单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28527 篇文献，本页显示第 22421 - 22440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22421 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the diversity and biology of valve cells in cardiac valve disease
2023-01, Journal of cardiology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.jjcc.2022.03.012
PMID:35414472
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综述 | 本文综述了心脏瓣膜疾病中瓣膜细胞的多样性和生物学特性，特别关注使用单细胞RNA测序技术发现的瓣膜细胞异质性和功能 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了瓣膜细胞的异质性和功能，为个性化治疗心脏瓣膜疾病提供了新的见解 | 文章主要为综述性质，未提供新的实验数据或研究结果 | 深入理解心脏瓣膜疾病的病理生物学，以开发更好的替代疗法 | 心脏瓣膜疾病中的瓣膜细胞 | 数字病理学 | 心脏瓣膜疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 22422 | 2024-08-08 |
YY1 safeguard multidimensional epigenetic landscape associated with extended pluripotency
2022-11-28, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac230
PMID:35425987
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研究论文 | 本研究探讨了YY1在扩展多能干细胞（EPSCs）中的转录调控机制及其对表观遗传景观的影响 | 发现YY1在EPSCs中绑定到特定的开放染色质区域，其缺失导致基因表达模式更接近胚胎干细胞（ESCs），并触发一系列表观遗传交叉活动 | NA | 揭示YY1在扩展多能性相关的多维表观遗传交叉中的关键调节作用 | 扩展多能干细胞（EPSCs）和YY1蛋白 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22423 | 2024-08-08 |
Fibroblast-Secreted Phosphoprotein 1 Mediates Extracellular Matrix Deposition and Inhibits Smooth Muscle Cell Contractility in Marfan Syndrome Aortic Aneurysm
2022-Oct, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-022-10239-8
PMID:35414038
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研究论文 | 本文研究了纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）在马方综合征（MFS）胸主动脉瘤（TAA）中对细胞外基质（ECM）沉积和抑制平滑肌细胞收缩性的作用。 | 通过转录组测序和单细胞测序数据分析，发现了Spp1在MFS TAA中的增加，并探讨了其通过Itga8/Itgb1调节纤维母细胞和平滑肌细胞间通信的机制。 | NA | 探讨马方综合征胸主动脉瘤中细胞外基质稳态破坏的机制。 | 纤维母细胞分泌的磷蛋白1（Spp1）及其在马方综合征胸主动脉瘤中的作用。 | NA | 马方综合征 | 转录组测序，单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用Fbn1小鼠模型和MFS患者的样本 |
| 22424 | 2024-08-08 |
Glioblastoma scRNA-seq shows treatment-induced, immune-dependent increase in mesenchymal cancer cells and structural variants in distal neural stem cells
2022-09-01, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac085
PMID:35416251
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序分析了新发和复发的胶质母细胞瘤及其邻近的侧脑室区，揭示了治疗诱导的免疫依赖性间质癌细胞增加和远端神经干细胞中的结构变异 | 发现了胶质母细胞瘤神经谱系的富集，免疫细胞和反应性星形胶质细胞在早期复发中的作用，以及远端神经干细胞中存在的染色体异常 | NA | 探究胶质母细胞瘤在治疗前后的细胞层次结构和肿瘤微环境的变化 | 新发和复发的胶质母细胞瘤及其邻近的侧脑室区 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22425 | 2024-08-08 |
The promising role of new molecular biomarkers in prostate cancer: from coding and non-coding genes to artificial intelligence approaches
2022-09, Prostate cancer and prostatic diseases
IF:5.1Q1
DOI:10.1038/s41391-022-00537-2
PMID:35422101
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综述 | 本文综述了通过转录组学、基因组学和人工智能发现新的分子生物标志物的最新进展，旨在改善前列腺癌患者的临床管理 | 文章介绍了新的分子标志物如mRNAs、microRNAs、lncRNAs和重复序列的搜索变化，以及人工智能在分析和理解测序数据中的应用 | NA | 提供关于通过转录组学、基因组学和人工智能发现新的分子生物标志物的最新进展的概述 | 前列腺癌的新分子标志物及其在诊断、预后和治疗预测中的应用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | RNA-Seq, 全基因组测序, 外显子测序, 空间转录组学 | 机器学习, 深度学习 | 基因组数据, 转录组数据 | NA |
| 22426 | 2024-08-08 |
Uncoupling immune trajectories of response and adverse events from anti-PD-1 immunotherapy in hepatocellular carcinoma
2022-09, Journal of hepatology
IF:26.8Q1
DOI:10.1016/j.jhep.2022.03.039
PMID:35430299
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研究论文 | 本研究旨在解析接受抗PD-1免疫治疗的肝细胞癌患者中，免疫反应轨迹和免疫相关不良事件的机制 | 本研究识别了抗PD-1免疫检查点阻断治疗在肝细胞癌患者中的早期临床反应预测因子，并提供了这些免疫亚群在反应与毒性之间界面的免疫轨迹的机制见解 | NA | 解析肝细胞癌患者在接受抗PD-1免疫治疗时的免疫反应轨迹和免疫相关不良事件的机制 | 肝细胞癌患者在接受抗PD-1免疫治疗时的免疫反应和免疫相关不良事件 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 流式细胞术、单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | 血液样本、肿瘤活检 | 60份血液样本，32名患者（新加坡队列），29名患者（韩国独立队列），20份肿瘤活检 |
| 22427 | 2024-08-08 |
MarcoPolo: a method to discover differentially expressed genes in single-cell RNA-seq data without depending on prior clustering
2022-07-08, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac216
PMID:35420135
|
研究论文 | 本文提出了一种名为MarcoPolo的方法，用于在单细胞RNA测序数据中识别差异表达基因，无需依赖先前的聚类 | MarcoPolo方法通过评估基因表达分布是否为双峰、是否存在相似表达模式以及表达细胞在低维空间中是否接近，独立于先前的聚类来识别信息性差异表达基因 | 标准分析流程中的聚类步骤可能导致不完美的聚类结果，进而影响后续步骤，特别是对于那些全局结构相似的细胞类型 | 开发一种不依赖于先前聚类的方法，以识别单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 单细胞RNA测序数据中的差异表达基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用带有FACS纯化细胞标签的真实数据集进行验证 |
| 22428 | 2024-08-08 |
Peripheral B-cell dysregulation is associated with relapse after long-term quiescence in patients with multiple sclerosis
2022-07, Immunology and cell biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1111/imcb.12552
PMID:35416319
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研究论文 | 本研究利用质谱流式细胞术和单细胞RNA测序分析了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）患者在阿仑单抗治疗前后及复发期间的B细胞变化 | 首次详细描述了IgA和IgG B细胞在RRMS患者中的异常变化及其在疾病复发中的作用，并展示了阿仑单抗治疗后这些细胞的恢复情况 | 研究仅限于RRMS患者，且样本量未在摘要中明确提及，可能影响结果的普遍性 | 探讨B细胞在多发性硬化症复发中的作用及阿仑单抗治疗的影响 | 复发缓解型多发性硬化症患者的B细胞 | NA | 多发性硬化症 | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 22429 | 2024-08-08 |
Analyses of murine lymph node endothelial cell subsets using single-cell RNA sequencing and spectral flow cytometry
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101267
PMID:35403006
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研究论文 | 本文介绍了一种酶消化淋巴结、富集基质细胞、分离血内皮细胞（BECs）及处理BEC相关数据用于现代分析方法的逐步协议，包括光谱流式细胞术和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 采用单细胞RNA测序和光谱流式细胞术分析小鼠淋巴结内皮细胞亚群 | NA | 描述一种用于分析淋巴结血内皮细胞的实验协议 | 小鼠淋巴结内的血内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），光谱流式细胞术 | NA | RNA | NA |
| 22430 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Unveils the Clonal and Transcriptional Landscape of Cutaneous T-Cell Lymphomas
2022-06-13, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-21-4437
PMID:35421230
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，揭示了皮肤T细胞淋巴瘤中的克隆性和转录组景观 | 首次在单细胞水平上直接评估了蕈样肉芽肿/塞扎里综合征患者样本中恶性T细胞克隆和反应性T淋巴细胞的转录组特征 | NA | 旨在通过单细胞RNA测序技术，揭示皮肤T细胞淋巴瘤的克隆性和转录组特征，为个性化治疗提供新的潜在靶点 | 蕈样肉芽肿和塞扎里综合征患者的皮肤和血液样本中的CD3+淋巴细胞 | 数字病理学 | 皮肤T细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个蕈样肉芽肿和塞扎里综合征患者的皮肤和血液样本 |
| 22431 | 2024-08-08 |
Landscape of the Peripheral Immune Response Induced by Local Microwave Ablation in Patients with Breast Cancer
2022-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202200033
PMID:35403824
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研究论文 | 本研究通过临床试验探讨微波消融（MWA）治疗早期乳腺癌的效果及其诱导的外周免疫反应 | 首次详细报道了微波消融治疗乳腺癌后诱导的免疫反应，包括NK细胞和CD8 T细胞的激活，以及B细胞和CD4 T细胞之间增强的相互作用 | 研究样本量较小，仅包括六名患者，可能影响结果的普遍性 | 确定微波消融治疗早期乳腺癌的效果及其对患者外周免疫系统的影响 | 早期乳腺癌患者的外周血单个核细胞（PBMCs） | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 六名患者 |
| 22432 | 2024-08-08 |
More than Just a Monolayer: the Multifaceted Role of Endothelial Cells in the Pathophysiology of Atherosclerosis
2022-06, Current atherosclerosis reports
IF:5.7Q1
DOI:10.1007/s11883-022-01023-9
PMID:35404040
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综述 | 本文综述了内皮细胞在动脉粥样硬化发病机制中的多重作用 | 通过使用单细胞测序、表观遗传学和细胞命运图谱等尖端技术，发现了新的调控机制和内皮细胞表型，挑战了传统的内皮细胞激活概念 | NA | 总结内皮细胞在动脉粥样硬化中的当前见解 | 内皮细胞在动脉粥样硬化的多重作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序, 表观遗传学, 细胞命运图谱 | NA | NA | NA |
| 22433 | 2024-08-08 |
Advances and applications of single-cell omics technologies in plant research
2022-06, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15772
PMID:35426954
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研究论文 | 本文介绍了单细胞组学技术在植物研究中的最新进展和应用，特别是单细胞基因组和转录组测序技术 | 本文通过基准研究突出了单细胞组学技术在植物生物学中的应用进展 | NA | 介绍单细胞组学技术在植物研究中的应用和未来发展 | 单细胞基因组和转录组测序技术 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组和蛋白质组数据 | 数百万个细胞 |
| 22434 | 2024-08-08 |
Spectral clustering of single cells using Siamese nerual network combined with improved affinity matrix
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac113
PMID:35419595
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研究论文 | 本文提出了一种基于元学习的模型SiaClust，结合Siamese卷积神经网络和改进的谱聚类方法，用于单细胞RNA测序数据的细胞类型检测 | SiaClust通过比较样本间的相似性来突出细胞类型间的差异，同时模糊细胞类型内的差异，更适合处理高维和不平衡的数据 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型检测的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | CNN | 数据 | 使用九种不同物种和组织的单细胞RNA测序数据进行评估 |
| 22435 | 2024-08-08 |
TedSim: temporal dynamics simulation of single-cell RNA sequencing data and cell division history
2022-05-06, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac235
PMID:35412632
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研究论文 | 本文介绍了TedSim，一个模拟单细胞RNA测序数据和细胞分裂历史的时序动态模拟器 | TedSim能够同时生成每个单细胞的谱系条形码和基因表达数据，连接谱系追踪和轨迹推断两个问题 | 需要开发更好的整合基因表达和条形码数据的方法 | 研究细胞分化中的时序动态 | 单细胞RNA测序数据和细胞分裂历史 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9基因编辑 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22436 | 2024-08-08 |
Human pluripotent stem cell-derived kidney organoids for personalized congenital and idiopathic nephrotic syndrome modeling
2022-05-01, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200198
PMID:35417019
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研究论文 | 本研究利用人多能干细胞衍生的肾脏类器官模型，模拟先天性和特发性肾病综合征的病理过程 | 通过混合培养协议获得的类器官足细胞在单细胞RNA测序、超分辨率成像和电子显微镜下显示出与成人足细胞相似的特征，优于二维培养的足细胞 | NA | 研究先天性和特发性肾病综合征的病理机制 | 人多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 数字病理学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序, 超分辨率成像, 电子显微镜 | NA | 类器官 | 从携带杂合NPHS2突变的患者细胞中培养的类器官 |
| 22437 | 2024-08-08 |
Suppressed COP9 signalosome 5 promotes hemocyte proliferation through Cyclin E in the early G1 phase to defend against bacterial infection in crab
2022-05, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101710RRRR
PMID:35429011
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研究论文 | 本研究报道了在中华绒螯蟹中，细菌感染诱导血细胞增殖，并通过抑制EsCsn5表达促进细胞周期早期G1阶段的Cyclin E表达，以增强免疫防御 | 首次揭示了EsCsn5在中华绒螯蟹血细胞增殖中的负调控作用，并通过调控Cyclin E的泛素化降解而非转录来影响细胞周期 | 研究主要集中在EsCsn5对血细胞增殖的影响，未涉及其他可能的免疫调控机制 | 探讨细菌感染下中华绒螯蟹血细胞增殖的分子机制 | 中华绒螯蟹的血细胞及EsCsn5和Cyclin E的表达调控 | NA | NA | 流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及不同组织的中华绒螯蟹样本 |
| 22438 | 2024-08-08 |
Integrated analysis of single-cell RNA-seq dataset and bulk RNA-seq dataset constructs a prognostic model for predicting survival in human glioblastoma
2022-05, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.2575
PMID:35429411
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序数据集和批量RNA测序数据集，构建了一个预测人类胶质母细胞瘤患者生存率的预后模型 | 该研究首次结合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建了一个更为精确的预后模型，能够更准确地反映肿瘤核心和周边区域的差异 | NA | 开发一个可靠的模型来预测新胶质母细胞瘤患者的生存概率 | 人类胶质母细胞瘤患者的生存率 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO Cox惩罚回归分析 | RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据集包含2128个差异表达基因，批量RNA测序数据集包含6461个差异表达基因 |
| 22439 | 2024-08-08 |
The macrophage: a key player in the pathophysiology of peripheral neuropathies
2022-Apr-16, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-022-02454-6
PMID:35429971
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综述 | 本文综述了巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性的最新知识，特别关注了它们在周围神经系统中的作用及其与活性氧物种的相互作用。 | 利用命运图谱和单细胞转录组学等新技术，详细描述了组织驻留巨噬细胞在周围神经系统中的起源和命运，并深入理解了它们在周围神经病变中的功能。 | NA | 总结巨噬细胞在周围神经病变中的作用，并探讨针对特定巨噬细胞以减轻周围神经系统功能缺陷的潜在益处。 | 巨噬细胞在周围神经病变中的起源、功能和组织特性，以及它们与活性氧物种的相互作用。 | NA | 周围神经病变 | 命运图谱、单细胞转录组学 | NA | NA | NA |
| 22440 | 2024-08-08 |
Interactive single-cell data analysis using Cellar
2022-04-14, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29744-0
PMID:35422041
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Cellar的软件工具，用于支持单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | Cellar提供交互式支持，能够统一分配细胞类型，并适用于不同的平台和数据类型 | NA | 开发一种软件工具，以改进跨大型联盟、平台和模式的细胞类型分配能力 | 单细胞数据分析中的细胞类型分配和数据集比较 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序，空间蛋白质组学 | NA | 单细胞数据，空间数据 | 多个HuBMAP数据集 |