单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28447 篇文献，本页显示第 22301 - 22320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22301 | 2024-08-08 |
Astrogenesis in the murine dentate gyrus is a life-long and dynamic process
2022-06-01, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021110409
PMID:35451150
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研究论文 | 本文通过结合免疫组织化学方法、遗传命运图谱、行为范式、单细胞转录组学和体内双光子成像技术，全面评估了小鼠齿状回中星形胶质细胞的生成和增殖过程。 | 研究发现齿状回中的星形胶质细胞生成主要通过局部星形胶质细胞的增殖实现，并且这些细胞能够根据环境和行为刺激调整其增殖，显示出意想不到的可塑性。 | NA | 研究星形胶质细胞在齿状回中的生成和增殖过程及其对海马可塑性的贡献。 | 小鼠齿状回中的星形胶质细胞。 | 神经科学 | NA | 免疫组织化学、遗传命运图谱、单细胞转录组学、双光子成像 | NA | 图像 | 小鼠 |
| 22302 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Heterogeneity of Myf5-Derived Cells and Altered Myogenic Fate in the Absence of SRSF2
2022-06, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202105775
PMID:35460187
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研究论文 | 本研究探讨了剪接因子SRSF2在肌细胞增殖和肌生成中的作用，通过单细胞RNA测序揭示了Myf5来源细胞的异质性及其在缺乏SRSF2情况下的肌生成命运改变 | 首次揭示了SRSF2在肌细胞增殖和肌生成中的关键作用，并通过单细胞RNA测序展示了Myf5来源细胞的异质性 | NA | 研究SRSF2在肌细胞增殖和肌生成中的作用及其对Myf5来源细胞命运的影响 | Myf5来源细胞和SRSF2在肌生成中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Myf5-cre小鼠缺乏SRSF2的细胞 |
| 22303 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing-Based Characterization of Resident Lung Mesenchymal Stromal Cells in Bronchopulmonary Dysplasia
2022-05-27, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxab023
PMID:35445270
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了正常和氧暴露新生小鼠肺部Ly6a+肺间充质基质细胞（L-MSCs）的表达谱，以探讨其在稳态和损伤后的特性 | 首次详细描述了肺部驻留间充质基质细胞在正常发育和支气管肺发育不良中的再生能力，并提出了Serpinf1作为L-MSCs的新型稳定标记物 | 研究仅限于小鼠模型，且未探讨人类中的相关性 | 旨在表征稳态和损伤后肺部间充质基质细胞的特性 | 肺部驻留间充质基质细胞在正常发育和支气管肺发育不良中的特性 | 数字病理学 | 支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 15,000个Ly6a+ L-MSCs |
| 22304 | 2024-08-08 |
GMHCC: high-throughput analysis of biomolecular data using graph-based multiple hierarchical consensus clustering
2022-05-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac290
PMID:35451457
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研究论文 | 本文开发了一种基于图的多层次共识聚类方法GMHCC，用于高吞吐量生物分子数据分析 | 提出了基于图的无监督特征排序模型和基于图的链接方法，以探索多类型生物分子数据的多层次信息 | 现有的计算方法常受限于高维度、数据异质性和噪声问题 | 开发新的聚类方法以解决生物分子数据分析中的挑战 | 多类型生物分子数据，包括35个癌症基因表达数据集和8个单细胞RNA-seq数据集 | 生物信息学 | 癌症 | 高吞吐量测序技术 | 基于图的多层次共识聚类（GMHCC） | 基因表达数据、单细胞RNA-seq数据 | 35个癌症基因表达数据集和8个单细胞RNA-seq数据集 |
| 22305 | 2024-08-08 |
scSGL: kernelized signed graph learning for single-cell gene regulatory network inference
2022-05-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac288
PMID:35451460
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研究论文 | 本文提出了一种新的单细胞基因调控网络推断方法scSGL，该方法基于图信号处理的图学习方法，能够处理单细胞RNA测序数据中的零值和高比例的细胞周期异质性 | scSGL方法能够学习带有符号的图，这是基因调控网络的一个特征，能够同时考虑基因网络中的激活和抑制关系，并通过核方法处理非线性共表达和有效处理高频零值 | NA | 阐明从大型单细胞RNA测序数据集中基因调控网络的拓扑结构，同时有效捕捉其内在的细胞周期异质性和缺失值 | 单细胞基因调控网络 | 计算系统生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图学习方法 | 基因表达数据 | 使用模拟数据集、人类和小鼠胚胎数据集进行性能评估 |
| 22306 | 2024-08-08 |
Fibroblastic SMOC2 Suppresses Mechanical Nociception by Inhibiting Coupled Activation of Primary Sensory Neurons
2022-05-18, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2132-21.2022
PMID:35437277
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研究论文 | 本文研究了成纤维细胞分泌的钙结合蛋白SMOC2在抑制机械痛觉中的作用 | 揭示了成纤维细胞SMOC2通过抑制邻近DRG神经元的耦合激活来抑制机械痛觉的特定作用 | NA | 探讨成纤维细胞分子在痛觉调节中的作用 | 成纤维细胞SMOC2及其在DRG神经元中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 钙成像 | NA | NA | 雌雄小鼠 |
| 22307 | 2024-08-08 |
Cilo-seq: highly sensitive cell-in-library-out single-cell transcriptome sequencing with digital microfluidics
2022-05-17, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/d2lc00167e
PMID:35439800
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research paper | 本文介绍了一种基于数字微流控技术的高性能单细胞转录组测序平台Cilo-seq | Cilo-seq平台通过特定的界面设计、微小的反应体积、辅助磁场控制和精确的液滴控制，实现了单细胞的高效分离、核酸扩增、低损耗核酸纯化和高质量文库制备 | NA | 开发一种集成化的单细胞转录组测序平台，以提高检测灵敏度、准确性和成本效率 | 单细胞转录组测序 | digital microfluidics | NA | scRNA-seq | NA | transcriptome | 单个细胞 |
| 22308 | 2024-08-08 |
scDeconv: an R package to deconvolve bulk DNA methylation data with scRNA-seq data and paired bulk RNA-DNA methylation data
2022-05-13, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac150
PMID:35453146
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研究论文 | 开发了一个名为scDeconv的R包，用于利用scRNA-seq数据和配对的bulk RNA-DNA甲基化数据来解决DNA甲基化数据的参考缺陷问题，并进行跨组学方式的细胞成分解析 | 提出了一种新的方法，通过利用scRNA-seq数据和配对的bulk RNA-DNA甲基化数据来解决DNA甲基化数据的细胞类型特异性参考缺乏问题，并进行细胞成分的解析 | 需要适当的配对数据集来应用该方法，且目前主要针对DNA甲基化数据，未来可能扩展到其他组学数据 | 开发一种新的方法来解决DNA甲基化数据的细胞类型特异性参考缺乏问题，并进行细胞成分的解析 | DNA甲基化数据、scRNA-seq数据和配对的bulk RNA-DNA甲基化数据 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq, DNA甲基化测序 | 集成模型 | DNA甲基化数据、RNA数据 | 涉及三个测试数据集 |
| 22309 | 2024-08-08 |
Multilayered omics reveal sex- and depot-dependent adipose progenitor cell heterogeneity
2022-05-03, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.03.012
PMID:35447091
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研究论文 | 本文采用多层组学方法，分析了不同性别和部位的脂肪前体细胞异质性 | 首次全面定义了脂肪前体细胞异质性的分子基础，并结合蛋白质组学和转录组学数据，提供了深入的见解 | NA | 揭示脂肪前体细胞异质性的分子机制 | 成年白色脂肪组织中的间充质基质细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、质谱法 | NA | 蛋白质、基因表达数据 | 从雄性和雌性小鼠的腹股沟和盆腔白色脂肪组织中采集的八种不同基质细胞群体 |
| 22310 | 2024-08-08 |
Publisher Correction: Museum of spatial transcriptomics
2022-May, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-022-01494-3
PMID:35440782
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22311 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Technology Revealed the Pivotal Role of Fibroblast Heterogeneity in Angiotensin II-Induced Abdominal Aortic Aneurysms
2022-May, DNA and cell biology
IF:2.6Q2
DOI:10.1089/dna.2021.0923
PMID:35451888
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术揭示了纤维母细胞异质性在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中的关键作用 | 本研究首次通过单细胞RNA测序技术揭示了纤维母细胞在腹主动脉瘤发展中的重要作用，包括免疫调节和细胞外基质代谢平衡 | NA | 旨在基于单细胞RNA测序技术，揭示血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤在小鼠中的细胞异质性、分子改变和功能转变 | 小鼠的腹主动脉组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 超过27,000个细胞 |
| 22312 | 2024-08-08 |
Virus-related collapsing glomerulopathy, a common mechanism of injury?
2022-05, Kidney international
IF:14.8Q1
DOI:10.1016/j.kint.2022.02.009
PMID:35461615
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研究论文 | 本文利用空间转录组技术研究了与HIV感染或SARS-CoV-2相关的塌陷性肾小球病，发现尽管形态相似，但可能具有不同的分子特征 | 首次应用空间转录组技术研究塌陷性肾小球病，揭示了可能存在的不同分子特征 | 由于组织样本不足，传统的转录组研究面临挑战 | 探讨塌陷性肾小球病是否存在共同的损伤机制 | 与HIV感染或SARS-CoV-2相关的塌陷性肾小球病患者 | NA | NA | 空间转录组技术 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 22313 | 2024-08-08 |
ZNF117 regulates glioblastoma stem cell differentiation towards oligodendroglial lineage
2022-04-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29884-3
PMID:35459228
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研究论文 | 研究探讨了ZNF117基因在调控胶质母细胞瘤干细胞向少突胶质细胞系分化的作用 | 首次发现ZNF117是调控胶质母细胞瘤干细胞向少突胶质细胞系分化的关键基因，并展示了CRISPR/Cas9基因编辑纳米颗粒在靶向治疗中的应用潜力 | NA | 旨在发现和验证调控胶质母细胞瘤干细胞分化的基因，以改善胶质母细胞瘤的治疗 | 胶质母细胞瘤干细胞及其分化 | NA | 脑瘤 | RNAi筛选，单细胞RNA测序 | NA | 图像，RNA序列 | NA |
| 22314 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics identifies Mcl-1 as a target for senolytic therapy in cancer
2022-04-21, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29824-1
PMID:35449130
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，发现衰老肿瘤细胞依赖抗凋亡基因Mcl-1生存，并探讨了针对Mcl-1的衰老疗法在癌症治疗中的潜力 | 首次揭示衰老肿瘤细胞通过上调Mcl-1基因来逃避凋亡，并验证了Mcl-1抑制剂S63845在消除衰老肿瘤细胞和转移中的有效性 | NA | 探讨衰老肿瘤细胞的生存机制及其在癌症治疗中的应用 | 衰老肿瘤细胞及其在癌症治疗中的作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22315 | 2024-08-08 |
One Cell At a Time (OCAT): a unified framework to integrate and analyze single-cell RNA-seq data
2022-04-20, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02659-1
PMID:35443717
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研究论文 | 提出了一种名为OCAT的机器学习方法，用于高效整合多个大规模单细胞RNA测序数据集 | OCAT方法通过稀疏编码单细胞基因表达，无需选择高变异基因或显式批次效应校正，即可整合来自多个来源的数据 | NA | 开发一种新的方法来高效整合和分析大规模单细胞RNA测序数据集 | 单细胞RNA测序数据集的整合与分析 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | OCAT | 基因表达数据 | 多个大规模数据集 |
| 22316 | 2024-08-08 |
Technique integration of single-cell RNA sequencing with spatially resolved transcriptomics in the tumor microenvironment
2022-Apr-19, Cancer cell international
IF:5.3Q1
DOI:10.1186/s12935-022-02580-4
PMID:35440049
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序与空间转录组学在肿瘤微环境中的整合应用 | 整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，以充分利用两者的优势，深入探索复杂的组织结构和相互作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序与空间转录组学整合方法在肿瘤微环境中的应用，特别是在细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 肿瘤微环境中的细胞成分及其在癌症发生和发展中的作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22317 | 2024-08-08 |
Metacell-2: a divide-and-conquer metacell algorithm for scalable scRNA-seq analysis
2022-04-19, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02667-1
PMID:35440087
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研究论文 | 介绍了一种名为Metacell-2的递归分治算法，用于高效地将任何大小的单细胞RNA测序数据集分解成称为metacells的小而紧密的细胞群 | Metacell-2算法提高了异常细胞检测和稀有细胞类型识别的能力 | NA | 开发一种可扩展的单细胞RNA测序分析方法 | 单细胞RNA测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分治算法 | 基因表达数据 | 涉及人类骨髓细胞图谱和鼠胚胎数据 |
| 22318 | 2024-08-08 |
Endothelial progenitor cells stimulate neonatal lung angiogenesis through FOXF1-mediated activation of BMP9/ACVRL1 signaling
2022-04-19, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-29746-y
PMID:35440116
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研究论文 | 本文研究了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成的分子机制 | 首次揭示了内皮祖细胞通过FOXF1介导的BMP9/ACVRL1信号通路促进新生肺血管生成和肺泡化的机制 | NA | 探究内皮祖细胞在新生肺血管生成中的作用及其分子机制 | 内皮祖细胞、FOXF1、BMP9、ACVRL1 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Foxf1突变小鼠和ACDMPV患者的肺组织 |
| 22319 | 2024-08-08 |
A single-cell atlas of diffuse large B cell lymphoma
2022-04-19, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.110713
PMID:35443163
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本的94,324个细胞的转录组，揭示了恶性细胞中的73个基因表达程序和复杂的细胞间相互作用 | 首次在单细胞水平上揭示了弥漫大B细胞淋巴瘤的高度异质性和复杂的肿瘤微环境，特别是发现了B细胞淋巴瘤中恶性细胞与T细胞间的CD70-CD27共刺激相互作用 | NA | 深入理解B细胞淋巴瘤的发病机制，并为设计靶向免疫治疗策略提供新思路 | 弥漫大B细胞淋巴瘤及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | B细胞淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 94,324个细胞来自17例弥漫大B细胞淋巴瘤和3个对照样本 |
| 22320 | 2024-08-08 |
Correction to: Using single-cell sequencing technology to detect circulating tumor cells in solid tumors
2022-Apr-18, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01564-2
PMID:35436930
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |