单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 22381 - 22400 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22381 | 2024-08-08 |
CRISPR activation enables high-fidelity reprogramming into human pluripotent stem cells
2022-02-08, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2021.12.017
PMID:35063129
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研究论文 | 本文描述了一种使用优化CRISPR激活（CRISPRa）将人类体细胞高效重编程为诱导多能干细胞（iPSCs）的方法 | 通过CRISPRa激活内源性多能性因子，减少了重编程过程中的异质性，提高了重编程的效率和质量 | NA | 探索使用CRISPRa进行高质量人类细胞多能性重编程的方法 | 人类体细胞和诱导多能干细胞 | NA | NA | CRISPR激活（CRISPRa） | NA | 单细胞转录组 | 未具体说明样本数量 |
| 22382 | 2024-08-08 |
Identification of a glioma functional network from gene fitness data using machine learning
2022-02, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.17182
PMID:35044082
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研究论文 | 本研究利用机器学习算法，结合高通量CRISPR-Cas9筛选数据，构建了胶质瘤功能网络，并预测了可能的Wnt/β-catenin信号通路靶向基因 | 本研究首次系统地整合了高通量CRISPR-Cas9筛选数据与机器学习算法，构建了胶质瘤功能网络，并预测了新的潜在靶向基因 | NA | 旨在通过机器学习方法，从基因适应性数据中识别胶质瘤的功能网络，以发现新的生物标志物 | 胶质母细胞瘤（GBM）及其相关生物标志物 | 机器学习 | 脑肿瘤 | CRISPR-Cas9 | 机器学习算法 | 基因适应性数据 | NA |
| 22383 | 2024-08-08 |
A muscle cell-macrophage axis involving matrix metalloproteinase 14 facilitates extracellular matrix remodeling with mechanical loading
2022-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202100182RR
PMID:35044708
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研究论文 | 研究揭示了肌肉细胞与巨噬细胞通过基质金属蛋白酶14（MMP14）轴促进机械负荷下的细胞外基质（ECM）重塑的机制 | 首次发现肌肉细胞通过白血病抑制因子（LIF）影响巨噬细胞行为，促进ECM重塑 | NA | 探讨机械负荷下肌肉组织适应性变化的分子机制 | 肌肉细胞、巨噬细胞及ECM重塑 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括老年人的大型队列及小鼠模型 |
| 22384 | 2024-08-08 |
LOW VULNERABILITY OF THE POSTERIOR EYE SEGMENT TO SARS-COV-2 INFECTION: Chorioretinal SARS-CoV-2 Vulnerability
2022-02-01, Retina (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1097/IAE.0000000000003320
PMID:35050927
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研究论文 | 研究探讨了SARS-CoV-2病毒是否能直接感染后眼部组织，特别是视网膜和脉络膜细胞，并通过单细胞RNA测序数据分析了相关宿主因子基因的表达水平。 | 首次通过单细胞RNA测序数据分析了SARS-CoV-2进入宿主细胞的关键基因ACE2和TMPRSS2在后眼部组织的表达情况，揭示了后眼部组织对SARS-CoV-2感染的低易感性。 | 研究仅基于单细胞RNA测序数据，未进行直接的病毒感染实验，因此关于后眼部组织对SARS-CoV-2的实际感染能力仍需进一步验证。 | 探究SARS-CoV-2病毒是否能直接感染后眼部组织，并评估其对COVID-19患者眼部病变的可能影响。 | 视网膜和脉络膜细胞中的SARS-CoV-2宿主因子基因表达水平。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22385 | 2024-08-08 |
IQGAP1-mediated mechanical signaling promotes the foreign body response to biomedical implants
2022-02, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202101354
PMID:35051300
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研究论文 | 本研究旨在进一步阐明介导生物医学植入物病理异物反应（FBR）的分子机制 | 识别了IQGAP1作为人类和小鼠FBR的关键分子介质，并发现IQGAP1缺陷小鼠的FBR显著降低 | NA | 探索减少病理FBR的分子靶点和机制 | 生物医学植入物的异物反应 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 组织样本 | 人类FBR样本和小鼠FBR模型 |
| 22386 | 2024-08-08 |
Neuronal identities derived by misexpression of the POU IV sensory determinant in a protovertebrate
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2118817119
PMID:35042818
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研究论文 | 研究在原脊椎动物中通过错误表达POU IV感觉决定因子导致神经元身份的变化 | 发现错误表达POU IV感觉决定因子会导致表皮细胞转变为具有混合感觉细胞类型特性的细胞，这些细胞同时表达PSC和BTN的特性 | NA | 探讨通过靶向错误表达细胞决定因子来重编程细胞类型的机会和挑战 | 原脊椎动物中的感觉细胞类型及其转变 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22387 | 2024-08-08 |
Pathogenic TNF-α drives peripheral nerve inflammation in an Aire-deficient model of autoimmunity
2022-01-25, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2114406119
PMID:35058362
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研究论文 | 本文研究了在自身免疫调节因子（Aire）缺陷的小鼠模型中，病理性TNF-α如何驱动外周神经炎症，并探讨了其对自身免疫性脱髓鞘的影响。 | 通过单细胞RNA测序和细胞间配体-受体相互作用的分析，揭示了巨噬细胞介导的TNF-α信号轴在自身免疫性脱髓鞘中的作用机制。 | NA | 探索在自身免疫性神经炎症中，免疫细胞从修复状态转变为炎症状态的分子机制，并寻找新的治疗靶点。 | Aire缺陷小鼠模型的坐骨神经，以及其中的多种髓样、先天淋巴样和淋巴样细胞类型。 | 自身免疫疾病 | 自身免疫性神经病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Aire缺陷小鼠模型的坐骨神经样本 |
| 22388 | 2024-08-08 |
Statistics or biology: the zero-inflation controversy about scRNA-seq data
2022-01-21, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02601-5
PMID:35063006
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序数据中大量零值的来源和处理方式，并评估了非生物学零值对数据分析的影响 | 介绍了五种在计算基准测试中添加非生物学零值的机制，并讨论了非生物学零值的开放性问题 | NA | 解决关于单细胞RNA测序数据中零值处理的争议 | 单细胞RNA测序数据中的零值 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 测序数据 | NA |
| 22389 | 2024-08-08 |
Coal dust exposure triggers heterogeneity of transcriptional profiles in mouse pneumoconiosis and Vitamin D remedies
2022-01-20, Particle and fibre toxicology
IF:7.2Q1
DOI:10.1186/s12989-022-00449-y
PMID:35057792
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研究论文 | 本研究主要探讨了可吸入大小的煤尘颗粒（CDP）在老鼠中的肺毒性，使用无偏差的单细胞RNA测序技术，并分析了煤尘颗粒对肺部稳态的影响。 | 这是首次在老鼠中重建煤尘肺病的病理进展和转录组模式的研究。 | NA | 研究煤尘颗粒对肺部稳态的影响及其分子变化。 | 老鼠的肺部组织和细胞。 | 数字病理学 | 尘肺病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 老鼠样本 |
| 22390 | 2024-08-08 |
Investigation of fiber utilization in the rumen of dairy cows based on metagenome-assembled genomes and single-cell RNA sequencing
2022-01-20, Microbiome
IF:13.8Q1
DOI:10.1186/s40168-021-01211-w
PMID:35057854
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研究论文 | 本研究通过宏基因组组装基因组和单细胞RNA测序技术，探讨了奶牛瘤胃中纤维利用的相关微生物和细胞亚型 | 首次通过宏基因组组装基因组和单细胞RNA测序技术，揭示了瘤胃中纤维消化、VFA吸收和代谢的关键微生物基因组和上皮细胞亚型 | NA | 研究奶牛瘤胃中纤维消化和VFA吸收代谢的微生物和细胞机制 | 奶牛瘤胃中的微生物和上皮细胞 | NA | NA | 宏基因组组装基因组、单细胞RNA测序 | NA | 基因组、转录组 | 52头处于泌乳中期的奶牛，20,728个瘤胃上皮细胞 |
| 22391 | 2024-08-08 |
Interpreting success or failure of peanut oral immunotherapy
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI155255
PMID:35040441
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，研究了与花生口服免疫疗法（OIT）结果相关的花生反应性CD4+ Th细胞表型和基因特征 | 首次描述了与OIT结果相关的花生反应性CD4+ Th细胞的特定亚群和基因特征 | 并非所有患者都对OIT有反应，且治疗停止后可能重新对花生产生敏感 | 旨在识别影响并预测OIT结果的生物标志物 | 花生反应性CD4+ Th细胞表型和基因特征 | NA | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 基因 | NA |
| 22392 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of early chick hypothalamic development reveals that hypothalamic cells are induced from prethalamic-like progenitors
2022-01-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.110251
PMID:35045288
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和杂交链反应技术，分析了早期小鸡下丘脑发育的多个阶段，揭示了下丘脑细胞从类似前下丘脑的前体细胞中诱导出来的过程 | 本研究首次详细描述了小鸡下丘脑发育的组织结构，并识别了多个先前未被表征的下丘脑诱导、区域化和神经发生的候选调控因子 | NA | 阐明新生下丘脑的组织结构，并识别可能控制其诱导和后续发育的分子机制 | 早期小鸡下丘脑的发育过程 | NA | NA | 单细胞RNA测序（RNA-seq）和杂交链反应（HCR） | NA | RNA序列数据 | 多个早期下丘脑发育阶段的小鸡样本 |
| 22393 | 2024-08-08 |
Molecular Landscape of the Coagulome of Oral Squamous Cell Carcinoma
2022-Jan-17, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020460
PMID:35053621
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研究论文 | 研究口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组及其与肿瘤微环境（TME）的关联 | 发现OSCC中F3和PLAU的mRNA表达水平最高，并观察到单细胞水平上的凝血和纤维蛋白溶解亚群共存现象 | 需要进一步研究凝血过程对肿瘤适应性免疫反应的潜在负面调节作用 | 探讨OSCC的凝血组及其与肿瘤微环境的联系 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）的凝血组 | NA | 口腔鳞状细胞癌 | bulk tumor DNA/RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | DNA/RNA | 使用The Cancer Genome Atlas的数据和OSCC细胞培养数据 |
| 22394 | 2024-08-08 |
Utilizing Shared Big Data to Identify Liver Cancer Dedifferentiation Markers
2022-Jan-14, Studies in health technology and informatics
DOI:10.3233/SHTI210862
PMID:35062095
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研究论文 | 本研究利用公开的单细胞RNA测序数据，重新分析大数据以识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 首次在大数据重新分析中识别出肝癌干细胞的去分化因子Msh Homeobox 2，并发现其在肝癌干细胞中显著上调 | NA | 通过重新分析大数据，探索和识别肝癌干细胞的去分化标志物 | 肝癌干细胞和健康肝细胞 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个公开的单细胞RNA测序数据集 |
| 22395 | 2024-08-08 |
Restoring FAS Expression via Lipid-Encapsulated FAS DNA Nanoparticle Delivery Is Sufficient to Suppress Colon Tumor Growth In Vivo
2022-Jan-12, Cancers
IF:4.5Q1
DOI:10.3390/cancers14020361
PMID:35053524
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研究论文 | 本研究通过脂质包裹的FAS DNA纳米粒子递送恢复FAS表达，以抑制体内结肠肿瘤生长 | 设计并合成了密码子使用优化的鼠和人FAS cDNA，并将其封装到阳离子脂质中形成纳米粒子，用于体内外抑制结肠肿瘤生长 | NA | 探讨恢复FAS表达是否足以抑制结直肠癌的发展 | 结直肠癌患者的结肠肿瘤细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及鼠和人的结肠肿瘤细胞 |
| 22396 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas reveals shared and distinct immune responses and metabolism during SARS-CoV-2 and HIV-1 infections
2022-Jan-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2022.01.10.475725
PMID:35043114
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法，比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫反应和代谢差异 | 首次系统比较了SARS-CoV-2和HIV-1感染的单细胞转录组数据，揭示了两种病毒感染的共同和独特免疫反应及代谢特征 | NA | 理解SARS-CoV-2和HIV-1感染的相似性和差异性，为疾病进展和疫苗及疗法开发提供依据 | SARS-CoV-2和HIV-1感染患者的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 94,442个PBMCs样本，来自7名COVID-19患者和9名HIV-1患者 |
| 22397 | 2024-08-08 |
Expression of Lineage Transcription Factors Identifies Differences in Transition States of Induced Human Oligodendrocyte Differentiation
2022-01-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11020241
PMID:35053357
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研究论文 | 本文通过定量图像分析和单细胞转录组学方法，比较了不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 研究发现，与单独使用SOX10相比，SOX10与OLIG2和NKX6.2的组合能增加iOLs的数量并促进更复杂的形态和更高的髓鞘标记基因表达水平 | NA | 研究不同转录因子组合在诱导人源少突胶质细胞分化中的效果 | 人源诱导少突胶质细胞的分化过程 | 细胞生物学 | NA | 定量图像分析、单细胞转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA |
| 22398 | 2024-08-08 |
Towards Tabula Gallus
2022-Jan-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms23020613
PMID:35054796
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研究论文 | Tabula Gallus项目旨在创建鸡体和鸡胚中每种细胞类型的地图 | 该项目将生成单细胞转录组数据的综合目录，并提供研究该物种生物学的工具，类似于其他正在进行的细胞图谱项目 | NA | 研究鸡和其他鸟类的基本科学，并最终增进对人类健康和疾病的理解 | 鸡体和鸡胚中的每种细胞类型 | 分子生物学 | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22399 | 2024-08-08 |
Combination of ultrasound-based mechanical disruption of tumor with immune checkpoint blockade modifies tumor microenvironment and augments systemic antitumor immunity
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003717
PMID:35039461
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研究论文 | 本文研究了超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗对肿瘤微环境和系统性抗肿瘤免疫的影响。 | 验证了新型高强度聚焦超声（M-HIFU）在增强抗肿瘤免疫中的作用，并探讨了与免疫检查点抑制剂（anti-PD-L1）联合使用的潜力。 | 研究主要在鼠类模型中进行，需要进一步的人体临床试验验证其效果。 | 探索通过超声机械破坏肿瘤与免疫检查点阻断联合治疗来增强系统性抗肿瘤免疫和抑制肿瘤生长的机制。 | 鼠类乳腺癌模型，包括三阴性（E0771）和人ErbB-2（HER2）表达（MM3MG-HER2）肿瘤。 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高强度聚焦超声（HIFU） | NA | 单细胞RNA测序数据 | 使用C57BL/6或BALB/c小鼠进行实验 |
| 22400 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Technologies and Computational Analysis Tools: Application in Cancer Research
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-1896-7_23
PMID:35044670
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其在癌症研究中的应用，介绍了最新的scRNA-seq技术和平台，以及相关的计算分析工具 | scRNA-seq技术为研究人员提供了发现新生物学现象和理解组织复杂性的独特机会 | NA | 介绍scRNA-seq技术及其在癌症研究中的应用 | 单细胞RNA测序技术和计算分析工具 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |