单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 22221 - 22240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22221 | 2024-08-08 |
Pathogenic Mechanisms Underlying Idiopathic Pulmonary Fibrosis
2022-01-24, Annual review of pathology
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化（IPF）的发病机制，涉及细胞类型和信号通路的复杂相互作用 | 近期单细胞RNA测序研究揭示了一种具有异常基底细胞特征的新型AEC，可能干扰正常的上皮修复并促进促纤维化表型 | NA | 探讨IPF的发病机制，利用新型生物信息学工具发现疾病通路、细胞特异性机制和细胞间相互作用 | 特发性肺纤维化的发病机制 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22222 | 2024-08-08 |
Peanut oral immunotherapy differentially suppresses clonally distinct subsets of T helper cells
2022-01-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI150634
PMID:34813505
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序和配对的T细胞受体α/β测序，评估了12名花生过敏患者在口服免疫治疗（OIT）过程中CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞的转录组 | 本研究首次揭示了OIT过程中不同临床反应与花生反应性CD4+ T细胞的预先存在特征以及Th2细胞亚群的抑制之间的关系 | 本研究仅涉及12名患者，样本量较小，可能影响结果的普遍性 | 探讨口服免疫治疗（OIT）对花生过敏患者临床结果的免疫学基础 | 花生过敏患者的CD154+和CD137+花生反应性辅助T细胞 | 免疫学 | 食物过敏 | 单细胞RNA测序，T细胞受体α/β测序 | NA | 转录组数据 | 12名花生过敏患者 |
| 22223 | 2024-08-08 |
Comparative Proteome Signatures of Trace Samples by Multiplexed Data-Independent Acquisition
2022-01, Molecular & cellular proteomics : MCP
IF:6.1Q1
DOI:10.1016/j.mcpro.2021.100177
PMID:34793982
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研究论文 | 本文结合DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing两种分析策略，开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，用于从超低输入样本中生成高度可重复的、定量的蛋白质组特征 | 本文开发了一种新的、独立于鉴定的蛋白质组数据分析流程，允许在数百个样本中定量比较DIA-TMT蛋白质组特征，无需考虑其生物学来源，以识别细胞类型和单个蛋白质敲除 | NA | 旨在通过结合DIA和TMT-multiplexing技术，提高单细胞蛋白质组分析的可重复性和定量性 | 超低输入样本的蛋白质组特征 | 蛋白质组学 | NA | DIA和Tandem-Mass-Tag（TMT）-multiplexing | NA | 蛋白质组数据 | 数百个样本 |
| 22224 | 2024-08-08 |
Macrophage-Targeted Therapy Unlocks Antitumoral Cross-talk between IFNγ-Secreting Lymphocytes and IL12-Producing Dendritic Cells
2022-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-0326
PMID:34795032
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研究论文 | 本研究评估了使用BLZ945（一种小分子CSF1R抑制剂）治疗的小鼠肺肿瘤免疫微环境，通过单细胞RNA测序和机制验证方法，揭示了CSF1R靶向治疗如何重塑CSF1R细胞景观并激活抗肿瘤细胞间的交叉对话。 | 首次展示了CSF1R靶向治疗不仅通过细胞耗竭，而是通过重塑CSF1R细胞景观来激活抗肿瘤细胞间的交叉对话，包括IFNγ产生的自然杀伤细胞和T细胞以及IL12产生的树突状细胞。 | 研究主要在动物模型中进行，其结果在人类中的适用性需要进一步验证。 | 探讨CSF1R抑制剂在肺肿瘤免疫治疗中的作用机制。 | 小鼠肺肿瘤中的免疫细胞，特别是CSF1R细胞及其在肿瘤微环境中的作用。 | 免疫学 | 肺肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 22225 | 2024-08-08 |
Early lung carcinogenesis and tumor microenvironment observed by single-cell transcriptome analysis
2022-Jan, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2021.101277
PMID:34800916
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究了从不吸烟患者的肺磨玻璃结节（GGN）和正常肺组织中观察到的早期肺癌发生和肿瘤微环境 | 首次揭示了肺癌细胞中与小泡处理和表面活性物质稳态相关的基因集富集，以及肿瘤微环境中免疫细胞的特定变化 | 研究样本仅来自6名从不吸烟的患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨早期肺癌发生过程中癌细胞特异性标志物和肿瘤微环境的变化 | 从不吸烟患者的肺磨玻璃结节和正常肺组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 11个肺磨玻璃结节和正常肺组织样本，来自6名从不吸烟患者 |
| 22226 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of Bisphenol A exposure reveals the key roles of the testicular microenvironment in male reproduction
2022-Jan, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2021.112449
PMID:34808557
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组分析研究了双酚A暴露对睾丸微环境的影响及其在男性生殖中的关键作用 | 首次系统分析了青春期人类睾丸中细胞类型组成的显著变化，并构建了青少年睾丸中生殖细胞与体细胞之间的细胞间通信网络 | NA | 揭示双酚A在支持细胞和男性生殖中的生殖毒性和分子机制 | 人类睾丸中的生殖细胞和体细胞 | NA | 非阻塞性无精症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22227 | 2024-08-08 |
Establishment of Trophoblast-Like Tissue Model from Human Pluripotent Stem Cells in Three-Dimensional Culture System
2022-01, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202100031
PMID:34813178
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研究论文 | 本文报道了从人多能干细胞（hPSCs）在三维（3D）培养系统中生成滋养层样组织模型的方法 | 该研究首次成功在体外建立了从hPSCs到3D滋养层样组织模型，这一模型能够展示微绒毛结构并分泌人胎盘特异性激素 | NA | 旨在深入理解人类早期胎盘发育的机制，并探索其在发育生物学和妊娠障碍研究中的应用潜力 | 人多能干细胞（hPSCs）及其在三维培养系统中的滋养层样组织模型 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 3D培养系统 | 细胞 | NA |
| 22228 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA Sequencing Reveals How the Aryl Hydrocarbon Receptor Shapes Cellular Differentiation Potency in the Mouse Colon
2022-01, Cancer prevention research (Philadelphia, Pa.)
DOI:10.1158/1940-6207.CAPR-21-0378
PMID:34815312
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学和高级分析策略，探讨了芳香烃受体（Ahr）在调节小鼠结肠隐窝稳态中的作用 | 本研究首次揭示了Ahr缺失对隐窝相关上皮细胞类型和亚型的促进作用，以及对单细胞熵和RNA速度长度的影响 | NA | 探讨Ahr在调节结肠隐窝稳态中的作用 | 小鼠结肠隐窝中的上皮细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 野生型和肠道特异性Ahr敲除小鼠的结肠隐窝 |
| 22229 | 2024-08-08 |
Stem cell aging in the skeletal muscle: The importance of communication
2022-01, Ageing research reviews
IF:12.5Q1
DOI:10.1016/j.arr.2021.101528
PMID:34818593
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综述 | 本文综述了骨骼肌中卫星细胞功能衰退的分子过程及其在衰老中的作用 | 强调了单细胞测序技术在研究骨骼肌衰老中的新兴应用，特别是在卫星细胞群体异质性和与微环境中其他细胞类型的分子相互作用方面 | 文中提到的许多外在因素仍未明确 | 探讨卫星细胞在衰老过程中的功能衰退机制及其与环境的相互作用 | 骨骼肌中的卫星细胞及其在衰老中的功能衰退 | NA | NA | 单细胞测序技术 | NA | NA | NA |
| 22230 | 2024-08-08 |
Optimized workflow for human PBMC multiomic immunosurveillance studies
2021-12-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2021.100900
PMID:34806044
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研究论文 | 本文详细介绍了一种用于人类外周血单个核细胞多组学免疫监测研究的优化工作流程 | 该工作流程通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序技术，减少了批次效应，提高了数据的可重复性和处理通量 | NA | 深入了解人类免疫系统在健康和疾病中的功能 | 人类外周血单个核细胞 | 数字病理学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 22231 | 2024-08-08 |
Absence of ERAP1 in B Cells Increases Susceptibility to Central Nervous System Autoimmunity, Alters B Cell Biology, and Mechanistically Explains Genetic Associations between ERAP1 and Multiple Sclerosis
2021-12-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100813
PMID:34810226
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研究论文 | 研究探讨了ERAP1基因在B细胞中的缺失如何增加中枢神经系统自身免疫的易感性，并揭示了ERAP1与多发性硬化症之间的遗传关联机制 | 首次通过多种小鼠模型和单细胞光谱流式细胞术，结合人类单细胞RNA测序数据的综合分析，揭示了ERAP1在B细胞中的作用及其与多发性硬化症的关联机制 | NA | 探究ERAP1基因多态性与多发性硬化症易感性增加的机制 | ERAP1基因在B细胞中的作用及其对中枢神经系统自身免疫的影响 | 免疫学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 36个个体 |
| 22232 | 2024-08-08 |
Delayed antiretroviral therapy in HIV-infected individuals leads to irreversible depletion of skin- and mucosa-resident memory T cells
2021-12-14, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2021.10.021
PMID:34813775
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研究论文 | 本文探讨了HIV感染者在接受抗逆转录病毒治疗（ART）后皮肤和黏膜中CD4组织驻留记忆T细胞的损耗情况及其对HPV相关癌症发展的影响 | 首次揭示了HIV感染者在接受晚期ART治疗后，皮肤和黏膜中CXCR3 Trm细胞的不可逆损失 | 研究样本量较小，且仅限于特定类型的HPV相关癌症 | 探究HIV感染者皮肤和黏膜中CD4 Trm细胞的损耗机制及其对HPV相关癌症发展的影响 | HIV感染者的皮肤和黏膜中的CD4 Trm细胞 | NA | HIV感染 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 具体样本数量未在摘要中明确 |
| 22233 | 2024-08-08 |
Epigenetically associated CCL20 upregulation correlates with esophageal cancer progression and immune disorder
2021-Dec, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2021.153683
PMID:34798484
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研究论文 | 本文研究了趋化因子CCL20在食管癌中的表达及其与肿瘤进展和免疫紊乱的关系 | 首次揭示了CCL20通过表观遗传学机制上调，促进食管癌进展和免疫失调 | NA | 探讨CCL20在食管癌中的作用及其机制 | 食管癌患者的趋化因子表达及免疫细胞浸润 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 独立食管癌队列及模拟人类食管鳞状细胞癌发展的鼠模型 |
| 22234 | 2024-08-08 |
Transfer learning compensates limited data, batch effects and technological heterogeneity in single-cell sequencing
2021-Dec, NAR genomics and bioinformatics
IF:4.0Q1
DOI:10.1093/nargab/lqab104
PMID:34805988
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研究论文 | 本文提出了一种元迁移学习方法，用于在单细胞测序数据中补偿有限数据、批次效应和技术异质性 | 通过迁移分子模式识别模型从无关领域的大数据集中学习，克服了数据稀缺和数据异质性的问题 | NA | 探索小样本数据集中的迁移学习方法，以提高分子模式识别任务的性能 | 单细胞测序数据 | 机器学习 | NA | 下一代测序技术 | 元迁移学习模型 | 单细胞测序数据 | 小样本数据集 |
| 22235 | 2024-08-08 |
Scaling concepts in 'omics: Nuclear lamin-B scales with tumor growth and often predicts poor prognosis, unlike fibrosis
2021-11-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2112940118
PMID:34810266
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研究论文 | 研究探讨了核层粘连蛋白-B与肿瘤生长之间的关系，并利用机器学习方法分析了其对患者生存预测的影响 | 首次发现核层粘连蛋白-B与肿瘤生长具有特定的基因-基因缩放指数，并能通过机器学习方法预测患者生存 | 研究主要集中在肿瘤类型和患者生存预测上，未涉及其他疾病或更广泛的生物学机制 | 探索核层粘连蛋白-B与肿瘤生长及患者预后之间的关系 | 核层粘连蛋白-B、肿瘤生长及患者生存 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 机器学习 | 基因表达数据 | 涉及32种肿瘤类型的数据 |
| 22236 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing of the Strongylocentrotus purpuratus larva reveals the blueprint of major cell types and nervous system of a non-chordate deuterostome
2021-11-25, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.70416
PMID:34821556
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术（scRNA-seq）分析了海胆早期浮游幼虫的细胞类型，揭示了其消化、骨骼、免疫和神经系统的主要细胞类型 | 首次通过scRNA-seq技术详细描绘了海胆幼虫的细胞多样性，并发现了海胆神经元与脊椎动物内分泌胰腺细胞共享的大量基因 | NA | 识别生物细胞类型的分子特征，以理解其功能和进化 | 海胆早期浮游幼虫的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 21个不同的细胞集群 |
| 22237 | 2024-08-08 |
Single-cell DNA and RNA sequencing of circulating tumor cells
2021-11-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-021-02165-7
PMID:34819539
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研究论文 | 本文通过单细胞DNA和RNA测序技术研究循环肿瘤细胞，以精确展现肿瘤异质性并提供癌症治疗和研究的有用信息 | 采用多种全基因组扩增（WGA）和全转录组扩增（WTA）方法，特别是基于多重置换扩增（MDA）的方法，显示出较高的扩增效率和覆盖深度 | 基于MDA的WTA方法在扩增mRNA时效果较差，并显示出非特异性基因表达模式 | 开发一种更可靠和适应性强的方法，用于单细胞水平上的循环肿瘤细胞（CTC）分析 | 循环肿瘤细胞的单细胞DNA和RNA | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA和RNA | 使用了来自健康志愿者的血液样本，并掺入了TGW神经母细胞瘤细胞 |
| 22238 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals intratumoural heterogeneity and malignant progression in retinoblastoma
2021-11-23, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-021-04390-4
PMID:34815392
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了视网膜母细胞瘤的肿瘤内异质性和恶性进展机制 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了视网膜母细胞瘤中的两种主要细胞类型及其在恶性进展中的作用 | NA | 探究视网膜母细胞瘤的肿瘤内异质性和恶性进展机制 | 视网膜母细胞瘤中的细胞类型及其在恶性进展中的作用 | 数字病理学 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,739个细胞来自两个视网膜母细胞瘤样本 |
| 22239 | 2024-08-08 |
Autoreactive T cell receptors with shared germline-like α chains in type 1 diabetes
2021-11-22, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.151349
PMID:34806648
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术在1型糖尿病患者的胰岛自身抗原反应性CD4+记忆T细胞中鉴定出一类共享TCRα链的T细胞受体 | 发现了一类在个体间共享的TCRα链，这些TCR序列更接近胚系，且具有较短的连接序列，表明随机核苷酸插入较少 | NA | 探讨1型糖尿病中胰岛自身抗原反应性T细胞的TCR特性及其在疾病机制中的作用 | 1型糖尿病患者的胰岛自身抗原反应性CD4+记忆T细胞及其TCR | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | TCR序列 | 从健康、新发和已建立的1型糖尿病供体血液中分离的2767个单个细胞 |
| 22240 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome identifies molecular subtype of autism spectrum disorder impacted by de novo loss-of-function variants regulating glial cells
2021-11-21, Human genomics
IF:3.8Q2
DOI:10.1186/s40246-021-00368-7
PMID:34802461
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研究论文 | 本研究通过整合大规模脑单细胞转录组数据和自发性失功能（LOF）ASD变异，探讨了ASD相关基因在时空和细胞类型表达上的模式 | 首次揭示了ASD相关基因在非神经细胞类型中的转录调控限制，并提出这些细胞类型在ASD发病机制中的潜在作用 | NA | 探究自闭症谱系障碍（ASD）的分子基础，特别是从'脑到行为'的致病机制角度 | 自闭症谱系障碍（ASD）相关基因的时空和细胞类型表达模式 | 数字病理学 | 自闭症谱系障碍 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 超过百万个脑细胞，40,122个病例中的852个基因 |