单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22301 - 22320 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22301 | 2024-08-08 |
Integrative Analysis of Bulk and Single-Cell RNA Sequencing Data Reveals Cell Types Involved in Heart Failure
2021, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2021.779225
PMID:35071201
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研究论文 | 本研究通过综合分析批量和单细胞RNA测序数据，揭示了心力衰竭中涉及的细胞类型 | 本研究首次综合利用批量和单细胞RNA测序数据，详细分析了心力衰竭中的细胞类型和分子机制 | NA | 旨在深入识别心力衰竭的遗传因素，为理解其分子基础提供新视角 | 心力衰竭相关的非衰竭（NF）、扩张型心肌病（DCM）和缺血性心肌病（ICM）心脏组织 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA测序 | PCA、GSEA、GSVA | RNA测序数据 | 包括非衰竭（NF）、扩张型心肌病（DCM）和缺血性心肌病（ICM）心脏组织 |
| 22302 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomes Combining with Consecutive Genomics Reveal Clonal Evolution and Gene Regulatory Networks in Relapsed and Refractory Multiple Myeloma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.794144
PMID:35071234
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞转录组学和连续基因组学，揭示了复发和难治性多发性骨髓瘤中的克隆进化和基因调控网络 | 首次结合单细胞RNA测序和全外显子测序，分析了从诊断到死亡的单个复发和难治性多发性骨髓瘤患者的动态基因组变化，并揭示了骨髓瘤细胞的内部异质性和基因调控网络 | 研究仅基于单一患者的数据，可能限制了结果的普遍性和广泛适用性 | 探讨多线治疗后复发/难治性多发性骨髓瘤中克隆结构的进化及其潜在的调控网络 | 复发和难治性多发性骨髓瘤患者的基因组和转录组 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全外显子测序（WES），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据，转录组数据 | 一名63岁女性患者，从诊断到死亡约37个月，进行了8次全外显子测序和1次单细胞RNA测序 |
| 22303 | 2024-08-08 |
Recent Advances in Single-Cell View of Mesenchymal Stem Cell in Osteogenesis
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.809918
PMID:35071243
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综述 | 本文综述了单细胞技术在骨生成中对间充质干细胞（MSCs）的研究进展 | 利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）识别骨生成标记物和分化途径，结合实验技术获得MSCs相关的新见解 | NA | 探讨MSCs在骨发育、维持和再生中的作用及其与微环境的相互作用 | 间充质干细胞（MSCs）及其在骨生成中的作用 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 22304 | 2024-08-08 |
The Cell Differentiation of Idioblast Myrosin Cells: Similarities With Vascular and Guard Cells
2021, Frontiers in plant science
IF:4.1Q1
DOI:10.3389/fpls.2021.829541
PMID:35082820
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综述 | 本文综述了异细胞芥子细胞与维管细胞/保卫细胞的相似性和差异性 | 分析了芥子细胞和保卫细胞在细胞类型特异性基因表达模式上的显著相似性 | NA | 探讨芥子细胞与维管细胞/保卫细胞的相似性和差异性 | 芥子细胞、维管细胞和保卫细胞 | NA | NA | 单细胞转录组学（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22305 | 2024-08-08 |
Dissecting Cellular Heterogeneity Based on Network Denoising of scRNA-seq Using Local Scaling Self-Diffusion
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.811043
PMID:35082838
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研究论文 | 本文提出了一种基于局部尺度自扩散网络去噪的单细胞RNA测序（scRNA-seq）方法，用于解析细胞异质性 | 本文创新性地提出了局部尺度自扩散（LSSD）方法，通过增强细胞相似性的度量学习来克服传统无监督聚类中的噪声和冗余信息问题 | NA | 识别不同细胞的表型和相互作用 | 细胞异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | 两个模拟数据集和四个真实scRNA-seq数据集 |
| 22306 | 2024-08-08 |
The Development of Single-Cell Metabolism and Its Role in Studying Cancer Emergent Properties
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.814085
PMID:35083160
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综述 | 本文综述了单细胞代谢组学技术在研究肿瘤代谢调控关键因子中的应用及其对基于代谢的抗癌策略发展的影响 | 单细胞代谢组学技术能够提供比传统代谢组学更详细的单细胞代谢信息，有助于筛选肿瘤治疗的代谢靶点 | NA | 探讨单细胞测序技术在寻找调控肿瘤代谢关键因子中的作用 | 肿瘤细胞的代谢调控关键因子 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞代谢组学 | NA | 代谢物 | NA |
| 22307 | 2024-08-08 |
Prognostic Autophagy-Related Model Revealed by Integrating Single-Cell RNA Sequencing Data and Bulk Gene Profiles in Gastric Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.729485
PMID:35083210
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出一个与自噬相关的风险模型，该模型能够区分胃癌患者的不良预后 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与自噬相关的风险模型，并验证了其在胃癌患者预后评估中的应用价值 | NA | 旨在揭示自噬相关模型在胃癌中的临床意义 | 胃癌患者的预后评估 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用了TCGA和两个独立的Gene Expression Omnibus队列的数据 |
