单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 22341 - 22360 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22341 | 2024-08-08 |
Oncostatin M can sensitize sensory neurons in inflammatory pruritus
2021-11-10, Science translational medicine
IF:15.8Q1
DOI:10.1126/scitranslmed.abe3037
PMID:34757808
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研究论文 | 研究探讨了细胞因子oncostatin M（OSM）在慢性瘙痒中的作用及其机制 | 首次揭示了OSM作为瘙痒神经调节剂的作用，并提出OSM信号转导作为抗瘙痒治疗的新靶点 | NA | 探究慢性瘙痒的分子成分和机制 | 慢性瘙痒及相关皮肤病 | NA | 皮肤病 | 单细胞测序 | NA | NA | 小鼠模型 |
| 22342 | 2024-08-08 |
Optimization of library preparation based on SMART for ultralow RNA-seq in mice brain tissues
2021-Nov-10, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08132-w
PMID:34758728
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研究论文 | 本文介绍了一种针对极低输入RNA测序的高灵敏度文库构建协议 | 使用Maxima H Minus反转录酶和rN修饰的TSO，以及所有m7G帽化的RNA模板，提高了测序灵敏度和低丰度基因检测能力 | NA | 优化文库准备方法，提高极低输入RNA测序的灵敏度和低丰度基因检测能力 | 小鼠脑组织中的极低输入RNA | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | 从低至0.5 pg的总RNA样本中成功制备RNA-seq文库，并鉴定出超过2000个基因 |
| 22343 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals opposing roles of Shp2 in Myc-driven liver tumor cells and microenvironment
2021-11-09, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2021.109974
PMID:34758313
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research paper | 本研究揭示了Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中扮演相反角色 | 首次展示了Myc驱动的肝细胞癌在Shp2缺失的小鼠中加剧，并依赖于Shp2维持的Ras-Erk信号通路 | NA | 探讨Myc驱动的肝癌发生机制 | Shp2在Myc驱动的肝肿瘤细胞和微环境中的作用 | digital pathology | 肝癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型和肝细胞癌患者样本 |
| 22344 | 2024-08-08 |
Olig2-astrocytes express neutral amino acid transporter SLC7A10 (Asc-1) in the adult brain
2021-11-08, Molecular brain
IF:3.3Q2
DOI:10.1186/s13041-021-00874-8
PMID:34749773
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研究论文 | 研究报道了转录因子Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中表达中性氨基酸转运蛋白SLC7A10（Asc-1） | 首次揭示了Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中表达SLC7A10，并探讨了其在这些细胞中的特定功能 | NA | 探究Olig2标记的星形胶质细胞亚群在成年大脑中的特定功能 | 成年小鼠大脑中的Olig2标记星形胶质细胞和GFAP标记星形胶质细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序, 激光显微切割, 定量逆转录PCR, 免疫组织化学 | NA | RNA | 来自成年小鼠大脑的Olig2和GFAP标记的星形胶质细胞 |
| 22345 | 2024-08-08 |
Profiling cellular diversity in sponges informs animal cell type and nervous system evolution
2021-Nov-05, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.abj2949
PMID:34735222
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研究论文 | 本研究通过在无神经系统和水肌动物海绵中进行全身单细胞RNA测序，揭示了18种不同的细胞类型，并探讨了动物细胞类型和神经系统的进化起源。 | 首次在海绵中发现并描述了与神经系统相关的细胞类型，如神经样细胞和收缩性扁平细胞，并展示了这些细胞在消化腔室中的组织和通信系统。 | NA | 探究动物细胞类型和神经系统的进化起源。 | 海绵中的细胞多样性及其在动物细胞类型和神经系统进化中的作用。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 一个海绵样本 |
| 22346 | 2024-08-08 |
OCT4-mediated inflammation induces cell reprogramming at the origin of cardiac valve development and calcification
2021-Nov-05, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abf7910
PMID:34739324
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研究论文 | 研究揭示了OCT4通过NFκB介导的炎症反应在心脏瓣膜发育和钙化中的作用 | 首次发现OCT4在成年瓣膜细胞中的表达导致钙化，并揭示了NFκB-和OCT4介导的炎症途径在瓣膜钙化中的新机制 | NA | 探讨细胞可塑性在心脏瓣膜发育和疾病中的作用 | 小鼠和人类的心脏瓣膜细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪和单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 涉及小鼠和人类的心脏瓣膜细胞 |
| 22347 | 2024-08-08 |
Fibromine is a multi-omics database and mining tool for target discovery in pulmonary fibrosis
2021-11-05, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-01069-w
PMID:34741074
