI网络 | 转录组数据 | 使用了三个微阵列数据集（GSE57338, GSE42955, GSE79962）和一个验证数据集（GSE116250），以及两个单细胞RNA测序数据集（GSE109816和GSE121893） |
| 22443 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of a Malignant Cell Subset Marker-Based Polygenic Risk Score in Stomach Adenocarcinoma Through Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720649
PMID:34733840
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研究论文 | 本研究旨在基于恶性细胞标记物的表达，构建胃腺癌（STAD）患者不良生存的多元风险评分（PRS） | 通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了胃腺癌中有限的但显著的肿瘤内异质性，并提出了一种基于恶性细胞亚群标记物的PRS | NA | 构建并验证基于恶性细胞标记物的多元风险评分，以预测胃腺癌患者的预后 | 胃腺癌患者的恶性细胞标记物及其预后影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及胃腺癌和正常胃组织的批量和单细胞RNA测序数据，以及两个独立的外部验证数据集 |
| 22444 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell Bioinformatics Analysis Reveals Intrinsic and Extrinsic Biological Characteristics of Hematopoietic Stem Cell Aging
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745786
PMID:34737765
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研究论文 | 本研究通过整合三个独立的造血干细胞（HSC）单细胞转录组数据集，揭示了HSC衰老的内在和外在生物学特征 | 首次识别出Stat3和Ifngr1作为偏向凋亡和炎症的衰老HSC的标志物，并发现Skp2诱导的信号通路在衰老HSC中加速G1期过渡 | NA | 阐明造血干细胞衰老的生物学特征及其潜在的标志物和治疗靶点 | 造血干细胞（HSC）的衰老机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立的HSC单细胞转录组数据集 |
| 22445 | 2024-08-08 |
Discussion of "Exponential-family Embedding with Application to Cell Developmental Trajectories for Single-cell RNA-seq Data"
2021, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1880920
PMID:34744216
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comments | 本文讨论了指数族奇异值分解（eSVD）在单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹应用的新方法及其面临的挑战 | eSVD提供了一个灵活的降维框架，能够处理单参数指数族分布并已证明其一致性 | 本文讨论了eSVD及其他类似方法在未来需要解决的多个开放问题和挑战 | 探讨eSVD及其类似方法的潜力和未来研究方向 | eSVD方法及其在数据分析中的应用 | NA | NA | 指数族奇异值分解（eSVD） | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 22446 | 2024-08-08 |
Meta-Analysis Reveals Transcription Factor Upregulation in Cells of Injured Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.688243
PMID:34744629
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meta-analysis | 本研究通过分析四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，识别并验证了在小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中至少两倍上调的55个转录因子 | 首次系统地分析了小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中转录因子的上调情况，并通过单细胞RNA测序数据进行了验证 | NA | 旨在理解关键转录因子在外周神经再生中的功能，并为未来研究设计提供实验依据 | 小鼠坐骨神经损伤后的转录因子上调情况 | NA | NA | 微阵列数据分析，mRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，以及单细胞RNA测序数据集 |
| 22447 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22448 | 2024-08-08 |
Ductal Macrophages Predominate in the Immune Landscape of the Lactating Mammary Gland
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.754661
PMID:34745127
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研究论文 | 本文通过结合单细胞RNA测序、流式细胞术和三维共聚焦显微镜技术，研究了哺乳期小鼠乳腺组织的免疫景观，发现巨噬细胞在免疫细胞中占主导地位，并可分为至少两种亚型：导管和基质巨噬细胞 | 首次精确描述了哺乳期乳腺组织的免疫组成，特别是导管巨噬细胞的高比例及其在乳腺免疫中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 研究哺乳期乳腺组织的免疫组成，以改进乳腺炎的预防和治疗策略 | 哺乳期小鼠乳腺组织的免疫细胞组成 | 数字病理学 | 乳腺炎 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、三维共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 未明确提及具体样本数量 |