| 22308 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiles of Age-Related Osteoarthritis Uncover Underlying Heterogeneity Associated With Disease Progression
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.748360
PMID:35083277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了与年龄相关的骨关节炎（OA）滑膜组织的细胞异质性 | 首次揭示了OA滑膜组织中免疫细胞亚群的转录组多样性及其在疾病进展中的作用 | NA | 旨在描绘骨关节炎滑膜组织的细胞间异质性 | 骨关节炎滑膜组织中的细胞异质性 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 整合了GSE55235和GSE55457两个数据集 |
| 22309 | 2024-08-08 |
The Crosstalk Between Malignant Cells and Tumor-Promoting Immune Cells Relevant to Immunotherapy in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.821232
PMID:35087839
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，评估了胰腺导管腺癌（PDAC）中恶性细胞与免疫细胞之间的细胞间通讯，构建了恶性-免疫细胞交叉对话（MIT）评分，用于预测PDAC患者的生存和治疗反应。 | 本研究首次构建了恶性-免疫细胞交叉对话（MIT）评分，用于预测PDAC患者的免疫检查点阻断（ICB）免疫治疗反应，并识别了15对恶性细胞与肿瘤促进免疫细胞之间的配体-受体对，为开发新的免疫治疗策略提供了潜在靶点。 | NA | 理解PDAC形成免疫抑制微环境的机制，开发新的有效免疫治疗策略。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的恶性细胞与免疫细胞之间的细胞间通讯。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 22310 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Unravels Distinct Peripheral Blood Immune Cell Signatures of RRMS and MOG Antibody-Associated Disease
2021, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2021.807646
PMID:35095746
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，揭示了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（MOGAD）在周围血免疫细胞中的独特特征 | 首次通过单细胞转录组测序技术，展示了RRMS和MOGAD在免疫细胞层面的显著差异，为这两种疾病的鉴别诊断提供了新的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括三名受试者（一名RRMS患者、一名MOGAD患者和一名健康对照），可能影响结果的普遍性和可靠性 | 旨在通过单细胞转录组测序技术，发现RRMS和MOGAD的独特免疫细胞特征，以提高这两种疾病的诊断和治疗效果 | 复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（MOGAD）的患者 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 三名受试者（一名RRMS患者、一名MOGAD患者和一名健康对照） |
| 22311 | 2024-08-08 |
Pulmonary Mesenchymal Stem Cells in Mild Cases of COVID-19 Are Dedicated to Proliferation; In Severe Cases, They Control Inflammation, Make Cell Dispersion, and Tissue Regeneration
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.780900
PMID:35095855
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19轻度和重度患者支气管肺泡灌洗样本中的间充质干细胞（MSCs），探讨了MSCs在不同病情中的生物学功能和治疗潜力。 | 首次详细分析了COVID-19不同病情下MSCs的基因表达变化，揭示了MSCs在控制炎症、细胞分散和组织再生中的作用。 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据分析，未涉及MSCs的体内功能验证和临床治疗应用。 | 探讨间充质干细胞在COVID-19不同病情中的生物学功能和治疗潜力。 | COVID-19轻度和重度患者的支气管肺泡灌洗样本中的间充质干细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19轻度和重度患者的支气管肺泡灌洗样本 |
| 22312 | 2024-08-08 |
The Transient IFN Response and the Delay of Adaptive Immunity Feature the Severity of COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.816745
PMID:35095917
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析COVID-19患者的免疫反应，揭示了不同临床结果患者的免疫特征 | 首次通过纵向单细胞RNA测序数据揭示了COVID-19患者免疫景观的动态变化及其与疾病进展和恢复的关系 | NA | 探究COVID-19患者免疫反应的异质性和动态特征及其与临床结果的关系 | COVID-19患者的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种临床结果的COVID-19患者 |
| 22313 | 2024-08-08 |
Single-Cell Ribonucleic Acid Sequencing Clarifies Cold Tolerance Mechanisms in the Pacific White Shrimp (Litopenaeus Vannamei)
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.792172
PMID:35096009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了太平洋白虾在不同温度下的肝胰腺细胞，以阐明其耐寒机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究太平洋白虾的耐寒机制，并识别了与耐寒相关的关键基因和代谢途径 | 研究仅限于特定的细胞类型和温度条件，可能需要进一步的研究来验证这些发现在更广泛条件下的适用性 | 阐明太平洋白虾的耐寒分子机制 | 太平洋白虾的肝胰腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 约5185个肝胰腺细胞，来自耐寒和普通太平洋白虾，分别在28°C和10°C下采集 |
| 22314 | 2024-08-08 |
Interactions Between Anti-Angiogenic Therapy and Immunotherapy in Glioblastoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.812916
PMID:35096619
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤中抗血管生成治疗与免疫治疗之间的相互作用及其潜在的协同效应 | 探讨了抗血管生成治疗与免疫治疗在胶质母细胞瘤中的协同作用，以及通过抑制VEGF等促血管生成因子来增加效应免疫细胞浸润的可能性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的肿瘤血管与免疫细胞的相互作用，并寻找针对这些相互作用的潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其与免疫治疗的相互作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22315 | 2024-08-08 |
Identification of prognostic biomarkers in papillary renal cell carcinoma and PTTG1 may serve as a biomarker for predicting immunotherapy response
2022-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2021.2011956
PMID:35037540
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研究论文 | 本研究旨在识别乳头状肾细胞癌（pRCC）中的潜在预后和治疗生物标志物，并探讨PTTG1作为预测免疫治疗反应的生物标志物的可能性。 | 本研究通过分析基因表达数据和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次发现PTTG1与肿瘤微环境中的淋巴细胞、免疫调节剂和趋化因子显著相关，并可能作为免疫检查点阻断（ICB）反应的预测因子。 | 本研究主要基于两个微阵列数据集和单细胞RNA测序数据，未来研究需要更多的临床样本和多中心数据来验证这些发现。 | 识别乳头状肾细胞癌中的预后和治疗生物标志物。 | 乳头状肾细胞癌（pRCC）患者及其肿瘤微环境中的生物标志物。 | 数字病理学 | 肾癌 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个微阵列数据集和复旦大学上海癌症中心（FUSCC）队列 |
| 22316 | 2024-08-08 |
Pre-existing Castration-resistant Prostate Cancer-like Cells in Primary Prostate Cancer Promote Resistance to Hormonal Therapy
2022-05, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2021.12.039
PMID:35058087
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研究论文 | 研究揭示了在前列腺癌早期存在的去势抵抗性前列腺癌样细胞，这些细胞促进了激素治疗的抵抗 | 发现了在激素治疗前就存在于前列腺癌中的去势抵抗性前列腺癌样细胞，这些细胞与疾病进展和远处转移有关 | 研究仅限于从新鲜的人类前列腺癌病例中分离的细胞，可能无法完全代表所有前列腺癌病例 | 理解早期前列腺癌中的亚克隆如何发展成去势抵抗性前列腺癌的机制 | 从新鲜的人类前列腺癌病例中分离的腺癌细胞，包括原发性腺癌、局部复发的去势抵抗性前列腺癌和转移性去势抵抗性前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 23226个上皮细胞 |
| 22317 | 2024-08-08 |
scJoint integrates atlas-scale single-cell RNA-seq and ATAC-seq data with transfer learning
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01161-6
PMID:35058621
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scJoint的迁移学习方法，用于整合大规模异构的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | scJoint利用半监督框架中的注释scRNA-seq数据，并通过神经网络同时训练标记和未标记数据，实现了标签转移和联合可视化 | NA | 开发一种方法以克服不同数据模式的异质性，从而更全面地理解细胞表型 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 迁移学习 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 使用图谱数据以及通过ASAP-seq和CITE-seq生成的多模态数据集进行验证 |
| 22318 | 2024-08-08 |
Transient Cell Cycle Induction in Cardiomyocytes to Treat Subacute Ischemic Heart Failure
2022-04-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过引入4个细胞周期因子（4F）促进心肌细胞增殖，以治疗亚急性缺血性心力衰竭 | 使用新型瞬时且心肌细胞特异性的病毒构建体，减少了细胞周期因子的致癌潜力 | NA | 研究强制心肌细胞增殖的过程，并推进该方法的临床可行性 | 心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型每组10只，猪模型每组6-7只 |
| 22319 | 2024-08-08 |
Age-related differences in immune dynamics during SARS-CoV-2 infection in rhesus macaques
2022-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101314
PMID:35039442
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研究论文 | 研究使用恒河猴模型探讨年龄相关的SARS-CoV-2感染免疫动力学差异 | 首次在恒河猴模型中详细分析了年龄对SARS-CoV-2感染后免疫反应的影响，特别是在急性后期阶段 | 研究仅限于恒河猴模型，可能不完全适用于人类 | 探究年龄对SARS-CoV-2感染免疫反应的影响 | 老年和年轻恒河猴的SARS-CoV-2感染免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组学、多参数流式细胞术、多重免疫组织化学、细胞因子检测、脂质组学分析 | NA | RNA、临床观察、胸部X光片、细胞因子、脂质 | 16只恒河猴（8只老年，8只年轻） |
| 22320 | 2024-08-08 |
Automation enables high-throughput and reproducible single-cell transcriptomics library preparation
2022-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2021.10.018
PMID:35058211
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程，用于提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）文库制备的通量并减少操作时间 | 通过自动化流程，将scRNA-seq文库制备的通量提高至48个反应，并将操作时间减少75% | NA | 提高单细胞RNA测序的效率和可重复性 | 单细胞RNA测序文库制备的自动化流程 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | RNA | 最多48个反应 |