单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27366 篇文献，本页显示第 22341 - 22360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22341 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals a Tumor-Reactive T Cell Signature Associated With Clinical Outcome and Immunotherapy Response In Melanoma
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.758288
PMID:34804045
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研究论文 | 本研究通过整合分析三个黑色素瘤中T细胞的单细胞RNA测序数据集，揭示了肿瘤微环境中T细胞的广泛异质性功能状态，并识别出表达肿瘤反应性标记和T细胞激活标志的肿瘤反应性T细胞亚群 | 本研究首次开发并验证了一个与临床结果和免疫治疗反应显著相关的肿瘤反应性T细胞相关标志（TRS），该标志在预测免疫治疗反应方面优于CD8+ T细胞浸润水平和先前发表的预后相关标志 | NA | 旨在识别肿瘤反应性T细胞并开发一个与临床结果和免疫治疗反应相关的标志 | 黑色素瘤中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 三个黑色素瘤T细胞数据集及四个外部独立队列 |
| 22342 | 2024-08-08 |
Clinical Impact of Molecular Subtyping of Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743908
PMID:34805152
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研究论文 | 本文探讨了胰腺癌分子亚型对临床的影响及其潜在的临床意义 | 文章介绍了通过激光捕获显微切割和单细胞RNA测序技术揭示的胰腺癌细胞群体的基因组进化，以及不同亚型在化疗反应和生存率上的差异 | 文章未明确提及具体的局限性 | 研究胰腺癌分子亚型的临床相关性，以优化从实验室到临床的转化 | 胰腺癌的分子亚型及其对治疗反应和生存率的影响 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22343 | 2024-08-08 |
Papillary Thyroid Carcinoma Landscape and Its Immunological Link With Hashimoto Thyroiditis at Single-Cell Resolution
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.758339
PMID:34805166
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的免疫学联系 | 首次在单细胞分辨率下揭示了PTC的肿瘤微环境异质性及其与HT的免疫学联系 | 样本量较小，仅包括八名PTC患者，其中三名同时患有HT | 深入理解PTC的肿瘤微环境及其与HT的免疫学联系 | 甲状腺乳头状癌（PTC）及其与桥本甲状腺炎（HT）的关系 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八名PTC患者，其中三名同时患有HT |
| 22344 | 2024-08-08 |
Deciphering the Intercellular Communication Network of Peripartum Decidua that Orchestrates Delivery
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770621
PMID:34805176
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研究论文 | 本研究通过CellCall方法基于围产期蜕膜的scRNA-seq数据重建了蜕膜细胞间的通信网络，并分析了其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 首次系统地解码了围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其内部级联反应，并探讨了其在分娩中的作用 | NA | 旨在理解妊娠维持和分娩过渡中蜕膜细胞间通信的机制 | 围产期蜕膜中的细胞间通信网络及其在分娩和母胎免疫耐受中的作用 | 数字病理学 | 妊娠相关疾病 | scRNA-seq, 单细胞BCR/TCR测序 | CellCall方法 | 单细胞RNA测序数据 | 围产期蜕膜样本 |
| 22345 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Revealed a Critical Role of SPP1/CD44-Mediated Crosstalk Between Macrophages and Cancer Cells in Glioma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.779319
PMID:34805184
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析，揭示了高级别胶质瘤中SPP1/CD44介导的巨噬细胞与癌细胞间的交叉对话在肿瘤进展中的关键作用 | 本研究首次揭示了SPP1/CD44信号轴在高级别胶质瘤进展中的重要作用，并提出其作为潜在治疗靶点的可能性 | NA | 旨在识别驱动高级别胶质瘤肿瘤异质性的细胞和分子机制 | 高级别胶质瘤中的单细胞转录组 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一个高级别胶质瘤样本 |
| 22346 | 2024-08-08 |
Dissecting the heterogeneity and tumorigenesis of BRCA1 deficient mammary tumors via single cell RNA sequencing
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.63995
PMID:34815798
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生机制 | 本研究首次将BRCA1缺陷型乳腺肿瘤分为四个亚型，并揭示了肿瘤内异质性的主要原因，包括细胞增殖、DNA损伤反应/修复和上皮-间质转化（EMT）的活性差异 | NA | 全面阐明BRCA1缺陷型乳腺肿瘤的异质性及其肿瘤发生和进展的潜在机制 | BRCA1缺陷型乳腺肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 来自敲除小鼠的乳腺腺体细胞和乳腺肿瘤细胞 |
| 22347 | 2024-08-08 |
Heterogeneity of cell composition and origin identified by single-cell transcriptomics in renal cysts of patients with autosomal dominant polycystic kidney disease
2021, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.57220
PMID:34815804
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序分析了常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿细胞组成和来源 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了多囊肾囊肿可能来源于集合管或同时来源于近端小管和亨利环，并发现不同来源的囊肿上皮细胞具有不同的基因集激活 | 研究样本仅来自一名患者，可能影响结果的普遍性 | 探索常染色体显性多囊肾病肾囊肿的细胞组成和来源 | 常染色体显性多囊肾病患者的肾囊肿 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 一名患者的正常肾组织和七个囊肿 |
| 22348 | 2024-08-08 |
Characterization of Alzheimer's Disease-Associated Excitatory Neurons via Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2021, Frontiers in aging neuroscience
IF:4.1Q2
DOI:10.3389/fnagi.2021.742176
PMID:34819847
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研究论文 | 本研究利用公开的单核RNA测序数据集，在5XFAD转基因模型和野生型小鼠中揭示了与阿尔茨海默病相关的兴奋性神经元群体（C3:Ex.Neuron）的特征 | 首次详细描述了阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征，并识别出一种先前未被发现的兴奋性神经元亚型（C3.1） | NA | 探索阿尔茨海默病中神经元细胞群体的特征 | 阿尔茨海默病中的兴奋性神经元群体 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 5XFAD转基因模型和野生型小鼠 |
| 22349 | 2024-08-08 |
Development of an Autophagy-Based and Stemness-Correlated Prognostic Model for Hepatocellular Carcinoma Using Bulk and Single-Cell RNA-Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.743910
PMID:34820373
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研究论文 | 本研究开发了一种基于自噬和干细胞相关性的肝细胞癌预后模型，使用批量和单细胞RNA测序数据 | 首次结合批量和单细胞RNA测序数据，构建了基于自噬相关基因的肝细胞癌预后模型，并验证了其预测效能 | 研究仅在ICGC和TCGA数据库中验证了预后模型的效能，未来需在更多独立数据集中进行验证 | 开发和验证一种新的肝细胞癌预后模型，以提高患者生存预测的准确性 | 肝细胞癌（HCC）及其自噬相关基因和干细胞特性 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | RNA测序 | LASSO回归分析 | RNA测序数据 | 使用了ICGC和TCGA数据库中的数据，具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22350 | 2024-08-08 |
Prediction of Non-canonical Routes for SARS-CoV-2 Infection in Human Placenta Cells
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.614728
PMID:34820418
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研究论文 | 研究分析了SARS-CoV-2在人类胎盘细胞中的非经典感染途径 | 发现了胎盘细胞中可能作为SARS-CoV-2非经典感染途径的蛋白质 | NA | 探讨SARS-CoV-2在胎盘细胞中的感染和复制机制 | 人类胎盘细胞中的SARS-CoV-2感染途径 | NA | COVID-19 | 微阵列和单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22351 | 2024-08-08 |
Effectively Clustering Single Cell RNA Sequencing Data by Sparse Representation
2022 Nov-Dec, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3128576
PMID:34788219
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞RNA测序数据聚类方法SPARC，通过稀疏表示系数来测量细胞间的关系，并开发了一种异常值检测方法以辅助参数选择 | SPARC方法引入了一种新的相似性度量，利用每个细胞相对于其他细胞的稀疏表示系数来衡量细胞间的关系，并开发了异常值检测方法以帮助参数选择 | NA | 研究如何更有效地对单细胞RNA测序数据进行聚类分析 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 十二个真实数据集 |
| 22352 | 2024-08-08 |
The effects of TNF-α/TNFR2 in regulatory T cells on the microenvironment and progression of gastric cancer
2022-04-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.33873
PMID:34766338
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研究论文 | 研究探讨了TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | 揭示了TNFR2 Tregs在肿瘤微环境中高浸润水平，并处于激活和效应状态，为胃癌治疗提供了新的理论基础 | NA | 探索TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的特征和作用 | TNFR2调节性T细胞在胃癌微环境和进展中的作用 | 数字病理学 | 胃癌 | 多色免疫荧光、单细胞RNA测序和流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 22353 | 2024-08-08 |
Identifying phenotype-associated subpopulations by integrating bulk and single-cell sequencing data
2022-04, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01091-3
PMID:34764492
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Scissor的方法，通过整合批量和单细胞测序数据来识别与特定表型相关的细胞亚群 | Scissor方法通过量化单个细胞与批量样本之间的相似性，并优化回归模型以识别相关亚群，从而直接将单细胞数据中的细胞簇与特定表型联系起来 | NA | 开发一种方法，能够从单细胞测序数据中识别与特定表型相关的细胞亚群 | 单细胞RNA测序数据和表型相关的批量表达数据 | 数字病理学 | 肺癌, 黑色素瘤, 面肩肱型肌营养不良, 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序 | 回归模型 | 表达数据 | NA |
| 22354 | 2024-08-08 |
Single-Cell, Single-Nucleus, and Spatial RNA Sequencing of the Human Liver Identifies Cholangiocyte and Mesenchymal Heterogeneity
2022-04, Hepatology communications
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/hep4.1854
PMID:34792289
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研究论文 | 本研究通过匹配的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq）分析了73,295个人类肝脏细胞的转录组景观 | 本研究首次结合scRNA-seq和snRNA-seq技术，揭示了人类肝脏中胆管细胞和间质细胞的异质性，并发现了罕见的肝脏间质细胞亚型和胆管细胞前体 | 细胞解离相关的细胞扰动可能限制了完全捕捉人类肝脏实质细胞部分的能力 | 旨在通过高分辨率转录组分析，全面描绘健康人类肝脏中的实质细胞群体 | 人类肝脏中的细胞类型及其转录组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 73,295个人类肝脏细胞 |
| 22355 | 2024-08-08 |
Fibroblast-mediated intercellular crosstalk in the healthy and diseased heart
2022-03, FEBS letters
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/1873-3468.14234
PMID:34787896
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综述 | 本文综述了心脏成纤维细胞在健康和疾病心脏中的细胞间交流作用 | NA | NA | 探讨成纤维细胞在心脏稳态和疾病状态中的作用 | 心脏成纤维细胞与其他心脏细胞的相互作用 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 22356 | 2024-08-08 |
Gain-of-function mutations in RPA1 cause a syndrome with short telomeres and somatic genetic rescue
2022-02-17, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2021011980
PMID:34767620
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研究论文 | 本文报道了RPA1基因的获得性功能突变导致一种综合征，该综合征表现为端粒缩短和体细胞遗传拯救现象 | 首次描述了由RPA1基因的获得性功能突变引起的人类疾病，并发现了体细胞遗传拯救现象 | NA | 研究RPA1基因突变对端粒生物学和临床症状的影响 | RPA1基因突变在4个无关联的短端粒综合征患者中的表现和机制 | NA | NA | CRISPR/Cas9 | NA | 单细胞测序数据 | 4个无关联的短端粒综合征患者 |
| 22357 | 2024-08-08 |
An in situ sequencing approach maps PLASTOCHRON1 at the boundary between indeterminate and determinate cells
2022-02-04, Plant physiology
IF:6.5Q1
DOI:10.1093/plphys/kiab533
PMID:34791481
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研究论文 | 本文优化了空间转录组学方法——原位测序（ISS），以在同一组织切片上同时共定位90个基因的转录本，并展示了其在玉米（Zea mays）茎尖顶端的应用。 | 本文首次将空间转录组学应用于植物茎尖顶端，提供了转录事件的时空序列，并展示了PLASTOCHRON1（PLA1）在不定细胞和定型细胞边界处的特异性表达。 | 本文提到的技术在分辨率和灵敏度上仍有改进空间，这可能会影响其在植物发育生物学研究中的应用。 | 研究植物茎尖顶端的分生组织中分子信号如何在离散细胞中决定叶片何时何地开始发育。 | 玉米（Zea mays）茎尖顶端的组织切片中的90个基因的转录本。 | 植物生物学 | NA | 原位测序（ISS） | NA | 转录本 | 同一组织切片上的90个基因 |
| 22358 | 2024-08-08 |
bollito: a flexible pipeline for comprehensive single-cell RNA-seq analyses
2022-01-27, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btab758
PMID:34788788
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研究论文 | bollito是一个用于全面分析单细胞RNA-seq数据的自动化、灵活且可并行化的计算管道 | bollito整合了超过30种最先进的工具，涵盖了从质量控制到RNA速度分析的多个单细胞分析任务，并且其模块化设计使得易于集成其他软件包以扩展功能 | NA | 开发一个全面的单细胞RNA-seq数据分析管道 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达矩阵 | NA |
| 22359 | 2024-08-08 |
Allelic variation in class I HLA determines CD8+ T cell repertoire shape and cross-reactive memory responses to SARS-CoV-2
2022-01-21, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abk3070
PMID:34793243
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研究论文 | 本研究利用单细胞多组学技术，分析了四种主要HLA I类等位基因在SARS-CoV-2感染中对CD8 T细胞反应的影响 | 首次通过单细胞多组学技术，统一体外表征了CD8 T细胞对SARS-CoV-2的反应，并揭示了HLA基因型对表位特异性、TCRα/β序列多样性和预存SARS-CoV-2反应性记忆T细胞池利用的关键影响 | NA | 研究HLA I类等位基因变异如何影响CD8 T细胞对SARS-CoV-2的反应 | CD8 T细胞对SARS-CoV-2的反应 | 免疫学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞多组学技术 | NA | 单细胞转录组 | 四种主要HLA I类等位基因 |
| 22360 | 2024-08-08 |
Resolving the difference between left-sided and right-sided colorectal cancer by single-cell sequencing
2022-01-11, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.152616
PMID:34793335
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了左半和右半结直肠癌的单细胞转录组，揭示了两者在免疫细胞状态和分子特征上的差异 | 首次发现左半结直肠癌中存在一种潜在的新型RBP4+NTS+癌细胞亚群，并且左半结直肠癌中的调节性T细胞显示出更高的免疫治疗相关基因表达水平 | 研究样本量较小，仅包括6名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究左半和右半结直肠癌在单细胞水平上的差异及其对预后的影响 | 左半和右半结直肠癌的单细胞转录组 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 27,927个单细胞来自3名左半和3名右半结直肠癌患者 |