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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2221 | 2025-11-21 |
Regulatory T cell therapies: from patient data to biological insights
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1675114
PMID:41246323
|
综述 | 本文综述了调节性T细胞疗法的临床进展与优化策略,重点探讨如何通过临床数据和先进监测技术改进治疗效果 | 整合临床样本数据与单细胞多组学技术,提出将Treg疗法优化为能够建立免疫耐受的“活体药物” | NA | 改进调节性T细胞疗法,提升其治疗自身免疫性疾病和促进移植耐受的效果 | 调节性T细胞疗法及临床样本数据 | 自然语言处理 | 自身免疫性疾病 | 单细胞多组学分析、表观遗传分析、空间转录组学 | NA | 临床数据、多组学数据 | NA | NA | 单细胞多组学、空间转录组学 | NA | NA |
| 2222 | 2025-11-21 |
Cholesterol metabolism shapes immune low-response states in LUAD: a multi-omics cholesterol metabolism signature predicts immunotherapy benefit and identifies DHCR7 as a therapeutic target
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1696360
PMID:41246332
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研究论文 | 本研究开发了基于胆固醇代谢基因的特征模型,用于预测肺腺癌患者的预后和免疫治疗反应,并鉴定DHCR7作为潜在治疗靶点 | 首次在肺腺癌中建立多组学胆固醇代谢特征模型,发现DHCR7基因与免疫抑制的关联,并验证其作为免疫治疗增敏靶点的潜力 | 研究主要基于回顾性队列分析,需要更多前瞻性研究验证 | 探究胆固醇代谢在肺腺癌免疫微环境中的作用及其对免疫治疗的影响 | 肺腺癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 肺腺癌 | 多组学分析,单细胞转录组,免疫组化,流式细胞术,体外和体内实验 | 特征模型 | 基因组数据,转录组数据,单细胞数据,实验数据 | 1,682例肺腺癌样本(包括7个初治队列和3个免疫治疗队列) | NA | 单细胞RNA-seq,多重免疫组化,流式细胞术 | NA | NA |
| 2223 | 2025-11-21 |
Single-cell and spatial transcriptomics integration reveals FAM49B promotes tumor-associated macrophages polarization in colorectal cancer via the MK pathway
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1682637
PMID:41246334
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了FAM49B通过MDK-NCL轴促进结直肠癌中肿瘤相关巨噬细胞极化的机制 | 首次发现FAM49B通过MDK-NCL信号轴调控肿瘤相关巨噬细胞极化,揭示了其在塑造免疫抑制肿瘤微环境中的新功能 | 样本量相对有限(16例患者),需要更大规模的研究验证 | 探究FAM49B在结直肠癌免疫抑制肿瘤微环境形成中的作用机制 | 结直肠癌患者组织样本、恶性上皮细胞、肿瘤相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、蛋白质组学分析 | CellChat分析、伪时间轨迹分析 | 单细胞RNA-seq数据、空间转录组数据、bulk RNA数据 | 16例结直肠癌患者的33个单细胞RNA-seq样本和2对配对空间转录组样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2224 | 2025-11-21 |
Lactylation-related gene AKR1A1 contributes to osteoporosis via metabolic-immune regulation: evidence from multi-omics integration, single-cell transcriptomics, and in vitro validation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680305
PMID:41246341
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合和单细胞转录组学发现AKR1A1基因通过乳酸化修饰在骨质疏松代谢-免疫调控中发挥关键作用 | 首次系统识别骨质疏松中乳酸化相关差异表达基因,从代谢-免疫双重角度揭示AKR1A1通过SPP1-CD44信号通路调控细胞间通讯的新机制 | 研究主要基于公共数据库和体外实验,缺乏体内实验验证和临床样本的直接证据 | 系统识别骨质疏松中乳酸化相关关键基因并探索其在疾病发病机制中的作用 | 骨质疏松相关基因表达数据、RAW264.7巨噬细胞 | 生物信息学 | 骨质疏松 | 单细胞RNA测序、qPCR、Western blot、免疫共沉淀 | 机器学习模型、UMAP聚类、CellChat分析 | 基因表达微阵列数据、单细胞转录组数据 | 5个骨质疏松相关基因表达数据集和1个单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2225 | 2025-11-21 |
Integrative multi-omics analysis of gastric cancer evolution from precancerous lesions to metastasis identifies a deep learning-based prognostic model
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1680517
PMID:41246350
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和深度学习技术,构建了胃癌从癌前病变到转移的演化图谱和预后模型 | 首次在胃癌中整合多组学数据揭示肿瘤微环境动态重塑过程,并开发基于深度学习的预后预测模型 | 样本量相对有限,仅包含6种组织类型的252,399个细胞 | 解析胃癌进展过程中肿瘤微环境的细胞异质性、空间组织和细胞间通讯 | 胃炎、肠化生、原发肿瘤、癌旁正常组织和转移病灶 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, WGCNA, 深度学习 | 深度学习模型 | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床数据 | 252,399个细胞来自6种组织类型 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2226 | 2025-11-20 |
Immunomodulatory effects of a short-term gluten-free diet on pediatric celiac disease: Findings from a single-cell transcriptomics study
2025-Dec, The Journal of nutritional biochemistry
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.jnutbio.2025.110063
PMID:40803542
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学分析探讨短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节作用 | 首次使用单细胞RNA测序技术分析儿科乳糜泻患者短期无麸质饮食后的免疫细胞转录变化 | 样本量较小(仅5名患者),结果需谨慎解读,需要更大规模队列研究验证 | 研究短期无麸质饮食对儿科乳糜泻患者免疫细胞的调节机制 | 儿科乳糜泻患者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 乳糜泻 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 5名儿科乳糜泻患者(治疗前后配对样本) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基于液滴的单细胞RNA测序技术 |
| 2227 | 2025-11-20 |
[Single cell sequencing technology for analyzing the interaction between type 3 innate lymphoid cells and regulatory T cells in patients with fibrostenotic Crohn's disease]
2025-Nov-25, Zhonghua yi xue za zhi
|
研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析纤维狭窄型克罗恩病患者中3型先天淋巴细胞与调节性T细胞的相互作用 | 首次在纤维狭窄型克罗恩病患者中利用单细胞测序技术系统分析ILC3与Treg细胞的相互作用及其对肠道免疫微环境的影响 | 样本量较小(共7例患者),且为回顾性研究设计 | 研究纤维狭窄型克罗恩病患者中ILC3与Treg细胞的相互作用机制 | 纤维狭窄型克罗恩病患者的肠道纤维化组织和非纤维化组织样本 | 单细胞生物学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 7例纤维狭窄型克罗恩病患者(温州组1例,瑞金组6例) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2228 | 2025-11-20 |
Nerandomilast, a PDE4B inhibitor, alleviates silica-induced lung inflammation and fibrosis by inhibition of NLRP3 inflammasome and TGF-β/Smad signalling
2025-Nov-19, British journal of pharmacology
IF:6.8Q1
DOI:10.1111/bph.70240
PMID:41255094
|
研究论文 | 本研究评估了PDE4B抑制剂Nerandomilast在矽肺模型中通过抑制NLRP3炎症小体和TGF-β/Smad信号通路减轻肺部炎症和纤维化的作用 | 首次发现PDE4B是矽肺发病机制的关键调控靶点,并证实其抑制剂Nerandomilast通过双重抑制经典/非经典NLRP3炎症小体通路和TGF-β/Smad信号发挥治疗作用 | 研究主要基于小鼠模型和细胞系,尚未在人体中进行验证 | 探究PDE4B抑制剂Nerandomilast治疗矽肺的疗效和作用机制 | 雄性C57BL/6N小鼠、THP-1巨噬细胞、MRC-5细胞 | 医学研究 | 矽肺 | 单细胞RNA测序、bulk RNA测序、转录组分析 | 动物模型、细胞模型 | 基因表达数据、功能测试数据 | 小鼠模型和细胞系实验 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2229 | 2025-11-20 |
LPS-Binding Hydrogel for TLR4-Mediated Microbiota-Immune Modulation
2025-Nov-19, Advanced materials (Deerfield Beach, Fla.)
DOI:10.1002/adma.202514484
PMID:41255157
|
研究论文 | 开发了一种结合抗菌和免疫调节功能的LPS结合水凝胶,用于治疗微生物失调引起的炎症并促进复杂粘膜伤口愈合 | 开发了协同LPS结合水凝胶(OCMC-PMBP),结合多粘菌素B靶向脂质A的细菌裂解和聚乙烯亚胺的静电LPS捕获功能 | NA | 解决微生物失调引起的炎症并增强复杂粘膜伤口的再生愈合 | 口鼻穿孔伤口(与腭裂修复相关的复杂易感染状况) | 生物材料 | 伤口愈合障碍 | 16S rRNA测序,宏基因组学,单细胞转录组学 | NA | 微生物组数据,基因表达数据,单细胞数据 | 临床微生物组分析和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2230 | 2025-11-20 |
Methodologies for Sample Multiplexing and Computational Deconvolution in Single-Cell Sequencing
2025-Nov-19, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202513396
PMID:41255264
|
综述 | 本文全面综述单细胞测序中的样本多重标记技术和计算解卷积方法 | 首次提供单细胞多重标记领域实验策略与计算算法的整合视角,强调实验设计与计算准确性的关键联系 | 作为综述文章,未涉及原始实验数据验证 | 指导研究人员选择合适方法加速疾病机制、治疗反应和发育生物学研究 | 单细胞测序技术及其在生物医学研究中的应用 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,单细胞多组学 | NA | NA |
| 2231 | 2025-11-20 |
C-X-C chemokine receptor CXCR4 mediates diurnal changes in the aggregation and dispersion of CD8+ T cells within the tumor microenvironment
2025-Nov-19, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.70252
PMID:41257391
|
研究论文 | 本研究揭示了CXCR4受体介导CD8+ T细胞在肿瘤微环境中昼夜节律性聚集与分散的机制 | 首次发现CXCR4介导的CD8+ T细胞在肿瘤微环境中的昼夜分布变化,并揭示TGF-β-SMAD信号通路通过SMAD7时间依赖性调控CXCR4表达的机制 | 研究主要聚焦于肺癌模型,未验证其他癌症类型中是否存在相同机制 | 探究昼夜节律如何调控CD8+ T细胞在肿瘤微环境中的空间定位及其对免疫检查点抑制剂疗效的影响 | CD8+ T细胞、肿瘤微环境、肺癌患者T细胞 | 免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 肺癌患者T细胞单细胞RNA-seq数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2232 | 2025-11-20 |
FMT promotes type 2 mucosal immune responses with colonic epithelium proliferation in recurrent CDI patients
2025-Nov-18, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195678
PMID:41252206
|
研究论文 | 本研究通过分析复发性艰难梭菌感染患者接受粪菌移植治疗后的样本,揭示了FMT通过促进结肠上皮增殖和2型免疫反应发挥治疗作用的机制 | 首次发现FMT通过上调IL-33和双调蛋白表达,激活Myc和mTORC1通路,促进结肠上皮增殖,从而驱动组织再生 | 样本量较小(n=16),缺乏长期随访数据,机制研究仍需进一步验证 | 探究粪菌移植治疗复发性艰难梭菌感染的分子机制 | 复发性艰难梭菌感染患者(n=16)和健康对照 | 微生物组学 | 肠道感染 | 高通量测序,流式细胞术,空间转录组学 | NA | 基因表达数据,微生物组数据,免疫表型数据 | 16名rCDI患者及健康对照 | NA | 空间转录组学,单细胞基因集 | NA | NA |
| 2233 | 2025-11-20 |
TNF Superfamily Member 14 Drives Post-Influenza Depletion of Alveolar Macrophages Enabling Secondary Pneumococcal Pneumonia
2025-Nov-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI185390
PMID:41252214
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研究论文 | 本研究揭示了TNF超家族成员14(TNFSF14)在流感后肺泡巨噬细胞耗竭及继发肺炎链球菌肺炎中的关键作用机制 | 首次发现TNFSF14配体-受体轴是驱动流感后组织驻留肺泡巨噬细胞死亡的关键因素,并证明靶向该通路可减轻疾病严重程度 | 研究主要基于动物模型,人类患者数据有限 | 阐明流感后继发细菌性肺炎的分子机制并探索治疗靶点 | 流感病毒感染和流感/肺炎链球菌共感染的小鼠模型,以及病毒诱导ARDS患者的支气管肺泡灌洗液 | 免疫学 | 肺炎 | 单细胞转录组学,细胞特异性PCR分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,基因表达数据 | 动物模型和人类患者样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2234 | 2025-11-20 |
Cell-dependent contributions of thrombospondin-1 to the rupture of abdominal aortic aneurysm in mice
2025-Nov-18, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvaf243
PMID:41252281
|
研究论文 | 本研究通过细胞特异性基因敲除技术探讨了不同细胞来源的血栓反应蛋白-1对小鼠腹主动脉瘤破裂的影响 | 首次揭示髓系细胞来源的TSP1在抑制动脉瘤破裂中的关键保护作用,而传统认为TSP1主要促进动脉瘤形成 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中得到验证;使用的动脉瘤诱导方法可能不完全模拟人类疾病自然进程 | 研究不同细胞类型中TSP1缺失对腹主动脉瘤破裂的影响机制 | 高胆固醇血症小鼠模型及细胞特异性TSP1敲除小鼠 | 心血管疾病研究 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,组织学分析,基因敲除技术 | 条件性基因敲除小鼠模型 | 基因表达数据,组织病理数据 | 多种基因修饰小鼠模型,具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2235 | 2025-11-20 |
Single-Cell and Spatial Transcriptomic Analysis Reveals Shared and Cancer-Type-Specific Cellular Interactions and Chemokine Signaling Associated With Tertiary Lymphoid Structures in Colorectal and Gastric Cancers
2025-Nov-18, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70058
PMID:41252687
|
研究论文 | 通过单细胞和空间转录组学分析结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的细胞相互作用和趋化因子信号 | 首次在单细胞分辨率下揭示结直肠癌和胃癌中三级淋巴结构的空间分布特征和癌症类型特异性免疫招募回路 | 研究样本量有限,调控机制仍需进一步验证 | 阐明胃肠道恶性肿瘤中三级淋巴结构的空间分布和趋化因子信号调控机制 | 结直肠癌和胃癌组织样本 | 数字病理学 | 结直肠癌,胃癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
| 2236 | 2025-11-20 |
Lactylation-Related Gene Signature and Immune Infiltration Crosstalk in Heart Failure: Insights from Bulk and Single-Cell Transcriptomics
2025-Nov-18, Journal of cardiovascular pharmacology
IF:2.6Q2
DOI:10.1097/FJC.0000000000001775
PMID:41252712
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研究论文 | 本研究通过批量转录组和单细胞转录组分析,探讨了乳酰化相关基因特征与心力衰竭免疫浸润的相互作用 | 首次系统研究蛋白质乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用,并建立了14基因乳酰化相关基因诊断模型和鉴定出6个枢纽基因 | 需要进一步研究验证这些基因通过免疫微环境机制在心力衰竭中的调控作用 | 探索乳酰化修饰在心力衰竭免疫微环境中的作用机制 | 心力衰竭患者样本和心力衰竭小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,批量RNA测序 | 基因特征模型 | 基因表达数据 | 200例心力衰竭样本和166例非心力衰竭对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
| 2237 | 2025-11-20 |
T cell immune dysfunction and progression to severe COVID-19 in asthma revealed by single-cell RNA sequencing
2025-Nov-18, Tuberculosis and respiratory diseases
IF:2.5Q2
DOI:10.4046/trd.2025.0099
PMID:41253375
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究哮喘患者中T细胞免疫功能障碍与进展为重症COVID-19的关联 | 首次使用单细胞RNA测序揭示哮喘患者中T细胞比例减少和细胞毒性CD8+ T细胞扩增与重症COVID-19发展的关联 | 样本量较小(仅12名患者),特别是哮喘/重症COVID-19组仅有1名患者 | 评估哮喘患者免疫功能障碍与进展为重症COVID-19之间的关联 | 哮喘和非哮喘COVID-19患者的外周免疫细胞 | 单细胞组学 | COVID-19, 哮喘 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 12名患者(4名哮喘,8名非哮喘),共155,565个细胞 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2238 | 2025-11-20 |
BM-MSC-derived migrasomes reverse stroke-induced thymic atrophy and immunosuppression via Pin1 delivery to thymic epithelial cells
2025-Nov-15, Journal of neuroinflammation
IF:9.3Q1
DOI:10.1186/s12974-025-03604-2
PMID:41241718
|
研究论文 | 本研究揭示骨髓间充质干细胞通过分泌迁移体递送Pin1蛋白,逆转中风诱导的胸腺萎缩和免疫抑制 | 首次发现BM-MSC来源的迁移体能够穿越血胸屏障,通过递送细胞周期调节蛋白Pin1特异性促进胸腺上皮细胞增殖 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 解决中风后神经保护与免疫抑制之间的临床困境 | 骨髓间充质干细胞、迁移体、胸腺上皮细胞、T细胞 | 细胞生物学 | 中风 | 单细胞RNA测序、液相色谱-串联质谱、体外实验 | 动物模型 | 基因表达数据、蛋白质组数据 | 中风模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、蛋白质组学 | NA | NA |
| 2239 | 2025-11-20 |
Inferring pathway activity from single-cell and spatial transcriptomics data with PaaSc
2025-Nov, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1013666
PMID:41212919
|
研究论文 | 开发了一种名为PaaSc的计算方法,用于从单细胞和空间转录组数据推断通路活性 | 使用多重对应分析将细胞和基因同时投影到共同潜在空间,并通过线性回归选择通路相关维度来推断通路活性得分 | NA | 将高维单细胞和空间转录组数据转化为功能性通路见解 | 单细胞和空间转录组数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,scATAC-seq | 多重对应分析,线性回归 | 单细胞转录组数据,空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,scATAC-seq | NA | NA |
| 2240 | 2025-11-20 |
Enhancing Spatial Transcriptomics via Spatially Constrained Matrix Decomposition with EDGES
2025-Nov, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202508346
PMID:40842021
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研究论文 | 本文开发了一种名为EDGES的空间约束矩阵分解框架,用于增强空间转录组数据的基因表达预测和去噪 | 通过图拉普拉斯正则化整合空间信息,同时协同整合细胞表示和基因特异性表示,确保预测基因表达与真实ST分布紧密对齐 | NA | 解决成像基空间转录组技术在基因检测能力和表达谱测量准确性方面的局限性 | 空间转录组数据 | 数字病理学 | NA | 空间转录组学 | 非负矩阵分解 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |