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当前共找到 38047 篇文献,本页显示第 2221 - 2240 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2221 2026-03-06
Inactivation of Histone Chaperone HIRA Unmasks a Link Between Normal Embryonic Development of Melanoblasts and Maintenance of Adult Melanocyte Stem Cells
2025-Jul, Aging cell IF:8.0Q1
研究论文 本研究通过在小鼠色素系统中条件性敲除组蛋白伴侣HIRA,探索其在胚胎发育和成年期对黑色素细胞干细胞维持的影响 首次揭示HIRA在胚胎黑色素细胞发育中的功能缺陷会持续影响成年期黑色素细胞干细胞的维持,建立了胚胎发育完整性与成年组织干细胞老化之间的直接遗传联系 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类系统中验证;机制层面虽涉及染色质可及性,但具体分子通路仍需进一步阐明 探究组蛋白伴侣HIRA在胚胎发育和成年组织干细胞维持中的双重作用,揭示发育完整性对老化过程的影响 小鼠色素系统,特别是神经嵴来源的黑色素细胞谱系(包括黑色素母细胞和黑色素细胞干细胞) 发育生物学 色素相关疾病 条件性基因敲除,单细胞RNA测序,ATAC-seq,体外细胞模型 遗传小鼠模型 单细胞转录组数据,染色质可及性数据,表型观察数据 未明确说明具体样本数量,但涉及胚胎期和成年期多个时间点的小鼠分析 NA 单细胞RNA-seq,ATAC-seq NA NA
2222 2026-03-06
Systematic characterization of the ovarian landscape across mouse menopause models
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统比较了三种小鼠绝经模型,通过组织学、血清激素分析、单细胞转录组学和机器学习方法,揭示了卵泡丢失、内分泌紊乱和转录重塑的共性与模型特异性特征 首次系统比较三种小鼠绝经模型(自然衰老、化学诱导卵泡耗竭、遗传模型),并整合单细胞转录组学与机器学习进行多维度表征 研究局限于小鼠模型,人类绝经的分子机制可能存在物种差异 建立绝经研究的临床前模型选择框架,解析卵巢衰老的分子机制 三种小鼠绝经模型(自然衰老、VCD化学诱导、Foxl2单倍体不足遗传模型) 计算生物学 妇科疾病 单细胞RNA测序,机器学习 机器学习方法 转录组数据,组织图像,血清激素数据 多种年龄段的三种小鼠模型群体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2223 2026-03-06
SMURF2 Facilitates GAP17 Isoform 1 Membrane Displacement to Promote Mutant p53-KRAS Oncogenic Synergy
2025-Jun-03, Molecular cancer research : MCR IF:4.1Q2
研究论文 本研究揭示了SMURF2通过PPLP基序与GAP17-1相互作用,使其从膜上移位,从而促进突变p53与KRAS的致癌协同作用 首次阐明SMURF2通过识别GAP17-1的PPLP基序导致其膜定位异常,从而维持突变KRAS的GTP结合活化状态,揭示了突变p53与KRAS协同致癌的新机制 研究主要基于细胞系和小鼠模型,临床样本验证相对有限;GAP17-1膜移位的确切分子机制仍需进一步解析 探究突变p53与突变KRAS在胰腺癌中协同致癌的分子机制 胰腺癌细胞系、基因工程小鼠模型、临床胰腺导管腺癌样本 癌症生物学 胰腺癌 单细胞RNA测序、组织微阵列、基因沉默、突变分析 基因工程小鼠模型(iKras*; iKras*, p53*, and p48-Cre; Kras*) 基因表达数据、组织病理数据、临床生存数据 多种胰腺癌细胞系、多个小鼠模型、临床前及临床样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA测序 NA NA
2224 2026-03-06
Single-cell RNA sequencing and spatial transcriptomics reveal unique subpopulations of infiltrating macrophages and dendritic cells following AKI
2025-Jun-01, American journal of physiology. Renal physiology
研究论文 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,揭示了急性肾损伤后肾脏浸润巨噬细胞和树突状细胞的独特亚群及其时空动态特征 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学和CITE测序技术,全面解析了AKI后肾脏浸润免疫细胞的时空异质性和动态变化,并发现了KIMs可能重编程表达KRM特征基因的新现象 研究主要基于小鼠缺血再灌注损伤模型,人类样本的验证和临床转化仍需进一步研究 阐明急性肾损伤后肾脏浸润免疫细胞的异质性、时空分布特征及其功能 小鼠肾脏浸润巨噬细胞(KIMs)、肾脏树突状细胞(KDCs)和肾脏驻留巨噬细胞(KRMs) 单细胞组学 急性肾损伤 单细胞RNA测序, 空间转录组学, CITE测序 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 表位数据 未明确样本数量,基于小鼠缺血再灌注损伤模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2225 2026-03-06
Avian photoreceptor homologies and the origin of double cones
2025-May-19, Current biology : CB IF:8.1Q1
研究论文 本文通过单细胞RNA测序技术,研究了鸟类视网膜中光感受器的进化关系,特别是双锥细胞的起源 首次系统性地探索了鸟类光感受器与其他脊椎动物类群的细胞类型同源性,并揭示了双锥细胞的两个组成部分(DC-P和DC-A)分别起源于祖先的红锥和蓝锥 研究主要基于新孵化的鸡视网膜,可能未涵盖所有鸟类或发育阶段,且进化推断依赖于转录因子表达模式,需进一步功能验证 追踪鸟类光感受器与其他脊椎动物物种的细胞类型同源性,并阐明双锥细胞的进化起源 鸟类(鸡)和绿安乐蜥(Anolis carolinensis)的视网膜光感受器细胞 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),CRISPR介导的基因敲除,顺式调控分析 NA 单细胞转录组数据 新孵化的鸡视网膜细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2226 2026-03-06
Defining pathogenic IL-17 and CSF-1 gene expression signatures in chronic graft-versus-host disease
2025-May-08, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序方法,在小鼠慢性移植物抗宿主病模型中定义了IL-17和CSF-1的基因表达特征,并验证其在患者中的适用性 利用单细胞测序技术在小鼠血液中逆向工程出IL-17和CSF-1的时序表达特征,并首次在cGVHD患者的相关单核细胞群体中识别这些特征 研究基于小鼠模型推导特征,在患者中的验证样本有限(70%诊断患者和50%后续发病患者),且未涉及治疗响应预测的临床前瞻性验证 开发用于识别cGVHD患者中可药物靶向的免疫失调的生物标志物,以指导个体化治疗选择 慢性移植物抗宿主病小鼠模型及患者样本 NA 慢性移植物抗宿主病 单细胞测序 NA 基因表达数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2227 2026-03-06
Single-cell RNA sequencing reveals a reprogramming of hepatic immune cells and a protective role for B cells in MASH-driven HCC
2025-May-01, Hepatology communications IF:5.6Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中肝内免疫细胞的重编程,并强调了B细胞在肝癌中的保护作用 首次在代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌模型中,利用单细胞RNA测序全面解析肝内免疫细胞的异质性和转录重编程,并发现B细胞通过增强T细胞反应发挥抗肿瘤免疫作用 研究基于小鼠模型,结果在人类中的直接适用性需进一步验证;单细胞测序样本量有限,可能未完全捕获所有免疫细胞亚群 探究代谢功能障碍相关脂肪性肝炎驱动的肝细胞癌中免疫细胞的重编程机制及B细胞的抗肿瘤作用 高脂高碳水化合物饮食喂养的MUP-uPA小鼠模型中的肝内免疫细胞 数字病理学 肝癌 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确指定样本数量,但使用小鼠模型进行单细胞RNA测序 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2228 2026-03-06
The dynamic immune behavior of primary and metastatic ovarian carcinoma
2025-Apr-25, NPJ precision oncology IF:6.8Q1
研究论文 本研究结合单细胞测序和空间转录组学,探索高级别浆液性卵巢癌中导致免疫抑制的分子机制 首次结合单细胞测序与空间转录组学技术,系统比较原发性与转移性卵巢癌的免疫微环境动态变化,并揭示上皮细胞与免疫细胞间的交互作用在免疫抑制中的关键角色 研究未明确说明样本量大小,且可能仅限于高级别浆液性卵巢癌亚型,未涵盖其他卵巢癌类型 揭示高级别浆液性卵巢癌免疫抑制的分子机制,为免疫调节药物临床试验设计提供依据 高级别浆液性卵巢癌患者的原发性肿瘤和网膜转移肿瘤 数字病理学 卵巢癌 单细胞测序, 空间转录组学 NA 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2229 2026-03-06
SORBET: Automated cell-neighborhood analysis of spatial transcriptomics or proteomics for interpretable sample classification via GNN
2025-Apr-21, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文介绍了SORBET,一种几何深度学习框架,用于分析空间转录组学或蛋白质组学数据,通过图卷积网络进行可解释的样本分类 SORBET是首个在空间转录组学数据上进行表型预测的示例,利用新颖的数据增强技术和定制可解释性分析,无需将完整细胞谱压缩为有限注释 NA 开发一种自动化细胞邻域分析框架,以整合空间信息与多重分子数据,准确预测表型,如免疫治疗反应 转移性黑色素瘤、非小细胞肺癌和结直肠癌样本 机器学习 黑色素瘤, 非小细胞肺癌, 结直肠癌 空间转录组学, 空间蛋白质组学 图卷积网络(GCN) 空间转录组学数据, 空间蛋白质组学数据 NA NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 CosMx, Imaging Mass Cytometry (IMC), Co-detection by indexing (CODEX) CosMx空间转录组学数据集, Imaging Mass Cytometry (IMC)和CODEX空间蛋白质组学数据集
2230 2026-03-06
Mapping dynamic regulation of gene expression using single-cell transcriptomics and application to complex disease genetics
2025-Apr-10, HGG advances
研究论文 本研究开发了一种基于单细胞转录组学的遗传模型,用于量化基因表达的动态遗传调控及其细胞类型特异性,并应用于精神分裂症等复杂疾病遗传学分析 开发了细胞类型特异性和细胞状态调整的基因表达遗传模型,能够量化基因表达的动态遗传调控并评估其细胞类型特异性,为复杂疾病机制提供新见解 NA 利用单细胞转录组学数据揭示遗传变异如何影响人类生理和疾病相关的生物过程,并应用于复杂疾病遗传学研究 诱导多能干细胞分化为中脑神经元的单细胞转录组数据,以及英国生物库中超过1,500种表型数据 自然语言处理 精神分裂症 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2231 2026-03-06
An expandable synthetic library of human paired antibody sequences
2025-Apr, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文介绍了IgHuAb,一种用于高通量生成配对人类抗体序列的大型语言模型,并基于此创建了模拟自然抗体序列特征的合成抗体库SynAbLib 开发了首个基于大型语言模型的高通量配对人类抗体序列生成方法,并构建了具有更高序列多样性的合成抗体库 未提及具体实验验证的抗体数量或功能活性数据 解决当前单细胞测序方法在配对抗体序列数据获取中的低通量和高成本问题,以更好地理解人类抗体序列的潜在多样性 人类抗体序列 自然语言处理 NA 单细胞测序 大型语言模型 序列数据 NA NA NA NA NA
2232 2026-03-06
The tectum transversum(TTR) maintains patency of the developing coronal suture
2025-Mar-31, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究探讨了小鼠模型中短暂软骨结构TTR在冠状缝发育中的作用,发现其通过抑制BMP信号通路维持冠状缝开放,为冠状缝早闭的病因提供了新见解 首次通过基因消融实验证明TTR在维持冠状缝开放中的关键作用,并利用空间转录组学数据揭示其作为BMP信号屏障的潜在机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性尚需进一步验证;BMP信号调控机制的具体分子通路有待深入探索 探究冠状缝发育的调控机制及冠状缝早闭的病因 小鼠模型中的冠状缝、TTR软骨及相关组织(颅骨、硬脑膜) 发育生物学 颅缝早闭 空间转录组学、基因消融 NA 空间转录组数据、组织学图像 NA NA 空间转录组学 NA NA
2233 2026-03-06
Histidine metabolism drives liver cancer progression via immune microenvironment modulation through metabolic reprogramming
2025-Mar-04, Journal of translational medicine IF:6.1Q1
研究论文 本研究探讨了组氨酸代谢如何通过代谢重编程和免疫微环境调控驱动肝细胞癌进展 揭示了组氨酸代谢通过下调关键细胞通讯通路(如MIF、CLEC、MHC II)和促进BUD23基因表达来重塑免疫抑制微环境的新机制 具体组氨酸代谢产物如何直接调控BUD23的分子机制尚未完全阐明,且临床样本量有限 探究组氨酸代谢在肝细胞癌进展中的作用及其对肿瘤免疫微环境的调控机制 肝细胞癌样本中的不同细胞类型,包括实质细胞、巨噬细胞和T细胞 肿瘤代谢与免疫学 肝细胞癌 单细胞RNA测序、体内外实验、TCGA数据库分析、多变量Cox回归模型 预后模型(基于多变量Cox回归) 单细胞RNA测序数据、TCGA数据库的转录组数据 未明确指定样本数量,但使用了HCC样本和TCGA数据库 NA 单细胞RNA测序 NA NA
2234 2026-03-06
Metabolic stress and age drive inflammation and cognitive decline in mice and humans
2025-Mar, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨代谢应激和年龄如何在小鼠和人类中驱动炎症和认知衰退 结合小鼠高脂饮食模型和人类死后脑组织分析,揭示了代谢应激通过微胶质细胞介导的炎症机制(特别是SPP1基因)促进认知衰退的共性 研究主要基于动物模型和死后组织,难以完全模拟人类活体动态过程,且样本量可能有限 阐明代谢应激(如肥胖、糖尿病)导致认知障碍(包括阿尔茨海默病)的免疫炎症机制 高脂饮食喂养的小鼠以及阿尔茨海默病和2型糖尿病患者的死后脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 空间转录组学,单细胞RNA测序 NA 转录组数据 未明确具体数量,但包括小鼠模型和人类死后组织样本 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
2235 2026-03-06
Transcriptomic responses of lung mesenchymal cells during pneumonia
2025-Feb-25, JCI insight IF:6.3Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠肺炎期间肺间充质细胞的转录组响应,揭示了其多样化和特异性的免疫活动 首次系统性地鉴定了肺炎期间肺间充质细胞的五种亚型及其转录组动态变化,并发现了跨细胞类型的核心响应和亚型特异性响应 研究仅基于小鼠模型,未在人类样本中验证,且时间点有限(仅24小时和6周),可能未覆盖所有疾病阶段 探究肺间充质细胞在肺炎期间的转录组响应及其免疫功能 小鼠肺组织中的间充质细胞 单细胞转录组学 肺炎 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 来自小鼠肺单细胞悬液的间充质细胞,包括初始组、肺炎组和感染恢复组 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2236 2026-03-06
Ag-driven CD8 + T cell clonal expansion is a prominent feature of MASH in humans and mice
2025-Feb-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
研究论文 本研究通过单细胞测序和流式细胞术,揭示了MASH(代谢功能障碍相关脂肪性肝炎)中肝脏T细胞的表型、T细胞受体多样性及抗原驱动的克隆扩增现象 首次在人类和小鼠模型中证实MASH诱导的肝硬化导致肝脏中T细胞发生抗原依赖性克隆扩增和功能分化,并识别了PD1、TIGIT和TOX等慢性抗原刺激标志物 研究未明确驱动T细胞激活的具体抗原靶点,且样本来源限于人类肝硬化和小鼠饮食诱导MASH模型,可能无法完全代表所有MASH亚型 旨在解析MASH进展中T细胞在肝脏积累的表型、T细胞受体多样性及其功能作用 人类肝硬化患者和小鼠饮食诱导MASH模型的肝脏驻留T细胞 免疫学 代谢功能障碍相关脂肪性肝炎 5'单细胞测序, 流式细胞术 NA 单细胞RNA测序数据, 流式细胞术数据 人类肝硬化患者和小鼠MASH模型的肝脏T细胞样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2237 2026-03-06
Mapping cell-cell fusion at single-cell resolution
2025-Jan-24, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本文开发了一种名为ClonMapper Duo(CMDuo)的分子工具包,用于在单细胞分辨率下映射肿瘤细胞群体中的细胞-细胞融合事件 通过结合报告基因表达和工程化的荧光相关索引序列与随机生成的核苷酸条形码,CMDuo能够识别并追踪单个细胞融合事件的起源和结果,这是首次在单细胞水平上实现此类映射 由于依赖于特定的实验系统和条形码技术,CMDuo可能不适用于所有细胞类型或疾病模型,且需要单细胞RNA-seq数据支持 研究细胞-细胞融合在癌症进展和治疗反应中的作用,开发一种高通量单细胞数据平台来映射融合事件 三阴性乳腺癌细胞 单细胞组学 乳腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2238 2026-03-06
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2025-Jan-17, Genome medicine IF:10.4Q1
研究论文 本文通过整合分析小鼠和人类前列腺的单细胞转录组数据,揭示了前列腺组织在稳态、退行、再生和癌症过程中上皮细胞状态的广泛可塑性 利用随机矩阵理论去噪和最优传输方法,首次系统比较了跨物种前列腺上皮细胞转录组相似性,并整合单细胞转录组与拷贝数变异分析,阐明了前列腺癌进展中的转录程序 研究主要基于已发表和新生成的scRNA-seq数据,可能受限于样本数量和技术平台的异质性,且功能验证实验较少 探究前列腺上皮细胞在组织稳态、退行、再生和癌症过程中的动态变化和可塑性 小鼠和人类前列腺组织,包括正常、雄激素剥夺后退行、良性前列腺增生和未经治疗的前列腺癌样本 单细胞转录组学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq) 随机矩阵理论、最优传输 单细胞转录组数据、拷贝数变异数据 整合了多个已发表和新生成的小鼠和人类前列腺scRNA-seq数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2239 2026-03-06
Dimensionality reduction for visualizing spatially resolved profiling data using SpaSNE
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文开发了一种名为SpaSNE的空间解析t-SNE方法,用于整合空间和分子信息,以更准确地可视化空间解析分析数据 SpaSNE是首个针对空间解析分析数据定制的降维方法,整合了空间和分子信息,相比传统方法如t-SNE和UMAP能提供更准确和有意义的数据可视化 NA 开发一种针对空间解析分析数据的降维和可视化方法,以更好地解释细胞类型和分子结构 空间解析分析数据集,包括来自不同疾病、组织和细胞类型的细胞 空间转录组学 NA 空间解析分析技术 t-SNE, UMAP, SpaSNE 空间解析分析数据 多个公共数据集,涵盖3个实验平台和不同疾病、组织及细胞类型 10x Genomics, 其他 空间转录组学, 空间解析分析 Visium, STARmap, MERFISH Visium, STARmap, MERFISH平台生成的空间解析分析数据
2240 2026-03-06
Lifting the curse from high-dimensional data: automated projection pursuit clustering for a variety of biological data modalities
2025-Jan-06, GigaScience IF:11.8Q1
研究论文 本文提出了一种名为自动投影追踪(APP)的无监督聚类方法,通过将高维数据顺序投影到低维表示来缓解维度诅咒,并在多种生物数据模态上验证其有效性 提出了一种替代传统高维空间聚类的方法,通过自动投影追踪技术降低维度诅咒的影响,从而更有效地揭示生物数据中的模式 未明确说明方法在极端高维或噪声数据下的鲁棒性,以及计算效率的详细评估 开发一种能缓解维度诅咒的无监督聚类方法,以改善高维生物数据的分析 高维生物数据,包括转录组学、蛋白质组学、单细胞组学数据等 机器学习 NA 自动投影追踪(APP) 无监督聚类算法 高维生物数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 流式细胞术, 质谱细胞术, 多重成像, T细胞受体库分析 NA NA
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