单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 22401 - 22420 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22401 | 2024-08-08 |
GRNUlar: A Deep Learning Framework for Recovering Single-Cell Gene Regulatory Networks
2022-01, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2021.0437
PMID:35050715
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研究论文 | 提出了一种名为GRNUlar的深度学习框架，用于从单细胞RNA测序数据中恢复基因调控网络 | 开发了一个多任务学习框架来捕捉转录因子与它们调控的基因之间的复杂依赖关系，并设计了一种展开算法技术来捕捉真实世界中基因调控网络的稀疏性 | NA | 旨在从单细胞RNA测序数据中监督学习基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据和基因调控网络 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 神经网络 | RNA测序数据 | NA |
| 22402 | 2024-08-08 |
A spatial and cellular distribution of rabies virus infection in the mouse brain revealed by fMOST and single-cell RNA sequencing
2022-01, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.700
PMID:35051311
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研究论文 | 本研究利用荧光微光学断层成像（fMOST）和单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术，揭示了狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 首次通过fMOST和scRNA-seq技术全面绘制了典型神经亲和性病毒在小鼠大脑中的空间和细胞感染图谱 | NA | 探索狂犬病毒在小鼠大脑中的感染分布及其发病机制 | 狂犬病毒在小鼠大脑中的空间和细胞分布 | 数字病理学 | 狂犬病 | 荧光微光学断层成像（fMOST），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 图像，RNA序列 | 小鼠样本 |
| 22403 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis of Aneurysmal Aortic Tissue in Patients with Marfan Syndrome Reveals Dysfunctional TGF-β Signaling
2021-12-30, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes13010095
PMID:35052435
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了马方综合征患者升主动脉瘤组织中的细胞群变化和基因表达 | 首次揭示了马方综合征中升主动脉瘤组织中细胞群的变化，特别是平滑肌细胞的增殖和分化状态的改变，以及TGF-β信号通路的异常 | 样本量较小，仅包括3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 | 探究马方综合征中升主动脉瘤发展的分子和细胞机制 | 马方综合征患者的升主动脉瘤组织和非动脉瘤对照组组织 | 数字病理学 | 马方综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3例马方综合征患者和4例年龄匹配的非动脉瘤对照组 |
| 22404 | 2024-08-08 |
mDrop-Seq: Massively Parallel Single-Cell RNA-Seq of Saccharomyces cerevisiae and Candida albicans
2021-Dec-27, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10010030
PMID:35062691
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研究论文 | 本文介绍了一种名为mDrop-seq的高通量单细胞RNA测序技术，用于分析两种酵母物种的转录组 | mDrop-seq技术能够克服微生物细胞壁坚硬和RNA含量低的挑战，实现高通量单细胞RNA测序 | NA | 旨在开发一种能够量化不同酵母物种基因表达变异的高通量单细胞RNA测序技术 | 研究对象包括酵母菌Saccharomyces cerevisiae和Candida albicans | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 共分析了74,814个细胞 |
| 22405 | 2024-08-08 |
Dissecting the Complexity of Early Heart Progenitor Cells
2021-Dec-26, Journal of cardiovascular development and disease
IF:2.4Q2
DOI:10.3390/jcdd9010005
PMID:35050215
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综述 | 本文综述了早期心脏发育中细胞异质性的三个关键方面 | 利用单细胞方法提供了前所未有的细胞异质性细节，为解析其功能作用提供了新机会 | 尽管有数十年的研究，我们对原始心脏管形成的谱系分隔的全面复杂性仍知之甚少 | 探讨早期心脏形态发生的关键方面，并讨论单细胞转录组学和表观基因组学等技术如何可能改变我们对心脏发育复杂性的理解 | 早期心脏发育中的心肌和内皮谱系分隔、信号引导的这些前体细胞分化以及原始心脏管中心肌细胞前体的转录异质性 | NA | 先天性心脏缺陷 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | NA | NA |
| 22406 | 2024-08-08 |
Decode the Stable Cell Communications Based on Neuropeptide-Receptors Network in 36746 Tumor Cells
2021-Dec-22, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10010014
PMID:35052689
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研究论文 | 本文通过系统性的单细胞转录组数据整合分析，研究了不同恶性肿瘤中神经肽介导的细胞通讯的相似性和变异性 | 首次在单细胞水平上阐明了神经肽及其受体的分子机制，并构建了细胞间的通讯网络 | 研究主要基于已知的神经肽和受体的相互作用，可能存在未知的相互作用未被纳入分析 | 旨在阐明不同癌症类型中神经肽-受体网络介导的稳定细胞通讯模式 | 36746个肿瘤细胞中的神经肽-受体网络 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 72个癌症数据集，涵盖24种癌症类型 |
| 22407 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analysis Reveals the Immune Characteristics of Myeloid Cells and Memory T Cells in Recovered COVID-19 Patients With Different Severities