| 22449 | 2024-08-08 |
The Single-Cell Sequencing: A Dazzling Light Shining on the Dark Corner of Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.759894
PMID:34745998
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研究论文 | 本文讨论了单细胞测序（SCS）在肿瘤研究中的应用及其对肿瘤内异质性（ITH）的理解 | SCS能够测量单个细胞中的基因组序列分布和肿瘤细胞间的遗传变异性，从而提高对ITH的理解 | NA | 探讨SCS的进展及其在肿瘤中的应用 | 肿瘤细胞及其遗传变异性和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组序列 | 单个细胞 |
| 22450 | 2024-08-08 |
Data-Driven Modeling of Breast Cancer Tumors Using Boolean Networks
2021, Frontiers in big data
IF:2.4Q2
DOI:10.3389/fdata.2021.656395
PMID:34746770
|
研究论文 | 本文提出了一种基于布尔网络的数据驱动模型，用于模拟乳腺癌肿瘤 | 结合单细胞RNA测序和相互作用组数据，研究上调基因的恶性子网络动态 | NA | 开发一种方法来检测与恶性吸引子稳定性相关的关键基因，这些基因的抑制可能应用于癌症治疗 | 乳腺癌肿瘤 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA-seq | 布尔网络 | 基因表达数据 | 来自癌症基因组图谱的单细胞乳腺癌数据集 |
| 22451 | 2024-08-08 |
Heterogeneity and Molecular Markers for CNS Glial Cells Revealed by Single-Cell Transcriptomics
2022-Nov, Cellular and molecular neurobiology
IF:3.6Q2
DOI:10.1007/s10571-021-01159-3
PMID:34704168
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综述 | 本文综述了通过单细胞转录组学技术揭示的中枢神经系统（CNS）胶质细胞的异质性和分子标志物 | 利用单细胞测序技术（scRNA-seq）从转录组层面扩展了对胶质细胞异质性的理解 | NA | 总结CNS中主要胶质细胞的标志基因，并揭示其在不同物种、CNS区域、发育阶段和病理状态下的异质性 | 中枢神经系统中的胶质细胞，包括星形胶质细胞、少突胶质细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | NA |
| 22452 | 2024-08-08 |
Translational pediatrics: clinical perspective for Phelan-McDermid syndrome and autism research
2022-08, Pediatric research
IF:3.1Q1
DOI:10.1038/s41390-021-01806-x
PMID:34702975
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研究论文 | 本文探讨了Phelan-McDermid综合征（PMS）及其与自闭症谱系障碍（ASD）的关系，利用诱导多能干细胞（iPS）技术开发脑类器官和微胶质细胞，并通过单细胞RNA测序探索神经发育障碍的病理生理学 | 利用iPS细胞技术开发脑类器官和微胶质细胞，以及通过单细胞RNA测序揭示人类特异性基因在皮质发育中的独特表达 | NA | 旨在通过患者来源的疾病模型识别SHANK3在人类大脑发育中的未知功能，并为PMS和其他疾病提供治疗见解 | Phelan-McDermid综合征患者及其脑类器官和微胶质细胞 | 数字病理学 | 自闭症 | 单细胞RNA测序 | 脑类器官 | 细胞 | NA |
| 22453 | 2024-08-08 |
Nuclear Factor I in neurons, glia and during the formation of Müller glia-derived progenitor cells in avian, porcine and primate retinas
2022-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25270
PMID:34729776
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研究论文 | 研究探讨了核因子I（NFI）在不同发育阶段和损伤后的鸡视网膜中的表达模式，以及在猪和猴视网膜中的表达情况 | 首次详细描述了NFI在鸡、猪和猴视网膜中的表达模式，并提出NFI可能抑制鸡视网膜中Müller胶质细胞衍生前体细胞（MGPCs）的神经发生潜力 | 研究主要集中在NFI的表达模式上，未深入探讨NFI如何具体抑制MGPCs的神经发生潜力 | 研究NFI在不同物种视网膜中的表达模式及其对MGPCs神经发生潜力的影响 | 鸡、猪和猴的视网膜中的NFI表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和免疫标记 | NA | RNA | 包括鸡、猪和猴的视网膜样本 |
| 22454 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing of Bone Marrow Mesenchymal Stem Cells from the Elderly People
2022-May-30, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc21042
PMID:34711696
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术将6,514个老年人的骨髓间充质干细胞分为三个集群，并分析了各集群的基因表达谱和功能 | 首次使用单细胞RNA测序技术揭示了骨髓间充质干细胞的异质性及其不同的细胞亚群 | NA | 探究骨髓间充质干细胞的细胞亚群及其功能 | 老年人的骨髓间充质干细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6,514个骨髓间充质干细胞 |
| 22455 | 2024-08-08 |
Data-driven comparison of multiple high-dimensional single-cell expression profiles
2022-Apr, Journal of human genetics
IF:2.6Q2
DOI:10.1038/s10038-021-00989-9
PMID:34719682
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研究论文 | 本文提出了一种完全数据驱动的计算生物学方法，用于比较多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据，以阐明疾病机制。 | 该方法克服了传统基于细胞子集比较的挑战，并促进了机器学习和基因集分析等进一步分析。 | NA | 旨在通过比较多个单细胞表达数据集来阐明疾病机制。 | 研究对象为多个高维单细胞表达数据集，如流式细胞术和scRNA-seq数据。 | 生物信息学 | NA | NA | NA | 表达数据 | NA |
| 22456 | 2024-08-08 |
NKG2A is a late immune checkpoint on CD8 T cells and marks repeated stimulation and cell division
2022-02-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33859
PMID:34716584
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研究论文 | 研究探讨了NKG2A作为CD8 T细胞上的晚期免疫检查点，及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 揭示了NKG2A作为晚期抑制受体的表达动力学，及其与TIM-3和CD39的共同表达模式 | 研究主要基于体外实验和单细胞转录组数据，未涵盖所有可能的体内环境 | 阐明NKG2A在CD8 T细胞中的表达模式及其在肿瘤免疫治疗中的潜在作用 | NKG2A在CD8 T细胞上的表达及其与细胞分裂和重复刺激的关系 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 涉及人类肿瘤浸润淋巴细胞（TILs）的单细胞转录组数据 |
| 22457 | 2024-08-08 |
Paligenosis: Cellular Remodeling During Tissue Repair
2022-02-10, Annual review of physiology
IF:15.7Q1
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研究论文 | 本文讨论了在组织修复过程中，新兴技术如何挑战了组织更新是由驻留干细胞单向分化的概念，并强调了细胞可塑性在组织更新中的核心作用。 | 提出了细胞可塑性作为组织更新的中心机制，并介绍了进化上保守的程序——paligenosis，成熟细胞通过这一程序重新进入细胞周期并再生受损组织。 | 文章指出，细胞可塑性虽然有益，但也带来了风险，如长期存活的细胞在周期性增殖和再分化过程中可能积累并传播获得性突变，增加癌症风险。 | 探讨细胞在组织修复过程中的重塑机制，并提出新的细胞增殖模式分类框架。 | 多细胞生物在稳态和修复过程中的细胞更新机制。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22458 | 2024-08-08 |
Mapping the genomic diaspora of gastric cancer
2022-02, Nature reviews. Cancer
DOI:10.1038/s41568-021-00412-7
PMID:34702982
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综述 | 本文综述了胃癌基因组学的最新进展，包括非编码变异、表观遗传异常和转录组改变，并探讨了这些改变如何与环境影响、遗传因素和肿瘤微环境相互作用 | 介绍了单细胞测序和液体活检等技术在胃癌治疗抵抗机制和临床前靶点识别中的应用 | 需要设计特定的胃癌队列，将多模态基因组数据与治疗挑战和患者结果的纵向数据相结合 | 提高对胃癌发展生物学机制的理解，并推动胃癌精准肿瘤学和预防的临床举措 | 胃癌的基因组学特征及其与环境、遗传因素和肿瘤微环境的相互作用 | NA | 胃癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22459 | 2024-08-08 |
Profiling the specificity of clonally expanded plasma cells during chronic viral infection by single-cell analysis
2022-02, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202149331
PMID:34727578
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组和抗体谱测序研究了慢性病毒感染后小鼠骨髓浆细胞的克隆扩增特异性 | 首次通过单细胞测序技术全面描述了浆细胞的基因型、表型和抗体谱特征，并揭示了慢性病毒感染诱导的浆细胞克隆扩增和交叉反应性抗体的产生 | 研究仅限于小鼠模型，可能需要进一步的人体研究来验证结果 | 探讨慢性病毒感染期间浆细胞的克隆扩增特异性及其对抗体反应的影响 | 小鼠骨髓浆细胞及其在慢性淋巴细胞性脉络膜脑膜炎病毒感染后的抗体谱 | NA | NA | 单细胞转录组测序，抗体谱测序 | NA | 基因表达数据，抗体序列数据 | 数千个浆细胞 |
| 22460 | 2024-08-08 |
Systems biological assessment of altered cytokine responses to bacteria and fungi reveals impaired immune functionality in schizophrenia
2022-02, Molecular psychiatry
IF:9.6Q1
DOI:10.1038/s41380-021-01362-0
PMID:34728799
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研究论文 | 本研究通过系统生物学方法评估了精神分裂症患者对细菌和真菌的细胞因子反应变化，揭示了其免疫功能障碍的分子和细胞基础。 | 首次系统比较了精神分裂症患者与对照组的外周血单个核细胞对不同病原体的细胞因子反应，并利用单细胞RNA测序技术揭示了免疫细胞亚群中的广泛抑制和受损的趋化因子/细胞因子受体相互作用网络。 | 研究主要集中在细胞和分子层面，未涉及更广泛的临床症状或治疗效果的评估。 | 旨在深入理解精神分裂症中的免疫变化和分子通路。 | 精神分裂症患者和对照组的外周血单个核细胞对细菌、真菌及纯化微生物配体的细胞因子反应。 | 免疫学 | 精神分裂症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 具体样本数量未在摘要中明确提及 |