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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 2221 - 2240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2221 | 2025-10-06 |
Integrated analysis reveals a novel 5-fluorouracil resistance-based prognostic signature with promising implications for predicting the efficacy of chemotherapy and immunotherapy in patients with colorectal cancer
2024-08, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01981-2
PMID:38824480
|
研究论文 | 开发基于5-氟尿嘧啶耐药性的预后特征模型，用于预测结直肠癌患者化疗和免疫治疗效果 | 首次构建5-氟尿嘧啶耐药相关特征模型，整合单细胞和bulk RNA测序数据，识别化疗和免疫治疗获益人群 | 需要进一步实验验证预测的潜在化合物疗效 | 预测结直肠癌患者预后及化疗和免疫治疗效果 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, RT-qPCR, 分子对接 | 逐步回归模型, 无监督共识聚类 | RNA测序数据, 临床数据 | 多个结直肠癌队列 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2222 | 2025-10-06 |
CXCR6 expression correlates with radiotherapy response and immune context in triple-negative breast cancer-experimental studies
2024-Aug-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001546
PMID:39143706
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研究论文 | 本研究探讨CXCR6在三阴性乳腺癌中的表达与放疗反应及免疫微环境的关系 | 首次揭示CXCR6表达与三阴性乳腺癌放疗疗效和免疫应答的临床相关性，并阐明其在CD8+ T细胞分化和免疫细胞间通讯中的作用机制 | 研究主要基于回顾性数据分析，需要进一步的前瞻性研究验证 | 阐明CXCR6在三阴性乳腺癌中的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | 三阴性乳腺癌患者样本 | 癌症免疫学 | 三阴性乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 转录组测序, 多重免疫组织化学 | NA | RNA测序数据, 蛋白质表达数据, 免疫组织化学图像 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 多重免疫组织化学 | NA | NA |
| 2223 | 2025-10-06 |
Feature selection followed by a novel residuals-based normalization that includes variance stabilization simplifies and improves single-cell gene expression analysis
2024-Jul-30, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-024-05872-w
PMID:39080559
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研究论文 | 提出一种新的单细胞RNA测序数据分析流程，包括先进行特征选择再进行包含方差稳定的残差归一化方法 | 提出先特征选择后归一化的修订工作流程，开发基于稳定基因的新型方差稳定残差归一化方法 | NA | 改进单细胞基因表达数据分析方法 | 单细胞RNA测序计数数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2224 | 2025-10-06 |
Integration tools for scRNA-seq data and spatial transcriptomics sequencing data
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elae002
PMID:38267084
|
综述 | 本文系统整理了19种整合单细胞RNA测序数据与空间转录组测序数据的方法，为研究人员选择合适的数据整合方法提供参考 | 首次对19种scRNA-seq与空间转录组数据整合方法进行系统性分类和比较分析，强调高变异基因在不同技术注释中的应用 | 未对整合方法进行实证性能比较，主要基于方法原理进行理论分析 | 为研究人员选择单细胞RNA测序与空间转录组数据整合方法提供指导 | 单细胞RNA测序数据与空间转录组测序数据的整合方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组测序 | NA | 基因表达数据，空间位置数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2225 | 2025-10-06 |
Improving cell type identification with Gaussian noise-augmented single-cell RNA-seq contrastive learning
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad059
PMID:38242863
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研究论文 | 提出一种基于高斯噪声增强的单细胞RNA测序对比学习方法，用于改进细胞类型识别任务 | 首次将高斯噪声增强策略应用于单细胞RNA测序数据的对比学习，专门针对困难细胞类型识别任务进行优化 | 未明确说明方法在特定细胞类型或组织中的适用性限制 | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型识别的准确性，特别是困难细胞类型的识别 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 对比学习 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2226 | 2025-10-06 |
Integrating multi-omics data to analyze the potential pathogenic mechanism of CTSH gene involved in type 1 diabetes in the exocrine pancreas
2024-07-19, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elad052
PMID:38050341
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研究论文 | 本研究通过整合多组学数据探索CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的潜在致病机制 | 首次结合eQTL研究、GWAS汇总数据和单细胞转录组数据系统分析CTSH基因在1型糖尿病外分泌胰腺中的作用机制 | 研究结果主要基于生物信息学分析，需要进一步的实验验证 | 探究CTSH基因在1型糖尿病发病机制中的潜在作用 | 1型糖尿病患者和健康对照者的胰腺组织 | 生物信息学 | 1型糖尿病 | eQTL分析, GWAS, 单细胞RNA测序, 单细胞WGCNA分析, 功能富集分析 | 基于汇总数据的孟德尔随机化(SMR) | 基因组数据, 转录组数据 | 1型糖尿病患者和健康对照者的胰腺单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2227 | 2025-10-06 |
SmartImpute: A Targeted Imputation Framework for Single-cell Transcriptome Data
2024-Jul-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.07.15.603649
PMID:39071378
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研究论文 | 提出一种针对单细胞转录组数据的靶向插补框架SmartImpute | 采用改进的生成对抗插补网络架构，专注于预定义标记基因，提高插补过程的生物学相关性和计算效率 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的dropout事件问题 | 头颈部鳞状细胞癌和人类骨髓的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | 生成对抗网络(GAN) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2228 | 2025-10-06 |
Detection of allele-specific expression in spatial transcriptomics with spASE
2024-Jul-08, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-024-03317-4
PMID:38978101
|
研究论文 | 开发了一种名为spASE的计算框架，用于从空间转录组数据中检测和估计空间等位基因特异性表达 | 首次实现了在空间转录组数据中研究空间等位基因特异性表达，并采用涉及空间平滑样条加性混合的分层模型来解决细胞类型混合和低信噪比挑战 | NA | 开发检测空间等位基因特异性表达的计算方法 | 小鼠小脑和海马体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 分层模型、空间平滑样条 | 空间转录组数据 | NA | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium, Slide-seq | 等位基因分辨的Visium和Slide-seq平台数据 |
| 2229 | 2025-10-06 |
Single-cell transcriptomic profiling unveils insights into ovarian fibrosis in obese mice
2024-07-02, Biology direct
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13062-024-00496-9
PMID:38956667
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序揭示了肥胖小鼠卵巢纤维化的细胞机制 | 首次构建肥胖小鼠卵巢组织的单细胞图谱，发现SPP1-CD44和TNF-TNFrsf1α相互作用在卵巢纤维化中的关键作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类样本中验证 | 探究肥胖条件下导致不孕的精确细胞亚群及其分子机制 | 肥胖成年雌性小鼠的卵巢组织 | 数字病理学 | 卵巢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 肥胖模型小鼠组与对照组 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2230 | 2025-10-06 |
Functional genomics of the human epididymis: Further characterization of efferent ducts and model systems by single-cell RNA sequencing analysis
2024-Jul, Andrology
IF:3.2Q1
DOI:10.1111/andr.13477
PMID:37301539
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术分析人类附睾输出管细胞组成并与体外培养模型进行比较 | 首次在单细胞水平上揭示人类附睾输出管的细胞类型组成，并发现具有膀胱和尿路上皮标记基因的特殊上皮细胞亚群 | 样本来源有限，组织获取困难 | 阐明人类附睾输出管的细胞身份特征及其与附睾头部的差异 | 人类附睾组织、原代人类附睾上皮细胞和类器官培养模型 | 单细胞基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 人类附睾组织样本及体外培养模型 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics Chromium平台 |
| 2231 | 2025-10-06 |
Impending HCC diagnosis in patients with cirrhosis after HCV cure features a natural killer cell signature
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000804
PMID:38381525
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研究论文 | 本研究通过分析自然杀伤细胞特征，识别HCV治愈后肝硬化患者发生肝细胞癌的早期指标 | 首次发现TIM-3hi和CD38+在NK细胞上的持续共表达可作为HCV相关HCC发展的早期预测标志物 | 研究样本量有限，仅针对HCV相关肝硬化患者，需要更大规模验证 | 探索HCV治愈后肝硬化患者发生肝细胞癌的自然杀伤细胞特征 | HCV感染后肝硬化患者（发展为HCC和未发展为HCC两组）及健康对照 | 免疫学 | 肝细胞癌 | 单细胞测序，功能分析实验 | NA | 单细胞测序数据，流式细胞术数据 | 8个队列覆盖HCC发展全过程 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2232 | 2025-10-06 |
Oleic acid-PPARγ-FABP4 loop fuels cholangiocarcinoma colonization in lymph node metastases microenvironment
2024-07-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000784
PMID:38377465
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研究论文 | 本研究揭示了油酸-PPARγ-FABP4正反馈环路在促进胆管癌淋巴结转移微环境定植中的作用机制 | 首次发现淋巴结转移中胆管癌细胞的脂代谢重编程特征，并鉴定出油酸-PPARγ-FABP4正反馈环路的关键调控作用 | NA | 探究胆管癌在淋巴结微环境中定植的代谢重编程机制 | 胆管癌患者的原发肿瘤病灶和配对淋巴结转移灶 | 单细胞测序分析 | 胆管癌 | 单细胞RNA测序,代谢组学,CRISPR/Cas9筛选 | NA | 单细胞转录组数据,代谢组数据 | 胆管癌患者的原发灶和淋巴结转移灶样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2233 | 2024-08-07 |
Alveolar macrophage-CD8 T cell interactions after acute lung allograft dysfunction: Insights from single-cell RNA sequencing
2024-07, The Journal of heart and lung transplantation : the official publication of the International Society for Heart Transplantation
DOI:10.1016/j.healun.2024.03.003
PMID:38490571
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2234 | 2025-10-06 |
Unveiling the hidden role of disulfidptosis in kidney renal clear cell carcinoma: a prognostic signature for personalized treatment
2024-06, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-023-01933-2
PMID:38296888
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于二硫化物死亡相关基因的肾透明细胞癌预后特征模型，用于个性化治疗 | 首次在肾透明细胞癌中系统研究二硫化物死亡的作用，并开发了包含四个基因的预后特征模型 | 需要进一步验证模型在更广泛人群中的适用性 | 探索二硫化物死亡在肾透明细胞癌中的作用并建立预后预测模型 | 肾透明细胞癌患者 | 生物信息学 | 肾癌 | 单细胞测序, 空间转录组学, RT-qPCR, 免疫组化 | 机器学习, 生存模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 发现队列和外部验证队列的肾透明细胞癌患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2235 | 2025-10-06 |
Amelioration of NAFLD by sleeve gastrectomy-triggered hepatocyte regeneration in mice - experimental research
2024-Jun-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000001387
PMID:38573134
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研究论文 | 本研究探讨了袖状胃切除术通过触发肝细胞再生改善非酒精性脂肪肝病的机制 | 首次发现袖状胃切除术通过Yes1蛋白而非YAP信号通路增强肝脏再生能力 | 研究仅在饮食诱导肥胖小鼠模型中进行，尚未在人类中验证 | 阐明袖状胃切除术改善非酒精性脂肪肝病的作用机制 | 饮食诱导肥胖小鼠模型 | NA | 非酒精性脂肪肝病 | 单细胞RNA测序,实时定量逆转录PCR,Olink蛋白质组学 | NA | 基因表达数据,蛋白质组数据,组织图像 | 饮食诱导肥胖小鼠 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 2236 | 2025-10-06 |
Single-cell dissection of the multicellular ecosystem and molecular features underlying microvascular invasion in HCC
2024-06-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1097/HEP.0000000000000673
PMID:37972953
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了肝细胞癌中微血管侵袭相关的多细胞生态系统和分子特征 | 首次在单细胞水平系统解析了HCC中MVI形成的肿瘤微环境特征，发现了TRM2+巨噬细胞与恶性细胞之间以midkine为主导的相互作用机制 | 样本量相对有限（10例患者），需要在更大队列中验证发现 | 探究肝细胞癌中微血管侵袭的细胞和分子机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织 | 数字病理 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，空间转录组数据，免疫荧光图像 | 10例患者样本，46,789个单细胞 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 2237 | 2025-10-06 |
A novel mitochondrial unfolded protein response-related risk signature to predict prognosis, immunotherapy and sorafenib sensitivity in hepatocellular carcinoma
2024-06, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-024-01945-6
PMID:38493408
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研究论文 | 基于线粒体未折叠蛋白反应相关基因构建肝细胞癌预后预测模型 | 首次利用线粒体未折叠蛋白反应相关基因构建肝细胞癌预后特征模型 | NA | 建立预测肝细胞癌患者预后、免疫细胞浸润、免疫治疗和化疗反应的生物标志物 | 肝细胞癌患者 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 转录组分析, Cox回归, LASSO回归, 免疫组织化学, 单细胞RNA测序, 空间转录组分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | 来自TCGA和ICGC数据库的肝细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组 | NA | NA |
| 2238 | 2025-10-06 |
Transcriptomic and Proteomic Characterization of the Immune Response to Elective Spinal Reconstructive Surgery: Impact of Aging and Comparison with Traumatic Injury Response
2024-May-01, Journal of the American College of Surgeons
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/XCS.0000000000000922
PMID:38095316
|
研究论文 | 本研究通过转录组学和蛋白质组学方法，比较了择期脊柱重建手术与创伤性损伤的免疫反应差异，并分析了年龄对免疫反应的影响 | 首次系统比较择期大手术与多发伤患者的免疫反应时序和细胞特征差异，揭示年龄对手术免疫反应的特异性影响 | 样本量较小（老年组5例，年轻组6例，创伤组8例），可能影响统计效力 | 探究择期脊柱重建手术与创伤性损伤的免疫应激反应差异及年龄因素的影响 | 接受择期脊柱重建手术的患者（分为老年组和年轻组）和匹配的创伤患者 | 免疫学 | 脊柱疾病 | 转录组测序，蛋白质组分析，单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据，蛋白质组数据，单细胞数据 | 19例患者（手术组11例，创伤组8例） | SomaLogic, O-link | 单细胞RNA测序，蛋白质组分析 | NA | 双平台蛋白质组分析（SomaLogic和O-link），细胞转录组和表位测序索引 |
| 2239 | 2025-10-06 |
Specific photoreceptor cell fate pathways are differentially altered in NR2E3-associated diseases
2024-05, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2024.106463
PMID:38485095
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析NR2E3基因突变对视网膜光感受器细胞命运分化的影响 | 发现了一种先前未报道的锥细胞通路，可产生同时表达锥细胞和视杆细胞相关基因的杂交锥细胞 | 研究仅使用小鼠模型，未直接验证人类患者样本 | 解析NR2E3基因在视杆细胞和锥细胞转录网络中的精确功能 | 野生型和两种不同Nr2e3突变小鼠模型的视网膜组织 | 单细胞基因组学 | 视网膜营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和两种Nr2e3突变小鼠模型的视网膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2240 | 2025-10-06 |
MAPPING ALZHEIMER'S DISEASE PSEUDO-PROGRESSION WITH MULTIMODAL BIOMARKER TRAJECTORY EMBEDDINGS
2024-May, Proceedings. IEEE International Symposium on Biomedical Imaging
DOI:10.1109/isbi56570.2024.10635249
PMID:39371469
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研究论文 | 本研究提出了一种利用多模态生物标志物轨迹嵌入来映射阿尔茨海默病伪进展的新方法 | 将单细胞转录组学领域的PHATE和Slingshot机器学习方法应用于神经退行性疾病的多模态生物标志物数据分析 | 研究依赖于ADNI数据集，可能需要更多样化的数据验证方法的普适性 | 开发更精确的阿尔茨海默病进展建模和早期诊断方法 | 阿尔茨海默病患者的纵向多模态生物标志物数据 | 机器学习 | 阿尔茨海默病 | PHATE, Slingshot, 轨迹嵌入 | PHATE, Slingshot | 医学影像, 多模态生物标志物数据 | ADNI数据集中的多个疾病阶段个体 | NA | NA | NA | NA |