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.781432
PMID:35046942
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了不同严重程度的康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞（PBMCs）的免疫特征 | 首次提供了大规模的康复期COVID-19患者外周免疫反应的单细胞图谱 | NA | 探究康复期COVID-19患者的免疫细胞特征 | 康复期COVID-19患者及健康对照者的外周血单个核细胞 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 41个样本，包含超过260,000个外周血单个核细胞 |
| 22408 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq of Bone Marrow Cells in Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745483
PMID:35046994
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞，揭示了B细胞在疾病中的作用及其对造血功能的影响 | 首次大规模单细胞转录组测序分析了再生障碍性贫血患者的骨髓细胞，并鉴定了B细胞与造血细胞相互作用的特定配体-受体对 | NA | 探讨B细胞在再生障碍性贫血中的作用及其对造血功能的影响 | 再生障碍性贫血患者的骨髓细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20,000个骨髓细胞，来自再生障碍性贫血患者和健康供体 |
| 22409 | 2024-08-08 |
A Ductal-Cell-Related Risk Model Integrating Single-Cell and Bulk Sequencing Data Predicts the Prognosis of Patients With Pancreatic Adenocarcinoma
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.763636
PMID:35047000
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量测序数据，开发了一种与导管细胞相关的风险模型，用于预测胰腺腺癌患者的预后 | 首次通过整合单细胞和批量测序数据，开发了一种新的风险评分模型，用于区分胰腺腺癌患者的高风险和低风险组 | 研究未提及免疫细胞浸润分数在两组间的显著差异 | 旨在通过整合单细胞和批量测序数据，提取导致不同预后的导管细胞特征 | 胰腺导管腺癌患者的预后 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞测序（scRNA-seq） | 风险评分模型 | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22410 | 2024-08-08 |
Single-Cell and Bulk Transcriptome Data Integration Reveals Dysfunctional Cell Types and Aberrantly Expressed Genes in Hypertrophic Scar
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.806740
PMID:35047019
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，揭示了肥厚性瘢痕中的功能障碍细胞类型和异常表达基因 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，详细分析了肥厚性瘢痕中的细胞组成、细胞间通讯和关键转录调控网络的变化 | NA | 研究肥厚性瘢痕的生物学特性，特别是细胞组成和转录调控网络的变化 | 肥厚性瘢痕中的细胞类型、细胞间通讯和转录调控网络 | 数字病理学 | 皮肤疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22411 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Mesenchymal Stromal Cells: Identification, Classification, and Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.787118
PMID:35047499
|
综述 | 本文综述了骨髓间充质干细胞（BMSCs）的鉴定、分类及其分化机制的最新进展 | 通过谱系追踪和单细胞测序技术，揭示了BMSCs的新亚群及其在生理和病理条件下的作用，以及调控BMSCs命运的关键因子和机制 | BMSCs的鉴定和分类仍存在争议，限制了其在临床上的应用 | 探讨BMSCs的鉴定、分类及其在临床应用中的重要意义 | 骨髓间充质干细胞（BMSCs）及其亚群 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22412 | 2024-08-08 |
Calcium-Prolactin Secretion Coupling in Rat Pituitary Lactotrophs Is Controlled by PI4-Kinase Alpha
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.790441
PMID:35058881
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研究论文 | 本文研究了磷脂酰肌醇激酶（PIKs）在钙驱动的垂体催乳素（PRL）释放中的作用，特别是在垂体乳头细胞中的作用 | 揭示了PI4KA在钙分泌偶联中的关键作用，这是通过电压门控和PI(4, 5)P2依赖的钙信号传导途径实现的 | NA | 分析磷脂酰肌醇激酶在钙驱动的催乳素释放中的作用 | 垂体乳头细胞中的催乳素释放 | NA | NA | 单细胞RNA测序、qRT-PCR分析、放射免疫测定、ELISA、Fura 2成像 | NA | RNA、激素、钙信号 | 单细胞水平的研究 |
| 22413 | 2024-08-08 |
Multi-Omics Profiling Identifies Pathways Associated With CD8+ T-Cell Activation in Severe Aplastic Anemia
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.790990
PMID:35058969
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和代谢组学分析，结合转录组学分析，探讨了严重再生障碍性贫血（SAA）患者中CD8+ T细胞激活的关键通路 | 本研究首次揭示了SAA患者中CD8+ T细胞激活的新通路，并提供了潜在的治疗靶点 | NA | 揭示严重再生障碍性贫血患者中CD8+ T细胞激活的调控机制 | 严重再生障碍性贫血（SAA）患者的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 再生障碍性贫血 | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学 | NA | 蛋白质、代谢物、RNA | SAA患者和健康捐赠者的血浆、骨髓上清液和CD8 T细胞 |
| 22414 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Phosphorylation-Related Genes in Hepatocellular Carcinoma Stem Cells
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.734287
PMID:35059393
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序数据和TCGA RNA-seq数据，分析了肝细胞癌患者中的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因的表达情况 | 发现了九种在肝细胞癌干细胞中高表达的蛋白激酶和磷酸化相关基因，这些基因与肝细胞癌患者的预后不良相关，并揭示了它们在细胞周期相关通路中的作用 | NA | 探讨蛋白激酶信号传导的潜在机制，以提高肝细胞癌治疗的效果 | 肝细胞癌患者的蛋白激酶、磷酸酶及其他磷酸化相关基因 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 肝细胞癌患者 |
| 22415 | 2024-08-08 |
Lidocaine Ameliorates Psoriasis by Obstructing Pathogenic CGRP Signaling‒Mediated Sensory Neuron‒Dendritic Cell Communication
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.002
PMID:35032503
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研究论文 | 本研究通过使用利多卡因的硬膜外注射治疗银屑病患者，发现利多卡因能显著降低患者的临床评分，并在咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型中显示出治疗效果。 | 首次揭示了利多卡因通过阻断病理性CGRP信号传导介导的感觉神经-树突状细胞通信来改善银屑病。 | 本研究为初步研究，样本量较小，需要进一步的大规模临床试验验证。 | 探索利多卡因对银屑病的治疗效果及其作用机制。 | 银屑病患者及咪喹莫特诱导的银屑病大鼠模型。 | NA | 银屑病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 患者样本量未明确提及，大鼠模型使用咪喹莫特诱导的银屑病大鼠。 |
| 22416 | 2024-08-08 |
FSCAM: CAM-Based Feature Selection for Clustering scRNA-seq
2022-Jun, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-021-00495-8
PMID:35028910
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研究论文 | 本文提出了一种基于凸分析混合方法的单细胞特征选择方法FSCAM，用于改进单细胞RNA测序数据的聚类准确性 | FSCAM方法考虑了基因间的'多对多'关系，与传统的'一对一'方法相比，增加了相关性、冗余性和完整性的组合选择 | NA | 提高单细胞RNA测序数据聚类的准确性和稳定性 | 单细胞RNA测序数据中的基因特征选择 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | PAM聚类算法 | 转录组数据 | 使用真实数据集进行验证 |
| 22417 | 2024-08-08 |
Combined effects of arsenic and 2,2-dichloroacetamide on different cell populations of zebrafish liver
2022-May-15, The Science of the total environment
DOI:10.1016/j.scitotenv.2022.152961
PMID:35031379
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研究论文 | 研究了砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 首次揭示了砷和2,2-二氯乙酰胺在斑马鱼肝脏中的细胞特异性联合反应 | NA | 探讨砷和2,2-二氯乙酰胺对斑马鱼肝脏不同细胞群体的联合效应 | 斑马鱼肝脏中的不同细胞群体 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 共获得13,563个细胞，包括肝细胞、肝管细胞、内皮细胞和巨噬细胞 |
| 22418 | 2024-08-08 |
Cell2location maps fine-grained cell types in spatial transcriptomics
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01139-4
PMID:35027729
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研究论文 | 本文介绍了一种名为cell2location的贝叶斯模型，用于在空间转录组数据中解析细粒度的细胞类型并创建全面的细胞图谱 | cell2location模型能够处理技术变异源，并通过跨位置借用统计强度，实现单细胞和空间转录组学数据的高灵敏度和高分辨率整合，优于现有工具 | NA | 开发一种能够全面映射细胞类型在空间转录组数据中的新模型 | 细胞类型在不同组织中的空间分布 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 贝叶斯模型 | 转录组数据 | 在三种不同组织（小鼠大脑、人类淋巴结和人类肠道）中进行了评估 |
| 22419 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling of tumour evolution in multiple myeloma - opportunities for precision medicine
2022-04, Nature reviews. Clinical oncology
DOI:10.1038/s41571-021-00593-y
PMID:35017721
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在多发性骨髓瘤（MM）中的应用，探讨了其在揭示MM克隆进化模式和个体细胞突变及表型特征方面的潜力 | 利用单细胞测序技术深入解析MM及其前体阶段的遗传异质性，为精准医疗提供新视角 | NA | 探讨单细胞测序技术在多发性骨髓瘤中的应用及其对临床诊断和治疗策略的潜在影响 | 多发性骨髓瘤及其前体阶段的遗传异质性和克隆进化模式 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞测序技术 | NA | 基因组数据 | NA |
| 22420 | 2024-08-08 |
A robust and scalable graph neural network for accurate single-cell classification
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab570
PMID:35018408
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研究论文 | 本文开发了一种基于图神经网络（GNN）的稳健且可扩展的方法GraphCS，用于准确进行单细胞分类 | 通过预计算扩散信息，使用近似广义PageRank算法，实现了亚线性复杂度，提高了处理大规模数据的速度和可扩展性 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞类型识别的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 图神经网络（GNN） | 数据 | 100万细胞 |