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研究论文 | 本文介绍了Fibromine数据库及其挖掘工具，用于肺纤维化中的靶点发现 | Fibromine是一个集成数据库和探索环境，包含重新分析和手动整理的转录组和蛋白质组肺纤维化数据集，提供动态数据探索和实时集成功能 | NA | 旨在通过比较分析和挖掘公开的肺纤维化相关数据集，验证和创建新的研究假设 | 肺纤维化的治疗靶点 | 数字病理学 | 肺纤维化 | scRNA-seq | NA | 转录组和蛋白质组数据 | 涵盖广泛的实验设计和患者及动物模型 |
| 22348 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq of out-of-thaw mesenchymal stromal cells shows tissue-of-origin differences and inter-donor cell-cycle variations
2021-11-04, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-021-02627-9
PMID:34736534
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了来自不同组织来源的人间充质基质细胞（hMSCs）在解冻后的转录组特征和组织特异性差异 | 首次揭示了解冻后人源间充质基质细胞的单细胞转录组景观及其组织特异性差异，并发现了与免疫调节和细胞周期状态相关的差异表达基因 | 研究仅限于从健康供体获得的hMSCs，且样本量相对较小 | 探讨解冻后人源间充质基质细胞的单细胞转录组特征及其组织特异性差异 | 来自骨髓和脐带组织的人源间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 13个hMSC样本来自10名健康供体 |
| 22349 | 2024-08-08 |
Construction and external validation of a 5-gene random forest model to diagnose non-obstructive azoospermia based on the single-cell RNA sequencing of testicular tissue
2021-11-04, Aging
DOI:10.18632/aging.203675
PMID:34738918
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研究论文 | 本文基于单细胞RNA测序数据构建并验证了一个用于诊断非阻塞性无精症的5基因随机森林模型 | 开发了一种新的基因标记，并基于单细胞RNA测序分析进行了外部验证，为揭示非阻塞性无精症的潜在机制提供了新的生物标志物 | NA | 开发和验证一种新的诊断非阻塞性无精症的基因模型 | 非阻塞性无精症和阻塞性无精症的诊断 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | 随机森林 (RF) | 单细胞RNA测序数据 | 432个睾丸细胞样本，58个训练集样本，20个外部验证集样本，20个阻塞性无精症和20个非阻塞性无精症的精液和睾丸活检样本 |
| 22350 | 2024-08-08 |
Single-cell spatial transcriptomics
2021-11, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-021-00778-8
PMID:34750575
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22351 | 2024-08-08 |
Temporal controls over inter-areal cortical projection neuron fate diversity
2021-11, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-04048-3
PMID:34754107
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研究论文 | 本文通过结合MAPseq和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠新皮层中单个ICPN的连接组和转录组，揭示了不同类型ICPN在分子和功能分化上的时间差异 | 首次将连接组和转录组数据结合，揭示了ICPN在分子和功能分化上的时间差异，并发现SOX11转录因子在不同类型ICPN中的差异表达 | 仅限于小鼠新皮层中的ICPN研究，未涉及其他物种或其他脑区 | 探究新皮层中ICPN的分子和功能分化机制 | 小鼠新皮层中的ICPN | 神经科学 | NA | MAPseq, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠新皮层中的单个ICPN |
| 22352 | 2024-08-08 |
A conserved expression signature predicts growth rate and reveals cell & lineage-specific differences
2021-11, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009582
PMID:34762642
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研究论文 | 研究通过RNA测序分析快速和慢速增殖的同源细胞，发现了一种进化上保守的与增殖相关的转录组特征，并揭示了细胞类型和谱系特异性的差异 | 识别了一种在所有真核生物中保守的与增殖相关的转录组特征，并能准确预测酵母和癌细胞的生长速率 | 研究主要集中在小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞，可能需要进一步验证在其他细胞类型中的适用性 | 探究快速和慢速增殖细胞之间的差异，并识别与增殖相关的转录组特征 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞的快速和慢速增殖亚群 |
| 22353 | 2024-08-08 |
Combined Mechanical and Enzymatic Dissociation of Mouse Brain Hippocampal Tissue
2021-10-21, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/63007
PMID:34747412
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research paper | 本文介绍了一种结合机械和酶解的神经解离协议，用于优化小鼠海马组织处理，以便进行详细的下游分析如流式细胞术或单细胞测序 | 该方法通过结合自动化机械解离和酶解消化，能够持续产生高存活率（>90%）的单细胞悬液，克服了传统方法中获取高存活率单细胞悬液的困难 | 部分步骤需要手动操作，这可能增加样本处理和潜在的细胞损失 | 优化小鼠海马组织的解离过程，以便进行下游的单细胞分析 | 小鼠海马组织 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞悬液 | 小量神经组织 |
| 22354 | 2024-08-08 |
Discovery and construction of prognostic model for clear cell renal cell carcinoma based on single-cell and bulk transcriptome analysis
2021-Sep, Translational andrology and urology
IF:1.9Q3
DOI:10.21037/tau-21-581
PMID:34733651
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研究论文 | 本研究基于单细胞和批量转录组分析，发现并构建了透明细胞肾细胞癌的预后模型 | 本研究整合了单细胞和批量转录组数据，发现了两种具有不同生物学特性的透明细胞肾细胞癌亚型及两个潜在的生物标志物，并构建了一个新的预后模型 | NA | 发现透明细胞肾细胞癌的新生物标志物并构建预后模型 | 透明细胞肾细胞癌 | 数字病理学 | 肾癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 5,933个细胞 |
| 22355 | 2024-08-08 |
Identification of the distinctive role of DPT in dilated cardiomyopathy: a study based on bulk and single-cell transcriptomic analysis
2021-Sep, Annals of translational medicine
DOI:10.21037/atm-21-2913
PMID:34733953
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研究论文 | 本研究通过批量和单细胞转录组分析，识别了DPT在扩张型心肌病中的独特作用 | 首次揭示了DPT在扩张型心肌病中的关键作用，并提出了DPT+成纤维细胞作为心脏重塑过程的新调节因子 | NA | 旨在通过批量和单细胞转录组分析，寻找扩张型心肌病中的潜在关键基因和调节因子 | 扩张型心肌病中的关键基因和调节因子 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 转录组分析 | LASSO回归, SVM-RFE, PPI网络 | 转录组数据 | 使用了三个微阵列数据集（GSE57338, GSE42955, GSE79962）和一个验证数据集（GSE116250），以及两个单细胞RNA测序数据集（GSE109816和GSE121893） |
| 22356 | 2024-08-08 |
Identification and Validation of a Malignant Cell Subset Marker-Based Polygenic Risk Score in Stomach Adenocarcinoma Through Integrated Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720649
PMID:34733840
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研究论文 | 本研究旨在基于恶性细胞标记物的表达，构建胃腺癌（STAD）患者不良生存的多元风险评分（PRS） | 通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了胃腺癌中有限的但显著的肿瘤内异质性，并提出了一种基于恶性细胞亚群标记物的PRS | NA | 构建并验证基于恶性细胞标记物的多元风险评分，以预测胃腺癌患者的预后 | 胃腺癌患者的恶性细胞标记物及其预后影响 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox回归分析 | RNA测序数据 | 涉及胃腺癌和正常胃组织的批量和单细胞RNA测序数据，以及两个独立的外部验证数据集 |
| 22357 | 2024-08-08 |
Integrated Single-Cell Bioinformatics Analysis Reveals Intrinsic and Extrinsic Biological Characteristics of Hematopoietic Stem Cell Aging
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.745786
PMID:34737765
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研究论文 | 本研究通过整合三个独立的造血干细胞（HSC）单细胞转录组数据集，揭示了HSC衰老的内在和外在生物学特征 | 首次识别出Stat3和Ifngr1作为偏向凋亡和炎症的衰老HSC的标志物，并发现Skp2诱导的信号通路在衰老HSC中加速G1期过渡 | NA | 阐明造血干细胞衰老的生物学特征及其潜在的标志物和治疗靶点 | 造血干细胞（HSC）的衰老机制 | 干细胞研究 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 三个独立的HSC单细胞转录组数据集 |
| 22358 | 2024-08-08 |
Discussion of "Exponential-family Embedding with Application to Cell Developmental Trajectories for Single-cell RNA-seq Data"
2021, Journal of the American Statistical Association
IF:3.0Q1
DOI:10.1080/01621459.2021.1880920
PMID:34744216
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comments | 本文讨论了指数族奇异值分解（eSVD）在单细胞RNA-seq数据中细胞发育轨迹应用的新方法及其面临的挑战 | eSVD提供了一个灵活的降维框架，能够处理单参数指数族分布并已证明其一致性 | 本文讨论了eSVD及其他类似方法在未来需要解决的多个开放问题和挑战 | 探讨eSVD及其类似方法的潜力和未来研究方向 | eSVD方法及其在数据分析中的应用 | NA | NA | 指数族奇异值分解（eSVD） | NA | 单细胞RNA-seq数据 | NA |
| 22359 | 2024-08-08 |
Meta-Analysis Reveals Transcription Factor Upregulation in Cells of Injured Mouse Sciatic Nerve
2021, Frontiers in cellular neuroscience
IF:4.2Q2
DOI:10.3389/fncel.2021.688243
PMID:34744629
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meta-analysis | 本研究通过分析四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，识别并验证了在小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中至少两倍上调的55个转录因子 | 首次系统地分析了小鼠坐骨神经损伤后远端神经节中转录因子的上调情况，并通过单细胞RNA测序数据进行了验证 | NA | 旨在理解关键转录因子在外周神经再生中的功能，并为未来研究设计提供实验依据 | 小鼠坐骨神经损伤后的转录因子上调情况 | NA | NA | 微阵列数据分析，mRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 涉及四个微阵列数据集和一个批量mRNA测序数据集，以及单细胞RNA测序数据集 |
| 22360 | 2024-08-08 |
A Dynamic Transcriptome Map of Different Tissue Microenvironment Cells Identified During Gastric Cancer Development Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.728169
PMID:34745098
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，生成了胃癌发展过程中不同组织微环境细胞的动态转录图谱 | 本研究首次揭示了组织微环境细胞在胃癌发展过程中的关键转变标志物和动态致癌轨迹 | NA | 揭示胃癌发展过程中组织微环境细胞的关键病理机制 | 胃癌发展过程中的组织微环境细胞 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |