单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27279 篇文献，本页显示第 22181 - 22200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22181 | 2024-08-08 |
Prognostic value of metabolic signature on 18F-FDGuptake in breast cancer patients after radiotherapy
2021-Dec-17, Molecular therapy oncolytics
IF:5.3Q1
DOI:10.1016/j.omto.2021.10.008
PMID:34853812
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研究论文 | 本研究旨在通过利用公共数据集的mRNA表达谱，识别与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | 首次构建并验证了与放射治疗后乳腺癌患者葡萄糖摄取相关的预后基因特征 | NA | 研究放射治疗后乳腺癌患者的葡萄糖摄取特征的预后价值 | 放射治疗后的乳腺癌患者 | NA | 乳腺癌 | 单样本基因集富集分析（ssGSEA） | NA | mRNA表达谱 | 三个放射治疗后乳腺癌队列（GSE103744、NKI和FUSCC数据库）以及五个乳腺癌患者的单细胞RNA测序数据库 |
| 22182 | 2024-08-08 |
Systematic temporal analysis of peripheral blood transcriptomes using TrendCatcher identifies early and persistent neutrophil activation as a hallmark of severe COVID-19
2021-Dec-07, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.05.04.442617
PMID:34845446
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研究论文 | 本研究开发了一个开源R包TrendCatcher，用于识别和可视化纵向转录组数据中的动态转录基因特征和生物过程 | TrendCatcher应用平滑样条ANOVA模型和断点搜索策略，优化了时间序列转录组数据的分析方法 | NA | 研究COVID-19疾病进展中的基因表达变化，以识别早期生物标志物和潜在的治疗靶点 | COVID-19患者的外周血转录组 | 生物信息学 | COVID-19 | RNA-seq | 平滑样条ANOVA模型 | 转录组数据 | 包括bulk RNA-seq和scRNA-seq的时间序列数据 |
| 22183 | 2024-08-08 |
Evolution of synapses and neurotransmitter systems: The divide-and-conquer model for early neural cell-type evolution
2021-12, Current opinion in neurobiology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.conb.2021.11.002
PMID:34826676
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综述 | 本文综述了非两侧对称动物中神经分子进化的当前理解，并通过重新分析刺胞动物的单细胞测序数据，揭示了其与两侧对称动物神经元类型的同源性证据 | 提出了Unc13-RIM神经元可能存在于最早的真后生动物中，并在两侧对称动物的进化中占据主导地位的假设 | NA | 探讨神经系统和神经递质系统的进化，特别是早期神经细胞类型的进化 | 非两侧对称动物的神经分子进化及刺胞动物与两侧对称动物神经元的同源性 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | 单细胞测序数据 | NA |
| 22184 | 2024-08-08 |
Transcriptional profiling of sequentially generated septal neuron fates
2021-12-01, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.71545
PMID:34851821
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序、组织学和遗传模型研究了海马神经元多样性在神经发生过程中的建立机制 | 发现海马前体细胞的转录组特征随神经发生而变化，并与不同神经元类型的生成相吻合 | NA | 探究海马神经元多样性的建立机制 | 海马神经元及其前体细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及至少三种形态学类别的神经元 |
| 22185 | 2024-08-08 |
Loss of PRC2 subunits primes lineage choice during exit of pluripotency
2021-11-30, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27314-4
PMID:34848733
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研究论文 | 本研究探讨了Polycomb抑制复合物2（PRC2）在胚胎干细胞（ESCs）中的两种不同形式PRC2.1和PRC2.2在谱系特化和承诺中的作用 | 揭示了MTF2和JARID2在PRC2复合物中的不同作用，以及它们在平衡谱系特异性基因激活中的重要性 | NA | 研究PRC2在胚胎干细胞谱系选择和承诺中的作用 | MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞及其衍生的胚胎体 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自MTF2和JARID2缺失的胚胎干细胞的胚胎体 |
| 22186 | 2024-08-08 |
ScLRTC: imputation for single-cell RNA-seq data via low-rank tensor completion
2021-Nov-29, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-021-08101-3
PMID:34844559
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研究论文 | 本文提出了一种基于低秩张量补全的方法scLRTC，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | scLRTC方法利用单细胞间的相似性构建三阶低秩张量，并通过张量分解去噪，采用低秩张量补全算法重建细胞表达，恢复基因间和细胞间的相关性 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中的缺失数据和噪声问题，以提高下游分析的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩张量补全 | 基因-细胞表达矩阵 | 不同数据规模的模拟数据集和真实单细胞RNA测序数据集 |
| 22187 | 2024-08-08 |
Subclone-specific microenvironmental impact and drug response in refractory multiple myeloma revealed by single-cell transcriptomics
2021-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-26951-z
PMID:34845188
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了20名复发/难治性多发性骨髓瘤（RRMM）患者治疗前后肿瘤细胞及其与骨髓微环境（BME）的复杂相互作用网络 | 揭示了具有1q染色体增益的亚克隆在治疗期间频繁扩增，并通过上调炎症细胞因子和与骨髓细胞紧密相互作用，塑造了一个免疫抑制的BME | NA | 解析RRMM中亚克隆的转录特征和微环境重编程机制，为临床决策提供依据 | 复发/难治性多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞及其微环境 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 20名复发/难治性多发性骨髓瘤患者 |
| 22188 | 2024-08-08 |
Germline biallelic mutation affecting the transcription factor Helios causes pleiotropic defects of immunity
2021-Nov-26, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abe3981
PMID:34826259
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研究论文 | 本文研究了一个患有反复呼吸道感染和低丙种球蛋白血症的患者，发现其存在编码转录因子Helios的种系同合子错义突变，并探讨了Helios在人类免疫稳态中的作用及其调控机制 | 首次发现Helios的种系突变导致免疫缺陷，揭示了Helios在人类免疫稳态中的细胞特异性表观遗传调控作用 | NA | 探究Helios在人类免疫稳态中的作用及其调控机制 | 患有反复呼吸道感染和低丙种球蛋白血症的患者 | 免疫学 | 免疫缺陷病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个患者的外周血单个核细胞 |
| 22189 | 2024-08-08 |
Stroke subtype-dependent synapse elimination by reactive gliosis in mice
2021-11-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27248-x
PMID:34836962
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研究论文 | 本研究利用小鼠缺血性和出血性中风模型，探讨了反应性神经胶质增生区域中微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在吞噬突触中的不同作用 | 通过特异性删除MEGF10和MERTK吞噬受体，发现抑制微胶质细胞/巨噬细胞或星形胶质细胞的吞噬作用可以改善神经行为结果并减轻脑损伤 | NA | 探讨反应性神经胶质增生在中枢神经系统修复中的病理作用 | 微胶质细胞/巨噬细胞和星形胶质细胞在反应性神经胶质增生区域中吞噬突触的作用 | NA | 中风 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠缺血性和出血性中风模型 |
| 22190 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis identifies dynamic gene expression networks that govern B cell development and transformation
2021-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-021-27232-5
PMID:34824268
|
研究论文 | 本文通过单细胞转录组学/蛋白质组学技术，分析了B细胞发育过程中的动态基因表达网络，并将其与B细胞白血病的亚型相关联 | 本文发现了独特的转录特征，将前B细胞扩张阶段细分为前BCR依赖和前BCR独立增殖阶段，并揭示了转录因子EBF1和RNA结合蛋白YBX3的表达变化与这些阶段的相关性 | NA | 研究B细胞发育和转化过程中的基因表达网络 | B细胞发育过程中的基因表达网络及其与B细胞白血病的关系 | 数字病理学 | B细胞白血病 | 单细胞转录组学/蛋白质组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22191 | 2024-08-08 |
Effects of poor sleep on the immune cell landscape as assessed by single-cell analysis
2021-11-25, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-021-02859-8
PMID:34824394
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研究论文 | 本文通过质谱流式细胞术和单细胞RNA测序技术，研究了睡眠不足对人类免疫细胞景观的影响 | 首次综合分析了睡眠不足对免疫细胞亚群组成、基因特征、富集通路、转录调控网络和细胞间相互作用的影响 | NA | 探讨睡眠不足对免疫细胞景观的细胞和分子机制 | 人类免疫细胞在睡眠不足条件下的变化 | 数字病理学 | NA | 质谱流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | 具体样本数量未提及 |
| 22192 | 2024-08-08 |
[Advances and applications of organoids: a review]
2021-Nov-25, Sheng wu gong cheng xue bao = Chinese journal of biotechnology
DOI:10.13345/j.cjb.200764
PMID:34841798
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综述 | 本文综述了类器官的分类、特性、当前应用、与其他技术的结合使用及未来展望 | 类器官作为一种新型模型系统，能够更精确地模拟人体生理现象，并可与基因编辑、芯片器官和单细胞RNA测序等技术结合，突破传统模型的局限 | NA | 探讨类器官在疾病建模、药物研究、精准医学和再生医学中的应用 | 类器官及其与其他技术的结合应用 | NA | NA | 基因编辑、器官芯片、单细胞RNA测序 | NA | NA | NA |
| 22193 | 2024-08-08 |
Identifying disease-critical cell types and cellular processes across the human body by integration of single-cell profiles and human genetics
2021-Nov-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2021.03.19.436212
PMID:34845454
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研究论文 | 本文介绍了sc-linker框架，通过整合单细胞RNA测序、表观基因组图谱和全基因组关联研究（GWAS）的统计数据，推断遗传变异影响疾病的潜在细胞类型和过程 | sc-linker框架的创新之处在于它能够整合多种数据类型，包括单细胞RNA测序、表观基因组图谱和GWAS数据，以推断疾病相关的细胞类型和细胞过程 | NA | 识别遗传变异影响疾病的关键细胞类型和细胞过程 | 分析了来自209个个体、涵盖11种组织类型和6种疾病状况的160万个单细胞RNA测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | 160万个单细胞RNA测序数据，来自209个个体 |
| 22194 | 2024-08-08 |
Single-Cell Atlas of Adult Testis in Protogynous Hermaphroditic Orange-Spotted Grouper, Epinephelus coioides
2021-Nov-22, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222212607
PMID:34830486
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，对橙点石斑鱼的成年睾丸细胞进行了研究，识别并定义了多种细胞类型及其标记基因。 | 首次对橙点石斑鱼的成年睾丸进行单细胞RNA测序，揭示了其细胞类型和标记基因的表达模式。 | 研究仅限于橙点石斑鱼的成年睾丸，未涉及其他发育阶段或其他物种。 | 探究橙点石斑鱼成年睾丸中的精子发生过程及其细胞类型。 | 橙点石斑鱼的成年睾丸细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 约9500个睾丸细胞 |
| 22195 | 2024-08-08 |
A Portrait of Intratumoral Genomic and Transcriptomic Heterogeneity at Single-Cell Level in Colorectal Cancer
2021-Nov-17, Medicina (Kaunas, Lithuania)
DOI:10.3390/medicina57111257
PMID:34833475
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综述 | 本文综述了结直肠癌中单细胞水平的肿瘤内基因组和转录组异质性的研究进展 | 介绍了单细胞技术在定义细胞亚群和分离稀有细胞群信号方面的应用，以及其在结直肠癌精准医疗中的潜力 | NA | 探讨单细胞技术在结直肠癌精准医疗中的应用，以及其在早期诊断、治疗反应预测和发现新药物靶点方面的可能性 | 结直肠癌的肿瘤内基因组和转录组异质性 | 数字病理学 | 结直肠癌 | NGS | NA | 基因组和转录组数据 | NA |
| 22196 | 2024-08-08 |
Identification of Potential Long Non-Coding RNA Candidates that Contribute to Triple-Negative Breast Cancer in Humans through Computational Approach
2021-Nov-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms222212359
PMID:34830241
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研究论文 | 本研究通过计算方法分析了公开的单细胞RNA测序数据，识别了与三阴性乳腺癌相关的潜在长非编码RNA候选物 | 本研究首次详细探索了长非编码RNA在三阴性乳腺癌患者中的作用，并识别了197个潜在的新型lncRNA | 研究仅使用了公开的单细胞RNA测序数据，可能需要更多的实验验证来确认这些lncRNA的功能 | 探索长非编码RNA在三阴性乳腺癌中的作用，并识别潜在的治疗干预生物标志物 | 三阴性乳腺癌患者中的长非编码RNA和mRNA表达变化 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 涉及三阴性乳腺癌患者的RNA测序数据 |
| 22197 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Expression of Aging- and Senescence-Associated Genes in Distinct Cancer Cell Populations
2021-11-11, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113126
PMID:34831349
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研究论文 | 本研究分析了公开的慢性髓性白血病、结直肠癌、肝细胞癌、肺癌和胰腺导管腺癌的bulk mRNA-seq和单细胞RNA-seq数据，揭示了衰老和衰老相关基因在不同癌细胞群体中的表达 | 首次检测到多种衰老/衰老诱导基因在恶性疾病中相对于健康对照样本的上调，并揭示了这些基因在细胞发育过程中的重要性 | 仅检测了少数癌症类型中衰老相关基因与转录组广泛变化之间的相关性 | 分析衰老相关转录模式，探讨衰老和衰老相关基因在人类恶性肿瘤中的作用 | 慢性髓性白血病、结直肠癌、肝细胞癌、肺癌和胰腺导管腺癌的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多种癌症类型的样本 |
| 22198 | 2024-08-08 |
Comparative Analyses of Single-Cell Transcriptomic Profiles between In Vitro Totipotent Blastomere-like Cells and In Vivo Early Mouse Embryonic Cells
2021-11-10, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113111
PMID:34831338
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术比较了体外培养的全能性类似囊胚细胞与体内早期小鼠胚胎细胞的转录组特征 | 首次报道了使用单一剪接体抑制剂pladienolide B（plaB）成功将小鼠多能干细胞重编程为全能性类似囊胚细胞（TBLCs），并发现TBLCs中存在一个表达高水平全能性相关基因的亚群 | 目前尚有争议TBLCs是否为与体内两细胞阶段胚胎等效的‘真正’全能干细胞 | 探讨体外培养的全能性类似囊胚细胞与体内早期小鼠胚胎细胞的转录组差异 | 体外培养的全能性类似囊胚细胞（TBLCs）与体内早期小鼠胚胎细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个体外培养的全能性类似囊胚细胞和体内早期小鼠胚胎细胞样本 |
| 22199 | 2024-08-08 |
Scientific Validation and Clinical Application of Lung Cancer Organoids
2021-11-04, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells10113012
PMID:34831235
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研究论文 | 本文探讨了肺腺癌类器官（LCO）的科学验证及临床应用，重点研究了LCO培养介质的优化及其在药物筛选中的应用 | 本文利用单细胞RNA测序技术验证LCO是否再现了原发性肿瘤的异质性和功能层次，并尝试通过培养含有间质细胞和免疫细胞的LCO来再现肿瘤微环境 | LCO的成功率差异较大，且培养介质成分显著不同，可能导致正常细胞类器官的过度生长 | 研究肺腺癌类器官的科学验证及其在药物发现和预后预测中的应用 | 肺腺癌类器官（LCO）及其培养介质 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | LCO的成功率从7%到87%不等，具体样本数量未详细说明 |
| 22200 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals the landscapes of human cord blood hematopoietic stem cell differentiation during ex vivo culture
2021-11, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.616
PMID:34841734
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |